PROS1基因新同义突变致以脑梗死起病的遗传性蛋白S缺陷症家系调查

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作者 赵瑾莹 潘蓉蓉 +4 位作者 金慧慧 刘春梅 黄婷 张颖冬 田有勇 《临床神经病学杂志》 CAS 2024年第3期184-187,共4页

目的调查一个以急性脑梗死起病的遗传性蛋白S缺陷症家系的临床特征,分析其PROS1基因的突变特点。方法收集先证者及其直系亲属的临床资料,采集血标本,检测蛋白S活性水平并对PROS1基因进行测序。结果该家系直系亲属三代8人,其中3名确诊为... 目的调查一个以急性脑梗死起病的遗传性蛋白S缺陷症家系的临床特征,分析其PROS1基因的突变特点。方法收集先证者及其直系亲属的临床资料,采集血标本,检测蛋白S活性水平并对PROS1基因进行测序。结果该家系直系亲属三代8人,其中3名确诊为遗传性蛋白S缺陷症,先证者及其兄均表现为急性脑梗死,余家系成员尚未发生血栓事件。检测蛋白S活性:先证者、先证者之兄、先证者母亲分别为16.8%、38.0%、31.8%,父亲正常。基因分析发现先证者、先证者之兄、先证者母亲PROS1基因第11外显子均存在c.1323G>A杂合变异,父亲为野生型。结论本家系为一个新发现的由PROS1基因c.1323G>A同义突变引起的遗传性蛋白S缺陷症家系;此突变可能导致青年缺血性脑卒中的发生。 展开更多

关键词 青年缺血性脑卒中 PROS1基因 同义突变 遗传性蛋白S缺陷症

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中国人群MYO15A基因同义突变引起剪接异常导致的非综合征型耳聋分析 被引量：1

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作者 王思霁 郭亿莲 +5 位作者 钟鸣骏 耿佳 彭婉 袁德健 严提珍 卢宇 《中国临床新医学》 2023年第5期421-426,共6页

目的对一个遗传性非综合征型耳聋家系的临床特征进行分析并鉴定其致聋基因突变,同时在大规模耳聋人群队列中对鉴定出的致病性突变致中国人群耳聋的特征进行分析。方法完善家系成员的问卷调查、听力学检查、体格检查等临床检查,同时采集... 目的对一个遗传性非综合征型耳聋家系的临床特征进行分析并鉴定其致聋基因突变,同时在大规模耳聋人群队列中对鉴定出的致病性突变致中国人群耳聋的特征进行分析。方法完善家系成员的问卷调查、听力学检查、体格检查等临床检查,同时采集血液样本,通过耳聋相关基因的大规模平行测序(MPS)和生物信息学分析进行致病基因鉴定。总结及分析鉴定出的致病性突变在中国耳聋基因研究战略联盟(CDGC)耳聋数据库中的检出情况。结果在一个早发性极重度感音神经性耳聋家系中鉴定出MYO15A基因NM_016239.4:c.8182C>G(p.Arg2728Gly)/c.9861C>T(p.Gly3287=)复合杂合突变,为该家系耳聋患者的致聋原因。其中MYO15A基因c.9861C>T(p.Gly3287=)同义突变通过改变剪接导致基因功能缺陷,其在中国广西壮族人群中次要等位基因频率为0.2%(3/1438),在其他人群及公共数据库中均未检出。结论研究确定了MYO15A基因c.9861C>T(p.Gly3287=)在中国非综合征型耳聋患者中的致病性,该突变在中国广西壮族自治区富集明显。通过研究强调了在致病基因鉴定时,高频与同义突变并非过滤的绝对指标,尤其是在某些地区富集格外明显的突变,应格外注意。 展开更多

关键词 遗传性耳聋 MYO15A基因 同义突变

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国人SCN5A基因新的同义突变位点 被引量：7

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作者 任法鑫 杨钧国 +4 位作者 李伟 胡骏 袁国会 杜戎 桂乐 《中国循环杂志》 CSCD 北大核心 2004年第5期370-372,共3页

