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基于生物信息学中DNA分子序列模式匹配算法研究实现
1
作者 陈亭宇 尹国才 魏国晟 《计算机科学与应用》 2023年第2期236-250,共15页
生物信息学是融合先进的生物科学和计算机技术的一门综合运用数学、信息科学、计算机技术等对生物学、医学的信息进行科学的组织、整理和归纳的科学。DNA分子序列比对是生物信息学中最重要和最基础的研究方向之一,是探究基因与疾病关系... 生物信息学是融合先进的生物科学和计算机技术的一门综合运用数学、信息科学、计算机技术等对生物学、医学的信息进行科学的组织、整理和归纳的科学。DNA分子序列比对是生物信息学中最重要和最基础的研究方向之一,是探究基因与疾病关系的重要手段。本文研究的主要目标是在不确定的分子序列数据中找到所有与目标序列相同且出现概率大于给定阈值的序列,并给出目标序列总数及每个目标序列的起始位点。本文针对现有基于“空间换时间”的分子序列模式匹配算法仅限于次数的计算以及基于生物信息学中双DNA序列比对算法的图像立体匹配方法对于不确定的源数据具有局限性的问题,提出了一种基于加权后缀树的DNA分子序列模式匹配算法。该方法应用加权后缀树为主要数据结构,改进了不确定的源数据的匹配准确度,解决了map数据结构仅限于次数计算的问题,实验结果表明,本文提出的算法在匹配速度及灵敏度上有了一定的提高。 展开更多
关键词 生物信息学 分子序列 模式匹配 算法
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近交系海南五指山猪SLA经典I类和II类分子序列分析 被引量：14
2
作者 吴群 熊平 +2 位作者 陈实 冯书堂 龚非力 《现代免疫学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期23-26,共4页
为筛选适合我国异种移植研究的猪种提供参考依据 ,采集近交系海南五指山猪种全血标本 6例 ,利用RT PCR扩增得到cDNA产物 ,纯化、克隆、测序得到SLA经典I类P1、P14座位和II类DQA、DQB、DRA、DRB座位基因序列共 6个。与Genbank中相关序列... 为筛选适合我国异种移植研究的猪种提供参考依据 ,采集近交系海南五指山猪种全血标本 6例 ,利用RT PCR扩增得到cDNA产物 ,纯化、克隆、测序得到SLA经典I类P1、P14座位和II类DQA、DQB、DRA、DRB座位基因序列共 6个。与Genbank中相关序列进行比较分析发现 :所得序列是SLAI类和II类基因的新等位基因。在中国非协调性猪 人异种移植中 ,海南五指山猪种在与人类MHC遗传基因水平相似性方面有一定优势 。 展开更多
关键词 SLA I类 II类 分子序列分析 核苷酸序列测定 RT—PCR 异种移植
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无比对的生物分子序列比较方法 被引量：3
3
作者 符维娟 汪源源 卢大儒 《生物医学工程学杂志》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第3期598-601,605,共5页
生物序列分析是生物信息学的主要研究领域,常常通过比较分析获取有用的信息。最常用的比较方法是序列比对,但是利用比对的序列比较假设了同源片断之间是邻接保守的,这和遗传重组相冲突,而且多序列比对在计算复杂性等方面存在困难,这些... 生物序列分析是生物信息学的主要研究领域,常常通过比较分析获取有用的信息。最常用的比较方法是序列比对,但是利用比对的序列比较假设了同源片断之间是邻接保守的,这和遗传重组相冲突,而且多序列比对在计算复杂性等方面存在困难,这些使得人们努力研究无比对的序列比较方法。本文综述了目前无比对序列比较的两类主要方法:一类基于字(低聚物)的出现率及其分布,通过出现率向量定义的笛卡尔空间中的距离计算来实现序列比较;另一类使用柯尔莫哥洛夫复杂度理论或混沌理论来实现序列比较。 展开更多
关键词 生物分子序列 生物信息学 频率向量 G-蛋白 氨基酸
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中国东海和韩国马山湾海域2株原甲藻的形态结构和分子序列比较 被引量：2
4
作者 王红霞 陆斗定 +4 位作者 黄海燕 夏平 戴鑫烽 Jeanette GOEBEL 鄭海■ 《海洋学研究》 2011年第1期42-48,共7页
