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基于重组酶聚合酶扩增结合侧向流试纸条快速检测H7亚型禽流感病毒的方法研究 被引量:2
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作者 李翔 方斌 +2 位作者 余晓 叶国军 刘琳琳 《国际病毒学杂志》 2020年第6期497-500,共4页
目的建立一种快速、灵敏、可视化的H7亚型禽流感病毒等温核酸扩增检测方法。方法针对H7N9禽流感病毒的HA片段保守区序列设计引物、探针,优化反应温度,建立H7亚型禽流感病毒的重组酶聚合酶扩增结合侧流层析试纸条检测技术,评价其特异性... 目的建立一种快速、灵敏、可视化的H7亚型禽流感病毒等温核酸扩增检测方法。方法针对H7N9禽流感病毒的HA片段保守区序列设计引物、探针,优化反应温度,建立H7亚型禽流感病毒的重组酶聚合酶扩增结合侧流层析试纸条检测技术,评价其特异性和敏感性,并与Real time PCR方法进行比较。结果该方法检测H7亚型禽流感病毒的最低检出限为20拷贝/μL,与其他流感/禽流感病毒无交叉反应,反应可在20~50℃温度范围内进行,临床样本检测结果与Real time PCR法一致性为100.0%。结论该检测方法具有快速、特异及灵敏的特点,为在基层和现场快速检测H7亚型禽流感病毒提供了新的方法。 展开更多
关键词 H7亚型禽感病毒 重组酶聚合酶扩增 侧向流试纸条 快速检测
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禽流感RT-RAA侧向流试纸条可视化检测方法的建立 被引量:4
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作者 王文静 李馨月 +4 位作者 张鹏 刘静茹 姚姗姗 王春光 张铁 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期2159-2163,共5页
禽流感(AI)是威胁我国养禽业健康发展的重要疫病,为建立该病高效、便捷的检测方法进行本项研究。本试验根据禽流感病毒(AIV)保守基因(NP)序列设计引物和探针,利用反转录重组聚合酶介导恒温扩增(RT-RAA)技术对NP基因进行快速扩增并形成... 禽流感(AI)是威胁我国养禽业健康发展的重要疫病,为建立该病高效、便捷的检测方法进行本项研究。本试验根据禽流感病毒(AIV)保守基因(NP)序列设计引物和探针,利用反转录重组聚合酶介导恒温扩增(RT-RAA)技术对NP基因进行快速扩增并形成双标产物,扩增产物通过侧向流试纸条(LFD)进行快速检测,通过对反应时间、温度和引物浓度等条件的优化,建立了1种能够检测禽流感病毒的RT-RAA-LFD检测方法。结果显示,该方法37℃条件下,反应24 min,即可实现NP目的基因片段的有效扩增,且扩增产物可通过侧向流试纸条肉眼观察;特异性良好,与传染性支气管炎病毒(IBV)、传染性喉气管炎病毒(AILV)、新城疫病毒(NDV)无核酸交叉反应;敏感性达到102 copies/μL,是常规PCR的100倍,临床检测符合率为94.8%。该方法具有特异性强、敏感性高、便捷快速等优点,为田间检测禽流感病毒提供一种可行方法。 展开更多
关键词 重组酶介导等温核酸扩增技术 侧向流试纸条 NP基因
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塞尼卡谷病毒重组酶聚合酶扩增-侧流层析试纸条检测方法的建立 被引量:15
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作者 樊晓旭 宋翥远 +11 位作者 赵永刚 赵明 董雅琴 张永强 李园丽 迟田英 刘春菊 戈胜强 张志诚 吴晓东 王树双 王志亮 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期406-410,共5页
为建立塞尼卡谷病毒(SVV)重组酶聚合酶扩增-侧流层析试纸条(RPA-LFD)检测方法,本研究针对SVV 3D基因设计了引物和探针,通过反应条件优化、特异性、灵敏性和重复性试验,建立了SVV RPA-LFD检测方法。特异性试验结果显示,该方法与口蹄疫病... 为建立塞尼卡谷病毒(SVV)重组酶聚合酶扩增-侧流层析试纸条(RPA-LFD)检测方法,本研究针对SVV 3D基因设计了引物和探针,通过反应条件优化、特异性、灵敏性和重复性试验,建立了SVV RPA-LFD检测方法。特异性试验结果显示,该方法与口蹄疫病毒、猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸道综合征病毒、猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒、圆环病毒、伪狂犬病毒无交叉反应;在40℃、20 min内可检测的最低浓度为56拷贝/μL质粒标准品;通过3次重复试验检测,LFD检测线灰度值变异系数范围在4.49%~9.73%。利用该方法对120份国内临床样品进行检测,结果均为阴性。本研究首次建立了检测SVV的等温、快速RPA-LFD方法,读取结果不依赖任何仪器设备,为猪群感染SVV的现场快速诊断、流行病学研究和根除方案的制定提供帮助。 展开更多
