题名 一种数据本地化存储与处理系统
被引量：2
1
作者
徐永士 霍菁 孙功星
机构
中国科学院高能物理研究所计算中心 中国科学院研究生院
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
2012年第5期7-11,共5页
基金
国家自然科学基金资助重点项目(No.90912004)
文摘
简述了当前大型数据中心普遍采用的计算节点集群与存储系统模块化设计的系统结构,说明了部署在各模块上的主要集群系统。分析了具有独立性的结构化数据本地化存储于计算节点的可能性,给出了系统基本框架,从总体拥有成本(TCO)的角度分析了其价值。结合高能物理研究的原始数据特点,认为数据本地化存储在节点上,有利于提高整体利用率,指出了关键部件——文件元数据管理系统的设计要点,分析了PBS作业批处理系统集成文件元数据管理系统的三种方案,给出第一种方案的详细设计,相应的用户提交作业方式的改变。在测试环境下,初步部署了文件元数据管理系统,测试了三种集成方案,给出了简要的分析比较。
关键词
作业批处理系统 (PBS)高能物理数据分析 文件元数据管理 数据存储本地化
Keywords
Portable Batch System（PBS） high physical energy data analyses file metadata manage data storage localization
分类号
TP393
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
题名 分布式文件元数据管理系统设计
被引量：1
2
作者
徐永士 臧冬松 孙功星
机构
中国科学院高能物理研究所计算中心 中国科学院研究生院
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
2012年第7期1-4,98,共5页
基金
国家自然科学基金重点项目(No.90912004)
文摘
简述了分布式文件元数据管理系统的应用环境和设计目标。目标系统设定应用于高能物理数据分析,关联Torque作业批处理系统;在这些条件的限制下,详细分析了各种限制因素,并以此为基础给出了目标系统的总体结构及模块化设计。详细阐述了目标系统的数据库设计、访问接口设计以及数据同步要点,给出了设计思路,并结合目标系统的记录新增操作、查询操作的测试性能,讨论了进一步的工作。
关键词
分布式 文件元数据管理 TORQUE 作业批处理系统
Keywords
distribution file metadata management Torque Portable Batch System（PBS）
分类号
TP393
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
题名 基于结构的利用分布式计算的虚拟筛选（英文）
被引量：1
3
作者
谭善阳 王泰一 王珲 徐峰
机构
天津科技大学 南开大学药学院药物化学生物学国家重点实验室 天津国际生物医药联合研究院 北京羚锐药物研究院
出处
《计算机与应用化学》
CAS
2015年第9期1025-1030,共6页
基金
Supported by National natural Science Foundation of China 21302102 Tianjin Municipal Science and Technology Commission Grants 12ZCZDSY14500 and 13JCYBJC20900~~
文摘
药物虚拟筛选的方法被广泛应用于从百万数量级的类药分子数据库中挑选出潜在的活性候选化合物,相比较于传统的流程可以显著降低研发成本和时间。为此,我们建立了一个大型分布式计算阵列,本论文详细说明了阵列系统的建立方法和对应的虚拟筛选流程。通过对以极光激酶A为药物筛选靶点的测试,我们从数据库中得到了包含已知的高活性分子等多个候选化合物,验证了系统的可行性。
关键词
虚拟筛选 分布式计算 极光激酶 交叉对接 批处理 作业 系统
Keywords
virtual screening distributed computing Aurora cross-docking PBS
分类号
R965.1
[医药卫生—药理学]