对采自我国东海温岭海域和韩国南部马山湾海域的2株原甲藻进行了藻种分离、纯化培养及rDNA ITS分子序列的PCR扩增与测序,并运用显微镜、扫描电镜、Jukes-Cantor距离矩阵及构建的系统发育树,比较研究了2株原甲藻的形态结构和分子序列。... 对采自我国东海温岭海域和韩国南部马山湾海域的2株原甲藻进行了藻种分离、纯化培养及rDNA ITS分子序列的PCR扩增与测序,并运用显微镜、扫描电镜、Jukes-Cantor距离矩阵及构建的系统发育树,比较研究了2株原甲藻的形态结构和分子序列。结果表明:温岭藻株(LAMB090508)和马山湾藻株(PDKS0206)具有十分相近的形态结构,细胞均呈不对称梨形,大部分细胞底部呈圆卵形,老化细胞在两侧壳面连接处形成间接带,细胞核位于细胞下半部,呈圆球形,细胞内存在不规则板块状叶绿体。温岭藻株和马山湾藻株的rDNA ITS分子序列总长度均为591 bp,GC含量均为49%,相似度为99.83%,核苷酸差异值为0.002。系统发育树显示,温岭藻株、马山湾藻株和东海原甲藻Pro-rocentrum donghaiense(AY465116)聚在一起,应属同一物种,支持率为100%。综合形态结构和分子序列的比较结果表明,分布于我国东海温岭海域和韩国马山湾海域的2株原甲藻属于同一物种,且均为东海原甲藻Prorocentrum donghaiense Lu。 展开更多
关键词 原甲藻 形态特征 RDNA ITS分子序列 东海 韩国马山湾
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东海赤潮异弯藻Heterosigma akashiwo的形态特征及其分子序列分析 被引量：1
5
作者 何飘霞 王红霞 +2 位作者 陆斗定 戴鑫烽 夏平 《海洋学研究》 2011年第3期155-161,共7页
将采集自东海南麂列岛海域水样进行分离、纯化,从中得到1株针胞藻,将其初步鉴定为赤潮异弯藻Heterosigma akashiwo（以下称东海藻株）,并使用光学和荧光显微镜对其形态特征进行了详尽描述,及通过rDNA ITS序列测定、系统发育进化树构建和... 将采集自东海南麂列岛海域水样进行分离、纯化,从中得到1株针胞藻,将其初步鉴定为赤潮异弯藻Heterosigma akashiwo（以下称东海藻株）,并使用光学和荧光显微镜对其形态特征进行了详尽描述,及通过rDNA ITS序列测定、系统发育进化树构建和Jukes-Cantor距离矩阵分析,研究了其分子进化关系。结果表明：东海藻株（编号为LAMB100718）为单细胞,无细胞壁,背腹略扁,细胞厚度及形态变化较大,细胞核位于细胞中部,略呈圆形,叶绿体周生,呈黄褐色盘状。东海藻株与其它4株赤潮异弯藻rDNA ITS序列比对的结果显示仅有1个碱基位点存在差异。系统发育树显示东海藻株与其它4株赤潮异弯藻聚在一起,属同一物种,支持率为100%。Jukes-Cantor遗传距离矩阵则表明东海藻株与其它4株赤潮异弯藻的rDNA ITS核苷酸差异值范围为0.000~0.004,属于种内差异。综合细胞形态结构和分子序列的比较结果,分布于东海南麂列岛海域的东海藻株确为赤潮异弯藻,这是该种在浙江海域的首次记录。 展开更多
关键词 赤潮异弯藻 形态特征 RDNA ITS分子序列 东海
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分子序列的突变危险性与遗传密码的编码规则 被引量：1
6
作者 纪丰民 罗辽复 《内蒙古大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 2000年第1期30-36,共7页
定义了分子序列（碱基序列和对应的氨基酸序列）的突变危险性函数；通过危险性函数的极小化可以导出遗传密码的简并规则，终止密码子在密码表上的位置及亲－疏水畴排布，氨基酸在密码表上的定位接近标准密码表．各个生物类别的突变危险... 定义了分子序列（碱基序列和对应的氨基酸序列）的突变危险性函数；通过危险性函数的极小化可以导出遗传密码的简并规则，终止密码子在密码表上的位置及亲－疏水畴排布，氨基酸在密码表上的定位接近标准密码表．各个生物类别的突变危险性函数值差别不超过５％ ，可看作守恒量．Ｒａｓ 家族癌基因产物具有较大的突变危险性函数值，这提示分子序列的突变危险性函数可能有重要的应用价值和理论意义． 展开更多
关键词 密码子 遗传密码 突变危险性 编码规则 分子序列
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分子序列进化方程的解的研究
7
作者 罗辽复 特木尔巴根 《内蒙古大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 1994年第5期504-510,共7页
利用龙格─库塔（５，６）法，对分子序列进化方程作了数值解，并求出了信息参数Ｄ＿１、Ｄ＿２、Ｘ的进化，及其与突变率和选择强度的依赖关系。分析了Ｄ＿１、Ｄ＿２、Ｘ的稳定值与选择参数之间的各种可能关系。
关键词 进化方程 分子序列 数值解 核酸
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一个分子序列的进化模型
8
作者 罗辽复 蔡禄 《内蒙古大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 1989年第3期340-344,共5页
