目的:为肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者开发一种新的免疫原性细胞死亡相关特征(immunogenic cell death related signatures,ICDRS)预后模型。方法:分别从TCGA、GEO和ICGC数据库下载RNA-seq表达数据和临床数据。使用AddMod...目的:为肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者开发一种新的免疫原性细胞死亡相关特征(immunogenic cell death related signatures,ICDRS)预后模型。方法:分别从TCGA、GEO和ICGC数据库下载RNA-seq表达数据和临床数据。使用AddModuleScore、单样本基因集富集分析(single-sample gene set enrichment analysis,ssGSEA)和加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选免疫原性细胞死亡(immunogenic cell death,ICD)相关基因。基于ICD相关基因使用10种机器学习算法、79种组合构建一致的ICDRS预后模型。采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评价预后模型,并使用单因素和多因素回归分析判断ICDRS的独立预后价值。同时评估不同风险组的基因组变异格局、肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)、免疫细胞浸润、免疫逃避能力。最后评估不同风险组对药物的敏感性。结果:通过一系列分析,我们构建了含有6种ICD相关基因(包括YWHAB、EHD1、TUBA4A、SRI、SLC16A3、FYN)的ICDRS模型。模型将患者分为高风险组或低风险组,而且通过分析得出高风险组患者的预后比低风险组差。该模型在预测HCC预后和临床转化方面具有较好的性能,且ICDRS是HCC患者OS的独立预后因素。此外,两组TMB差异无统计学意义,但较高风险组而言,低风险组患者具有更丰富的免疫细胞浸润和较低的TIDE评分,表明低风险组可能对免疫治疗的反应更好。我们还发现高风险组对奥沙利铂、米托蒽醌和索拉菲尼等药物敏感性更高,而低风险组从西地尼布、长春新碱和多西他赛等药物中获益更多。结论:该研究结合了ICD相关基因,使用生物信息学和机器学习构建了HCC的预后特征。可帮助临床医生为不同风险的HCC患者选择个性化的治疗策略。展开更多
在兔场中发现一只疑似感染了产气荚膜梭菌病兔,从该兔的病理组织中分离到1株兔源产气荚膜梭菌,对分离株进行血清学分型。毒力以及免疫原性检测。结果表明:该分离株血清型为A型,该分离株肉肝胃酶消化汤培养液的无菌毒素对小鼠和家兔均有...在兔场中发现一只疑似感染了产气荚膜梭菌病兔,从该兔的病理组织中分离到1株兔源产气荚膜梭菌,对分离株进行血清学分型。毒力以及免疫原性检测。结果表明:该分离株血清型为A型,该分离株肉肝胃酶消化汤培养液的无菌毒素对小鼠和家兔均有毒力、对小白鼠的最小致死量为0.05 m L/只,对家兔的最小致死量为1.5 m L/只。按《中华人民共和国兽用生物制品规程》(以下简《规程》)方法制备疫苗进行效力检验,免疫保护率不低于80%。展开更多
文摘在兔场中发现一只疑似感染了产气荚膜梭菌病兔,从该兔的病理组织中分离到1株兔源产气荚膜梭菌,对分离株进行血清学分型。毒力以及免疫原性检测。结果表明:该分离株血清型为A型,该分离株肉肝胃酶消化汤培养液的无菌毒素对小鼠和家兔均有毒力、对小白鼠的最小致死量为0.05 m L/只,对家兔的最小致死量为1.5 m L/只。按《中华人民共和国兽用生物制品规程》(以下简《规程》)方法制备疫苗进行效力检验,免疫保护率不低于80%。