关键词 塞尼卡谷病毒 重组酶聚合酶扩增 侧向流试纸条
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牛诺瓦病毒和牛轮状病毒双重RAA-LFD快速检测方法的建立及应用
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作者 李惠惠 董可儿 +6 位作者 刘馨博 张春晓 马超 陈利苹 钟旗 姚刚 马雪连 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期406-412,共7页
为建立能同时检测牛诺瓦病毒(bovine norovirus,BNoV)和牛轮状病毒(bovine rotavirus,BRV)的重组酶辅助扩增-侧流层析试纸条(recombinase aided amplification-lateral flow dipstick,RAA-LFD)快速检测方法。本试验按照RAA引物探针设计... 为建立能同时检测牛诺瓦病毒(bovine norovirus,BNoV)和牛轮状病毒(bovine rotavirus,BRV)的重组酶辅助扩增-侧流层析试纸条(recombinase aided amplification-lateral flow dipstick,RAA-LFD)快速检测方法。本试验按照RAA引物探针设计原则,分别针对BNoV RdRp基因和BRV VP7基因的保守区设计引物和探针,制备标准重组质粒,建立并优化RAA-LFD反应体系,同时对该检测方法进行特异性、敏感性及重复性评估,用建立的RAA-LFD法与PCR法、qPCR法分别对采集的168份腹泻犊牛的临床样本进行平行检测。结果显示,该方法可在20 min,39℃的条件下扩增目标片段,对BNoV和BRV敏感度均为103 copies·μL^(-1),与PCR的检测结果基本一致,且与牛冠状病毒(bovine coronavirus,BCoV)、牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)和牛传染性鼻气管炎病毒(infectious bovine rhinotracheitis virus,IBRV)无交叉反应,虽低于qPCR检测结果,但可通过肉眼直接观察试纸条的检测结果。综上所述,RAA-LFD法灵敏度较高、且简便、快速、同时不依赖于仪器、专业操作人员,适用于现场检测。 展开更多
关键词 牛诺瓦病毒 牛轮状病毒 重组酶介导扩增 侧向流试纸条
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基于微流控芯片的核酸检测技术 被引量:9
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作者 姚梦迪 吕雪飞 邓玉林 《生命科学仪器》 2017年第4期22-28,共7页
核酸检测,作为一种分子诊断技术,包括核酸提取、扩增和检测,对微生物分析、医学诊断、及时就医等起着根本性的作用。目前核酸检测存在工作量大、成本高、而且耗时长等问题,显著影响了其在诊断中的应用。微流控芯片技术以及侧向流层析试... 核酸检测,作为一种分子诊断技术,包括核酸提取、扩增和检测,对微生物分析、医学诊断、及时就医等起着根本性的作用。目前核酸检测存在工作量大、成本高、而且耗时长等问题,显著影响了其在诊断中的应用。微流控芯片技术以及侧向流层析试纸条,具有制作成本低、设备小型化、分析速度快、灵敏度高等特点,且结果可传送给最终用户,在医疗诊断中具有巨大的发展潜力。鉴于前人的相关研究成果,本文首先介绍了微流控技术在核酸检测中的意义,其次介绍了以微流控芯片为平台的核酸提取技术、扩增技术,以及核酸检测技术,在文章最后展望了将核酸的提取、扩增、检测技术集成到一个微装置中的可行性。 展开更多
关键词 核酸提取 核酸扩增 核酸检测 侧向层析试纸 控芯片
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猫杯状病毒RAA-CRISPR/Cas12a-LFS检测方法的建立及初步应用 被引量:2
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作者 周红蕾 程淑琴 +3 位作者 李佳鹏 刘涵 卓国荣 张蕾 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期494-501,共8页
