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妊娠糖尿病Calpain10基因表达与其单倍型组合的研究 被引量：2
1
作者 罗毅平 刘国成 +2 位作者 张温麑 黄珊 甘艳微 《中国妇幼保健》 CAS 北大核心 2013年第25期4235-4238,共4页
目的:对广东汉族妊娠糖尿病(GDM)患者进行钙蛋白酶10(Calpain10)基因单核苷酸多态性(SNP-43、-19、-63),及其胎盘组织Calpain10基因产物的检测,探讨Calpain10基因易感单倍型组合GDM罹患率增高的可能相关机制。方法:选择60例正常孕妇(NGT... 目的:对广东汉族妊娠糖尿病(GDM)患者进行钙蛋白酶10(Calpain10)基因单核苷酸多态性(SNP-43、-19、-63),及其胎盘组织Calpain10基因产物的检测,探讨Calpain10基因易感单倍型组合GDM罹患率增高的可能相关机制。方法:选择60例正常孕妇(NGT)和60例GDM患者,PCR-RFLP法检测Calpain10基因SNP-43、-19、-63位点,统计并分析其易感单倍型组合。RT-PCR法检测研究对象剖宫产后胎盘组织中Calpain10mRNA的表达,分析其与Calpain10基因易感单倍型组合的相关性。结果:①Calpain10基因单倍型组合112/112(SNP-43、-19、-63)的广东汉族孕妇有较高的GDM罹患率(χ2=4.324,P=0.037)。②与其他单倍型组合个体相比较,112/112个体胎盘组织(t=2.135,P=0.035)中Calpain10 mRNA表达明显下降。③112/112个体孕期体重指数变化(t=2.153,P=0.033)及胰岛素抵抗水平(t=2.189,P=0.031)明显增加。结论:Calpain10基因单倍型组合为112/112的妇女有较高的GDM发患率,这可能与通过增加孕期体重以及胎盘组织Calpain10表达减少,进而增加胰岛素抵抗水平相关。 展开更多
关键词 妊娠糖尿病 钙蛋白酶10基因 单倍型组合 胎盘组织
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陆地棉纤维强度KASP-SNP标记的开发及效应评价
2
作者 李丽花 孙正文 +5 位作者 柯会锋 谷淇深 吴立强 张艳 张桂寅 王省芬 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期46-55,共10页
纤维强度(fiber strength,FS)是判断棉花纤维品质优劣的重要指标之一,开发可用于目标性状选择的分子标记将会大大提高选择准确性并加快育种进程。设计KASP引物,对国内外的376份品种(系)进行基因型鉴定,筛选多态性标记并验证其对高强纤... 纤维强度(fiber strength,FS)是判断棉花纤维品质优劣的重要指标之一,开发可用于目标性状选择的分子标记将会大大提高选择准确性并加快育种进程。设计KASP引物,对国内外的376份品种(系)进行基因型鉴定,筛选多态性标记并验证其对高强纤维材料选择的有效性。3个SNP位点在材料中均具有多态性,标记FS-15对高强纤维材料的选择率为63.2%,FS-16和FS-29分别为60.0%和56.1%。对单倍型组合(Hap1、Hap2、Hap3和Hap4)的有效性评价表明,携带Hap3(TTA)的材料纤维强度显著高于其他组合,对高强纤维材料选择率达72.7%。此外,Hap3对纤维长度、铃重、籽指和衣指无不利影响。以上结果表明,开发的KASP标记及Hap3可用于高纤维强度材料的辅助选择,同时未对纤维长度、铃重、籽指和衣指等性状产生不利影响。 展开更多
关键词 棉花 纤维强度 KASP-SNP标记 单倍型组合 效应评价
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Calpain-10基因的SNP组合变异与2型糖尿病及其临床代谢性状的关系 被引量：17
3
作者 项坤三 方启晨 +5 位作者 郑泰山 贾伟平 王延庆 张蓉 李杰 沈坤雪 《中华医学遗传学杂志》 EI CAS CSCD 2001年第6期426-430,共5页
