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武汉地区住院患者克罗诺杆菌感染及其临床分离株分子特征与耐药性研究
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作者 余欢 毛晓丽 费龙 《皖南医学院学报》 CAS 2024年第4期346-350,共5页
目的:研究武汉地区住院患者克罗诺杆菌感染及其临床分离株分子特征与耐药性。方法:选取2021年6月~2022年5月在武汉市第一医院就诊的克罗诺杆菌感染住院患者137例为研究对象,对患者克罗诺杆菌分离株行血清型分型鉴定、脉冲场凝胶电泳(PF... 目的:研究武汉地区住院患者克罗诺杆菌感染及其临床分离株分子特征与耐药性。方法:选取2021年6月~2022年5月在武汉市第一医院就诊的克罗诺杆菌感染住院患者137例为研究对象,对患者克罗诺杆菌分离株行血清型分型鉴定、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型分析、克隆群结构特征分析与耐药性检验。结果:483例患者检出克罗诺杆菌感染137例,总检出率28.36%。男、女检出率差异无统计学意义(P>0.05),年龄分布以低龄(0~6岁)检出率最高,科室分布以儿科检出率最高,感染后易发疾病类型为脑膜炎(P<0.05);血清型分型鉴定以O 1为主要血清型分型,占比36.50%(50/137),ST型分布以ST4、ST1为主,分别占比40.15%(55/137)和31.38%(43/137),CC结构特征以CC4、CC7为主,分别占比32.85%(45/137)和40.15%(55/137);经内切酶Xba I和Spe I酶切后,分成14个PFGE图谱类型,其中BQ9、BQ11和BQ12相似系数较高(98.0%);耐药性检验结果提示,氨苄西林的耐药性较强(67.15%),对测定的其他抗生素全部敏感,未发现多重耐药菌株。结论:武汉地区住院患者克罗诺杆菌感染血清型分型以O 1型为主,PFGE分子分型具有多样性,其中氨苄西林的耐药性较强。 展开更多
关键词 克罗诺杆菌 临床分离株 分子特征 耐药性 武汉地区
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新型鹅细小病毒徐州分离株NGPV XZ-01的分离和致病性研究
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作者 迟兰 蔺辉星 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2024年第2期82-88,共7页
为了研究2021年6月江苏徐州某商品半番鸭养殖场所发疾病的病原及其致病性,从该养殖场发病的半番鸭群中无菌采集肝脏、脾脏、肠道等临床样品,采用PCR方法对病原进行鉴定,将所采集样本处理后接种至非免疫鸭胚中,连续多次传代后,对鸭胚组... 为了研究2021年6月江苏徐州某商品半番鸭养殖场所发疾病的病原及其致病性,从该养殖场发病的半番鸭群中无菌采集肝脏、脾脏、肠道等临床样品,采用PCR方法对病原进行鉴定,将所采集样本处理后接种至非免疫鸭胚中,连续多次传代后,对鸭胚组织及尿囊液进行病理学、电镜检查及动物试验。结果显示:PCR检测结果鉴定为新型鹅细小病毒阳性;鸭胚尿囊液在电镜下观察到细小病毒粒子,胚体病理切片观察显示符合细小病毒所致病变;动物试验显示,攻毒试验鸭主要表现为生长发育明显受阻,大部分试验鸭成为“僵鸭”,于20日龄后陆续出现上下喙变短、舌头外露等症状,剖检病变主要为肠内容物稀薄及泄殖腔膨大,肠道组织切片观察显示肠绒毛上皮细胞坏死、脱落及部分肠腺坏死,符合鸭短喙侏儒综合征(short beak and dwarfism syndrome,SBDS)所致雏鸭的症状与病变。结果表明:该肉鸭养殖场所发疾病为SBDS,将该场分离的病毒命名为新型鹅细小病毒徐州分离株(NGPV XZ-01株)。 展开更多
关键词 鸭短喙侏儒综合征 新型鹅细小病毒 徐州分离株 分离鉴定 动物试验
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新型鹅细小病毒徐州分离株(NGPV XZ-01株)对半番鸭生长发育的影响
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作者 迟兰 蔺辉星 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第12期64-68,126-128,共8页
