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题名基于ITS序列对独活17个种的分子鉴定
被引量:7
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作者
彭禄
余岩
王志新
赵丽华
何兴金
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机构
四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室
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出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第12期1648-1653,共6页
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基金
国家自然科学基金资助项目(31070166)
教育部博士点基金资助项目(20090181110064)
+1 种基金
中国科学院大科学装置开放研究项目(2009-LSF-GBOWS-01)
科技部科技基础性工作专项重点项目(2007FY110100)
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文摘
目的通过对17个种共26个独活样本的ITS序列分析,为国内中药市场上的常见独活的分子鉴定提供依据,并探索其科学分类标准。方法对26个样本的ITS进行PCR扩增和测序。通过MEGA 5.0软件比较各序列间的差异性,计算K2P遗传距离;采用邻接法构建NJ系统树并应用Network 4.2.0.1软件进行中间连接网法分析构建单倍型网状图。结果 NJ系统树和单倍型网状图显示,26个样本聚集为5大类群,综合分析后将17种独活归为4大类;重齿毛当归Angelica pubescens的ITS序列具有特征碱基片段,可明显区别于其他样本;除牛尾独活类中3个样本不能通过ITS序列鉴定到种以外,其他样本均可以通过ITS序列鉴定到种。结论 ITS序列可为药用独活的鉴定和分类提供有力证据,四带芹类可以作为独活的首选替补品,牛尾独活类其次,九眼独活为最后之选。
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关键词
独活
ITS序列
分子鉴定
PCR扩增
NJ系统树
单倍型网状图
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Keywords
Angelicae Pubescentis Radix
ITS sequence
molecular identification
PCR amplification
NJ tree
haplotype network map
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分类号
R282.12
[医药卫生—中药学]
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