目的　观察 NIDDM1位点 calpain- 10基因 (CAPN- 10 )的单核苷酸多态性 (SNP)组合与中国人 2型糖尿病 (type 2 diabetes,T2 DM)及有关临床代谢性状的关系。方法　 2 6 8名上海地区中国人 ,其中144人为正常糖耐量 (NGT)者 ,12 4例为 T2 D... 目的　观察 NIDDM1位点 calpain- 10基因 (CAPN- 10 )的单核苷酸多态性 (SNP)组合与中国人 2型糖尿病 (type 2 diabetes,T2 DM)及有关临床代谢性状的关系。方法　 2 6 8名上海地区中国人 ,其中144人为正常糖耐量 (NGT)者 ,12 4例为 T2 DM患者。予口服 75 g葡萄糖后 0、30、6 0、12 0及 180分钟测血浆葡萄糖 (PG)、胰岛素 (INS)、C-肽 (CP)及游离脂肪酸 (FFA) ,并估测胰岛β细胞胰岛素分泌及组织胰岛素敏感性。检测 CAPN- 10 UCSNP44、- 43、- 19及 - 6 3基因型。结果　 (1)中国人 NGT者 4个 SNP的优势等位基因在 UCSNP44为 T(频率 91%)、UCSNP43为 G(89%)、UCSNP19为 I(3次 32 bp序列重复 ) (6 7%)及 UCSNP6 3为 C(79%)。这些频率与文献报道的其他种群频率间差异有显著性。 (2 )中国人 NGT者中上述 4个 SNP基因型组合类型共见 14种。群体中 6 9%由 4种基因型组合构成。按 UCSNP44 - 43- 19- 6 3排列 ,这 4种主要组合分别为组合 A∶ TT- GG- DI- CC(单倍型组合 112 1/1111) (频率为 10 %)、组合 B∶ TT- GA-II- CC(112 1/12 2 1) (10 %)、组合 C∶ TT- GG- II- CC(112 1/112 1) (2 6 %)及组合 D∶ TT- GG- DI- CT(112 1/1112 ) (2 2 %)。 (3) CAPN- 10上述单个 SNP或 4个 SNP组合频率在 NGT及 T2 DM者间? 展开更多
关键词 CALPAIN-10基因 单核苷酸多态 单倍型组合 2型糖尿病 临床代谢性状
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禾本科8种牧草DNA条形码通用序列筛选 被引量：3
4
作者 李永青 焦婷 +6 位作者 吴建平 权金强 汪文强 郑王山 郭永博 姚喜喜 赵生国 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1702-1710,共9页
DNA条形码技术是利用DNA保守片段对物种进行快速准确鉴定的新兴技术。本研究根据GenBank中禾本科牧草matK和rbcL基因的核苷酸序列,设计4对通用引物,建立并优化了针对禾本科7个主要牧草属8种牧草11个样品[高丹草（Sorghum bicolor×S... DNA条形码技术是利用DNA保守片段对物种进行快速准确鉴定的新兴技术。本研究根据GenBank中禾本科牧草matK和rbcL基因的核苷酸序列,设计4对通用引物,建立并优化了针对禾本科7个主要牧草属8种牧草11个样品[高丹草（Sorghum bicolor×S.sudanense）、玉米（Zea mays）、针茅（Stipa capillata）、＂贝克＂多年生黑麦草（Lolium perenne‘Plxie）、＂凯帝莎＂多年生黑麦草（L.perenne‘Caddieshack’）、甘肃羊茅（Festuca kansuensis）、＂百琪＂紫羊茅（F.rubra‘Bargena’）、＂梦神＂紫羊茅（F.rubra‘Maxima’）、＂百胜＂草地早熟禾（Poa pratensis‘Barvictor’）、＂钻石＂草地早熟禾（P.pratensis‘Diamond’）和芨芨草（Achnatherum splendens）]的目的片段的扩增条件。对扩增产物进行测序和分析,经分别比对,筛选出8种牧草的4个标记位点5’端和3’端保守序列。对各标记位点保守区内的核苷酸进行单核苷酸多态性（SNPs）的单倍型分析。