为了探究新型鹅细小病毒徐州分离株(NGPV XZ-01株)对半番鸭生长发育的影响,试验将180只健康非免疫半番鸭随机分为3组,分别为对照组、3日龄攻毒组和7日龄攻毒组,每组60只,对照组于3日龄时皮下注射灭菌生理盐水0.2 mL,3日龄攻毒组和7日龄... 为了探究新型鹅细小病毒徐州分离株(NGPV XZ-01株)对半番鸭生长发育的影响,试验将180只健康非免疫半番鸭随机分为3组,分别为对照组、3日龄攻毒组和7日龄攻毒组,每组60只,对照组于3日龄时皮下注射灭菌生理盐水0.2 mL,3日龄攻毒组和7日龄攻毒组分别于3日龄和7日龄时皮下注射NGPV XZ-01株病毒液(第7代,效价为5.7 lgELD_(50)/mL)0.2 mL,攻毒后观察并记录各组的生长发育情况、临床症状、发病和死亡情况,并对喙长和体重进行测定,于25日龄时全部扑杀,进行剖检、病理切片观察和X光检查。结果表明:攻毒后,3日龄攻毒组和7日龄攻毒组均生长发育迟缓或成僵鸭;24日龄时,3日龄攻毒组和7日龄攻毒组的体型明显小于对照组,3日龄攻毒组体型明显小于7日龄攻毒组。试验期间,3日龄攻毒组和7日龄攻毒组表现为精神萎靡不振、喜卧、打堆、排白色或黄白色粪便,部分患鸭出现运动障碍、瘫痪等症状;随着日龄的增长,上下喙变短及舌头外露的症状逐渐明显。其中3日龄攻毒组发病率为90.0%、死亡率为11.7%;7日龄攻毒组发病率为76.7%、死亡率为6.7%;对照组无发病和死亡情况。10~22日龄时,3日龄攻毒组和7日龄攻毒组的体重和喙长均显著低于对照组(P<0.05),3日龄攻毒组的体重和喙长均显著低于7日龄攻毒组(P<0.05)。3日龄攻毒组和7日龄攻毒组剖检可见泄殖腔膨大,肠道内容物稀薄,肝脏均出现水肿、质脆等病变;病理切片观察可见十二指肠肠绒毛顶端上皮细胞坏死,十二指肠绒毛不同程度脱落,部分肠腺坏死;部分肝细胞出现坏死,肝窦淤血,有炎性细胞浸润;其他脏器未见明显病变。对照组未见明显异常。X光检查可见3日龄攻毒组和7日龄攻毒组下喙、翅、腿等部位明显小于对照组,且胫骨长度远低于对照组。说明NGPV XZ-01株可使半番鸭的生长发育明显受阻,具有很强的致病性,且对半番鸭的影响随感染日龄的增加而减小。 展开更多
关键词 鸭短喙侏儒综合征 新型鹅细小病毒 徐州分离株 半番鸭 生长发育
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浙江省首例14型猪链球菌人源分离株鉴定及分子特征分析 被引量:3
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作者 朱水荣 李萍 +3 位作者 吕沈聪 杨章女 吴蓓蓓 张严峻 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期115-123,共9页
目的对浙江省首例14型猪链球菌菌株进行综合鉴定与分子分型特征研究。方法对目标菌株进行镜检、生化、血清学玻片凝集试验、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI TOF MS)鉴定,同时利用聚合酶链(PCR)技术检测该菌株链球菌属(tuf)、... 目的对浙江省首例14型猪链球菌菌株进行综合鉴定与分子分型特征研究。方法对目标菌株进行镜检、生化、血清学玻片凝集试验、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI TOF MS)鉴定,同时利用聚合酶链(PCR)技术检测该菌株链球菌属(tuf)、猪链球菌种(16S rRNA)、猪链球菌血清型基因以及毒力基因,另采用脉冲场凝胶电泳技术(pulsed-fieId gel electrophoresis,PFGE)、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)以及最小核心基因组群(minimum core genome groups,MCG群)方法分别对菌株进行分子分型检测。结果传统细菌学方法和质谱鉴定技术以及核酸检测均将这株人源分离株鉴定为14型猪链球菌;25种毒力基因检测,除salKR与89K PAI基因检测为阴性,其它均为阳性;分子分型检测该菌株为高致病性ST1及MCG Group1型,PFGE检测结果表明此菌株同浙江省主要流行毒力株在同一主分支,相似性达94.95%。结论本次检出14型人源猪链球菌强毒力株,属高致病基因型ST1/MCG Group1型菌株,属浙江省首次报道,今后应密切关注省内该型别菌株流行趋势。 展开更多