本文提出了关于分子序列进化的一个简单模型,序列由于随机的点突变和一定的选择规则作用而不断变化,利用这个模型,可以解释进化中信息参数<D_1>的下降,<D_2>和<X>的上升,并可解释序列具有短程的关联长度,对不同物种... 本文提出了关于分子序列进化的一个简单模型,序列由于随机的点突变和一定的选择规则作用而不断变化,利用这个模型,可以解释进化中信息参数<D_1>的下降,<D_2>和<X>的上升,并可解释序列具有短程的关联长度,对不同物种的出现,也可作初步讨论。 展开更多
关键词 分子序列 信息参数 进化模型
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生物大分子序列一级结构同源性分析专家系统
9
作者 逯燕玲 任强 《北京联合大学学报》 CAS 1996年第1期17-21,共5页
介绍了一个在微机上用Ｃ语言开发的专家系统的实现。该专家系统试图模拟生物大分子序列一级结构的同源性分析过程，为生物学家进行生物实验和进一步的理论研究提供依据。在系统设计中采用产生式规则作为知识的主要表示方式，并通过推理... 介绍了一个在微机上用Ｃ语言开发的专家系统的实现。该专家系统试图模拟生物大分子序列一级结构的同源性分析过程，为生物学家进行生物实验和进一步的理论研究提供依据。在系统设计中采用产生式规则作为知识的主要表示方式，并通过推理、用户界面以及黑板结构向用户提供合理的候选方案。为了做到控制结构与知识库中具体的生物知识无关，使系统结构在不做太大改变的前提下能够适用于其它领域，该系统设计了通用调度器。 展开更多
关键词 分子序列 结构 同源性 生物大分子 专家系统
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数字信号处理技术用于生物分子序列的分析
10
作者 杨福生 《中国医疗器械杂志》 CAS 2002年第3期157-160,共4页
对数字信号处理用于生物分子序列的分析作了初步的概念介绍。主要从时域和频域两方面说明符号序列如何转换为数值序列。
关键词 数字信号处理技术 生物分子序列 基因组信号分析 符号序列 数值序列
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栗疫病菌低毒性病毒(CHV1)分子序列的多态性 被引量：1
11
作者 刘福秀 丁平 +1 位作者 徐陈贤 王克荣 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期232-238,共7页
为了探明欧洲栗疫病菌低毒性病毒(CHV1)病毒的起源,采用序列测定方法对来自中国、日本和意大利的30个CHV1的遗传多样性进行了分析。测定了所有病毒的部分序列,根据测序结果可将其分为29个单元型,分属于3个不同的亚型:中国菌株的病毒群... 为了探明欧洲栗疫病菌低毒性病毒(CHV1)病毒的起源,采用序列测定方法对来自中国、日本和意大利的30个CHV1的遗传多样性进行了分析。测定了所有病毒的部分序列,根据测序结果可将其分为29个单元型,分属于3个不同的亚型:中国菌株的病毒群体归属于亚型Ⅰ和Ⅲ;日本病毒群体除Ja55属于亚型Ⅲ外,其余属于亚型Ⅱ;意大利病毒群体除IT192属于亚型Ⅰ外,其余都属于亚型Ⅲ。中国CHV1病毒群体的地理分布特点为:亚型Ⅰ主要分布在长江以北,其中只有09344(来自湖南)例外;而亚型Ⅲ主要分布在长江以南,但09228(北京)、09235(北京)、09277(辽宁)例外。这不同于欧洲主要以一种亚型为主的情况,表明各群体之间存在着一定的基因流动。本研究的结果表明中国CHV1病毒群体的遗传多样性比日本群体和意大利群体都丰富。 展开更多
关键词 栗疫病菌 低毒性 病毒 分子序列 多态性 遗传多样性 意大利 测定方法 中国菌株 分布特点 基因流动 日本群体 亚型 欧洲 长江 北京 性比
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休眠单体策略在高分子序列调控中的研究进展 被引量：1
12
作者 宋雨阳 宣孙婷 +1 位作者 黄智豪 张正彪 《功能高分子学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期395-407,共13页
序列是指高分子链中的单体单元通过共价键连接的次序。自然界中的生物大分子,如蛋白质和DNA等,他们的精确序列结构决定了其复杂且精密的功能。受此启发,序列可控高分子的合成及其结构性能研究日益成为高分子学科的热点,受到越来越多研... 序列是指高分子链中的单体单元通过共价键连接的次序。自然界中的生物大分子,如蛋白质和DNA等,他们的精确序列结构决定了其复杂且精密的功能。受此启发,序列可控高分子的合成及其结构性能研究日益成为高分子学科的热点,受到越来越多研究者关注。本文聚焦于近年来在序列调控中的重要成果,重点介绍本课题组提出的休眠单体策略在序列可控高分子合成中的研究进展。最后,基于这些研究进展对休眠单体策略进行了总结和展望。 展开更多
