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优质抗旱小麦种质的筛选及功能基因检测
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作者 薛振宇 张康康 +9 位作者 张元元 闫强强 姚立蓉 张宏 孟亚雄 司二静 李葆春 马小乐 王化俊 汪军成 《中国农业科技导报(中英文)》 北大核心 2025年第1期35-49,共15页
为有效筛选优异抗旱小麦种质,以163份小麦种质资源为材料,对其高分子量麦谷蛋白亚基组成、萌发期和苗期的抗旱性进行分析,筛选优质抗旱种质资源,并对优质抗旱种质资源的已知功能基因/位点进行检测。结果表明,供试材料中鉴定出包含优质... 为有效筛选优异抗旱小麦种质,以163份小麦种质资源为材料,对其高分子量麦谷蛋白亚基组成、萌发期和苗期的抗旱性进行分析,筛选优质抗旱种质资源,并对优质抗旱种质资源的已知功能基因/位点进行检测。结果表明,供试材料中鉴定出包含优质面条亚基组合1/7+8/5+10和N/14+15/2+12的材料分别有11和1份,包含优质馒头亚基组合1/7+9/5+10和N/7+8/2+12的材料分别有5和53份。将萌发期和苗期抗旱性综合评价结果联合后,发现有14份抗旱性强的小麦种质。此外,结合14份抗旱种质的HMW-GS鉴定结果最终筛选出9份优质抗旱种质资源,分别为中41-42、陇育5号、陇麦079、兰天31号、92-47、绵麦367、西科麦531号、铜麦3号和临旱5322。经检测,9份优质抗旱材料均含有提高粒重基因以及抗赤霉病、条锈病和叶锈病的基因/位点,6份材料含有提高多酚氧化酶活性的基因Ppo2-D1,6份材料含有半矮化基因RHT-8,仅陇麦079含有抗旱基因TaSINA-2。以上结果为小麦育种提供了优异种质资源与必要的理论支撑。 展开更多
关键词 小麦 HMW-GS 干旱胁迫 功能基因/位点 优质
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微生物插入序列的多样性及其与功能基因的共现
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作者 钟文婧 苏建强 +1 位作者 李虎 周艳艳 《中国环境科学》 北大核心 2025年第4期2314-2322,共9页
基于ISfinder数据库,结合文献检索,对5812种插入序列(IS)的多样性及其与功能基因的共现关系进行了系统分析.研究表明,不同IS家族(IS family)在宿主中的分布以及与功能基因的共现特征存在差异.DDE转座酶类型IS占据主导地位,IS5和IS3家族... 基于ISfinder数据库,结合文献检索,对5812种插入序列(IS)的多样性及其与功能基因的共现关系进行了系统分析.研究表明,不同IS家族(IS family)在宿主中的分布以及与功能基因的共现特征存在差异.DDE转座酶类型IS占据主导地位,IS5和IS3家族涵盖的IS种类最多,而ISH6最少.IS广泛存在于细菌和古菌中,多个IS家族具有宿主特异性,仅发现于细菌或古菌.进一步分析发现IS与多种功能基因(如抗生素抗性、重金属抗性、应激抗性等)共现,显示出它们在环境适应和微生物抗性基因传播中的重要作用.部分IS具有与多种功能基因共现的特性,展现了更广泛的生态适应性;而另一些IS的共现基因则功能相对专一.实验验证IS在基因传播和宿主适应中的机制是未来研究重点.这不仅有助于理解微生物如何适应环境变化、应对选择压力,还能为抗生素抗性、病原体传播等公共卫生问题提供理论基础,从而为发展新的防控策略和生物技术应用奠定基础. 展开更多
关键词 插入序列 ISfinder数据库 多样性 功能基因 共现
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双氢青蒿素对新孢子虫感染雄性小鼠精子质量和生精功能基因的影响
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作者 赵芳琳 刘萌 +3 位作者 唐泽宇 赵健豪 李璐 贾立军 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第4期1796-1806,共11页
【目的】新孢子虫病是引起孕畜流产、死胎或新生儿运动障碍等临床症状的一种原虫病,目前尚无有效的药物防治该病。试验旨在确定双氢青蒿素对新孢子虫感染雄性小鼠精子质量和生精功能基因的影响作用,以期达到抗虫效果。【方法】以新孢子... 【目的】新孢子虫病是引起孕畜流产、死胎或新生儿运动障碍等临床症状的一种原虫病,目前尚无有效的药物防治该病。试验旨在确定双氢青蒿素对新孢子虫感染雄性小鼠精子质量和生精功能基因的影响作用,以期达到抗虫效果。【方法】以新孢子虫感染BALB/c雄性小鼠模型为研究对象,进行双氢青蒿素灌胃给药,给药剂量为0.2 g/kg,连续给药7 d,同时设置空白对照组和模型组。给药后检测雄性小鼠的生殖器官指数和精子质量,采用改良巴氏染色法观察精子形态变化。