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基于线粒体Cyt b基因序列的4个黄尾鲴养殖群体遗传多样性分析
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作者 刘士力 陈大伟 +7 位作者 朱鹏灿 郑建波 夏冯博 程顺 蒋文枰 迟美丽 杭小英 李飞 《江苏农业学报》 CSCD 2024年第2期342-347,共6页
黄尾鲴(Xenocypris davidi)是浙江省自然水域增殖放流的主要鱼类,为了解人工繁育对黄尾鲴遗传多样性的影响,利用线粒体DNA细胞色素b基因(Cyt b)对4个养殖群体的遗传多样性进行研究,旨在为黄尾鲴增殖放流策略制定和实施提供基础数据。结... 黄尾鲴(Xenocypris davidi)是浙江省自然水域增殖放流的主要鱼类,为了解人工繁育对黄尾鲴遗传多样性的影响,利用线粒体DNA细胞色素b基因(Cyt b)对4个养殖群体的遗传多样性进行研究,旨在为黄尾鲴增殖放流策略制定和实施提供基础数据。结果显示,在编码Cyt b的1 140 bp序列中,检测到157个变异位点,界定了21种单倍型,其中长兴、双浦、八里店和醴陵群体的单倍型数目分别为10个、11个、7个和2个,单倍型多样性介于0.226~0.794,核苷酸多样性介于0.006 14~0.023 86。除醴陵群体遗传多样性较低外,其余3个养殖群体的遗传多样性具有高单倍型数和高核苷酸多样性的特点。4个黄尾鲴养殖群体间的遗传距离为0.018 74~0.092 74,遗传分化指数为0.808 63(P<0.01),其中长兴和八里店群体的分化程度较低,双浦和醴陵群体的分化程度较高,且遗传变异主要发生在群体间。本研究结果可从分子水平为黄尾鲴的资源保护和人工增殖放流提供参考依据。 展开更多
关键词 黄尾鲴 养殖群体 Cyt b基因 遗传多样性
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中华鳖5个养殖群体肌肉营养成分分析与评价
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作者 吴聪聪 姜群 +5 位作者 张晓君 李伟 纪利芹 刘晓莉 朱新平 陈辰 《广东海洋大学学报》 CAS CSCD 2024年第2期54-61,共8页
【目的】分析和评价国内中华鳖(Pelodiscus sinensis)主要养殖群体的肌肉营养品质,为中华鳖品质性状遗传改良及相关配合饲料的研发提供依据。【方法】测定东莞、高要、萧山、郓城和余姚5个群体的肌肉常规营养成分、氨基酸和脂肪酸含量,... 【目的】分析和评价国内中华鳖(Pelodiscus sinensis)主要养殖群体的肌肉营养品质,为中华鳖品质性状遗传改良及相关配合饲料的研发提供依据。【方法】测定东莞、高要、萧山、郓城和余姚5个群体的肌肉常规营养成分、氨基酸和脂肪酸含量,并进行营养评价。【结果】(1)各群体之间粗蛋白、粗脂肪、水分和灰分存在显著差异(P<0.05)。其中,萧山群体的粗蛋白质量分数最高,水分质量分数最低,东莞群体的粗脂肪质量分数最高,粗蛋白质量分数最低,高要群体的粗灰分质量分数最高,粗脂肪质量分数最低,而郓城和余姚群体的常规营养成分质量分数相对居中;(2)以鲜质量计,检出必需氨基酸总质量分数为8.65%(东莞)~10.21%(萧山),非必需氨基酸总质量分数为8.61%(东莞)~10.73%(萧山)。各群体的氨基酸评分为0.62~1.68,化学评分为0.42~1.29,必需氨基酸指数为77.72~83.98,苯丙氨酸+酪氨酸为第一限制性氨基酸;(3)5个群体均检出10种脂肪酸。以鲜质量计,脂肪酸总质量分数为348.41 mg/100 g(高要)~708.55 mg/100 g(东莞),饱和脂肪酸总质量分数为133.69 mg/100 g(高要)~212.58 mg/100 g(东莞),单不饱和脂肪酸总质量分数为86.02 mg/100 g(高要)~246.25 mg/100 g(东莞),多不饱和脂肪酸总质量分数为128.70 mg/100 g(高要)~249.73 mg/100 g(东莞)。【结论】中华鳖肌肉具有高蛋白(19.63%~21.42%)、低脂肪(0.37%~0.95%)的营养特点,可作为优质食物蛋白来源。不同养殖群体中华鳖的肌肉营养组成基本一致,但含量和营养价值存在差异,其中,萧山群体表现出较为突出的高蛋白、低脂肪营养特性,而东莞群体脂肪和脂肪酸质量分数较高,可能具有更好的风味和口感。 展开更多
关键词 中华鳖 养殖群体 肌肉营养成分 氨基酸 脂肪酸
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凡纳滨对虾全基因组SSR标记开发及不同养殖群体的遗传多样性 被引量:1
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作者 王佳佳 王琼 +3 位作者 秦桢 陈耀辉 李健 李吉涛 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期62-72,共11页
