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题名杨梅侧生器官边界域基因组鉴定及进化分析
被引量：2
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作者
梁健翔
吴进樟
张尧
曹世江
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机构
福建农林大学林学院
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出处
《森林与环境学报》
CSCD
北大核心
2021年第2期172-179,共8页
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基金
国家自然科学基金项目(31600228)
福建农林大学高峰学科项目(71201800739)。
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文摘
为探究杨梅侧生器官边界域基因(LBD)在杨梅全基因组中的数量和结构,利用杨梅最新基因组的数据,结合生物信息学的方法对基因蛋白进行结构、系统进化和共线性分析,对杨梅LBD基因家族进行了鉴定,并分析其分子质量和等电点,为今后研究LBD基因家族在杨梅成长过程和逆境调节中的详细功能奠定基础。结果表明,从杨梅基因组中共鉴定出33个杨梅LBD(MrLBD)基因,根据染色体分布对其进行重命名。根据其LBD结构域和系统进化树分析的特征,杨梅LBD家族基因分为ClassⅠ和ClassⅡ两类,各有28个和5个LBD基因。杨梅LBD家族基因的结构并不复杂,其中内含子总数不超过2。在对保守域的研究中,通过对LBD基因进行亚细胞定位、三级结构的同源建模和种内与种间共线性分析,发现同一组的基因往往具有相似的外显子-内含子、基序和蛋白质结构。
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关键词
杨梅
侧生器官边界域基因组
系统进化分析
转录因子
生物信息学
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Keywords
Myrica rubra
lateral organ boundary domain genome
system evolution analysis
transcription factors
bioinformatics
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分类号
S184
[农业科学—农业基础科学]
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题名HvLBD19基因对大麦不定根发育的调控
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作者
郭宝健
王爽
吕超
王菲菲
许如根
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机构
江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室/植物功能基因组学教育部重点实验室/江苏省作物遗传生理重点实验室
扬州大学农学院/江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心
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出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期2435-2442,共8页
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基金
国家自然科学基金项目(31771771)
江苏省高等学校自然科学研究重大项目(19KJA560005)
+1 种基金
财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-05)
江苏高校优势学科建设工程项目资助。
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文摘
植物LBD基因家族是植物特异的转录因子家族,在调控植物生长发育和氮素代谢方面起到重要的作用。基因组共线性分析表明,大麦(Hordeum vulgare L.)HvLBD19基因为水稻ARL1和玉米RTCS基因直系同源基因。基因时空表达分析结果表明,该基因在不定根中表达丰度最高,且受外源生长素诱导表达,所编码蛋白定位于细胞核内。转基因功能验证结果表明,苗期超表达株系相对于野生型不定根长度增长近1倍,不定根数目增加40%。本研究初步明确了HvLBD19基因影响大麦不定根发育,为进一步深入探究大麦HvLBD19基因调控不定根发育的分子机制提供了基础。
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关键词
大麦
侧生器官边界域基因
超表达
不定根
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Keywords
barley
LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN gene
overexpression
adventitious root
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分类号
S512.3
[农业科学—作物学]
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