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咖啡短体线虫分子鉴定 被引量：5
1
作者 陈晓玲 陈永红 +3 位作者 张洪玲 武目涛 钟国强 方羽生 《植物检疫》 北大核心 2009年第2期7-9,共3页
本实验采用单条线虫法提取DNA,rDNA-ITS-PCR技术扩增目的片段(ITS1、5.8S、ITS2和部分的18S和28S),将此片段纯化回收,克隆测序分析,与GenBank比对,结果为:该种群的基因序列与AY561436(基因库编号)的相似度为92.3%,与AB053485的相似度为9... 本实验采用单条线虫法提取DNA,rDNA-ITS-PCR技术扩增目的片段(ITS1、5.8S、ITS2和部分的18S和28S),将此片段纯化回收,克隆测序分析,与GenBank比对,结果为:该种群的基因序列与AY561436(基因库编号)的相似度为92.3%,与AB053485的相似度为91.3%。分子鉴定结果与形态鉴定该线虫为咖啡短体线虫。 展开更多
关键词 咖啡短体线虫 单条线虫 rDNA—ITS—PCR分子鉴定
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基于核糖体ITS区和28S rRNA D2～D3区的短体线虫系统发育研究 被引量：15
2
作者 王金成 魏亚东 +5 位作者 顾建锋 张瑞丰 黄国明 王暄 李红梅 孙建华 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2012年第4期687-693,共7页
短体线虫又称根腐线虫,是世界分布最为广泛和最具破坏性的迁徙性植物内寄生线虫之一。本研究根据214条核糖体ITS序列,218条核糖体28S大亚基D2～D3序列,应用MEGA4.0软件,通过邻接法(NJ)构建了短体线虫的系统发育树。结果发现,2个系统树... 短体线虫又称根腐线虫,是世界分布最为广泛和最具破坏性的迁徙性植物内寄生线虫之一。本研究根据214条核糖体ITS序列,218条核糖体28S大亚基D2～D3序列,应用MEGA4.0软件,通过邻接法(NJ)构建了短体线虫的系统发育树。结果发现,2个系统树在整体上大致相似,仅在小的分支上存在差异。基于ITS序列的系统树将25种短体线虫至少分为8组,相应的基于D2～D3序列的系统树将23种短体线虫至少分为7组。其中,有3个大组内部的系统发育关系比较清晰。根据本研究的系统发育分析仍然无法从总体上确定短体线虫种间的系统发育关系。 展开更多
关键词 单条线虫 邻接法 MEGA 4 0 DNA
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