为了探究SSR标记对凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性和群体遗传结构的影响,为凡纳滨对虾种质资源的遗传改良提供基础信息。实验利用MISA软件对凡纳滨对虾全基因组SSR位点进行搜索,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳获得多态性高的SSR标记,基于POPGE... 为了探究SSR标记对凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性和群体遗传结构的影响,为凡纳滨对虾种质资源的遗传改良提供基础信息。实验利用MISA软件对凡纳滨对虾全基因组SSR位点进行搜索,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳获得多态性高的SSR标记,基于POPGENE 1.32、PIC-CALC和Mega 6.0软件分析6个不同来源的凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性和群体结构特征。在凡纳滨对虾全基因组数据中共鉴定出10 453 975个微卫星,约占基因组序列总长度的18.56%,其中,二碱基微卫星最丰富,占总数的82.15%。利用具有多态性的14个SSR标记分析3个国内群体[桂海1号(CG)、海兴农2号(CH)和山东养殖群体(CT)],及3个国外群体[厄瓜多尔1号(FO)、厄瓜多尔2号(FT)和墨西哥群体(FM)]的遗传特征。结果显示,14个SSR标记在6个群体中共检测到208个等位基因变异,等位基因数、观测杂合度、期望杂合度和多态性信息含量的范围分别为6~25、0.112~0.994、0.234~0.925和0.226~0.918;遗传多样性丰富程度为CH>FO>FM>CT>FT>CG。桂海1号与山东养殖群体、3个国外群体间属于中等程度的遗传分化。聚类分析结果显示,国内群体桂海1号和海兴农2号聚为一大类,山东养殖群体与国外群体厄瓜多尔1号、厄瓜多尔2号和墨西哥群体聚为一大类。研究表明,筛选的14个SSR标记可用于凡纳滨对虾群体遗传多样性的评估;3个国外群体的遗传多样性相对较高,且与国内群体桂海1号和海兴农2号的亲缘关系较远。本研究对凡纳滨对虾种质资源的开发利用与新品种选育具有十分重要的意义。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 养殖群体 遗传多样性 基因组 微卫星标记
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基于线粒体COI基因对棘胸蛙养殖群体的遗传多样性分析
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作者 张燕萍 章海鑫 +2 位作者 习宏斌 吴子君 廖再生 《江西水产科技》 2023年第4期1-5,共5页
为研究江西省棘胸蛙的遗传多样性,利用线粒体COI分子标记对采自江西省内峡江、靖安、金溪、明月山、于都5个棘胸蛙养殖群体144个样本进行遗传多样性分析。结果显示:144条棘胸蛙线粒体COI长度为990bp,共检测出变异位点270个,包括简约信... 为研究江西省棘胸蛙的遗传多样性,利用线粒体COI分子标记对采自江西省内峡江、靖安、金溪、明月山、于都5个棘胸蛙养殖群体144个样本进行遗传多样性分析。结果显示:144条棘胸蛙线粒体COI长度为990bp,共检测出变异位点270个,包括简约信息位点250个,单突变位点20个,2个缺失和插入;共检测到35个不同的单倍型,单倍型多样性为0.927;核苷酸多样性为0.0405,平均核苷酸差异数(K)为40.018。养殖群体除峡江和于都群体的遗传多样性较高,其余3个群体均较低;群体内发生了极大的分化,群体变异主要来源于群体内(78.08%)。 展开更多
关键词 棘胸蛙 COI 养殖群体 遗传多样性
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基于线粒体NADH1基因对棘胸蛙养殖群体的遗传多样性分析
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作者 章海鑫 丁国栋 +3 位作者 吴子君 习宏斌 史小元 张燕萍 《江西水产科技》 2023年第6期1-6,共6页
以江西省峡江、靖安、金溪、明月山、于都5个地理群体138只棘胸蛙为研究对象,通过PCR扩增获得序列长度为1187 bp的线粒体NADH1基因全序列,共检测出变异位点101个,其中简约信息位点96个,单突变位点5个,无缺失和插入。138条序列共定义了4... 以江西省峡江、靖安、金溪、明月山、于都5个地理群体138只棘胸蛙为研究对象,通过PCR扩增获得序列长度为1187 bp的线粒体NADH1基因全序列,共检测出变异位点101个,其中简约信息位点96个,单突变位点5个,无缺失和插入。138条序列共定义了41个单倍型,平均单倍型多样性为0.956;平均核苷酸多样性为0.0232,平均核苷酸差异数(K)为27.514。群体间的平均遗传距离为0.024~0.035,除峡江群体与于都群体外遗传分化指数F_(st)值均大于0.05,群体间存在显著的遗传分化。AMOVA结果显示,江西省棘胸蛙变异主要来源于群体内(63.06%)。单倍型系统发育树显示,41个单倍型NJ聚类为3个分支。中性检验结果表明5个棘胸蛙养殖群体历史上未经历种群扩张。 展开更多
