研究从大规模单细胞转录组测序数据出发,获得结直肠癌(colorectal cancer, CRC)中肠道内分泌细胞(enteroendocrine cell, EEC)的单细胞转录组图谱;对此转录组测序数据作差异表达、功能以及拟时序分析,结果提示肿瘤微环境中EEC发育与激...研究从大规模单细胞转录组测序数据出发,获得结直肠癌(colorectal cancer, CRC)中肠道内分泌细胞(enteroendocrine cell, EEC)的单细胞转录组图谱;对此转录组测序数据作差异表达、功能以及拟时序分析,结果提示肿瘤微环境中EEC发育与激素合成/分泌相关功能不全有关;结合肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)和肿瘤药敏多组学数据库(Genomics of Drug Sensitivity in Cancer, GDSC)中CRC的bulk转录组测序数据、随访信息和药物测试数据,筛选出对CRC患者生存具有积极影响的生物学标志物——胰高血糖素(glucagon,GCG)基因;利用肿瘤细胞系药物测试数据探究了GCG基因在CRC治疗中的潜在应用价值。该研究为CRC的治疗提供了新的思路。展开更多
文摘研究从大规模单细胞转录组测序数据出发,获得结直肠癌(colorectal cancer, CRC)中肠道内分泌细胞(enteroendocrine cell, EEC)的单细胞转录组图谱;对此转录组测序数据作差异表达、功能以及拟时序分析,结果提示肿瘤微环境中EEC发育与激素合成/分泌相关功能不全有关;结合肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)和肿瘤药敏多组学数据库(Genomics of Drug Sensitivity in Cancer, GDSC)中CRC的bulk转录组测序数据、随访信息和药物测试数据,筛选出对CRC患者生存具有积极影响的生物学标志物——胰高血糖素(glucagon,GCG)基因;利用肿瘤细胞系药物测试数据探究了GCG基因在CRC治疗中的潜在应用价值。该研究为CRC的治疗提供了新的思路。