关键词 14型猪链球菌 散发人源分离株 鉴定 毒力基因 耐药基因 分子分型
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猫细小病毒洛阳分离株VP2蛋白原核表达及多克隆抗体制备 被引量:2
5
作者 王文婕 茹鹏辉 +5 位作者 郁川 杜付熙 陈松彪 尚珂 张春杰 程相朝 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1511-1521,共11页
【目的】研究旨在对猫细小病毒(Feline panleukopenia virus,FPV)洛阳分离株VP2蛋白进行原核表达和鼠源多克隆抗体制备。【方法】根据已公布的FPV VP 2基因序列(GenBank登录号:EU018143.1)设计1对特异性引物,以洛阳地区7例疑似FPV感染... 【目的】研究旨在对猫细小病毒(Feline panleukopenia virus,FPV)洛阳分离株VP2蛋白进行原核表达和鼠源多克隆抗体制备。【方法】根据已公布的FPV VP 2基因序列(GenBank登录号:EU018143.1)设计1对特异性引物,以洛阳地区7例疑似FPV感染猫粪便为样本提取DNA,对VP 2基因进行PCR鉴定及测序,利用Mega 11.0软件对VP 2基因进行遗传进化分析;应用在线软件预测分离株VP2蛋白结构特征并找出优势抗原表位,克隆VP2优势抗原(sVP2)并连接pET-32a(+)载体,构建pET-32a-sVP2重组质粒,转化大肠杆菌Rosetta(DE3)感受态细胞后进行诱导表达,对重组蛋白表达条件进行优化,并使用SDS-PAGE与Western blotting方法进行鉴定;将pET-32a-sVP2用镍柱亲和层析蛋白纯化后免疫BABL/c小鼠,制备多克隆抗体,采用ELISA法检测抗体效价。【结果】分离得到1株FPV,命名为LY-1。遗传进化分析发现,该毒株属于FPV-G2亚群,与北京株(GenBank登录号:MT270581)亲缘关系最近。生物信息学分析显示,VP2属于稳定膜内蛋白,无信号肽与跨膜区,在N-端具有丰富的B细胞抗原表位(1―800 bp,sVP2)。试验成功构建pET-32a-sVP2重组质粒并表达,SDS-PAGE显示重组蛋白分子质量约50 ku,主要以包涵体形式存在,在30℃、1 mmol/L IPTG诱导6 h蛋白表达量最佳;Western blotting结果表明,重组蛋白能与鼠抗His单克隆抗体发生特异性反应;ELISA结果表明,该重组蛋白抗体效价为1∶128000,能够较好地识别免疫原sVP2和原核表达VP2蛋白并发生特异性反应。【结论】本试验克隆获得FPV sVP2片段,并制备多克隆抗体,为进一步研究VP2在FPV复制和致病过程中的作用及建立诊断FPV方法提供参考。 展开更多
关键词 猫细小病毒(FPV) 洛阳分离株 VP 2基因 原核表达 多克隆抗体
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血清4型禽腺病毒广西分离株单克隆抗体的制备及鉴定 被引量:1
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作者 谢丽基 邓显文 +10 位作者 谢芝勋 韦悠 谢志勤 罗思思 李孟 黄娇玲 张民秀 范晴 王盛 曾婷婷 张艳芳 《中国兽药杂志》 2023年第10期9-15,共7页
为制备血清4型禽腺病毒(FAdV-4)广西分离株(FAdV-4-GX2018-005)的特异性单克隆抗体,将FAdV-4-GX2018-005作为免疫原免疫BALB/c小鼠后,取小鼠脾细胞与SP2/0细胞融合,利用间接ELISA法筛选阳性杂交瘤细胞株。利用阳性杂交瘤细胞株制备腹水... 为制备血清4型禽腺病毒(FAdV-4)广西分离株(FAdV-4-GX2018-005)的特异性单克隆抗体,将FAdV-4-GX2018-005作为免疫原免疫BALB/c小鼠后,取小鼠脾细胞与SP2/0细胞融合,利用间接ELISA法筛选阳性杂交瘤细胞株。利用阳性杂交瘤细胞株制备腹水并纯化得到单克隆抗体,利用ELISA和IFA鉴定单克隆抗体的特异性。结果表明,成功获得3株单克隆细胞株3A3、13A11和4D5。3株杂交瘤细胞株分泌的抗体,能与FAdV-4产生特异性反应,与其他血清型禽腺病毒(FAdV-1、FAdV-2、FAdV-3、FAdV-5、FAdV-6、FAdV-7、FAdV-8a、FAdV-8b、FAdV-9、FAdV-10和FAdV-11)不发生反应。本研究成功制备FAdV-4广西分离株单克隆抗体,为FAdV-4检测方法的建立奠定了良好基础。 展开更多