关键词 棘胸蛙 NADH1 养殖群体 遗传多样性
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黄颡鱼养殖群体遗传多样性与遗传结构的微卫星分析
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作者 李燕平 覃川杰 +4 位作者 吕云云 龚全 王均 颉江 文正勇 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2023年第3期3-14,共12页
为研究14个不同养殖群体的黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)遗传多样性及遗传结构,采用8对多态性微卫星引物对14个群体的209尾个体进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示:14个群体的平均等位基因数在8~10之间,平均有效等位基因在5.160... 为研究14个不同养殖群体的黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)遗传多样性及遗传结构,采用8对多态性微卫星引物对14个群体的209尾个体进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示:14个群体的平均等位基因数在8~10之间,平均有效等位基因在5.160~6.882之间,平均观测杂合度在0.633~0.717之间,平均期望杂合度在0.358~0.749之间,平均多态信息含量在0.594~0.681之间,均大于0.5。分子方差分析结果表明:3.69%的遗传变异来自群体间,3.93%来自群体内个体间,92.38%来自所有个体间,变异来源主要来自个体间,其中RB群体和WH群体的遗传分化最大(F_(st)=0.116),ZL群体和XB群体的遗传分化最小(F_(st)=-0.009)。基于遗传距离构建了UPGMA系统树,发现14个群体共分为5个聚类支,HJ、YZ、YH、YB 4个群体聚为一支,HQ和LG单独各自聚为一支,LZ和RB 2个群体聚为一支,DB、ZJ、WH、XH、XB和ZL 6个群体聚为一支。基于贝叶斯的Structure聚类分析同样支持14个黄颡鱼群体可分为5个聚类支,与聚类树的结果吻合。14个黄颡鱼群体的遗传多样性均处于高度多态水平,遗传分化处于低等分化水平。 展开更多
关键词 黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco) 养殖群体 微卫星标记 遗传多样性
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14个克氏原螯虾养殖群体遗传多样性分析
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作者 刘小宇 熊礼静 +4 位作者 彭波 罗翠荣 蓬国辉 朱玺 白旭峰 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期457-465,共9页
克氏原螯虾种苗自繁自育使其种质严重退化。遗传多样性是反映种质退化与否的重要指标之一。为评估我国克氏原螯虾养殖群体的遗传多样性,采集我国江西、浙江、广东和湖北省14个地域的464尾克氏原螯虾养殖群体,利用35个微卫星分子标记分... 克氏原螯虾种苗自繁自育使其种质严重退化。遗传多样性是反映种质退化与否的重要指标之一。为评估我国克氏原螯虾养殖群体的遗传多样性,采集我国江西、浙江、广东和湖北省14个地域的464尾克氏原螯虾养殖群体,利用35个微卫星分子标记分别对其等位基因数、期望杂合度、观测杂合度、多态性信息含量、哈迪-温伯格平衡、遗传距离及群体结构等进行分析。结果显示:14个养殖群体的不同标记位点的等位基因数为2~3个;多态信息含量、平均观测杂合度与期望杂合度分别为0.33~0.43、0.32~0.41与0.36~0.44;各标记位点均存在杂合子缺失而未达到哈迪-温伯格平衡;14个群体可聚类为4个遗传群体,其中香树坝、温州、衢州群体与吉安、天荒坪、递铺群体分别聚为2个遗传群体,龙南群体及其余的群体属于另外2个遗传群体。以上结果表明,我国克氏原螯虾养殖群体仅具有中等遗传多样性,收集和保护遗传多样性较高的克氏原螯虾野生种质资源对其遗传育种具有重要意义。 展开更多
关键词 克氏原螯虾 微卫星分子标记 养殖群体 遗传多样性 群体结构
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贵州7个鲤养殖群体遗传多样性与遗传结构分析