为建立猫杯状病毒(FCV)基于重组酶介导的等温核酸扩增(RAA)结合CRISPR-Cas12a系统及侧向流层析试纸条(LFS)(RAA-CRISPR/Cas12a-LFS)的快速检测的方法,本研究基于FCV衣壳蛋白(VP1)基因序列保守区设计RAA引物、4对针对VP1靶标的扩增引物、... 为建立猫杯状病毒(FCV)基于重组酶介导的等温核酸扩增(RAA)结合CRISPR-Cas12a系统及侧向流层析试纸条(LFS)(RAA-CRISPR/Cas12a-LFS)的快速检测的方法,本研究基于FCV衣壳蛋白(VP1)基因序列保守区设计RAA引物、4对针对VP1靶标的扩增引物、4对VP1-cr RNA扩增引物和1条报告探针。利用4对VP1-crRNA扩增引物经退火和T7 RNA聚合酶转录合成4条靶标crRNA:VP1-1/2/3/4-crRNA,利用4对VP1靶标扩增引物经退火合成4条靶标双链DNA:VP1-1/2/3/4,经EnGen Lba Cas12a (Cpf1)核酸酶试剂的切割反应和Cas12a试纸条检测,根据出现条带的强弱筛选最佳VP1-crRNA。结果显示,VP1-2-crRNA对应的T线条带最强且C线不完全切割的条带最弱。因此选择VP1-2-crRNA进行后续试验。分别以FCV VR-782株及6株分离的FCV RNA为模板,利用RAA引物扩增其VP1基因,并通过琼脂糖凝胶电泳检测并评估RAA引物的扩增效果;利用Cas12a (Cpf1)核酸酶,以上述RAA扩增的VP1基因(来自FCV VR-782株RNA)为模板,在37℃恒温水浴30 min进行CRISPR/Cas12a-LFS检测,评估RAA产物、Cas12a、VP1-2-crRNA和ss DNA报告基团对CRISPR/Cas12a-LFS检测体系的重要性。RAA扩增效果的评估结果显示,从FCV VR-782株及6株分离的FCV RNA中均扩增到282 bp的VP1基因目的条带。重要性评估结果显示,只有上述4种试剂全部存在时CRISPR/Cas12a-LFS检测体系才能有效扩增。利用该方法检测FCV、猫疱疹病毒I型、支气管败血波氏菌、猫细小病毒、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、F81细胞,结果显示,该方法仅能够特异性检测FCV,而其他病原的检测结果 均为阴性,且分别在42℃30 min内和37℃40 min内完成对FCV的RAA扩增及CRISPR/Cas12a-LFS检测;利用该方法检测10倍倍比稀释的重组质粒标准品p MD18T-FCV-VP1以评估其敏感性,结果显示,该方法的检测限为37.5拷贝/μL,与本研究室建立的Taq Man荧光定量PCR方法的敏感性相当;分别利用同一批次和3批次配置的RAA-CRISPR/Cas12a-LFS体系分别检测不同浓度的重组质粒标准品p MD18T-FCV-VP1,以评估该方法的重复性,结果显示,该方法批内和批间重复性检测结果均一致;利用该方法和Taq Man荧光定量PCR方法同时检测临床采集的76份猫呼吸道拭子样品。结果显示,该方法检测到37份FCV阳性样品,39份阴性样品;Taq Man荧光定量PCR检测到36份FCV阳性样品,40份阴性样品。二者的阳性符合率达97.30%,阴性符合率97.50%,总符合率98.68%。本研究初步建立的FCV RAA-CRISPR/Cas12a-LFS检测方法简单、快速,且特异性强、敏感性高、重复性好、不依赖昂贵设备,为现场FCV的检测提供新的技术手段。 展开更多
关键词 猫杯状病毒 CRISPR-Cas12a系统 侧向层析试纸 现场检测
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两种基于重组酶介导扩增技术的沙门氏菌检测方法比较 被引量:2
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作者 张雅薇 林碧莲 +2 位作者 张芳 傅德江 韩涛 《现代食品科技》 CAS 北大核心 2023年第3期341-347,共7页
该研究旨在利用重组酶介导扩增技术建立并比较两种食品中沙门氏菌快速检测方法。根据沙门氏菌菌毛蛋白fimY基因设计引物和探针,分别采用荧光法和侧向流试纸条法对扩增产物进行检测,构建重组酶介导等温核酸扩增方法,验证两种方法的特异... 该研究旨在利用重组酶介导扩增技术建立并比较两种食品中沙门氏菌快速检测方法。根据沙门氏菌菌毛蛋白fimY基因设计引物和探针,分别采用荧光法和侧向流试纸条法对扩增产物进行检测,构建重组酶介导等温核酸扩增方法,验证两种方法的特异性、灵敏度及对人工污染样品的检测效果。该研究构建的两种方法均在39℃下恒温运行,检测时间30~40 min,方法特异性良好,与大肠埃希氏菌、金黄色葡萄球菌等常见的其他食源性致病菌无交叉反应,侧向流试纸条法灵敏度可达到1 pg/μL,荧光法灵敏度为10 pg/μL,对人工污染样品的检测结果与传统分离培养法检测结果一致。因此该研究建立了两种快速、特异、灵敏的方法用于检测沙门氏菌,为食品中沙门氏菌污染的快速筛查提供一定的参考价值和数据支撑。 展开更多
关键词 重组酶介导扩增 侧向流试纸条 荧光法 快速检测 沙门氏菌
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鲤春病毒血症病毒RT-RAA-LFD检测方法的建立
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作者 朱裕敏 吴江 +7 位作者 廖立珊 王婉君 孙洁 陈兵 王津津 郑晓聪 贾鹏 刘荭 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期916-921,共6页