关键词 高分子序列调控 活性/可控自由基聚合 休眠单体策略 DIELS-ALDER反应 马来酰亚胺
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分子序列压缩算法在卫星IP网络中的应用
13
作者 沈超凡 黄雷君 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期126-133,139,共9页
以冗余消除技术中的分子序列压缩算法(MSR)为例,分析卫星链路高误码率和长时延对MSR算法压缩性能的影响,提出一种基于确认的历史同步机制(PAS)。将PAS机制与MSR算法相结合,把接收端确认收到的数据包作为收发两端的历史数据并使历史数据... 以冗余消除技术中的分子序列压缩算法(MSR)为例,分析卫星链路高误码率和长时延对MSR算法压缩性能的影响,提出一种基于确认的历史同步机制(PAS)。将PAS机制与MSR算法相结合,把接收端确认收到的数据包作为收发两端的历史数据并使历史数据始终保持同步,从而确保接收端能对所有数据包进行解压,避免数据包丢失。实验结果表明,MSR-PAS在高误码率和长时延的环境下能有效降低因冗余消除技术引起的丢包率,同时保证了数据压缩效果和端到端时延稳定性,适用于卫星IP网络。 展开更多
关键词 冗余消除 分子序列压缩 历史同步 卫星IP网络 时延波动
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生物大分子序列一级结构同源性分析的算法及其软件实现
14
作者 钟五一 许赞军 《北京联合大学学报》 CAS 1994年第4期1-6,共6页
本系统是用微机来实现生物大分子序列一级结构的同源性分析，对生物学家在一级结构同源性分析的科研工作中具有一定的实用价值。本系统是在寻找保守区的基础上进行率匹配，分别使用了顺序搜索法，优先队列法及分枝定界法，并采用了深度... 本系统是用微机来实现生物大分子序列一级结构的同源性分析，对生物学家在一级结构同源性分析的科研工作中具有一定的实用价值。本系统是在寻找保守区的基础上进行率匹配，分别使用了顺序搜索法，优先队列法及分枝定界法，并采用了深度优先与广度优先的搜索方式以及对角线方向扩展，相邻对角线传递等技术，在实现过程中，采用了运算速度快的结构程序语言——Ｃ语言，并运用数据结构的技巧提高了系统的使用效率． 展开更多
关键词 生物大分子 结构 分子序列 同源性分析 算法
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水芹SSR分子标记开发与遗传多样性分析
15
作者 邢啸林 陈丹 +3 位作者 况勇 徐文娟 黄然 甘德芳 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第7期1285-1296,共12页
水芹是伞形科水芹属多年生草本植物,是一种重要的药食两用蔬菜作物。在中国,水芹的种植区域十分广泛,然而目前对其种质资源的鉴定、培育及遗传信息的研究较少。本研究利用溧阳白芹基因组开发水芹简单重复序列(SSR)分子标记,分析55份水... 水芹是伞形科水芹属多年生草本植物,是一种重要的药食两用蔬菜作物。在中国,水芹的种植区域十分广泛,然而目前对其种质资源的鉴定、培育及遗传信息的研究较少。本研究利用溧阳白芹基因组开发水芹简单重复序列(SSR)分子标记,分析55份水芹的遗传多样性并用非加权组平均法(UPGMA)构建系统进化树,同时用SSR扩增条带数据构建DNA指纹图谱。结果显示,共鉴定到325699个SSR位点,其中单核苷酸SSR重复单元、二核苷酸SSR重复单元、三核苷酸SSR重复单元、四核苷酸SSR重复单元、五核苷酸SSR重复单元、六核苷酸SSR重复单元的出现频率分别为33.94%、54.62%、9.31%、1.66%、0.17%、0.29%,其中二核苷酸SSR重复单元数最多,有177887个,且A/T(占比为29.98%)和AT/AT(占比为35.70%)是较丰富的重复类型。UPGMA分析结果表明,33对高多态性引物[多态信息含量(PIC)>0.25]可将55份水芹材料分为4组。利用筛选出的4对引物(Oj-084、Oj-110、Oj-112、Oj-156)可以将55份水芹材料完全区分开,并且可构建指纹图谱。研究结果可为水芹种质资源鉴定、保护及分子遗传育种提供有力依据。 展开更多
关键词 水芹 简单重复序列(SSR)分子标记 聚类分析 遗传多样性
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基于快速沃尔什变换的分子子序列识别 被引量：1
16
作者 涂俐兰 王能超 +1 位作者 梅启鹏 陈莹 《生命科学研究》 CAS CSCD 2003年第3期279-282,共4页
提出了一种基于快速沃尔什变换的分子子序列识别的方法.这种方法不仅能快速识别出子序列并确定子序列的位置,而且极大地降低了CPU运行时间和计算复杂度.结合实例对这种方法进行了分析.