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作者 纪达 杨玉梅 +2 位作者 姚俊杰 王益海 张书海 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2023年第3期257-266,共10页
为探究贵州鲤(Cyprinus carpio)养殖群体遗传多样性与遗传分化现状,基于线粒体DNA Cyt b基因,采用PCR扩增与直接测序法,对贵州7个鲤养殖群体进行了遗传多样性及遗传结构分析。结果显示,152尾个体共界定了16种单倍型,7个养殖群体整体单... 为探究贵州鲤(Cyprinus carpio)养殖群体遗传多样性与遗传分化现状,基于线粒体DNA Cyt b基因,采用PCR扩增与直接测序法,对贵州7个鲤养殖群体进行了遗传多样性及遗传结构分析。结果显示,152尾个体共界定了16种单倍型,7个养殖群体整体单倍型多样性指数(H_(d))、核苷酸多样性指数(P_(i))分别为0.792、0.00323。单倍型网络图(network)显示,7个养殖群体间没有形成明显的谱系结构和地理结构。AMOVA分析结果显示,群体间和群体内变异占比分别为41.63039%和58.36961%,遗传分化指数(Fst)为0.41630,达到极显著差异水平(P<0.0001)。基因流(N_(m))值显示,除松浦镜鲤与松浦红镜鲤群体、金背鲤与建鲤群体N_(m)值分别为2.238、4.805外,其余群体间N_(m)值均小于1.000。7个养殖群体中性检验Fu’s F_(s)、Tajima’s D结果均未出现显著负值。结果表明,贵州7个鲤养殖群体总体核苷酸多样性指数偏低,其中,松浦镜鲤、松浦红镜鲤、福瑞鲤核苷酸多样性指数极低;7个鲤养殖群体总体遗传分化程度较高;各群体遗传变异主要发生在群体内部,遗传多样性有待提高。 展开更多
关键词 贵州省 养殖群体 遗传多样性 遗传结构
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基于形态学特征和线粒体Cyt b序列的横带髭鲷野生与养殖群体比较
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作者 刘灏宇 宋日雨 +4 位作者 郑昀亚 冯啉晓 刘璐 杨天燕 高天翔 《安徽农业科学》 CAS 2023年第5期70-73,共4页
对横带髭鲷形态特征以及野生群体和养殖群体的遗传差异进行了分析。共测定94尾横带髭鲷的19项生物学特征。结果表明,野生群体和养殖群体间形态差异不明显。同时,扩增了野生群体和养殖群体的线粒体Cyt b基因片段,22尾横带髭鲷个体共检测... 对横带髭鲷形态特征以及野生群体和养殖群体的遗传差异进行了分析。共测定94尾横带髭鲷的19项生物学特征。结果表明,野生群体和养殖群体间形态差异不明显。同时,扩增了野生群体和养殖群体的线粒体Cyt b基因片段,22尾横带髭鲷个体共检测到5种单倍型,其中养殖群体仅有1种单倍型,野生群体具有5种单倍型,且养殖群体的单倍型多样度及核苷酸多样度均低于野生群体。基于横带髭鲷线粒体Cyt b片段构建的单倍型网络图及系统发育树未发现该物种存在明显的谱系结构。综上所述,相较于野生群体,横带髭鲷养殖群体的遗传多样性水平较低,因此有必要采取科学的人工繁育技术与方法,提高养殖群体的遗传多样性水平,以保护横带髭鲷的种质资源。 展开更多
关键词 横带髭鲷 形态学 Cyt b基因 野生群体 养殖群体
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牙鲆野生群体与养殖群体的遗传多样性分析 被引量:56
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作者 张全启 徐晓斐 +2 位作者 齐洁 王兴莲 包振民 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期816-820,共5页
利用AFLP技术对荣成野生群体和养殖群体牙鲆进行遗传多样性分析和比较。实验采用 7对引物组合在 2个群体中共扩增出 797个位点 ,其中多态位点数为 43 3个 ,占总位点数的 5 4.2 7%。各引物组合在 2个群体中的扩增位点数目和多态位点比例... 利用AFLP技术对荣成野生群体和养殖群体牙鲆进行遗传多样性分析和比较。实验采用 7对引物组合在 2个群体中共扩增出 797个位点 ,其中多态位点数为 43 3个 ,占总位点数的 5 4.2 7%。各引物组合在 2个群体中的扩增位点数目和多态位点比例有较大不同 ,但养殖群体的总扩增位点数和多态位点比例均低于野生群体 ,野生群体和养殖群体的平均多态位点率分别为 46.18%和 40 .0 7% ,其中 ,E3 8M 5 0引物组合在两群体中扩增的多态位点比例差异显著 (P <0 .0 5 )。养殖群体中低频位点明显减少而隐性纯合基因位点显著增加。群体遗传结构分析表明 ,两群体间的遗传距离比较小 ,群体遗传结构相似 ,说明养殖群体尚没有形成自己独立的遗传结构。 展开更多