在给药第7、14、21、35、42天分别检测生精功能基因C-kit、Plzf、Sycp3、Stra8的表达情况。在给药第7天,应用流式细胞术检测生精细胞的凋亡情况。【结果】试验成功建立了新孢子虫感染雄性小鼠模型,与空白对照组相比,模型组小鼠生殖器官指数、精子密度、精子活力均极显著降低(P<0.01),精子畸形率极显著升高(P<0.01),C-kit、Plzf、Sycp3、Stra8基因表达量显著或极显著降低(P<0.05;P<0.01),生精细胞凋亡率极显著升高(P<0.01);双氢青蒿素组小鼠生殖器官指数(除第21天外)、精子密度、精子活力均极显著或显著降低(P<0.01;P<0.05),精子畸形率极显著升高(P<0.01),Plzf、C-kit、Sycp3和Stra8基因表达量均降低,部分时间点达显著水平(P<0.05),生精细胞凋亡率极显著升高(P<0.01)。与模型组相比,双氢青蒿素组小鼠生殖器官指数显著或极显著升高(P<0.05;P<0.01),精子密度增加,精子活力增强,精子畸形率极显著降低(P<0.01),C-kit、Plzf、Sycp3和Stra8基因表达量均升高,部分时间点达显著或极显著水平(P<0.05;P<0.01),生精细胞凋亡率极显著降低(P<0.01)。【结论】双氢青蒿素能够调节雄性小鼠生殖器官指数,提高精子质量,减少畸形精子的产生,提高生精功能基因Sycp3、C-kit、Plzf、Stra8的表达量,改善新孢子虫对雄性小鼠精子质量和生精功能基因的损伤。本研究结果为抗新孢子虫有效药物的研究提供了参考依据。 展开更多
关键词 新孢子虫 双氢青蒿素 生殖器官指数 精子质量 生精功能基因
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小麦新品种郑大181优异功能基因组成解析
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作者 关攀锋 崔东洁 +11 位作者 马香花 马若男 李兵 池青 孙昊 许航博 张世洁 朱育攀 吴玉萍 康欣娜 张学斌 焦浈 《山西农业科学》 2025年第2期101-112,共12页
郑大181是郑州大学农学院/河南省离子束绿色农业生物工程重点实验室利用有性杂交结合离子束诱变、分子标记辅助选择、多年系谱选育而成的国审小麦新品种。为解析郑大181控制重要性状的功能基因并挖掘优异等位变异,利用58个与矮秆、产量... 郑大181是郑州大学农学院/河南省离子束绿色农业生物工程重点实验室利用有性杂交结合离子束诱变、分子标记辅助选择、多年系谱选育而成的国审小麦新品种。为解析郑大181控制重要性状的功能基因并挖掘优异等位变异,利用58个与矮秆、产量、品质、适应性、抗病性、抗逆性等重要农艺性状基因相关的功能分子标记对郑大181进行基因型检测。结果表明,郑大181携带Rht2、Rht4、Rht12、Rht25等多个矮秆基因,其协同作用可能是该品种半矮秆株型及强抗倒伏性的遗传基础。在15个粒质量、粒数等产量基因中,郑大181聚合了AWN、TaGS2-A1、TaGS2-B1、TaSus2-2B、TaCWI-4A、TaGW2-6B、TaTGW7、TaSus1-7A等8个优异等位基因,占比53.3%;这些优异位点的聚合可能是其在各项田间试验中表现丰产的重要原因。在品质相关基因方面,郑大181只在Glu-A3d、Glu-A3g、Glu-B3f位点表现为高分子量麦谷蛋白亚基类型,与高分子量麦谷蛋白亚基SDS-PAGE检测结果一致,其亚基组成为Null、7+9和5+10,符合中筋小麦分类标准。在适应性与抗性基因方面,春化基因Vrn-A1和Vrn_5A为冬性类型等位变异,Vrn-D3为春性类型,而光周期基因TaELF3表现为晚开花类型;同时郑大181携带抗穗发芽基因Vp1B1、抗旱基因TaDreb-B1、抗条锈基因Sr36和抗叶锈基因Lr34;而对于赤霉病,郑大181属于感病类型。综上,郑大181通过聚合矮化、高产、优质、多抗等优异功能基因,表现出综合农艺性状优势。 展开更多
关键词 小麦 功能基因 分子标记 郑大181 产量 品质 抗逆性
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复合菌剂对厨余垃圾堆肥中有机质降解及酶活性、功能基因的影响
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作者 陈硕夫 黄红丽 +4 位作者 徐峥勇 刘艳 赵儒乐 朱逸纯 刘萍 《环境工程技术学报》 北大核心 2025年第1期297-307,共11页