目的研究中国人心原性猝死相关基因SCN5A突变位点。方法采用聚合酶链反应和DNA测序对1例RQT间期综合征(LQTs)和2例特发性J波患者SCN5A基因进行突变检测。结果①3例患者在国内、外已知的SCN5A突变位点上,均未发现有突变。②发现1个新的... 目的研究中国人心原性猝死相关基因SCN5A突变位点。方法采用聚合酶链反应和DNA测序对1例RQT间期综合征(LQTs)和2例特发性J波患者SCN5A基因进行突变检测。结果①3例患者在国内、外已知的SCN5A突变位点上,均未发现有突变。②发现1个新的同义突变(T990C),位于钠通道α-亚基的DⅠ区段S5～S6胞外环上。结论这个新的同义突变可能通过影响门控性钠通道的跨膜电流而与恶性心律失常的发生相关。 展开更多

关键词 SCN5A基因 同义突变位点 心原性猝死 RQT间期综合征

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一种罕见的同义突变导致的β-地中海贫血的基因诊断和表型分析 被引量：5

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作者 秦丹卿 杜丽 +4 位作者 丁红珂 王继成 袁腾龙 姚翠泽 兰菲菲 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期577-582,共6页

目的:对血常规和血红蛋白电泳筛查结果提示疑为β-地中海贫血携带者的孕妇及其丈夫进行β-地中海贫血基因诊断,鉴定其表型并对胎儿进行产前基因诊断。方法:采用聚合酶链式反应-反向点杂交(PCR-RDB)方法及DNA测序方法分析并鉴定孕妇及其... 目的:对血常规和血红蛋白电泳筛查结果提示疑为β-地中海贫血携带者的孕妇及其丈夫进行β-地中海贫血基因诊断,鉴定其表型并对胎儿进行产前基因诊断。方法:采用聚合酶链式反应-反向点杂交(PCR-RDB)方法及DNA测序方法分析并鉴定孕妇及其丈夫的外周血和孕妇的羊水样本的β-珠蛋白基因突变。结果:检测到孕妇本人为常见的β-珠蛋白基因IVS-Ⅱ-654(C>T)位点杂合突变,其丈夫携带一种罕见β-珠蛋白基因CD29(c.90C>T)位点杂合突变,产前基因诊断出胎儿基因型为βIVS-Ⅱ-654/βCD29。结论:本研究在中国人群中确切基因鉴定出β-珠蛋白基因CD29(c.90 C>T)突变,此突变类型虽为同义突变但其携带者表现为β+-地中海贫血表型。考虑遗传风险应对此类同义突变给予重视,尤其对指导遗传咨询和产前基因诊断有重要意义。 展开更多

关键词 Β-地中海贫血 同义突变 剪接供体位点 中间型地中海贫血

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家族性偏头痛家系中发现的CACNA1A基因同义突变 被引量：5

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作者 吴宣富 何玉琴 +3 位作者 张现伟 吴智兵 徐秋英 史成军 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期296-299,共4页

目的探讨家族性偏头痛中CACNA1A基因的突变情况。方法采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)和DNA测序技术,检测20例有家族史的有先兆和无先兆偏头痛患者及65名健康成人CACNA1A基因中已有报道存在突变的11个外显子。结果在1个家系... 目的探讨家族性偏头痛中CACNA1A基因的突变情况。方法采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)和DNA测序技术,检测20例有家族史的有先兆和无先兆偏头痛患者及65名健康成人CACNA1A基因中已有报道存在突变的11个外显子。结果在1个家系的2例患者的外显子16上检测到G2094A同义突变,编码的氨基酸未改变,均为苏氨酸(Thr)。结论G2094A突变可能通过转录、转录后翻译及翻译后加工等多环节中的某些步骤影响蛋白质的表达,从而导致偏头痛的发生。 展开更多

关键词 偏头痛 同义突变 CACNA1A基因

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鸡毒霉形体pMGA基因中TGA的同义突变及其原核表达 被引量：3

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作者 胡思顺 肖运才 +1 位作者 李自力 毕丁仁 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期188-191,共4页