关键词 牙鲆 野生群体 养殖群体 遗传多样性
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草鱼野生和养殖群体间遗传变异的微卫星分析 被引量:40
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作者 张志伟 曹哲明 +4 位作者 杨弘 王金龙 曹谨玲 韩曜平 吴婷婷 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期189-196,共8页
运用微卫星标记对江苏境内草鱼(Ctenopharyngodon idella)一个野生群体(邗江群体)和两个养殖群体(淡水中心群体和无锡前洲群体)遗传多样性进行了分析。在10个座位中,每个座位检测到的等位基因数2~8个。有效等位基因数、多态信... 运用微卫星标记对江苏境内草鱼(Ctenopharyngodon idella)一个野生群体(邗江群体)和两个养殖群体(淡水中心群体和无锡前洲群体)遗传多样性进行了分析。在10个座位中,每个座位检测到的等位基因数2~8个。有效等位基因数、多态信息含量、期望杂合度、平均表观杂合度均以邗江草鱼野生群体最高,分别为3.9、0.5068、0.6939、0.7;无锡前洲草鱼养殖群体最低,分别为2.2、0.1796、0.5235、0.5286;淡水中心草鱼养殖群体各参数均介于两者之间,分别为3.5、0.2902、0.5418、0.5429。以上结果表明:草鱼野生群体遗传多样件更为丰富,而草鱼养殖群体存在杂合度降低,遗传多样性下降的现象。邗江草鱼野生群体与淡水中心草鱼养殖群体和无锡前洲草鱼养殖群体间遗传分化系数分别为0.219和0.246,而两个草鱼养殖群体间遗传分化系数为0.034。这表明草鱼野生群体与草鱼养殖群体间分化严重,而草鱼养殖群体间分化微弱。各座位分化程度的χ^2检验结果表明,10个座位中有GM18、MFW1-1、MFW1-2三个座位群体间分化达到极显著水平,GM03-2、MFW5两个座位群体间分化差异显著,其他座位分化不显著。针对每个座位对各群体进行HaMy-Weinberg平衡检验发现:由于草鱼养殖群体在GM03-1、GM03-2、GM18三个位点杂合子缺失,草鱼野生群体在位点GM19杂合子过剩而严重偏离平衡。实验表明:近交容易引起草鱼遗传多样性下降,纯合速度加快。 展开更多
关键词 草鱼 微卫星 野生群体 养殖群体 遗传变异
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山东近海牙鲆(Paralichthys olivaceus)自然和养殖群体10个微卫星基因座位的遗传多态性分析 被引量:53
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作者 王伟 尤锋 +1 位作者 高天翔 张培军 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期530-537,共8页
采用微卫星遗传标记技术对山东近海牙鲆自然群体和养殖群体的遗传多样性进行了研究。实验所用牙鲆于 2 0 0 3年 5月分别采自山东近海和青岛胶南养鱼场 ,各 2 0尾 ,取全血或肌肉组织 ,以酚 仿抽提方法提取基因组DNA ,利用筛选获得的 1 0... 采用微卫星遗传标记技术对山东近海牙鲆自然群体和养殖群体的遗传多样性进行了研究。实验所用牙鲆于 2 0 0 3年 5月分别采自山东近海和青岛胶南养鱼场 ,各 2 0尾 ,取全血或肌肉组织 ,以酚 仿抽提方法提取基因组DNA ,利用筛选获得的 1 0对微卫星引物进行PCR扩增 ,反应产物经 8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离、EB显色 ,用ImageMaster1DElite(Version3 0 1 )软件分析电泳结果 ,并计算了相应的遗传学参数。结果表明 ,在自然和养殖群体中 ,1 0个基因座位的等位基因平均数 (a)分别为 6 7和 6 1 ,每个基因座位有效等位基因数 (ae)分别为1 8— 6 8和 2 5— 6 7,群体平均杂合度 (H)分别为 0 81 2 0和 0 731 0 ;两个群体间的遗传相似性系数、遗传距离和基因分化系数为 0 85 5 8、0 1 5 5 7和 0 0 5 5 8;自然群体内每个座位上的多态信息含量 (PIC)为 0 5 9— 0 84、个体识别率 (DP)为 0 5 4— 0 86、非父排除率 (PPE)为 0 41— 0 72 ,其累积个体识别率和非父排除率均达到 0 9999,表明所选座位属中高识别力的遗传标记 ,可以将它们应用于今后牙鲆雌核发育群体的遗传变异分析以及进一步的遗传育种的研究中。 展开更多
关键词 牙鲆 自然和养殖群体 微卫星 遗传变异
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用RAPD技术对我国栉孔扇贝野生种群与养殖群体的遗传结构及其遗传分化的研究 被引量:46