关键词 血清4型禽腺病毒 广西分离株 单克隆抗体
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腹泻患者空肠弯曲菌分离株的抗生素敏感性和PFGE分子分型特征分析
7
作者 王熙 曹健 +2 位作者 施京君 朱婷婷 肖建伟 《中文科技期刊数据库(引文版)医药卫生》 2023年第7期199-202,共4页
临床分析腹泻患者空肠弯曲菌分离株的抗生素敏感性和脉冲场凝胶电泳分子分型特征。方法 回顾性方法分析,选取本区哨点医院于2019年1月-2020年1月收治的425例腹泻者为研究对象,采用商品化药敏板进行空肠弯曲菌抗生素耐药性检测,并按照Pul... 临床分析腹泻患者空肠弯曲菌分离株的抗生素敏感性和脉冲场凝胶电泳分子分型特征。方法 回顾性方法分析,选取本区哨点医院于2019年1月-2020年1月收治的425例腹泻者为研究对象,采用商品化药敏板进行空肠弯曲菌抗生素耐药性检测,并按照PulseNet China弯曲菌PFGE分子分型进行脉冲场凝胶电泳实验及聚类分析。结果 425例腹泻粪便标本中,检测出空肠弯曲菌29株,阳性率6.82%。空肠弯曲菌对抗生素耐药率的依次分类:环丙沙星的耐药率(95.16%)、四环素耐药率(94.27%)、萘啶酸耐药率(92.55%)。29株空肠弯曲菌共分离出22种不同的带型。结论 腹泻患者空肠弯曲菌对抗生素有着较高耐药性,且脉冲场凝胶电泳分子分型呈现多态性分布。 展开更多
关键词 腹泻 空肠弯曲菌分离株 抗生素敏感性 脉冲场凝胶电泳 分子分型特征
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牛支原体贵州分离株P33基因的克隆及遗传进化分析 被引量:1
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作者 韩帅博 成虹松 +5 位作者 王婕 万芝灵 罗怡泓 盛伊果 牟真权 程振涛 《贵州畜牧兽医》 2023年第4期51-54,共4页
为了解牛支原体贵州分离株的遗传进化情况,对其P33基因进行PCR扩增,扩增产物克隆至pMD19-T载体,筛选阳性克隆质粒进行基因序列和同源性分析,构建遗传进化树。结果:牛支原体贵州株P33基因PCR产物长度约690 bp(命名为GZ-Mb),与湖北株HB080... 为了解牛支原体贵州分离株的遗传进化情况,对其P33基因进行PCR扩增,扩增产物克隆至pMD19-T载体,筛选阳性克隆质粒进行基因序列和同源性分析,构建遗传进化树。结果:牛支原体贵州株P33基因PCR产物长度约690 bp(命名为GZ-Mb),与湖北株HB0801、Hubei-1同源性为99.6%,且在同一进化分支。结论:牛支原体贵州株P33基因与湖北株同源性最高,亲缘关系最近。 展开更多
关键词 牛支原体 贵州分离株 P33基因 克隆 遗传进化
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海产品中副溶血性弧菌的分离、鉴定及与临床分离株的生化性状比较 被引量:9
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作者 宁喜斌 刘代新 张继伦 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期918-922,共5页
利用TCBS和科玛嘉两种选择性培养基从60份海产品中初筛得到27株疑似副溶血性弧菌,经生化鉴定,27株均为副溶血性弧菌,其中22株是从鲜活海产品中分离得到,5株从冷冻海产品中分离得到。进一步与临床上得到的32株副溶血性弧菌进行了四个特... 利用TCBS和科玛嘉两种选择性培养基从60份海产品中初筛得到27株疑似副溶血性弧菌,经生化鉴定,27株均为副溶血性弧菌,其中22株是从鲜活海产品中分离得到,5株从冷冻海产品中分离得到。进一步与临床上得到的32株副溶血性弧菌进行了四个特殊生化试验的比较,结果发现副溶血性弧菌临床分离株与海产品分离株在溶血、脲酶及枸橼酸盐利用3个生化试验上存在差异,而阿拉伯糖利用试验无差异,这为根据生化性状研究不同来源副溶血性弧菌提供基础。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 海产品分离株 临床分离株 生化性状
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3个猪链球菌2型四川分离株4个毒力因子基因序列测定与分析 被引量:5