为建立一种可现场快速准确检测鲤春病毒血症病毒(SVCV)的方法,本研究结合重组酶介导扩增(RAA)和侧向流试纸条(LFD)技术,根据SVCV L基因保守区域设计引物及探针,通过优化反应时间和温度等条件,初步建立了可用于SVCV现场可视化检测的RT-RA... 为建立一种可现场快速准确检测鲤春病毒血症病毒(SVCV)的方法,本研究结合重组酶介导扩增(RAA)和侧向流试纸条(LFD)技术,根据SVCV L基因保守区域设计引物及探针,通过优化反应时间和温度等条件,初步建立了可用于SVCV现场可视化检测的RT-RAA-LFD方法。优化后的检测方法在35℃水浴锅中恒温反应15 min即可实现对SVCV目的基因片段的有效扩增。结果显示,该方法可以特异性的检测SVCV,并且不与病毒性出血败血症病毒、传染性鲑鱼贫血症病毒、病毒性神经坏死病毒等其他常见鱼类病毒发生交叉反应;对SVCV重组质粒标准品的检测限为2.42×10^(2)拷贝/μL,并具有较好的稳定性和重复性;采用该方法和病毒分离、套式RT-PCR、荧光定量RT-PCR、荧光定量RT-RAA共5种方法同时对45份临床样品检测,其中病毒分离、套式RT-PCR和荧光定量RT-PCR均检测到29份阳性样品,荧光定量RT-RAA和本研究建立的方法均检测到28份阳性样品,本研究与前3种方法的阳性符合率为97.8%,与荧光定量RT-RAA的阳性符合率为100%。上述结果表明,本研究建立的SVCV RT-RAA-LFD检测方法简便快捷、特异性强、敏感性高、结果可靠,且不依赖于复杂的仪器,可适用于现场和实验室对SVCV的快速检测。 展开更多
关键词 鲤春病毒血症病毒 重组酶介导扩增 侧向流试纸条 恒温扩增 快速检测
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基于RPA-LFD法的多黏菌素耐药基因mcr-1可视化快速检测方法建立与应用
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作者 焦雪 董羽织 +3 位作者 王靖雯 吕晨泽 方结红 蒋晗 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2023年第18期209-216,共8页
目的:建立一种快速、高效、可视化的细菌多黏菌素耐药基因mcr-1检测方法,为其基层检测的展开提供依据和便利。方法:利用重组酶聚合酶扩增结合胶体金侧向流试纸条技术(Recombinase polymerase amplification combined with a lateral flo... 目的:建立一种快速、高效、可视化的细菌多黏菌素耐药基因mcr-1检测方法,为其基层检测的展开提供依据和便利。方法:利用重组酶聚合酶扩增结合胶体金侧向流试纸条技术(Recombinase polymerase amplification combined with a lateral flow dipstick,RPA-LFD),辅以手持式胶体金读数仪;根据mcr-1基因保守序列设计合成一对特异性RPA引物,通过对反应条件和体系的优化,以及特异性试验、灵敏度试验、模拟食样试验和实际样品试验,成功建立了可视化定量检测细菌多黏菌素耐药基因mcr-1的RPA-LFD方法。结果:在引物浓度400 nmol/L,引物比例1:1时,该方法最佳反应条件为Mg^(2+)浓度14.0 mmol/L,反应温度37℃,反应时间20 min;灵敏度好,标准曲线方程为y=0.117x+0.051,定量限为10^(1)~108 copies/μL,检出限为10^(1)copies/μL,比PCR法低一个数量级且模拟样品检出结果与PCR法一致。利用建立的RPA-LFD法对猪肉样品、鸡肉样品、生猪养殖场环境样品、肉鸡养殖场环境样品、大肠杆菌分离株和弯曲肠杆菌分离株各15份中多黏菌素耐药基因mcr-1携带情况进行分析;RPA-LFD法与常规PCR法阳性样本检出率一致,共检出9份mcr-1基因阳性样品。RPA-LFD定量分析显示,阳性样品中mcr-1基因浓度在4.5×10^(2)~8.6×10^(4)copies/μL之间。结论:本研究建立的细菌多黏菌素耐药基因mcr-1的RPA-LFD检测法特异性强、灵敏性高、操作简单,可广泛应用于基层检验。 展开更多
关键词 多黏菌素耐药基因 mcr-1 重组酶聚合酶扩增技术 胶体金侧向流试纸条 快速检测 可视 定量
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基于ERA-CRISPR/Cas12a-LFD的犀牛特异性检测技术
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作者 王瑛 张冲 +4 位作者 蔡一村 王鑫杰 林颖峥 冯之航 潘良文 《野生动物学报》 北大核心 2023年第4期798-806,共9页
野生犀牛(Rhinocerotidae)种群的生存正面临极大威胁,包括栖息地减少、碎片化及偷猎等,在对打击犀牛角等非法贸易的努力中,物种的特异性检测至关重要,为了在现场就可以迅速完成犀牛源性成分鉴定,将酶促重组等温扩增(enzymatic recombina... 野生犀牛(Rhinocerotidae)种群的生存正面临极大威胁,包括栖息地减少、碎片化及偷猎等,在对打击犀牛角等非法贸易的努力中,物种的特异性检测至关重要,为了在现场就可以迅速完成犀牛源性成分鉴定,将酶促重组等温扩增(enzymatic recombinase amplification,ERA)、CRISPR/Cas12a和侧向流试纸条(lateral flow dipstick,LFD)技术相结合,研发了一种适于现场使用的犀牛特异性核酸检测方法。结果表明:该方法只能检测出5种现生犀牛特异性核酸,与其他哺乳动物核酸测试样本没有交叉反应,最低检测下限可达100拷贝/孔,具有较好的特异性和灵敏度。该方法可以在36.5~40.0℃条件下,27~30 min完成特异性识别,无需高规格的实验室环境和精密仪器,从而提供更快、更准确和更灵敏的检测方案。 展开更多