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作者 宋林生 李俊强 +4 位作者 李红蕾 崔朝霞 李成华 胥炜 常亚青 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2002年第7期83-86,共4页
利用RAPD技术对我国栉孔扇贝野生种群和养殖群体的遗传结构及其分化进行了研究。在对 2 0个野生栉孔扇贝和 2 0个养殖栉孔扇贝的基因组DNA的检测中 ,2 0个 1 0碱基的随机引物共扩增出 1 5 3条清晰可分辨的DNA片段 ,片段的长度为 2 0 0~... 利用RAPD技术对我国栉孔扇贝野生种群和养殖群体的遗传结构及其分化进行了研究。在对 2 0个野生栉孔扇贝和 2 0个养殖栉孔扇贝的基因组DNA的检测中 ,2 0个 1 0碱基的随机引物共扩增出 1 5 3条清晰可分辨的DNA片段 ,片段的长度为 2 0 0~3 0 0 0bp其中多态性片段分别为 1 1 6和 1 1 2条 ,野生种群和养殖群体的多态位点比例分别为 75 82 %和 73 47% ,杂合度分别为 0 2 7和 0 2 6。根据基因频率计算出两个群体的近交系数为 0 0 0 1 2 9,遗传距离为 0 0 2 8。栉孔扇贝野生种群的多态位点比例和杂合度处于较高水平 ,说明我国栉孔扇贝野生种群的遗传多样性水平较高 ,种质资源尚处于较好状态 ,应制定相应的渔业生产和管理措施加以保护。养殖群体的多态位点比例和杂合度都低于野生种群 ,这与人工累代养殖过程中 ,群体较小 ,近交机会增加有关。 展开更多
关键词 野生种群 养殖群体 遗传分化 栉孔扇贝 遗传结构 RAPD 人工养殖
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牙鲆5个养殖群体的遗传多样性分析 被引量:34
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作者 刘海金 朱晓琛 +3 位作者 孙效文 杨立更 薛玲玲 毛连菊 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期30-37,共8页
利用16对微卫星分子标记对牙鲆(Paralichthys olivaceus)的5个养殖群体进行遗传多样性分析。结果表明,等位基因数为2-9个,平均等位基因数为6.0625;有效等位基因数1.2596-5.5161,平均有效等位基因数3.692;各位点的杂合度观测... 利用16对微卫星分子标记对牙鲆(Paralichthys olivaceus)的5个养殖群体进行遗传多样性分析。结果表明,等位基因数为2-9个,平均等位基因数为6.0625;有效等位基因数1.2596-5.5161,平均有效等位基因数3.692;各位点的杂合度观测值(Ho)0.2200-0.8000;杂合度期望值(He)0.2061-0.8187。各群体之间无偏倚杂合度期望值从小到大依次为丹东、北戴河、威海、青岛、荣成。Kruskal-Wallis检验结果(H=0.672,df=4,P=0.955)则说明,5个群体遗传多样性差异不显著。群体间基因分化系数(Gs,)为0.0991,各群体之间存在中度遗传分化。采用UPGMA法对5个群体进行聚类,可分3类:丹东和北戴河各为一类,威海、荣成、青岛为一类,其中威海与荣成群体的分化最小。结合Hardy-Weinberg平衡,拟合度检验和遗传偏离指数(动的分析结果表明,各群体的遗传平衡状况存在很大差别。遗传变异的分析结果说明5群体遗传多样性比较丰富。 展开更多
关键词 牙鲆 养殖群体 遗传多样性 微卫星
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山东近海褐牙鲆自然与养殖群体生化遗传结构及其遗传变异的比较分析 被引量:48
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作者 尤锋 王可玲 +1 位作者 相建海 徐成 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期512-518,共7页
山东近海褐牙鲆自然群体活样本共 79尾 ,分别于 1 996年 5月、1 997年 1月和 1 998年 4月采自青岛近海 ;养殖群体活样本 5 2尾于 1 997年 1 2月采自山东荣成寻山养鱼场。采用水平淀粉胶和垂直聚丙烯酰胺凝胶电泳方法及 3种缓冲系统 (TC... 山东近海褐牙鲆自然群体活样本共 79尾 ,分别于 1 996年 5月、1 997年 1月和 1 998年 4月采自青岛近海 ;养殖群体活样本 5 2尾于 1 997年 1 2月采自山东荣成寻山养鱼场。采用水平淀粉胶和垂直聚丙烯酰胺凝胶电泳方法及 3种缓冲系统 (TC、EBT和TG)分别对自然和养殖群体的 1 5种同工酶进行生化遗传分析。结果表明 ,山东近海牙鲆自然群体的多态基因座位比例 ( 31 .0 % )和群体平均杂合度 ( 0 .0 80 2 )都明显高于养殖群体 ( 2 4 .1 % ,0 .0 788) ;在自然群体的 9个多态基因座位、养殖群体的 7个多态基因座位中 ,除了Cat(P <0 .0 5 )和Idhp - 1(P <0 .0 5 ,养殖群体中 )有显著差异、Ldh -C(P <0 .0 1 )完全偏离Hardy -Weinberg定律外 。 展开更多