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作者 蔡振鸿 范伟兴 +5 位作者 赵冉 何海权 王幼明 姜平 李晓成 黄保续 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期901-905,共5页
目的设计了特异性引物对3个致病性猪链球菌2型(Ss2)四川分离株4个主要毒力因子基因mrp、epf、sly和orf2分别进行了扩增,序列测定与分析结果表明3个Ss2四川分离株均存在4个毒力因子基因mrp、epf、sly和orf2,其核苷酸序列与1998年江苏分离... 目的设计了特异性引物对3个致病性猪链球菌2型(Ss2)四川分离株4个主要毒力因子基因mrp、epf、sly和orf2分别进行了扩增,序列测定与分析结果表明3个Ss2四川分离株均存在4个毒力因子基因mrp、epf、sly和orf2,其核苷酸序列与1998年江苏分离株9801及国外参考菌株的同源性均大于99.5%,提示3个四川分离菌株与1998年江苏流行的高毒力菌株可能具有共同的来源。 展开更多
关键词 猪链球菌2型 毒力因子 核苷酸序列测定 Ss2四川分离株 Ss2江苏分离株9801
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传染性支气管炎病毒中国和东南亚分离株的分子流行病学 被引量:6
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作者 蒋贻海 陈溥言 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期417-421,共5页
对 2 4个鸡传染性支气管炎病毒中国和东南亚分离株的 S1基因 5′端 (含 HVR 和 HVR )和 N基因 3′端进行了扩增和序列分析 ,通过与公开的其他毒株序列间的比较和分析 ,对分离毒株的分子流行病学进行了研究。结果表明 ,2 4个分离毒株分... 对 2 4个鸡传染性支气管炎病毒中国和东南亚分离株的 S1基因 5′端 (含 HVR 和 HVR )和 N基因 3′端进行了扩增和序列分析 ,通过与公开的其他毒株序列间的比较和分析 ,对分离毒株的分子流行病学进行了研究。结果表明 ,2 4个分离毒株分属于美洲、亚洲和欧洲 3个基因群。其中一些毒株形成一相对独立的亚洲基因群 ,提示 IBV在亚洲已存在相当长时间 ;另一些毒株则可能来源于欧洲和美洲或来源于不同毒株 (包括疫苗株 ) 展开更多
关键词 传染性支气管炎病毒 中国分离株 东南亚分离株 分子流行病学 S1基因 N基因 基因变异 鸡病毒
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猪繁殖与呼吸综合征病毒河南分离株ORF5基因的遗传变异分析
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作者 崔付文 李永峰 《河南畜牧兽医》 2023年第5期6-7,24,共3页
对来自河南省部分地区159份临床PRRS组织样品进行RT-PCR检测,并对阳性样品病毒ORF5扩增、测序和生物信息学分析。为河南省部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)分子流行病学提供了数据支撑,对于针对性PRRS防控和研制疫苗具有一定的参... 对来自河南省部分地区159份临床PRRS组织样品进行RT-PCR检测,并对阳性样品病毒ORF5扩增、测序和生物信息学分析。为河南省部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)分子流行病学提供了数据支撑,对于针对性PRRS防控和研制疫苗具有一定的参考意义。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 河南分离株 ORF5 遗传变异
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PubMLST数据库克罗诺杆菌中外分离株的分型比较 被引量:2
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作者 王小曼 赵炜 +1 位作者 李诗瑶 周帼萍 《中国酿造》 CAS 北大核心 2020年第4期165-170,共6页
