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单细胞转录组测序技术在水产养殖领域的应用
1
作者 张志强 简纪常 《广东海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期130-138,共9页
单细胞转录组测序技术可揭示不同组织细胞间和同一组织不同细胞间的异质性,已大量用于模式物种研究,但在水产养殖物种中的应用则处于起步阶段。综述单细胞转录组测序技术在水产养殖物种的人工繁殖、良种选育和病害防控相关研究中的应用... 单细胞转录组测序技术可揭示不同组织细胞间和同一组织不同细胞间的异质性,已大量用于模式物种研究,但在水产养殖物种中的应用则处于起步阶段。综述单细胞转录组测序技术在水产养殖物种的人工繁殖、良种选育和病害防控相关研究中的应用,指出其在应用过程中存在样本采集、单细胞分离、数据分析方面的困难,并提出相应的解决举措,展望其在水产养殖领域内应用的发展前景,为促进单细胞转录组测序技术在水产养殖领域的广泛应用提供参考。 展开更多
关键词 单细胞转录组测序技术 水产养殖 应用 进展
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单细胞转录组测序技术在炎症性肠病中的研究进展
2
作者 姚尧 王丹丹 +3 位作者 耿丽 张哲 冯百岁 刘占举 《胃肠病学》 北大核心 2021年第12期762-766,共5页
炎症性肠病(IBD)为病因复杂的慢性非特异性肠道炎症,其具体的发病机制仍不完全清楚。随着高通量测序技术的不断更新和发展,其中基于单细胞水平的单细胞转录组测序技术的应用大大推进了对IBD发病机制、治疗等的认识。本文就近年单细胞转... 炎症性肠病(IBD)为病因复杂的慢性非特异性肠道炎症,其具体的发病机制仍不完全清楚。随着高通量测序技术的不断更新和发展,其中基于单细胞水平的单细胞转录组测序技术的应用大大推进了对IBD发病机制、治疗等的认识。本文就近年单细胞转录组测序技术在IBD中的研究进展作一综述,以期为IBD发病机制的深入了解以及新药物的开发提供指导。 展开更多
关键词 炎症性肠病 单细胞转录组测序技术 肠上皮细胞 肠间质细胞 单核巨噬细胞 淋巴细胞
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单细胞转录组学测序技术的发展和挑战
3
作者 潘雅婷 朱强远 《生命科学仪器》 2023年第3期19-22,共4页
单细胞转录组测序技术为表征细胞异质性,解析复杂的生物系统提供了强大的工具;生物医学研究的进一步发展不断地向该技术提出新的需求。经过过去十年的飞速发展,该技术的灵敏度在逐渐提高,并且通量发生了巨大的飞跃,也实现了全转录组和... 单细胞转录组测序技术为表征细胞异质性,解析复杂的生物系统提供了强大的工具;生物医学研究的进一步发展不断地向该技术提出新的需求。经过过去十年的飞速发展,该技术的灵敏度在逐渐提高,并且通量发生了巨大的飞跃,也实现了全转录组和全长转录本测序。本文主要介绍单细胞测序技术的发展,在灵敏度提升,通量提高和实现全转录组测序和全长转录本测序上面临的技术挑战。我们也提出未来需要开发更优的单细胞转录组测序技术,开发自动化单细胞测序仪器,并需要将该技术与空间组学和多组学测序技术更好的结合。 展开更多
关键词 单细胞转录组测序技术 灵敏度 通量 全转录组测序 全长转录本测序
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单细胞转录组测序技术在细胞分类中的应用 被引量：4
4
作者 杨佳凤 陈鹏璐 龚熹 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 2021年第2期476-483,共8页
多细胞有机体的细胞类型多且复杂,细胞间普遍存在异质性。目前,单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术是一项新兴的研究单个细胞转录水平的技术,其从数千个平行的细胞中生成转录谱,揭示个体细胞基因组的差异性表... 多细胞有机体的细胞类型多且复杂,细胞间普遍存在异质性。目前,单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术是一项新兴的研究单个细胞转录水平的技术,其从数千个平行的细胞中生成转录谱,揭示个体细胞基因组的差异性表达,反映细胞间的异质性,从而鉴定出不同细胞类型,形成组织或器官的细胞图谱,在生物和临床医学等领域发挥重要作用。该文在对scRNA-seq测序平台进行阐述和比较的基础上,着重介绍其在神经系统和免疫系统细胞类型探索中的应用,并且总结scRNA-seq与空间转录组技术相结合的研究成果。 展开更多