结果表明,matK1、matK2、matK3分别有6个单倍型（H1^A、H1^B、H1^C、H1^D、H1^E和H1^F）、7个单倍型（H2^A、H2^B、H2^C、H2^D、H2^E、H2^F和H2^G）和3个单倍型（H3^A、H3^B和H3^C）,rbcL基因有5个单倍型（H4^A、H4^B、H4^C、H4^D和H4^E）。根据matK（matK1、matK2、matK3）和rbcL基因筛选的4个标记位点为8种牧草建立了相对应的特异DNA识别码。本研究可为混合禾本科牧草饲料中的高粱属、玉蜀黍属、芨芨草属、针茅属、黑麦草属、羊茅属和早熟禾属的8种牧草准确识别提供分子水平上的科学依据。 展开更多
关键词 单倍型组合 MATK基因 RBCL基因 DNA条形码 通用序列
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人类KIR基因PCR-SSP分型及家系研究 被引量：27
5
作者 张磊 Katharine C.Hsu +5 位作者 LIU Xiao-rong 杨珏琴 姚芳娟 许玲娣 Bo Dupont 范丽安 《上海免疫学杂志》 CSCD 北大核心 2003年第2期99-103,共5页
杀伤细胞免疫球蛋白样受体 (KIR )是NK细胞和某些T细胞表面表达的一组特异识别人类主要组织相容性抗原MHCI类分子的受体 ,对NK细胞效应功能的发挥起重要免疫调节作用。KIR由一组位于人类 19q13 4染色体上的多态性丰富的多基因家族所编... 杀伤细胞免疫球蛋白样受体 (KIR )是NK细胞和某些T细胞表面表达的一组特异识别人类主要组织相容性抗原MHCI类分子的受体 ,对NK细胞效应功能的发挥起重要免疫调节作用。KIR由一组位于人类 19q13 4染色体上的多态性丰富的多基因家族所编码 ,其结构和功能具有多样性。每一个体含有不同种类和数目的KIR基因 ,而同一位点的等位基因又具有丰富的多态性 ,目前在低分辨率水平上 ,可检测到包括两个假基因在内的 18个所有已知基因。文章介绍我室建立的在KIR多基因家族多样性研究中所采用的PCR SSP基因分型方法以及单倍型的家系分析。 展开更多
关键词 基因分型 KIR PCR-SSP 基因多样性 单倍型组合 单倍型制定
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豆科六种牧草DNA条形码鉴定技术研究 被引量：1
6
作者 李永青 赵生国 焦婷 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期322-329,共8页
DNA条形码技术是基于物种种内特异性和种间多样性利用一个或几个标准的DNA片段(DNA barcode)构建生物鉴别数据库。本研究根据Gen Bank中豆科牧草matK和rbcL基因的核苷酸序列,设计4对通用引物对豆科五个主要牧草属(苜蓿属Medicago,车轴草... DNA条形码技术是基于物种种内特异性和种间多样性利用一个或几个标准的DNA片段(DNA barcode)构建生物鉴别数据库。本研究根据Gen Bank中豆科牧草matK和rbcL基因的核苷酸序列,设计4对通用引物对豆科五个主要牧草属(苜蓿属Medicago,车轴草属Trifolium,红豆属Onobrychis,小冠花属Coronilla,野豌豆属Vicia)的六种牧草进行扩增。扩增产物进行测序和分析,筛选出六种牧草的四个标记位点5'端和3'端保守序列,并对各标记位点保守区内的核苷酸进行单核苷酸多态性(SNPs)的单倍型分析,数据表明:matK1、matK2、matK3均有5个单倍型,五个牧草属有其特有单倍型;rbcL基因有6个单倍型,车轴草属白三叶和红三叶有其特有单倍型。根据matK(matK1,matK2,matK3)和rbcL基因筛选的四个标记位点为六种牧草建立了相对应的特异DNA识别码。说明matK和rbcL组合后可作为豆科六种牧草的潜在条形码。 展开更多
关键词 单倍型组合 MATK基因 RBCL基因 DNA条形码
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