为了解中国与全球其他地区克罗诺杆菌(Cronobacter)分离株的差异,从PubMLST数据库下载具有完整序列型(ST)的菌株信息进行分离源、种、序列型及克隆复合体(CC)分析,并深入分析国内外食品及临床分离株。结果显示,具有完整ST型的中国克罗... 为了解中国与全球其他地区克罗诺杆菌(Cronobacter)分离株的差异,从PubMLST数据库下载具有完整序列型(ST)的菌株信息进行分离源、种、序列型及克隆复合体(CC)分析,并深入分析国内外食品及临床分离株。结果显示,具有完整ST型的中国克罗诺杆菌分离株(907株)最多,来源主要是婴儿配方奶粉、香料和即食食品。克罗诺杆菌中国分离株具有高度遗传多样性,我国的食品分离株(580株)中,CC4和CC7型菌株占比较高;但我国及其他东亚和南亚国家都没有临床株的信息。我国分离株明确致病型信息与欧美国家的差异较大,仅ST256(1株)、ST60(2株)、ST83(2株)与新生儿脑膜炎相关,欧美国家则主要包括ST4、ST1、ST12、ST7,说明我国的克罗诺杆菌与其他国家地域的菌株在系统进化和毒力可能具有差异,或与克罗诺杆菌的感染对象-人种的差异有关。 展开更多
关键词 克罗诺杆菌 中国分离株 临床分离株 食品分离株 感染对象
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鹅副粘病毒分离株生物学特性的研究 被引量:44
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作者 丁壮 王承宇 +3 位作者 向华 潘玉民 于为民 邹啸环 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期390-391,共2页
鹅副粘病毒病是一种新发现的由副粘病毒引起的能引起不同年龄鹅发病、以消化系统损害为主的传染病。本研究对一野毒株 (NA_1)应用鸡胚传代、电镜形态学观察、红细胞凝集_红细胞凝集抑制试验、鹅体回归试验、实验免疫保护试验等进行了研... 鹅副粘病毒病是一种新发现的由副粘病毒引起的能引起不同年龄鹅发病、以消化系统损害为主的传染病。本研究对一野毒株 (NA_1)应用鸡胚传代、电镜形态学观察、红细胞凝集_红细胞凝集抑制试验、鹅体回归试验、实验免疫保护试验等进行了研究 ,并进行了三项毒力指标的测定。依据国际上判定新城疫病毒毒力的标准 ,NA_1毒株均具有与新城疫病毒速发型相似的毒力 ,属于强毒力的毒株。应用NA_1毒株制备的油乳剂灭活苗实验免疫雏鹅 。 展开更多
关键词 副粘病毒 分离株 生物学特性
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柯萨奇病毒A组16型中国分离株(Cox.A16 SHZH00-1)全基因组序列测定及分析 被引量:61
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作者 李琳琳 何雅晴 +4 位作者 朱俊萍 薛颖 朱雅芳 徐星晔 金奇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期217-222,共6页
对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7410bp,其中5′端非编码区(5′U... 对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7410bp,其中5′端非编码区(5′UTR)长为745bp,病毒基因组编码区全长6582个核苷酸,编码一个含2193个氨基酸残基的多聚蛋白,3′端非编码区长为83bp。Cox.A16SHZH00-1基因组的结构与Cox.A16亚洲地方株Tainan-5079-98(AF177911)十分相近,整个基因组的核苷酸同源性为97.5%,氨基酸同源性为98.8%;而与Cox.A16国际标准株G10(U05876)差别较大,两者核苷酸同源性仅为79.1%,氨基酸同源性为94.5%。Cox.A16SHZH00-1与两株肠道病毒71型SHZH03(AY465356)和BrCr(U22521)比较,核苷酸同源性均不超过80%。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组16型 基因组 手足口病 同源性 序列分析 中国分离株 儿童
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I群禽腺病毒江苏分离株(FAVI-JS)的分离鉴定 被引量:30