关键词 单细胞转录组测序技术 细胞类型 空间转录组 细胞图谱
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单细胞转录组测序技术在头颈癌中应用的研究进展
5
作者 钟雪敏 黄光武 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期445-450,共6页
头颈癌(head and neck cancer,HNC)具有较高的瘤内异质性,即转录、遗传和表观遗传学均存在明显差异。研究表明,肿瘤内的异质性对癌症的预后有着十分重要的意义。近10年来,随着单细胞转录组测序技术(single cell RNA-sequencing,scRNA-s... 头颈癌(head and neck cancer,HNC)具有较高的瘤内异质性,即转录、遗传和表观遗传学均存在明显差异。研究表明,肿瘤内的异质性对癌症的预后有着十分重要的意义。近10年来,随着单细胞转录组测序技术(single cell RNA-sequencing,scRNA-seq)的飞速发展,为研究肿瘤异质性提供了重要的信息。该技术可从单个细胞层面识别肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)中不同的细胞群,从而获得特定微环境下的细胞序列差异,为研究HNC的发病机制及治疗提供了新的方向。目前,通过scRNA-seq已经对HNC的异质性及免疫细胞与癌细胞之间的关系有了创新性了解。这些研究结果必将引导着临床治疗,促进HNC个性化和精准治疗的发展。因此,本综述旨在介绍scRNA-seq,并讨论该技术在HNC领域中的研究进展。 展开更多
关键词 头颈肿瘤 单细胞转录组测序技术 肿瘤微环境
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基于CRISPR的单细胞转录组测序技术研究进展
6
作者 郭俊璠 黄行许 乔云波 《生命的化学》 CAS 2022年第1期1-11,共11页
基于CRISPR的单细胞转录组测序技术是将单细胞转录组测序技术与CRISPR集中筛选技术结合,用于研究传统技术无法完成的细胞异质性、细胞谱系追踪、细胞互作及空间位置、药物作用靶点预测和鉴定等。本文简单比较了六种最常用的单细胞转录... 基于CRISPR的单细胞转录组测序技术是将单细胞转录组测序技术与CRISPR集中筛选技术结合,用于研究传统技术无法完成的细胞异质性、细胞谱系追踪、细胞互作及空间位置、药物作用靶点预测和鉴定等。本文简单比较了六种最常用的单细胞转录组测序技术,重点介绍了五种基于CRISPR的单细胞转录组测序技术及应用研究,并对其推广应用所面临的挑战作出了分析,旨在为单细胞转录组测序技术的应用及创新提供参考。 展开更多
关键词 单细胞转录组测序技术 Perturb-Seq CRISP-Seq CROP-Seq Mosaic-Seq Direct capture Perturb-Seq
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基于10×Genomics技术对蓖麻毒素中毒后中性粒细胞的转录组分析
7
作者 申梦 杨晓岚 +3 位作者 赵玲娜 姜永强 谷宏婧 王慧 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期300-307,共8页
目的探究中性粒细胞在蓖麻毒素(Ricin Toxin,RT)致毒过程中的作用,寻找解毒的有效策略。方法采用10×Genomics单细胞转录组测序技术对中毒小鼠外周血单个核细胞(PBMCs)进行转录组测序及分析,并通过流式细胞术测定目的细胞亚群。结... 目的探究中性粒细胞在蓖麻毒素(Ricin Toxin,RT)致毒过程中的作用,寻找解毒的有效策略。方法采用10×Genomics单细胞转录组测序技术对中毒小鼠外周血单个核细胞(PBMCs)进行转录组测序及分析,并通过流式细胞术测定目的细胞亚群。结果经降维聚类、差异基因、拟时序分析结果显示CD177^(-)CD121b^(+)CCRL2^(+)中性粒细胞亚群为RT致毒过程关键亚群,随后通过流式细胞术测定显示该亚群在中毒后6小时在中性粒细胞中的比例显著升高。同时利用CCRL2抗体治疗中毒小鼠其保护率达60%。结论本研究首次发现在RT中毒后中性粒CD177^(-)CD121b^(+)CCRL2^(+)细胞亚群呈现显著升高,同时CCRL2抗体能够有效保护RT中毒小鼠,为RT致毒机制研究提供新的思路,为其治疗提供新的策略。 展开更多
关键词 Ricin Toxin 中性粒细胞 单细胞转录组测序技术 CCRL2
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