关键词 快速沃尔什变换 分子子序列 生物序列分析 序列数据
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金黄色葡萄球菌耐药基因分析及多位点序列分子分型 被引量：3
17
作者 吴德群 巢国祥 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期513-518,共6页
目的对临床来源金黄色葡萄球菌(金葡菌)进行分子分型及溯源,研究耐药基因与克隆复合体(CC)关系。方法检测94株金葡菌中的耐甲氧西林金葡菌(MRSA)并分型,测定氨基糖苷类耐药基因[aac(6')/aph(2'')、aph(3')-Ⅲ、ant(4... 目的对临床来源金黄色葡萄球菌(金葡菌)进行分子分型及溯源,研究耐药基因与克隆复合体(CC)关系。方法检测94株金葡菌中的耐甲氧西林金葡菌(MRSA)并分型,测定氨基糖苷类耐药基因[aac(6')/aph(2'')、aph(3')-Ⅲ、ant(4',4'')]、大环内酯类耐药基因(ermA、ermC、msrA)、四环素类耐药基因(tetM、tetk)共8个耐药基因;用多位点序列分子分型(MLST)进行克隆分析。结果 94株菌株中共检出MRSA菌株36株,其中,医源MRSA(HA-MRSA)29株,包括Ⅲ型28株,Ⅰ型1株;社区源MRSA(CA-MRSA)7株,包括V型6株,Ⅳd型1株。94株菌株中,耐药基因aac(6')/aph(2'')、aph(3')-Ⅲ、ant(4',4'')、ermA、ermC、msrA、tetM、tetk的携带率分别为55.3%、58.5%、26.6%、37.2%、34.0%、19.1%、37.2%、25.5%;共84株菌株耐药基因阳性,共形成35种耐药基因谱;含3种以上耐药基因的菌株占48.9%(46/94)。MLST分型共得到27个ST型,6个同源复合体;有3个重要同源复合体CC239、CC630、CC5及1个重要ST398型。HA-MRSA均属于CC239,而多数CAMRSA属于CC630;HA-MRSA耐药基因携带率与CA-MRSA及所有甲氧西林敏感金葡菌(MSSA)携带率差异有统计学意义(P<0.01)。CC239克隆与所有其他克隆菌株耐药基因的携带率差异有统计学意义(P<0.01)。结论引起感染的MRSA主要是HA-MRSA-Ⅲ,其次为CA-MRSA-Ⅴ。CC630是国际上新出现的克隆;ST398主要是起源于人而非动物。MRSA主要存在于几类特定克隆中,主要来源于相同克隆的MSSA;金葡菌获得及携带耐药基因主要与CC克隆有关,推测此类复合体中含有相关分子构型,有利于耐药基因如SCCmec插入。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 耐药基因 多位点序列分子分型 克隆复合体
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黄瓜白粉病抗性序列相关扩增多态性的分子标记研究 被引量：9
18
作者 景然 陈新娟 +3 位作者 朱育强 张鹏 张玉琼 周胜军 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期387-392,共6页
以高抗和高感白粉病的黄瓜亲本及其杂交后代F2分离群体为材料,应用序列相关扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)技术开展与黄瓜白粉病抗性基因连锁的SRAP分子标记研究.结果表明:从437对SRAP引物组合中筛选出62对... 以高抗和高感白粉病的黄瓜亲本及其杂交后代F2分离群体为材料,应用序列相关扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)技术开展与黄瓜白粉病抗性基因连锁的SRAP分子标记研究.结果表明:从437对SRAP引物组合中筛选出62对能够在2个亲本抗、感池间扩增出稳定多态性条带的引物组合,进一步用这些引物分析F2群体,发现有1对引物组合Me1/Em9扩增出的SRAP标记(Me1/Em9—284 bp)能与黄瓜抗白粉病基因连锁,遗传距离为9.8 c M.获得的分子标记对克隆抗病基因和利用分子标记辅助选择提高育种效率具有重要意义. 展开更多