关键词 褐牙Ping 同工酶 生化遗传结构 养殖群体 遗传变异 山东 自然群体
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虾夷扇贝微卫星标记的分离及其养殖群体的遗传结构分析 被引量:35
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作者 李春艳 丁君 +1 位作者 常亚青 孙效文 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期39-46,共8页
采用新型生物素-磁珠吸附微卫星与同位素杂交相结合的方法筛选出15对微卫星引物,并对大连地区3个虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)养殖群体(黑石礁海区、小长山岛海区、广鹿岛海区)的遗传结构进行分析。获得175个阳性克隆并测序,得到... 采用新型生物素-磁珠吸附微卫星与同位素杂交相结合的方法筛选出15对微卫星引物,并对大连地区3个虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)养殖群体(黑石礁海区、小长山岛海区、广鹿岛海区)的遗传结构进行分析。获得175个阳性克隆并测序,得到160个含微卫星的序列,其中完美型,非完美型和混合型分别占42.69%(73)、46.20%(79)和11.11%(19),经筛选得到15个微卫星标记。虾夷扇贝3个群体的有效等位基因数在1.0000~8.8573之间;期望杂合度在0.0211~0.9111之间;观测杂合度在0.0000~0.8778之间。表明这几个群体遗传多样性水平较高。群体间遗传相似系数在0.9291~0.9624,相似性较高。聚类分析显示,黑石礁群体与小长山岛群体遗传距离最小,亲缘关系最近。基于Hardy-Weinberg平衡的卡方检验表明3个群体均在一定程度上偏离了平衡。本研究所获得的微卫星位点可以为虾夷扇贝的群体遗传多样性分析和遗传图谱的构建等研究提供参考,群体的遗传结构分析对虾夷扇贝的养殖和遗传育种具有一定的指导意义。 展开更多
关键词 虾夷扇贝 微卫星 养殖群体 遗传结构
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大黄鱼(Pseudosciaena crocea)养殖群体遗传多样性的降低 被引量:27
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作者 黎中宝 方秀 +5 位作者 陈锦 常建波 雷光高 张桂玲 赵斌丽 王展林 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期446-450,共5页
采用AFLP技术方法,对福建二个野生及二个养殖大黄鱼群体进行了遗传多样性的研究。实验采用7对引物组合,在四个群体的120个个体中共扩增出472个位点,其中多态位点为220个,多态位点比例为46.61%。结果表明,大黄鱼养殖群体的遗传多样性降低... 采用AFLP技术方法,对福建二个野生及二个养殖大黄鱼群体进行了遗传多样性的研究。实验采用7对引物组合,在四个群体的120个个体中共扩增出472个位点,其中多态位点为220个,多态位点比例为46.61%。结果表明,大黄鱼养殖群体的遗传多样性降低:宁德野生群体和湄州野生群体多态位点比例分别为42.42%和45.14%,Nei遗传多样性指数分别为0.1046和0.1245,Shannon多样性指数分别为0.1659和0.1942,平均有效等位基因数(Ne)分别为1.4153和1.4428;宁德养殖群体和连江养殖群体多态位点比例分别为40.83%和40.53%,Nei遗传多样性指数分别为0.1027和0.1039,Shannon多样性指数分别为0.1615和0.1633,平均有效等位基因数(Ne)分别为1.3919和1.3856。四个群体间遗传距离为0.0359—0.1465,平均为0.079,群体间基因流为1.0808。 展开更多
关键词 大黄鱼 AFLP 养殖群体 遗传多样性的降低
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太平洋牡蛎和葡萄牙牡蛎养殖群体数量性状比较分析 被引量:24
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作者 林清 王亚骏 +4 位作者 王迪文 郑怀平 刘合露 孙泽伟 陈兴强 《海洋通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期106-111,共6页