关键词 犀牛源性成分 CRISPR/Cas12a 酶促重组等温扩增 侧向流试纸条
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鸡传染性喉气管炎病毒RPA-LFD检测方法的建立 被引量:7
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作者 马国和 高冬生 +5 位作者 王增 杨盼盼 杨霞 王新卫 边传周 赵军 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期1128-1132,共5页
为建立一种简便、快捷的现地检测鸡传染性喉气管炎病毒(ILTV)的方法,本研究联合重组酶聚合酶扩增(RPA)和侧向流试纸条(LFD)技术,在优选的RPA上、下游引物的5'端分别进行异硫氰酸荧光素和生物素标记,通过引物浓度、RPA反应时间和温... 为建立一种简便、快捷的现地检测鸡传染性喉气管炎病毒(ILTV)的方法,本研究联合重组酶聚合酶扩增(RPA)和侧向流试纸条(LFD)技术,在优选的RPA上、下游引物的5'端分别进行异硫氰酸荧光素和生物素标记,通过引物浓度、RPA反应时间和温度等条件的优化建立了一种可以用于ILTV现地检测的RPA-LFD方法。该检测方法在30℃~42.5℃恒温反应20 min即可实现对ILTV目的基因片段的有效扩增;与其它常见禽病病原DNA无交叉反应;RPA扩增产物直接用胶体金侧向流免疫层析试纸条肉眼观察,最低检测限为100拷贝/μL,比常规PCR灵敏度高100倍。结果表明,本研究建立的RPA-LFD检测方法灵敏度高,操作方便,可用于ILTV的临床快速检测。 展开更多
关键词 鸡传染性喉气管炎病毒 重组酶聚合酶扩增 侧向流试纸条 快速检测
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杀鲑气单胞菌可视化重组酶聚合酶扩增检测技术的建立 被引量:1
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作者 谷庆花 李铭远 +1 位作者 司鑫鑫 高嵩 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2022年第1期52-57,共6页
本研究根据杀鲑气单胞菌(Aeromonas salmonicida)的铁载受体(fstA)基因的保守序列设计特异性引物和探针,建立了一种基于重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)与侧向流试纸条(lateral flow strips,LFS)相结合的... 本研究根据杀鲑气单胞菌(Aeromonas salmonicida)的铁载受体(fstA)基因的保守序列设计特异性引物和探针,建立了一种基于重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)与侧向流试纸条(lateral flow strips,LFS)相结合的可视化快速检测杀鲑气单胞菌的方法。结果显示:本研究建立的基于RPA-LFS的杀鲑气单胞菌检测方法在37℃孵育25 min即可完成,特异性良好,与其他致病菌无交叉反应;灵敏度实验结果显示,该菌的纯培养物和人工污染的鲤鱼组织中的最低检测限均为单次反应1 CFU(colony forming unit)。本研究建立的基于RPA-LFS的杀鲑气单胞菌检测方法具有特异、灵敏、快速等优点,检测结果可通过肉眼直接观察,操作简单,不依赖昂贵的仪器设备,适用于养殖业中杀鲑气单胞菌的现场检测。 展开更多
关键词 杀鲑气单胞菌(Aeromonas salmonicida) 重组酶聚合酶扩增 侧向流试纸条 现场检测
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嗜水气单胞菌RPA-LFS快速检测方法的建立 被引量:1
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作者 曾丽媚 高嵩 余泓 《江苏海洋大学学报(自然科学版)》 CAS 2021年第4期42-46,共5页