关键词 黄瓜 白粉病 序列相关扩增多态性分子标记
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镉胁迫对不同甜玉米自交系幼苗生长的影响及其相关简单重复序列分子标记初筛 被引量：3
19
作者 姜昊梁 黄允 +7 位作者 梁绍芳 谢梦晨 徐天成 宋芷婷 向文文 陈青春 万小荣 孙伟 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第8期1582-1590,共9页
为探究不同甜玉米自交系幼苗期对镉的响应差异,发掘与甜玉米苗期耐镉性状相关的分子标记位点,选取13份甜玉米自交系进行镉胁迫处理(Cd浓度为0.01 mol·L^(-1)),综合评价甜玉米幼苗生理指标差异,并寻找与甜玉米苗期耐镉性相关的简单... 为探究不同甜玉米自交系幼苗期对镉的响应差异,发掘与甜玉米苗期耐镉性状相关的分子标记位点,选取13份甜玉米自交系进行镉胁迫处理(Cd浓度为0.01 mol·L^(-1)),综合评价甜玉米幼苗生理指标差异,并寻找与甜玉米苗期耐镉性相关的简单重复序列(SSR)分子标记。结果显示,从耐镉性判断,KY188、M114A为敏感型自交系,T96-4、M3、T35和T8-1为耐受型自交系。与对照处理相比:KY188(敏感型)经过镉胁迫处理后,叶绿素含量随时间推进显著(P<0.05)降低,苗高、总根数、根长、地上部鲜重和干重、地下部鲜重和干重、总鲜重、总干重分别显著(P<0.05)降低了18.87%、24.32%、21.13%、58.86%、2.04%、33.77%、26.11%、47.11%、14.29%;T96-4(耐受型)经过镉胁迫处理后,上述指标无显著变化。通过相关性分析,共检测到9个与甜玉米苗期耐镉性状相关的SSR标记,分别位于第2、3、4、5、6、8、9、10号染色体上。 展开更多
关键词 镉胁迫 主成分分析 耐镉性 简单重复序列分子标记 甜玉米
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BSPST:形变监测仪器故障分类算法
20
作者 吴晓赢 邓红霞 +2 位作者 胡玉良 李颖 穆慧敏 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2024年第18期306-315,共10页
针对现有形变监测仪器发生故障时故障类别难以准确分类的问题,提出了一种基于最大区分子序列(Shapelet)转换的时间序列分类算法(best qualify Shapelet Transform,BSPST)。为了提升Shapelet质量,利用布隆过滤器和相似度匹配保留一组高... 针对现有形变监测仪器发生故障时故障类别难以准确分类的问题,提出了一种基于最大区分子序列(Shapelet)转换的时间序列分类算法(best qualify Shapelet Transform,BSPST)。为了提升Shapelet质量,利用布隆过滤器和相似度匹配保留一组高质量的候选Shapelet来构建分类模型,BSPST利用布隆过滤器筛选出同类别中重复的符号聚合近似(symbolic aggregation approximation,SAX)单词。随后通过位图中标记的单词来评价SAX单词的重复度,以此去除类别中相似的SAX单词。最终将处理后的符号聚合近似单词转化为高质量的Shapelet。通过Shapelet转换技术,对数据进行转换。最后采取集成分类器进行分类。根据地震形变仪器故障数据建立了7个地震设备故障数据集,并结合东安格利亚大学和加州大学河滨分校时间序列分类仓库中选取的44个数据集和具代表性的最先进的方法进行了充分的实验验证。结果表明,BQST算法在分类精度、分类速度上稳居前列,有效解决了形变监测仪器的故障分类问题。 展开更多
关键词 故障诊断 时间序列分类 最大区分子序列 形变仪器
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