为了进一步研究鸡毒霉形体黏附素蛋白(pMGA)基因的生物学特性,利用PCR对该基因进行分段扩增,同时同义突变编码色氨酸的TGA及另外2个氨基酸的编码子以便形成酶切位点。将扩增片段连入pMD18-T载体获得含不同长度片段的质粒pMD-Ⅰ,pMD-Ⅱ,p... 为了进一步研究鸡毒霉形体黏附素蛋白(pMGA)基因的生物学特性,利用PCR对该基因进行分段扩增,同时同义突变编码色氨酸的TGA及另外2个氨基酸的编码子以便形成酶切位点。将扩增片段连入pMD18-T载体获得含不同长度片段的质粒pMD-Ⅰ,pMD-Ⅱ,pMD-Ⅲ和pMD-Ⅳ,利用限制性内切酶消化pMD-Ⅰ和pMD-Ⅱ及pMD-Ⅲ和pMD-Ⅳ后回收相应的片段并进行连接获得pMD-Ⅴ(Ⅰ+Ⅱ)和pMD-Ⅵ(Ⅲ+Ⅳ)。再用限制性内切酶消化pMD-Ⅴ和pMD-Ⅵ,回收Ⅴ和Ⅵ,并将其插入表达载体pGEX-KG中构建了含突变基因的GST融合表达载体。同时分别构建了片段Ⅲ及Ⅳ的GST融合表达载体。在IPTG诱导下,构建的表达载体在BL21(DE3)中获得了高效表达。表达产物相对分子质量大小分别为92000、39000、60000,经Western blotting分析证明均具有免疫原性。 展开更多

关键词 pMGA 同义突变 pGEX-KG

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抗siRNA的GFP-Plk1同义突变表达载体及其稳定细胞系的构建

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作者 李伟 李峰生 +4 位作者 于楠 刘萱 李平 江其生 曹诚 《生物技术通讯》 CAS 2015年第2期207-210,共4页

目的:构建GFP-Plk1同义突变表达载体及其稳定转染细胞系。方法:设计Polo样激酶1(Plk1)si RNA序列及相对应的同义突变引物,并利用二次PCR方法扩增Plk1基因,定向克隆到p Rex-EGFP-IRES-Hygro载体中,构建p Rex-EGFP-r Plk1-IRES-Hygro表达... 目的:构建GFP-Plk1同义突变表达载体及其稳定转染细胞系。方法:设计Polo样激酶1(Plk1)si RNA序列及相对应的同义突变引物,并利用二次PCR方法扩增Plk1基因,定向克隆到p Rex-EGFP-IRES-Hygro载体中,构建p Rex-EGFP-r Plk1-IRES-Hygro表达载体;利用逆转录病毒感染的方法,构建He La/GFP-r Plk1稳定细胞系;利用免疫印迹及激光共聚焦显微镜,验证Plk1 si RNA的干扰效果及稳定细胞系的构建。结果:双酶切鉴定和测序结果表明构建的p Rex-EGFP-r Plk1-IRES-Hygro正确;免疫印迹实验证明Plk1 si RNA序列可以有效抑制He La/GFP-r Plk1细胞中内源性Plk1蛋白的表达,但不能干扰掉外源GFP-r Plk1蛋白;在荧光共聚焦显微镜下,观察到有丝分裂的前中期和末期,GFP-r Plk1分别定位于着丝粒和中间体上。结论:构建了Plk1同义突变表达载体p Rex-EGFP-r Plk1-IRES-Hygro和He La/GFP-r Plk1稳定细胞系,为下一步研究Plk1在有丝分裂期的调控机制提供了模型。 展开更多

关键词 PLK1 抗siRNA 同义突变 稳定细胞系

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von-Hippel Lindau基因同义突变导致家族性嗜铬细胞瘤 被引量：1

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作者 马晓森 张学斌 +2 位作者 周颋 崔云英 童安莉 《基础医学与临床》 CSCD 2020年第11期1489-1493,共5页

目的报道1例罕见的VHL同义突变导致的家族性嗜铬细胞瘤家系,并探讨该突变在嗜铬细胞瘤/副神经节瘤(PPGL)中的发生频率。方法收集患者及其家系临床资料和外周血标本。提取患者外周血DNA,进行全外显子测序及生物信息学分析,并对候选变异... 目的报道1例罕见的VHL同义突变导致的家族性嗜铬细胞瘤家系,并探讨该突变在嗜铬细胞瘤/副神经节瘤(PPGL)中的发生频率。方法收集患者及其家系临床资料和外周血标本。提取患者外周血DNA,进行全外显子测序及生物信息学分析,并对候选变异进行一代测序验证。在另外107例PPGL患者中检测该突变的发生频率。结果先证者为15岁男性,表现为发作性心悸、大汗伴血压升高。生化检测提示去甲肾上腺素明显升高,肾上腺CT显示双肾上腺占位,手术切除后病理符合双侧嗜铬细胞瘤。家系中仅先证者姑姥姥患右侧嗜铬细胞瘤,已行手术切除肿瘤。先证者及其姑姥姥、母亲和妹妹均携带VHL同义突变c.414A>G(p.Pro138Pro)且无其他VHL病相关临床表现。并且,在另外107例PPGL中也发现一例携带相同胚系突变的患者。结论首次报道中国人中VHL同义突变导致的VHL病的家系,该突变在PPGL中的发生频率约为1%。 展开更多