为探明不同时期接种复合菌剂对水稻秸秆与厨余垃圾共堆肥中有机质降解、微生物酶活性及功能基因的影响,进行了为期38 d的秸秆与厨余垃圾共堆肥试验。结果表明:在堆肥前期,一次发酵阶段接种复合菌剂的处理组(A)中微生物酶活性和淀粉、蛋... 为探明不同时期接种复合菌剂对水稻秸秆与厨余垃圾共堆肥中有机质降解、微生物酶活性及功能基因的影响,进行了为期38 d的秸秆与厨余垃圾共堆肥试验。结果表明:在堆肥前期,一次发酵阶段接种复合菌剂的处理组(A)中微生物酶活性和淀粉、蛋白质等有机质的降解率明显提高,碳降解基因丰度更高。在堆肥后期,二次发酵阶段接种复合菌剂的处理组(B)中淀粉、蛋白质、纤维素和油脂的降解率均高于空白组、A组,并且第25天时蛋白酶活性和纤维素酶活性分别提升了14.14%、31.01%。通过Pearson相关分析得出温度对蛋白酶、纤维素酶活性的影响较大,且有机质(OM)与淀粉降解(P<0.01)、油脂降解(P<0.01)和蛋白质降解(P<0.05)呈正相关,说明堆肥过程中碳氮元素的变化显著,并且存在大量的蛋白质发生降解。编码纤维二糖脱氢酶的cdh基因丰度不仅与纤维素降解存在显著相关(P<0.01),同时与淀粉、油脂降解也显著相关(P<0.01),说明cdh基因丰度可能是厨余垃圾堆肥过程中与碳降解相关最为密切的基因。研究显示,在不同时期接种复合菌剂均能提升秸秆与厨余垃圾共堆肥中微生物酶活性、碳降解基因丰度,其中一次发酵阶段接种复合菌剂对堆肥中有机质的降解具有更好的促进作用。 展开更多
关键词 秸秆 厨余垃圾 好氧堆肥 复合菌剂 微生物酶活性 功能基因
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岩溶湖泊微生物群落结构及功能基因预测
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作者 梁丽营 杨景媛 +5 位作者 牟春霞 杜军 欧宇翔 李炫漫 刘细祥 刘艳 《安全与环境学报》 北大核心 2025年第2期767-778,共12页
为揭示岩溶泉上覆水的水化学特征,总结分析微生物多样性、群落组成特征及潜在功能基因预测结果,挖掘微生物与环境因子的相互作用关系,采集灵水岩溶泉的上覆水,并采用地球水化学法、16S rRNA基因的高通量测序法测定分析样品中的水化学特... 为揭示岩溶泉上覆水的水化学特征,总结分析微生物多样性、群落组成特征及潜在功能基因预测结果,挖掘微生物与环境因子的相互作用关系,采集灵水岩溶泉的上覆水,并采用地球水化学法、16S rRNA基因的高通量测序法测定分析样品中的水化学特征、微生物多样性、群落结构特征和测定功能基因。结果显示,在细菌域中,检测出40个门、106个纲、251个目、424个科、822个属,灵水泉上覆水不同采样点中优势菌门、菌属种类相似,但相对丰度有所差异。在门水平上,排名前3的优势菌门为变形菌门、厚壁菌门、放线菌门。冗余分析(Redundancy analysis,RDA)分析表明,NO3-和Chl a是显著影响灵水泉微生物群落组成的环境因子。通过PICRUSt功能预测分析发现了6个一级功能和45个二级功能,表明细菌群落的潜在功能代谢比较活跃。灵水泉中存在丰富的新陈代谢基因,其中氨基酸代谢基因最高,其次为碳水化合物代谢基因,辅助因子和维生素的代谢基因丰度相对较高。代谢功能分析共获得182条代谢途径,灵水岩溶泉细菌代谢途径丰富,主要为能量代谢途径、碳水化合物代谢途径,通过参与生态系统中的能量和碳循环,有益于水体健康。研究阐述了岩溶湖泊中微生物群落的分布及其代谢途径,为岩溶湖泊水生态系统的健康发展提供了基础数据和科学依据。 展开更多
关键词 环境工程学 岩溶泉水 微生物多样性 群落结构 16S rRNA高通量测序 功能基因
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疥螨功能基因及其应用的研究进展
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作者 郭茂川 何冉 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第2期492-500,共9页
疥螨宿主广泛,呈全球分布,疥螨感染可威胁宿主健康,并对养殖业造成严重经济损失。目前疥螨致病机制尚未明确,疥螨感染仍无理想的诊治措施,而研究疥螨基因功能对解决这一难题意义重大。近年来,随着分子生物学的不断发展,促进了疥螨基因... 疥螨宿主广泛,呈全球分布,疥螨感染可威胁宿主健康,并对养殖业造成严重经济损失。目前疥螨致病机制尚未明确,疥螨感染仍无理想的诊治措施,而研究疥螨基因功能对解决这一难题意义重大。近年来,随着分子生物学的不断发展,促进了疥螨基因功能和致病机制的深入研究,为疥螨研究奠定了数据基础。本文主要综述迄今疥螨重要功能基因及其在防治应用上的研究进展,以期为从分子水平上深入了解疥螨致病机制、寻找高效诊治手段提供新思路。 展开更多
关键词 疥螨 功能基因 防治 进展
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优质食味粳稻香软米新品种云粳37号选育及功能基因优势等位基因型分析 被引量:3
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作者 赵国珍 陈于敏 +3 位作者 吴志刚 刘慰华 刘似玉 刘家稳 《中国稻米》 北大核心 2024年第1期93-97,共4页