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作者 何秀苗 张科 +3 位作者 秦爱建 金文杰 刘岳龙 陈溥言 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期42-45,共4页
通过形态学、致细胞病变和序列比较等对一株疑为I群禽腺病毒江苏分离株FAVI_JS进行了鉴定 ,试验结果表明 :该病毒为球形、无囊膜、二十面体对称 ,直径为 70nm~ 80nm ;不具有凝集鸡、鸭、鹅红细胞的能力但可以凝集大鼠红细胞。在鸡胚肾... 通过形态学、致细胞病变和序列比较等对一株疑为I群禽腺病毒江苏分离株FAVI_JS进行了鉴定 ,试验结果表明 :该病毒为球形、无囊膜、二十面体对称 ,直径为 70nm~ 80nm ;不具有凝集鸡、鸭、鹅红细胞的能力但可以凝集大鼠红细胞。在鸡胚肾细胞 (CEK)上可致细胞变圆 ,折光性增强等病变 ;通过PCR方法扩增出的FAVI_JSL、R、ITR三个片段 ,经过测序分析并与GenBank上发表的属于血清I型的CELO病毒、FAV_1、FAV_A和血清 8型的禽腺病毒 (FAV_8)全基因组的相应序列比较 ,FAVI_JS与I群禽腺病毒各毒株在三个片段上同源性都很高 ,其中与血清I型的同源性高达 96 %以上 ,在根据对遗传上具有重要意义的ITR序列绘制的遗传进行树分析 ,FAVI_JS与Ⅲ群禽腺病毒EDS、Y81G4株明显属于不同的分支 ,而与群禽腺病毒 ,特别是与血清I型的禽腺病毒更接近 ,这些结果证明 。 展开更多
关键词 Ⅰ群禽腺病毒 江苏分离株 FAVI-JS 分离 鉴定 形态学 序列分析
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猪链球菌1998分离株病原特性鉴定 被引量:193
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作者 姚火春 陈国强 陆承平 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第2期67-70,共4页
对1998年江苏分离的3株猪源链球菌进行了鉴定,其形态、染色均符合链球菌的特点,具α或β溶血,生化试验结果不稳定。用国际通用的链球菌乳胶分型诊断液检测上述分离株,均不在其检测范围,即不属于链球菌兰氏分群的A~G群。但... 对1998年江苏分离的3株猪源链球菌进行了鉴定,其形态、染色均符合链球菌的特点,具α或β溶血,生化试验结果不稳定。用国际通用的链球菌乳胶分型诊断液检测上述分离株,均不在其检测范围,即不属于链球菌兰氏分群的A~G群。但它们凝集猪链球菌2型抗血清,人工接种兔有致病性。表明此次流行的猪败血症的病原不同于以往的C群链球菌,不是马腺疫链球菌兽疫亚种,而是属于R群的猪链球菌2型。 展开更多
关键词 链球菌 分离株 病原鉴定
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我国鸡传染性支气管炎病毒地方分离株生物学特性的研究 被引量:28
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作者 贺秀媛 刘胜旺 +3 位作者 王玮 刘丽玲 孔宪刚 王建华 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期349-353,共5页
从我国新疆维吾尔自治区某鸡场发病症状及病理变化疑似鸡传染性支气管炎的病鸡有出血点病变的腺胃组织中分离病毒 ,在 9~ 11日龄SPF鸡胚上连续传代 9次 ,通过病毒对鸡胚的致病作用、病毒在电镜下的形态观察、病毒在鸡胚中的增殖动态变... 从我国新疆维吾尔自治区某鸡场发病症状及病理变化疑似鸡传染性支气管炎的病鸡有出血点病变的腺胃组织中分离病毒 ,在 9~ 11日龄SPF鸡胚上连续传代 9次 ,通过病毒对鸡胚的致病作用、病毒在电镜下的形态观察、病毒在鸡胚中的增殖动态变化、病毒在CEF中的增殖特性、凝集鸡红细胞的特性以及动物回归试验等来研究我国鸡传染性支气管炎病毒地方流行株的生物学特性。结果表明 ,该毒株的第一代尿囊液对鸡胚无肉眼可见的致病作用 ,当继代到第 5代后 ,胚体严重病变 ;电镜观察该病毒为典型的冠状病毒 ;病毒在鸡胚中随着接种病毒时间的延长 ,其效价增高 ,96小时可达到 48小时的 1倍 ,该毒株可在CEF上生长 ,但不能形成明显的蚀斑 ;并且经 1%胰酶处理后可凝集鸡红细胞 ;鸡胚的第 4代尿囊液病毒回归动物体 ,可致鸡病变病死鸡肾脏病变尤为明显 ,呈典型的花斑肾 ,腺胃则未见肉眼可见的病变 ,接种鸡、同居鸡和对照鸡之间NDV疫苗免疫后其HI抗体水平无明显差异 ,但从发病症状来看 。 展开更多