太平洋牡蛎和葡萄牙牡蛎是两个近缘种,属亚种关系,二者都是中国重要的养殖贝类。为了查明这两种牡蛎养殖群体数量性状间的相关性及影响产量的组成因素,分别对179只太平洋牡蛎和140只葡萄牙牡蛎1龄贝的形态性状(壳长、壳宽、壳高)和活体... 太平洋牡蛎和葡萄牙牡蛎是两个近缘种,属亚种关系,二者都是中国重要的养殖贝类。为了查明这两种牡蛎养殖群体数量性状间的相关性及影响产量的组成因素,分别对179只太平洋牡蛎和140只葡萄牙牡蛎1龄贝的形态性状(壳长、壳宽、壳高)和活体重4个性状进行了测量,并应用通径分析等方法讨论了形态性状对活体重的影响。结果表明,3个形态性状都能够显著地影响活体重,其中壳高的作用是最大的,其对太平洋牡蛎和葡萄牙牡蛎活体重的直接作用分别为19.5%和23.89%。形态性状对太平洋牡蛎和葡萄牙牡蛎活体重间接决定作用差异较大,其中太平洋牡蛎3个形态性状对活体重的间接决定作用较大,均达到10%以上,而葡萄牙牡蛎3个形态性状对活体重的间接决定作用却非常小。利用多元回归分析建立了壳长、壳宽、壳高估计这两种牡蛎活体重(Y1,太平洋牡蛎)和(Y2,葡萄牙牡蛎)的回归方程,分别为:Y1=-119.456 5+1.389 7x1+2.089 0x2+0.777 8x3(R2=0.767 9),Y2=-42.373 9+0.532 8x1+1.289 5x2+0.5 177x3(R2=0.490 9)。本研究结果可为这两种牡蛎的选择育种提供理论依据,即以提高活体重为目标,主要选择壳高,但对太平洋牡蛎还应该加强对壳宽的协同选择。 展开更多
关键词 牡蛎 养殖群体 数量性状 相关性 多元回归 通径分析
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亲本数目对鲍养殖群体AFLP标记位点及其遗传结构的影响 被引量:21
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作者 万俊芬 包振民 +2 位作者 汪小龙 张全启 王如才 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期127-132,共6页
为了探讨不同的交配亲本数对鲍养殖群体遗传结构的影响,实验中对两个皱纹盘鲍自交群体SS(亲本数少)和LS(亲本数多)及两个皱纹盘鲍(♀)×日本盘鲍(♂)的杂交群体SH(亲本数少)和LH(亲本数多)进行了位点频率和遗传结构的AFLP标记分析... 为了探讨不同的交配亲本数对鲍养殖群体遗传结构的影响,实验中对两个皱纹盘鲍自交群体SS(亲本数少)和LS(亲本数多)及两个皱纹盘鲍(♀)×日本盘鲍(♂)的杂交群体SH(亲本数少)和LH(亲本数多)进行了位点频率和遗传结构的AFLP标记分析。研究表明,自交组中亲本数少的SS群体的总位点数少于LS群体,后者的一些低频位点在前者中丢失,同时群体的位点频率发生漂移,SS的低频位点数目减少而高频位点略有增加。另外统计了各群体的相似指数和杂合度,发现SS群体的相似指数低于LS,而杂合度高于LS群体。在杂交组两群体(SH,LH)中位点数目频率、相似指数和杂合度变化趋势与两自交群体相似。两组结果均表明群体的亲本数减少会引起一些低频位点丢失及位点频率发生漂移,同时亲本数过少会导致群体的杂合度暂时升高。 展开更多
关键词 亲本数目 养殖群体 AFLP标记 遗传结构 位点频率 杂合度 皱纹盘鲍
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鳜野生群体与养殖群体的RAPD分析 被引量:25
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作者 方展强 陈军 +2 位作者 郑文彪 伍育源 肖智 《大连水产学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期16-19,共4页
用 60个随机引物对鳜SinipercachuatsiBasilewsky野生群体和养殖群体进行随机扩增多态DNA(RAPD) 分析, 经过引物筛选, 分别用 55个和 54个引物对野生鳜和养殖鳜进行群体内分析。结果表明, 野生群体多态位百分率为 85 75%, 群体内遗传相... 用 60个随机引物对鳜SinipercachuatsiBasilewsky野生群体和养殖群体进行随机扩增多态DNA(RAPD) 分析, 经过引物筛选, 分别用 55个和 54个引物对野生鳜和养殖鳜进行群体内分析。结果表明, 野生群体多态位百分率为 85 75%, 群体内遗传相似率和遗传距离分别为 0 8547和 0 1453; 养殖群体多态位百分率为 16 39%, 遗传相似率和遗传距离分别为 0 9527和 0 0473; 两群体间遗传相似率和遗传距离分别为 0 6905和 0 3095; 鳜野生群体具有较高的遗传多样性, 养殖群体的遗传多样性却显著降低, 野生群体与养殖群体间有明显的遗传差异, 说明人工繁育对鳜基因组造成了显著的影响。 展开更多
关键词 野生群体 养殖群体 随机扩增多态DNA
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