云粳37号是以具有香味且表现高产稳产的粳稻品种云粳26号作母本,以持有低直链淀粉含量调控基因Wx^(y37)且稻米食味品质优异、耐寒性和抗病性强的粳稻软米品种银光作父本杂交育成,具有食味品质优异、高产、稳产、耐寒、抗病等优良性状。... 云粳37号是以具有香味且表现高产稳产的粳稻品种云粳26号作母本,以持有低直链淀粉含量调控基因Wx^(y37)且稻米食味品质优异、耐寒性和抗病性强的粳稻软米品种银光作父本杂交育成,具有食味品质优异、高产、稳产、耐寒、抗病等优良性状。通过对云粳37号及双亲全基因组重测序和功能基因优势等位基因型分析发现,云粳37号遗传了双亲的多个优势等位基因,如香味基因Badh2、抗稻瘟病基因Pi35、调控低直链淀粉含量基因Wx^(y37)、耐冷基因CTB4a、抗旱基因OsPP15和抗白叶枯病基因Xa26等,是目前云南省影响较大的粳稻品种。 展开更多
关键词 粳稻 云粳37号 优质食味 功能基因 Wx^(y37)
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从品种特性到功能基因组:双峰驼基因组学研究进展 被引量:1
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作者 明亮 Tuyatsetseg Jambal 吉日木图 《家畜生态学报》 北大核心 2024年第2期1-8,共8页
双峰驼是亚洲中部戈壁沙漠地区重要的畜种之一,具有耐寒、耐热、耐饥饿、免疫系统较强等独特的生物学特性,受到国内外学者的广泛关注。近年来,随着生物测序技术的快速发展,双峰驼全基因组测序及其功能基因组的研究相继发布。该文归纳了... 双峰驼是亚洲中部戈壁沙漠地区重要的畜种之一,具有耐寒、耐热、耐饥饿、免疫系统较强等独特的生物学特性,受到国内外学者的广泛关注。近年来,随着生物测序技术的快速发展,双峰驼全基因组测序及其功能基因组的研究相继发布。该文归纳了不同家养双峰驼品种特性,总结了双峰驼全基因组研究现状,回顾了双峰驼起源驯化历程,并重点介绍了双峰驼沙漠适应能力和免疫相关功能基因的研究进展,为全面了解双峰驼独特的生物学特性和遗传改良提供理论参考。 展开更多
关键词 双峰驼 品种特性 基因组测序 功能基因
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利用宏转录组学技术分析酸马奶发酵过程中活性微生物功能基因表达的变化特征
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作者 布仁其其格 董超 +5 位作者 包玉龙 红梅 张三润 李少华 芒来 马春丽 《畜牧与饲料科学》 2024年第4期1-9,共9页
[目的]探究酸马奶不同发酵时期活性微生物功能基因表达的变化特征。[方法]收集发酵初期(12 h)、中期(48 h)、后期(96 h)酸马奶样品,构建宏转录组文库,进行RNA-Seq高通量测序;对测序数据进行组装和功能注释后,分析差异表达基因,确定GO和K... [目的]探究酸马奶不同发酵时期活性微生物功能基因表达的变化特征。[方法]收集发酵初期(12 h)、中期(48 h)、后期(96 h)酸马奶样品,构建宏转录组文库,进行RNA-Seq高通量测序;对测序数据进行组装和功能注释后,分析差异表达基因,确定GO和KEGG信号通路中显著差异表达基因的静态富集。[结果]3个发酵时期酸马奶样品的宏转录组高通量测序共产生12.17 GB的高质量短序列。序列组装后进行数据分析,发现酸马奶发酵过程中代谢过程相关基因表达占主导地位。差异表达基因的筛选与分析显示,发酵前期、中期、后期酸马奶样品间两两相比,下调表达基因数量多于上调表达基因数量。GO功能富集分析显示,发酵初期与中期酸马奶样品间差异表达基因高度富集的GO条目是细胞过程、代谢过程、有机环状化合物结合、杂环化合物结合;发酵中期与后期样品间差异表达基因高度富集的GO条目是细胞过程、细胞大分子代谢过程;发酵初期与后期样品间差异表达基因高度富集的GO条目主要涉及细胞过程、有机物质代谢过程、核苷结合、核糖核苷结合、嘌呤核苷酸结合。KEGG通路富集分析显示,发酵前期与中期酸马奶样品间仅有1条差异表达基因显著富集的信号通路,即核糖体通路;发酵中期与后期酸马奶样品间差异表达基因显著富集的信号通路包括醚酯代谢、氨基苯甲酸降解、mRNA监测途径、类固醇生物合成;发酵前期与后期酸马奶样品间差异表达基因显著富集的信号通路包括类固醇生物合成、氨基苯甲酸降解、mRNA监测途径、核糖体、乙苯降解。[结论]酸马奶发酵过程中涉及活性微生物多种功能基因的差异表达,不同发酵时期活性微生物功能基因的差异表达呈现动态变化。研究结果为深入了解酸马奶发酵机制、优化酸马奶发酵工艺提供了参考。 展开更多
关键词 酸马奶 发酵 宏转录组 功能基因
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青藏高原灌丛土壤碳氮含量及其相关功能基因分布特征 被引量:6
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作者 李传虹 张林 +5 位作者 刘四义 韩丽丽 姚保民 申聪聪 郝志鹏 张丽梅 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期392-404,共13页