根据嗜水气单胞菌的气溶素(aerolysin,aerA)基因设计了特异性引物和探针,基于重组酶聚合酶扩增结合侧向流试纸条(RPA-LFS),建立了嗜水气单胞菌的快速检测方法。结果显示:建立的嗜水气单胞菌RPA-LFS检测方法在37℃孵育20 min即可完成;与... 根据嗜水气单胞菌的气溶素(aerolysin,aerA)基因设计了特异性引物和探针,基于重组酶聚合酶扩增结合侧向流试纸条(RPA-LFS),建立了嗜水气单胞菌的快速检测方法。结果显示:建立的嗜水气单胞菌RPA-LFS检测方法在37℃孵育20 min即可完成;与其他水产养殖与食品安全致病菌无交叉反应;检测限为单次反应10 CFU。结果表明,建立的RPA-LFS检测嗜水气单胞菌的方法具有快速、特异、灵敏等优点,不依赖精密仪器,适用于实验资源有限的嗜水气单胞菌现场检测。 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 重组酶聚合酶扩增 侧向流试纸条 现场检测
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迟缓爱德华氏菌等温扩增快速检测方法的建立
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作者 廖磊 马超 +1 位作者 高嵩 吉敬 《江苏海洋大学学报(自然科学版)》 CAS 2021年第4期35-41,共7页
迟缓爱德华氏菌是一种危害淡水及海水水产动物的致病菌,可感染包括鳗鲡、牙鲆、罗非鱼、鲤鱼等在内的多种水产鱼类,极易给水产养殖业造成严重的经济损失。现有的迟缓爱德华氏菌检测方法须借助实验室条件才能完成,检测过程较为复杂。建... 迟缓爱德华氏菌是一种危害淡水及海水水产动物的致病菌,可感染包括鳗鲡、牙鲆、罗非鱼、鲤鱼等在内的多种水产鱼类,极易给水产养殖业造成严重的经济损失。现有的迟缓爱德华氏菌检测方法须借助实验室条件才能完成,检测过程较为复杂。建立一种简便的、无需依赖实验室条件即可快速检测迟缓爱德华氏菌的方法,对水产养殖业预警和该病菌引发病害的防治具有重要指导意义和实用价值。针对迟缓爱德华氏菌的基因组设计了特异性引物和探针,建立了重组酶聚合酶扩增与侧向流试纸条(RPA-LFS)相结合的检测方法,评价了该方法的特异性和灵敏度,并使用人工模拟样本进行了方法验证。结果显示,RPA-LFS法在37℃孵育20 min即可完成核酸扩增步骤,整体检测时间不超过40 min,与参试的嗜水气单胞菌、豚鼠气单胞菌、创伤弧菌、副溶血弧菌、溶藻弧菌、灿烂弧菌、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌这8种水产和食品中常见的致病菌不发生交叉反应,对迟缓爱德华氏菌培养物的检测限为单次反应1个菌落形成单位(CFU),在富集培养后,可检出1×10^(1) CFU/g人工污染样本中的迟缓爱德华氏菌。该方法具有良好的特异性和灵敏度,不依赖精密仪器,是一种快速、便捷的迟缓爱德华氏菌检测方法,具有良好的应用前景。 展开更多
关键词 迟缓爱德华氏菌 重组酶聚合酶扩增 侧向流试纸条 快速检测
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肝肠胞虫RPA-LFS快速检测方法的建立及应用
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作者 马超 高嵩 王伟玲 《江苏海洋大学学报(自然科学版)》 CAS 2022年第3期25-30,共6页
肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei)感染虾不会出现明显的临床症状,养殖场无法及时发现并进行针对性治疗,最终极易给养殖带来较大的经济损失。目前尚无治疗肝肠胞虫的有效方法,因此,快速、准确地开展早期检测对控制其传播、减少经... 肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei)感染虾不会出现明显的临床症状,养殖场无法及时发现并进行针对性治疗,最终极易给养殖带来较大的经济损失。目前尚无治疗肝肠胞虫的有效方法,因此,快速、准确地开展早期检测对控制其传播、减少经济损失具有重要意义。针对孢壁蛋白(spore wall protein,swp)基因设计了特异性引物和探针,建立了重组酶聚合酶扩增结合侧向流试纸条(RPA-LFS)的等温检测方法,测试了该方法的特异性及敏感性,并对不同虾养殖场的48份临床样本进行了检测。结果表明,该方法在37℃恒温下反应30 min即可完成扩增,整体检测时间可控制在35 min内;特异性试验中对于其他种类水产致病菌无交叉反应;检测限为10~0 copies;临床样本检测准确度比巢式PCR更高。该方法简单、快速、准确,可解决偏远地区养殖场缺乏专业人员和专业设备的问题,因此有望成为偏远地区养殖场实时检测肝肠孢虫的手段之一。 展开更多
关键词 肝肠胞虫 重组酶聚合酶扩增 侧向流试纸条 现场检测
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向日葵黑茎病菌RPA/CRISPR-Cas12a快速检测方法的建立 被引量:2
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作者 邝瑞瑞 雷荣 +6 位作者 江丽 段维军 李雪莲 符娜 范在丰 李远 吴品珊 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期69-76,89,共9页
