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全外显子组测序法对中国先天性白内障一家系致病基因的研究
被引量:
1
1
作者
布娟
刘敬
+2 位作者
庞宏蕾
刘峰
王乐今
《中华实验眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期896-899,共4页
背景 基因突变是导致遗传性先天性白内障的主要原因,全外显子组测序技术是目前研究致病基因突变较为理想的检测手段. 目的 应用高通量测序技术对中国汉族常染色体显性遗传先天性白内障(ADCC)一家系的3例患者进行全外显子组测序,筛选该...
背景 基因突变是导致遗传性先天性白内障的主要原因,全外显子组测序技术是目前研究致病基因突变较为理想的检测手段. 目的 应用高通量测序技术对中国汉族常染色体显性遗传先天性白内障(ADCC)一家系的3例患者进行全外显子组测序,筛选该ADCC家系的致病基因. 方法 采用横断面研究方法,收集中国汉族先天性白内障一家系,共有4代48人家系成员,其中Ⅰ1和Ⅰ2已去世.在Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ代中各取1例患者的静脉血8 ~ 10 ml,采用全外显子捕获和新一代测序技术进行高通量测序,测序结果与人类HA PMAP8、dbSNP130和1000 Genome Project数据库进行比对,过滤已报道的常见变异后,再过滤掉同义突变,最后通过Sanger法测序排除外显子测序的假阳性结果,筛选出候选基因,并对其进行突变筛查.结果 该家系的所有成员中共11例患病者,且各代均有患病者,男女发病比例相当,符合ADCC的遗传规律,所有患者均为核性白内障.全外显子组测序发现,在各候选基因中,主要内源性蛋白(MIP)基因是ADCC的已知基因,故采用Sanger法首先对MIP基因进行验证并确定杂合突变(chr12:56845250 C>T)为该家系的致病突变.该突变位于剪切位点上,造成由第4外显子编码的61个氨基酸被亮氨酸-组氨酸-丝氨酸所替代,导致异常截短蛋白的产生.结论 MIP基因剪切位点的杂合突变是导致该ADCC家系致病的分子发病机制.
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关键词
家系
白内障/遗传
膜糖蛋白
/基因
突变
/基因
水通道蛋白/遗传
可变剪切/基因
常染色体显性遗传
全外显子组测序
主要内源性蛋白
/基因
中国人
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题名
全外显子组测序法对中国先天性白内障一家系致病基因的研究
被引量:
1
1
作者
布娟
刘敬
庞宏蕾
刘峰
王乐今
机构
北京大学第三医院眼科教育部视觉损伤与修复重点实验室
出处
《中华实验眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期896-899,共4页
基金
国家自然科学基金项目(81300789、81470665)
文摘
背景 基因突变是导致遗传性先天性白内障的主要原因,全外显子组测序技术是目前研究致病基因突变较为理想的检测手段. 目的 应用高通量测序技术对中国汉族常染色体显性遗传先天性白内障(ADCC)一家系的3例患者进行全外显子组测序,筛选该ADCC家系的致病基因. 方法 采用横断面研究方法,收集中国汉族先天性白内障一家系,共有4代48人家系成员,其中Ⅰ1和Ⅰ2已去世.在Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ代中各取1例患者的静脉血8 ~ 10 ml,采用全外显子捕获和新一代测序技术进行高通量测序,测序结果与人类HA PMAP8、dbSNP130和1000 Genome Project数据库进行比对,过滤已报道的常见变异后,再过滤掉同义突变,最后通过Sanger法测序排除外显子测序的假阳性结果,筛选出候选基因,并对其进行突变筛查.结果 该家系的所有成员中共11例患病者,且各代均有患病者,男女发病比例相当,符合ADCC的遗传规律,所有患者均为核性白内障.全外显子组测序发现,在各候选基因中,主要内源性蛋白(MIP)基因是ADCC的已知基因,故采用Sanger法首先对MIP基因进行验证并确定杂合突变(chr12:56845250 C>T)为该家系的致病突变.该突变位于剪切位点上,造成由第4外显子编码的61个氨基酸被亮氨酸-组氨酸-丝氨酸所替代,导致异常截短蛋白的产生.结论 MIP基因剪切位点的杂合突变是导致该ADCC家系致病的分子发病机制.
关键词
家系
白内障/遗传
膜糖蛋白
/基因
突变
/基因
水通道蛋白/遗传
可变剪切/基因
常染色体显性遗传
全外显子组测序
主要内源性蛋白
/基因
中国人
Keywords
Pedigree
Cataract/genetics
Membrane glycoproteins/genetics
Mutation/genetics
Aquaporins/genetics
Alternative splicing/genetics
Autosomal dominant
Whole-exome sequencing
Major intrinsic protein/genetics
Chinese
分类号
R776.1 [医药卫生—眼科]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
全外显子组测序法对中国先天性白内障一家系致病基因的研究
布娟
刘敬
庞宏蕾
刘峰
王乐今
《中华实验眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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