在微生物的代谢活动下,土壤中有机态碳氮化合物矿化分解释放矿质养分和二氧化碳,深刻影响着自然生态系统土壤碳、氮等元素的循环转化、土壤的养分供应和有机质的更新,并对地上植被的演替和分布有极为重要的意义。青藏高原灌丛面积分布广... 在微生物的代谢活动下,土壤中有机态碳氮化合物矿化分解释放矿质养分和二氧化碳,深刻影响着自然生态系统土壤碳、氮等元素的循环转化、土壤的养分供应和有机质的更新,并对地上植被的演替和分布有极为重要的意义。青藏高原灌丛面积分布广泛,地形和气候条件复杂,但目前对灌丛分布地区土壤碳氮含量、矿化作用强度及其影响因素等的认识较少。研究结合土壤理化分析和高通量定量PCR(quantitative microbial element cycling, QMEC)技术研究了青藏高原喜马拉雅山-冈底斯山地区不同类型灌丛土壤碳氮含量、碳氮矿化速率和相关功能基因的分布特征及其与植被、气候和土壤因子间的耦联关系。结果表明,不同类型灌丛土壤的有机碳、全氮含量、CO_(2)释放速率、净氮矿化速率、碳氮矿化基因的丰度有显著差异。其中,位于青藏高原东南部的雪层杜鹃和香柏灌丛分布区土壤有机碳和全氮含量、CO_(2)释放速率、净氮矿化速率显著高于位于中西部的变色锦鸡儿、金露梅和砂生槐灌丛地区,并与年平均降雨量显著正相关。然而,碳、氮矿化基因丰度分布趋势与之相反,在雪层杜鹃和香柏灌丛分布区丰度显著低于中西部的三类灌丛,且与年平均降雨量呈显著负相关,但与土壤pH呈显著正相关。同时pH与年平均降水量、湿润指数和土壤含水率均为显著负相关。这些结果表明降水可通过增加盐基离子淋溶,使土壤盐基饱和度下降、氢饱和度增加,引起土壤酸化,进而影响碳氮循环过程,导致不同类型灌丛土壤碳氮元素的赋存及其周转速率差异。同时,碳、氮矿化相关功能基因丰度各类群间呈现显著的正相关关系,表明土壤碳氮循环过程间紧密的耦联关系。这些结果为准确评估青藏高原土壤碳、氮库及其动态平衡提供了重要信息和参考依据。 展开更多
关键词 青藏高原 高寒灌丛 碳氮循环 碳氮矿化功能基因 高通量定量PCR(QMEC)
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基于宏基因组技术分析自然发酵羊肉香肠中微生物多样性及挥发性风味功能基因 被引量:2
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作者 牛茵 吴双慧 +3 位作者 何济坤 蔡自建 尤天棋 陈娟 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第2期139-148,共10页
利用宏基因组技术测定自然发酵过程中羊肉香肠的微生物群落演替,并运用直系同源蛋白分组比对、京都基因与基因组百科全书和碳水化合物活性酶数据库对挥发性风味物质代谢途径、参与代谢的微生物和酶进行注释与分析。结果发现,羊肉香肠样... 利用宏基因组技术测定自然发酵过程中羊肉香肠的微生物群落演替,并运用直系同源蛋白分组比对、京都基因与基因组百科全书和碳水化合物活性酶数据库对挥发性风味物质代谢途径、参与代谢的微生物和酶进行注释与分析。结果发现,羊肉香肠样品中流感嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌、酒类酒球菌等是发酵过程的优势菌种,样品发酵至14d腐生葡萄球菌与马胃葡萄球菌相对丰度达到最大值(16.52%与10.53%)。在发酵0、5、14d和26d样品中,发酵5d样品注释到的基因数最多,发酵过程中碳水化合物代谢和氨基酸代谢是注释最多的代谢途径,糖苷水解酶与糖基转移酶是数量最多的碳水化合物酶。有167个基因参与氨基酸代谢所需酶的编码,碳水化合物代谢途径所需酶由217个基因编码,脂肪酸代谢途径中共有92个基因参与了相关酶的编码,参与3条代谢途径的酶注释到的微生物主要是葡萄球菌属、明串珠菌属、假单胞菌属、嗜冷杆菌属、弧菌属等,发酵14d样品中3条代谢途径的大部分酶丰度达到最大值。研究结果对于解析羊肉香肠中微生物的动态变化以及挥发性风味物质的形成机理具有重要的参考价值。 展开更多
关键词 羊肉香肠 基因组学 微生物多样性 挥发性风味物质 代谢途径 功能基因
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林火强度对兴安落叶松林土壤氮循环功能基因的影响 被引量:1
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作者 舒洋 陈金平 +7 位作者 丁兆华 李航 赵鹏武 周梅 贾文杰 张轶超 张国臣 魏江生 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期726-735,共10页