关键词 传染性 支气管炎 病毒 地方分离株 生物学特性
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犬细小病毒分离株VP2基因的克隆与序列分析 被引量:23
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作者 杨玲 徐向明 +3 位作者 殷俊 宗卫峰 陈璐 李厚达 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 2002年第3期12-14,共3页
以犬细小病毒 (Canine parvovirus,CPV)扬州分离株病毒的 DNA为模板 ,根据基因库 CPV-d序列设计合成了VP2基因的 1对特异引物 ,进行聚合酶链式反应 ,扩增出约 1 .7kb的片段 ,按常规方法克隆进 p UC1 8载体 ,经 Eco R 和Sal 双酶切筛选... 以犬细小病毒 (Canine parvovirus,CPV)扬州分离株病毒的 DNA为模板 ,根据基因库 CPV-d序列设计合成了VP2基因的 1对特异引物 ,进行聚合酶链式反应 ,扩增出约 1 .7kb的片段 ,按常规方法克隆进 p UC1 8载体 ,经 Eco R 和Sal 双酶切筛选到阳性质粒 ,进一步对该片段进行序列分析。结果表明 :所扩增基因片段长度为 1 740 bp,与美国参考株 CPV-d (type 2 )、CPV-1 5 (type 2 a)、CPV-3 9(type 2 b)相比较 ,核苷酸同源性分别高达 99.5 %、99.7%、99.7%。 展开更多
关键词 细小病毒 分离株 VP2基因 克隆 序列分析
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肠道病毒ECHO_(13)中国分离株的基因特征 被引量:27
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作者 毛乃颖 许文波 +4 位作者 杨秀惠 刘中华 严延生 潘伟毅 张勇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期308-314,共7页
为研究ECHO13病毒中国分离株的分子特征及其与世界其它分离株之间的基因关系,对1998年、2000年从中国福建省分离到2株ECHO13病毒进行基因序列对比分析。2株病毒分别命名为Fujian98-1和Fujian00-1,用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出VP... 为研究ECHO13病毒中国分离株的分子特征及其与世界其它分离株之间的基因关系,对1998年、2000年从中国福建省分离到2株ECHO13病毒进行基因序列对比分析。2株病毒分别命名为Fujian98-1和Fujian00-1,用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出VP1蛋白编码基因全长861个核苷酸片段并进行序列测定,将2株E CHO13病毒的VP1序列与所有已发表的ECHO13病毒VP1基因全长进行同源性比较。结果显示,福建分离株之间核苷酸同源性为79 6%,氨基酸同源性为93 4%;与遗传距离最近的法国CF1089-91(AJ537604)毒株的核苷酸同源性分别为80%和88%,与代表株DelCarmen的核苷酸同源性分别为75 8%和77 9%。通过VP1基因分析,福建2株病毒均属于ECHO13病毒,与血清中和试验鉴定结果一致。下载所有已发表的ECHO13病毒VP1序列并构建进化树,发现福建2株病毒分属不同的分枝,提示这2株病毒来自不同的病毒传播链。进一步分析发现,整个E CHO13病毒可划分为3个不同的基因型:A、B和C基因型。福建Fujian98-1和Fujian00-1分别被划分在基因型B和C中,各基因型之间的核苷酸差异均大于20%。为验证该分型方法,将26株来自不同国家和时间的ECHO13病毒和2株福建分离ECHO13病毒部分VP1基因序列进行对比分析,建立进化树。结果显示,所有ECHO13病毒被分在A。 展开更多
关键词 肠道病毒 核苷酸 基因型 VP1基因 C基因 中国分离株 对比分析 同源性 遗传距离 划分
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