向日葵黑茎病菌是向日葵上的一种毁灭性真菌,是我国的植物检疫性有害生物。为了准确快速检测向日葵黑茎病菌,本研究根据向日葵黑茎病菌及其近似种的ITS序列差异,设计特异性RPA引物和CRISPR-Cas12a crRNA,建立了RPA等温扩增技术结合CRISP... 向日葵黑茎病菌是向日葵上的一种毁灭性真菌,是我国的植物检疫性有害生物。为了准确快速检测向日葵黑茎病菌,本研究根据向日葵黑茎病菌及其近似种的ITS序列差异,设计特异性RPA引物和CRISPR-Cas12a crRNA,建立了RPA等温扩增技术结合CRISPR-Cas12a检测的快速检测方法。通过条件优化,RPA/CRISPR-Cas12a检测体系在37℃恒温条件下,RPA反应30 min,CRISPR/Cas12a反应20 min,即可特异性检测向日葵黑茎病菌。荧光法检测灵敏度与实时荧光PCR的灵敏度相当,最低检测量为0.1 pg,试纸条法检测最低检测量为1 pg。由于试纸条检测结果可用肉眼观察,快速便携,操作简单,更适合用于田间和口岸的向日葵黑茎病菌快速早期检测;而荧光检测灵敏度高,对环境要求高,更适合用于实验室检测。 展开更多
关键词 向日葵黑茎病菌 RPA CRISPR-Cas12a 荧光检测 侧向层析试纸
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柑橘黄化脉明病毒RT-RPA检测方法的建立 被引量:2
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作者 马志敏 许建建 +6 位作者 段玉 王春庆 苏越 张琦 宾羽 周常勇 宋震 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第15期3241-3249,共9页
【目的】利用逆转录重组酶聚合酶扩增技术(reverse transcription-recombinase polymerase amplification,RT-RPA),结合侧向流层析(lateral flow dipstick,LFD)试纸条,建立一种快速简便、特异、灵敏、裸眼可视的柑橘黄化脉明病毒(citrus... 【目的】利用逆转录重组酶聚合酶扩增技术(reverse transcription-recombinase polymerase amplification,RT-RPA),结合侧向流层析(lateral flow dipstick,LFD)试纸条,建立一种快速简便、特异、灵敏、裸眼可视的柑橘黄化脉明病毒(citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)检测新方法。【方法】根据CYVCV外壳蛋白基因的保守序列设计5对引物,通过样品检测筛选出扩增效果好、特异性强的引物对。将选出的引物进行标记物修饰,并设计对应的特异性探针,分别设置6个反应时间梯度(5、10、20、30、40、50 min)和8个反应温度梯度(37、38、39、40、41、42、43、44℃),对RT-RPA反应条件进行优化,建立CYVCV的RT-RPA检测体系。分别以仅感染了CYVCV、柑橘叶斑驳病毒(citrus leaf blotch virus,CLBV)、柑橘衰退病毒(citrus tristeza virus,CTV)、柑橘碎叶病毒(citrus tatter leaf virus,CTLV)、柑橘裂皮病类病毒(citrus exocortis viroid,CEVd)、柑橘鳞皮病毒(citrus psorosis virus,CPV)、温州蜜柑萎缩病毒(satsuma dwarf virus,SDV)、柑橘黄龙病菌(Candidatus Liberibacter asiaticus,CLas)和柑橘溃疡病菌(Xanthomonas citri subsp.citri,Xcc)柑橘材料的总核酸为模板,采用所筛选的最佳引物、探针和反应条件进行检测,评价所建立RT-RPA检测体系的特异性。将感染了CYVCV的柑橘总RNA样品进行10倍梯度稀释,以原液和10~(-1)、10~(-2)、10~(-3)、10~(-4)、10~(-5)、10~(-6)、10~(-7)稀释液作为模板,平行进行RT-PCR及RT-RPA的检测,评价所建立检测方法的灵敏度。随机采集来自田间9个不同品种柑橘的叶片,同时进行RT-RPA和RT-PCR检测,检验所建立RT-RPA检测方法的适用性。【结果】建立了CYVCV的RT-RPA检测体系:最佳引物为CY1-F/R,对应探针为CY1-Probe(47 bp),最佳反应条件为39℃,30 min,特异扩增目的片段为177 bp,检测结果可通过侧向流层析试纸条直接判读。特异性检测结果显示,利用该检测体系仅对感染了CYVCV的样品检测结果为阳性,其余均为阴性;灵敏度检测结果显示,RT-RPA与RT-PCR方法均最低可检测到10~(-4)稀释液,两种方法检测灵敏度相当。随机采集的45株田间柑橘样品中,RT-PCR与RT-RPA均检测出37个阳性样品,检出率均为82.2%,表明该方法检测效果稳定可靠。【结论】建立了CYVCV的RT-RPA检测方法,该检测方法操作简单、反应快速,结果裸眼可视,适用于基层条件不足的实验室或者植检站现场快速检测。 展开更多
关键词 柑橘 柑橘黄化脉明病毒 RT-RPA 侧向层析试纸 快速检测
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传染性造血器官坏死病病毒RT-RAA-LFD检测方法的建立与应用