为了探究林火强度对土壤氮素循环的影响,本研究以内蒙古大兴安岭兴安落叶松林火烧迹地为研究对象,通过DNA提取及定量PCR分析测定了不同火烧强度样地内土壤氮循环功能基因丰度以及土壤基本的理化性质。结果表明:固氮nifH功能基因丰度随... 为了探究林火强度对土壤氮素循环的影响,本研究以内蒙古大兴安岭兴安落叶松林火烧迹地为研究对象,通过DNA提取及定量PCR分析测定了不同火烧强度样地内土壤氮循环功能基因丰度以及土壤基本的理化性质。结果表明:固氮nifH功能基因丰度随着火烧强度的增加而减少,而硝化amoA-AOA和amoA-AOB功能基因丰度呈相反变化趋势;反硝化nirS,nirK和nosZ功能基因丰度在重度火烧后显著降低,在轻度火烧后显著升高。火烧同样也会对土壤基本理化性质产生显著影响,RDA分析和Pearson相关性分析表明土壤氮循环功能基因与土壤理化因子之间存在密切的联系,有机碳、速效磷、全氮含量和pH值是影响火后土壤氮循环功能基因差异变化的主要因子。本研究为火干扰对土壤氮素循环的影响机制和火后植被快速更新提供数据支撑。 展开更多
关键词 火烧强度 氮循环功能基因 兴安落叶松 土壤养分循环
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人工湿地各组分氮素削减定量及功能基因分析 被引量:2
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作者 高静湉 汤世科 +3 位作者 刘哲铭 张鹏 于凤萍 李卫平 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期654-664,共11页
为探讨人工湿地各组分氮素削减贡献度及微生物脱氮机理,本研究构建6组(3组无植物对照)不同类型人工湿地系统,3组有植物人工湿地基质分别为陶粒+煤渣、陶粒+沸石、沸石+煤渣,探究其对包头南海湖水中氮素的去除效果;采用氮稳定同位素示踪... 为探讨人工湿地各组分氮素削减贡献度及微生物脱氮机理,本研究构建6组(3组无植物对照)不同类型人工湿地系统,3组有植物人工湿地基质分别为陶粒+煤渣、陶粒+沸石、沸石+煤渣,探究其对包头南海湖水中氮素的去除效果;采用氮稳定同位素示踪技术,量化植物、基质和微生物在人工湿地氮去除中的贡献度;并利用高通量测序技术分析人工湿地系统中微生物的群落结构及氮代谢功能基因。结果表明:陶粒+煤渣有植物组人工湿地氮去除效果最佳,对TN、NH_(4)^(+)-N、NO_(3)^(-)-N、NO_(2)^(-)-N的去除率分别为(41.18±2.61)%、(50.44±2.63)%、(40.93±2.32)%、(74.34±1.97)%。^(15)N示踪发现,植物、基质和微生物对人工湿地系统NO_(3)^(-)-N去除的贡献率分别为27.74%、48.43%和23.83%。高通量测序和PICRUSt2功能预测分析结果表明,植物对微生物群落组成和代谢途径有显著影响。在植物根部样本中,优势菌门为Proteobacteria,其大部分菌属均参与了氮代谢,在生物脱氮过程中发挥重要的作用。有植物人工湿地系统基质中微生物的nir S基因、植物根系的nir K基因丰度明显增加,植物有效促进了人工湿地系统中微生物的反硝化作用。 展开更多
关键词 人工湿地 氮同位素 微生物群落 氮代谢 功能基因
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CRISPR/Cas9基因编辑技术在羊育种功能基因验证中的应用研究进展 被引量:3
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作者 闫晓敏 李文泽 +5 位作者 龚高 严晓春 苏奕忻 张露丹 张嘉欣 苏蕊 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第1期29-35,53,共8页
基因编辑技术是一种对目的基因进行特定修饰的技术,被广泛应用于生物育种、疾病模型构建等研究领域。CRISPR/Cas9系统由重复和间隔单元组成的CRISPR阵列和一个Cas基因座位组成,能够对生物体性状进行目的基因定点编辑,具有简单、精确且... 基因编辑技术是一种对目的基因进行特定修饰的技术,被广泛应用于生物育种、疾病模型构建等研究领域。CRISPR/Cas9系统由重复和间隔单元组成的CRISPR阵列和一个Cas基因座位组成,能够对生物体性状进行目的基因定点编辑,具有简单、精确且高效的特点。CRISPR/Cas9基因编辑技术通过引入基因敲除、基因敲入、缺失、点突变和单核苷酸突变等不同形式的修饰广泛应用于畜禽的基因编辑,以研究畜禽关键基因功能,从而加速性状改良。相较于猪、鸡等其他畜禽,CRISPR/Cas9技术对羊的研究相对滞后。文章重点阐述了CRISPR/Cas9基因编辑技术在羊育种功能基因验证中的应用,对其在产肉性状、纤维性状、泌乳性状和人类疾病模型等方面的应用研究进展及前景进行了简要概述,以期为我国羊产业的可持续发展提供参考。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9系统 基因编辑技术 功能基因验证 山羊 绵羊
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土壤含水率对豫中植烟土壤微生物群落多样性及氮循环功能基因丰度的影响 被引量:2
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作者 刘威 赵园园 +1 位作者 陈小龙 史宏志 《中国农业科技导报》 CSCD 北大核心 2024年第1期214-225,共12页
为揭示豫中典型浓香型烤烟产区植烟土壤氮素矿化动态变化、土壤微生物多样性以及氮素循环功能基因对水分条件的响应特征,通过室内培养法研究50%(H-50%)、65%(H-65%)和80%(H-80%)持水量条件下,河南许昌植烟土壤细菌和真菌群落功能多样性... 为揭示豫中典型浓香型烤烟产区植烟土壤氮素矿化动态变化、土壤微生物多样性以及氮素循环功能基因对水分条件的响应特征,通过室内培养法研究50%(H-50%)、65%(H-65%)和80%(H-80%)持水量条件下,河南许昌植烟土壤细菌和真菌群落功能多样性的差异。结果表明,H-65%处理土壤的无机氮矿化量及矿化速率均高于其他处理。在土壤细菌中,变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、厚壁菌门(Firmicutes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)为优势菌门(相对丰度>3%),其中,H-80%处理中变形菌门的相对丰度显著高于其他处理,而厚壁菌门的相对丰度显著低于其他处理;H-50%处理中放线菌门、绿弯菌门的相对丰度显著高于其他处理。在土壤真菌中,子囊菌门(Ascomycota)占土壤真菌总OTU(operational taxonmic units)数的90%以上,其相对丰度随土壤含水率增加呈倒“V”的变化趋势。LEfSe(LDA effect size)分析结果表明,各处理在细菌属水平共检测出6种活性生物标志物(LDA值>3.5)。细菌群落具有丰富的功能多样性,一级功能层表现为代谢方面较活跃,二级功能层的功能基因丰度在不同含水率条件下发生明显变化;与固氮过程相关的固氮酶基因nifK、nifD、nifH的相对丰度在不同处理中表现为H-50%>H-65%>H-80%,反硝化过程相关基因norB、nirK、nosZ的相对丰度均在H-65%处理最高。综合来看,合理调控土壤含水率可以有效调节豫中烟区土壤氮素矿化动态、土壤微生物群落功能多样性以及氮循环相关功能基因的丰度。 展开更多
关键词 氮素矿化 土壤含水率 氮素循环 功能基因 土壤微生物群落结构
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油菜功能基因组学研究进展及其育种应用 被引量:1
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作者 关志林 顾建伟 +3 位作者 焦禹顺 夏瑞 刘克德 洪登峰 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1187-1202,共16页
油菜是我国食用植物油的主要来源之一,兼有饲用、菜用、蜜用、观光、盐碱地改良和工业等多种用途。随着基因组测序、基因分型和表型鉴定技术的快速发展和广泛应用,油菜重要育种目标性状相关基因的挖掘与功能研究进展迅速。本文总结了油... 油菜是我国食用植物油的主要来源之一,兼有饲用、菜用、蜜用、观光、盐碱地改良和工业等多种用途。随着基因组测序、基因分型和表型鉴定技术的快速发展和广泛应用,油菜重要育种目标性状相关基因的挖掘与功能研究进展迅速。本文总结了油菜重要性状的功能基因组学研究进展,综述了目前定位及克隆的油菜产量、品质、开花期、株型和抗性等重要农艺性状的关键基因及功能,讨论了其在油菜分子设计育种中的应用价值和利用策略,将为更高效地培育油菜优良品种提供有益参考。 展开更多
关键词 油菜 功能基因 基因 育种 农艺性状
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植物抗旱功能基因研究进展 被引量:1
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作者 杨翠苹 段俊枝 +1 位作者 燕照玲 卓文飞 《现代农业科技》 2024年第6期157-161,172,共6页
干旱会严重影响植物生长发育,甚至降低作物产量和品质。为了应对干旱胁迫,植物体内会有大量基因被诱导表达,以适应或抵御干旱胁迫,其中功能基因是干旱胁迫调控通路的终端,直接起保护作用。功能基因主要包括渗透调节物质合成相关基因、... 干旱会严重影响植物生长发育,甚至降低作物产量和品质。为了应对干旱胁迫,植物体内会有大量基因被诱导表达,以适应或抵御干旱胁迫,其中功能基因是干旱胁迫调控通路的终端,直接起保护作用。功能基因主要包括渗透调节物质合成相关基因、活性氧清除相关基因、保护细胞免受水分胁迫伤害的功能蛋白基因等。本文从上述三方面综述了植物抗旱功能基因的研究进展,以期为通过基因工程技术改良植物抗旱性、培育抗旱品种提供参考。 展开更多
关键词 植物 抗旱 调节基因 功能基因 基因工程