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作者 廖立珊 徐彬 +6 位作者 陈兵 吴江 王津津 朱裕敏 刘荭 王婉君 孙洁 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期991-996,共6页
为针对传染性造血器官坏死病病毒(IHNV)建立一种可实现现场快速、准确的检测方法,结合重组酶介导扩增(RAA)和侧向流试纸条(LFD)技术,在IHNVG基因保守区域设计引物和探针,通过优化反应时间和温度等条件,建立了可用于IHNV现场可视化检测的... 为针对传染性造血器官坏死病病毒(IHNV)建立一种可实现现场快速、准确的检测方法,结合重组酶介导扩增(RAA)和侧向流试纸条(LFD)技术,在IHNVG基因保守区域设计引物和探针,通过优化反应时间和温度等条件,建立了可用于IHNV现场可视化检测的RT-RAA-LFD方法。优化后的检测方法在35℃水浴锅中恒温反应15 min即可实现对IHNV目的基因片段的有效扩增。结果显示:该方法可以特异性地检测出IHNV,不与其他常见鱼类病毒发生交叉反应;对IHNV质粒标准品的检测下限可以达到2.15×101 copies/μL;采用该方法和实时荧光RT-PCR、实时荧光RT-RAA同时对35份临床样本进行检测,其阳性符合率为100%。上述结果表明,本研究针对IHNV成功建立了一种快速、准确、便捷的试纸条检测方法,并可适应于多种场合。 展开更多
关键词 传染性造血器官坏死病病毒 重组酶介导扩增 侧向流试纸条 快速检测
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禽腺病毒血清4型RPA-LFD快速检测方法的建立 被引量:18
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作者 万文妍 刘延珂 +3 位作者 吴艳阳 杨东东 王增 赵军 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期41-45,共5页
为了建立一种快速、灵敏、简便的禽腺病毒血清4型(FAdV-4)现场检测方法,本试验将重组酶聚合酶扩增(RPA)与胶体金侧向流试纸条(LFD)技术联合,设计针对FAdV-4hexon基因的特异性RPA引物,上、下游引物的5′端分别进行6-羧基荧光素(FAM)和生... 为了建立一种快速、灵敏、简便的禽腺病毒血清4型(FAdV-4)现场检测方法,本试验将重组酶聚合酶扩增(RPA)与胶体金侧向流试纸条(LFD)技术联合,设计针对FAdV-4hexon基因的特异性RPA引物,上、下游引物的5′端分别进行6-羧基荧光素(FAM)和生物素(Biotin)标记。通过对引物浓度、RPA反应时间和温度等条件的优化,建立了一种可用于FAdV-4现场检测的RPA-LFD方法。该检测方法在25~45℃恒温反应15 min即可实现对FAdV-4目的基因片段的有效扩增,RPA扩增产物用胶体金侧向流试纸条进行检测,检测结果肉眼可见。该方法的最低检测限为100拷贝,敏感性是常规PCR的100倍,且与其他常见禽病病原核酸检测无交叉反应。结果显示,本试验建立的RPA-LFD可用于FAdV-4的临床快速检测,为FAdV-4感染的流行病学检测提供了一种有效方法。 展开更多
关键词 禽腺病毒血清4型 重组酶聚合酶扩增 侧向流试纸条 快速检测
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猪霍乱沙门菌RPA-LFS快速检测方法的建立 被引量:1
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作者 周红蕾 钱俞佳 刘静 《吉林农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期456-460,共5页
为建立一种快速、准确的猪霍乱沙门菌现场检测方法,针对猪霍乱沙门菌侵袭蛋白A(Invasion protein A,invA)基因序列设计特异性引物和探针,优化反应条件,建立重组酶聚合酶等温扩增结合侧向流层析试纸条(RPA-LFS)检测方法。结果表明:建立... 为建立一种快速、准确的猪霍乱沙门菌现场检测方法,针对猪霍乱沙门菌侵袭蛋白A(Invasion protein A,invA)基因序列设计特异性引物和探针,优化反应条件,建立重组酶聚合酶等温扩增结合侧向流层析试纸条(RPA-LFS)检测方法。结果表明:建立的方法在39℃等温条件下15 min内即可特异性检出猪霍乱沙门菌,与金黄色葡萄球菌、副猪嗜血杆菌、巴氏杆菌、铜绿假单胞菌、单增李斯特菌无交叉反应,该方法对猪霍乱沙门菌的最低检出限为1 CFU/反应;应用该方法对50份猪肉样本进行检测,与PCR方法检测结果一致。建立的猪霍乱沙门菌现场RPA-LFS检测方法敏感性高、特异性强、反应快速、操作简便的特点,可应用于猪霍乱沙门菌的临床快速检测。 展开更多
关键词 霍乱沙门菌 侵袭蛋白A 重组酶聚合酶等温扩增 侧向层析试纸
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