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缓释肥对木薯根际土壤真菌和C、N、P、S功能基因动态的影响
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作者 赵鑫鑫 韦云东 +6 位作者 陈蕊蕊 周时艺 郑华 马崇熙 徐钏 李军 卢赛清 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期914-926,共13页
【目的】研究木薯缓释肥对根际土壤真菌和C、N、P、S功能基因动态的影响。【方法】开展木薯田间试验,设置3个处理:不施肥(T1)、双膜缓释肥C2基施(T2)和植后34 d追施(T3)。在植后77、104、134 d采集根际和非根际土样,测定高通量(Illumina... 【目的】研究木薯缓释肥对根际土壤真菌和C、N、P、S功能基因动态的影响。【方法】开展木薯田间试验,设置3个处理:不施肥(T1)、双膜缓释肥C2基施(T2)和植后34 d追施(T3)。在植后77、104、134 d采集根际和非根际土样,测定高通量(Illumina Miseq PE300)真菌(ITS rRNA)多样性,C、N、P、S共72个(含总DNA)功能基因的copies(基因芯片技术)和土壤速效养分(仅用于相关分析)。【结果】(1)植后104 d根际土壤被孢霉纲、银耳纲、圆盘菌纲相对丰度均为T2<T1;植后134 d,根际土壤散囊菌纲为T2>T1。T2散囊菌纲(134 d)、T3丛赤壳科(77 d)和T3粪壳菌纲(104 d)在根际相对富集。T1根际被孢霉纲相对丰度的时间大小顺序为134 d<104 d;T2根际散囊菌纲和粪壳菌纲均为134 d>77 d;T3根际的球囊菌纲为104 d>77 d。(2)Sobs、ACE、Chao1指数在T1(104 d)、T2(104 d)和T3(134 d)根际分别显著或极显著大于非根际。根际土壤Shannon指数在植后77 d为T1<T2和T3,T1和T2的时间大小顺序分别为104 d>77 d和104 d<77 d。土壤Simpson指数的大小顺序为T1根际(77 d)大于T1非根际(77 d)、T1根际(104 d)、T2根际(77 d)和T3根际(77 d)。(3)LEfSe分析结果表明,处理间根际相对富集1个纲、1个目和2个科。对比非根际,植后77 d根际相对富集2个种,植后104 d相对富集3个目、1个科、1个属,植后134 d相对富集各1个门、目、科和属。时间比较中,104 d和134 d根际分别相对富集2个目和1个纲。(4)134 d,lig等9个功能基因在T1非根际土壤中的丰度显著高于根际土壤。在T1根际土壤中,chiA和aclB的丰度均为77 d高于104 d和134 d。(5)AK在104 d与31个功能基因显著相关。银耳纲、肉座菌目、丛赤壳科和球囊菌纲分别和其他40个、15个、14个、9个功能基因显著相关。【结论】缓释肥基施和追施可提高木薯根际真菌群落的多样性和丰度,施肥、时间、根际等均对真菌群落结构和少数功能基因有显著的影响,相关性分析结果暗示木薯根际真菌可能参与土壤速效养分的循环和功能基因的作用,为进一步了解木薯根际微生态过程提供科学依据。 展开更多
关键词 木薯 双膜缓释肥 速效养分 功能基因 根际真菌
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新疆小麦地方品种重要功能基因的KASP标记检测
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作者 哈力旦·依克热木 刘娜 +3 位作者 刘联正 周安定 曹俊梅 张新忠 《种子》 北大核心 2024年第8期126-133,138,共9页
本研究利用10种与表型性状有关的44个高通量KASP(Kompetitive allele specific PCR)分型标记技术,检测了117份新疆小麦地方品种的表型、品质、面粉色泽、籽粒蛋白质含量、粒重、抗逆、抗病等相关基因。结果表明,Ppd-D1光周期位点检测到... 本研究利用10种与表型性状有关的44个高通量KASP(Kompetitive allele specific PCR)分型标记技术,检测了117份新疆小麦地方品种的表型、品质、面粉色泽、籽粒蛋白质含量、粒重、抗逆、抗病等相关基因。结果表明,Ppd-D1光周期位点检测到非敏感材料116份。春化、矮杆基因位点检测中,冬性材料比例97%以上,矮化基因比例96%以上。Glu-A3和Glu-B3的标记检测中,高筋材料的比例仅占1%。有利等位基因Psy-B1中被检测出低黄色素材料,占95.7%;Pds-B1和Psy-A1基因中,以高黄色素材料为主。NAMA1检测出品质相关A1b、A1d类型材料116份。GCP_DUP标记鉴定携带低分子量谷蛋白亚基的材料占97%以上。抗病相关基因中,以抗叶锈病的材料为主。113份材料检测为抗穗发芽类型。 展开更多
关键词 小麦地方品种 功能基因 KASP标记
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