关键词 双侧嗜铬细胞瘤 VHL基因 同义突变

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肝豆状核变性家系ATP7B基因错义和同义突变

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作者 王建文 常乐 +3 位作者 谷涛 李东初 王珍珍 陈桂生 《宁夏医学杂志》 CAS 2022年第5期385-387,共3页

目的通过第二代DNA测序技术,对以“头部不自主抖动”为首发症状的成人肝豆状核变性患者家系内ATP7B致病基因特点及候选突变位点进行分析,探讨错义和同义突变的临床意义。方法采用第二代DNA测序技术,检测先证者及其家系其他成员ATP7B基... 目的通过第二代DNA测序技术,对以“头部不自主抖动”为首发症状的成人肝豆状核变性患者家系内ATP7B致病基因特点及候选突变位点进行分析,探讨错义和同义突变的临床意义。方法采用第二代DNA测序技术,检测先证者及其家系其他成员ATP7B基因序列。结果先证者ATP7B基因存在Exon8 c.2333G>T p.(Arg778Leu)错义杂合突变、Exon14 c.3243G>A p.(Glu1081=)同义杂合突变(参考序列NM_000053.3),其小妹存在相同突变;先证者女儿基因检测提示:Exon14 c.3243G>A p.(Glu1081=)同义杂合突变(参考序列NM_000053.3),其儿子及大妹存在相同突变位点;患者母亲基因检测提示:Exon8 c.2333G>T p.(Arg778Leu)错义杂合突变,与患者弟弟存在相同突变;生物信息学分析结果表明,突变位点c.2333G>T p.(Arg778Leu)致病,并同时存在c.3243 G>A p.(Glu1081=)同义突变。结论c.3243G>A同义突变影响mRNA的剪接,导致外显子跳跃,进一步丰富了同义突变的临床意义。通过肝豆状核变性家系内基因筛查,可为早期诊断、治疗及预防提供依据。 展开更多

关键词 肝豆状核变性 ATP7B基因 第二代DNA测序 错义和同义突变

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IGF-1 c.258同义突变对破骨细胞增殖分化及相关通路的影响

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作者 张洵铭 李常红 +2 位作者 房嘉园 王兆国 郝林琳 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期170-175,共6页

研究发现IGF-1同义突变影响骨形成及骨吸收,破骨细胞是介导骨吸收的关键细胞。为分析同义突变对破骨细胞增殖分化及相关通路的影响,本研究以IGF-1 c.258A>G小鼠为实验对象,分离培养破骨前体细胞并诱导分化,以检测不同基因型破骨细胞... 研究发现IGF-1同义突变影响骨形成及骨吸收,破骨细胞是介导骨吸收的关键细胞。为分析同义突变对破骨细胞增殖分化及相关通路的影响,本研究以IGF-1 c.258A>G小鼠为实验对象,分离培养破骨前体细胞并诱导分化,以检测不同基因型破骨细胞增殖和骨吸收功能,通过qRT-PCR检测相关基因及相关通路基因表达量。结果显示,OCL-G的IGF-1表达量显著高于OCL-A(P<0.01);NFATc1与LPAR基因表达量无显著性差异(P>0.05);而ephrinB2基因表达量OCL-G较高(P<0.01);Sema4D基因表达量同样OCL-G较高(P<0.001);At6v0d2则与之相反(P<0.001)。破骨细胞增殖与骨吸收功能变化不显著。结果表明,本试验证实了IGF-1同义突变影响了IGF-1基因与相关通路基因的表达,并解释了破骨细胞增殖与骨吸收没有显著变化的原因,为进一步研究IGF-1同义突变对破骨细胞的影响奠定了基础。 展开更多

关键词 IGF-1 同义突变 信号通路 破骨细胞

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利用生物信息学技术分析APC基因同义突变SNP在家族性腺瘤性息肉病发病机制的研究 被引量：4

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作者 杨军 刘为青 +2 位作者 李文亮 王志强 董坚 《重庆医学》 CAS 北大核心 2017年第2期218-222,共5页

目的利用生物信息学技术分析APC基因同义突变SNP(sSNP)在家族性腺瘤性息肉病(FAP)中的发病机制。方法选取云南省遗传性大肠癌组织标本库中的5个FAP患者的组织标本进行APC基因突变比对分析,将筛选得到的sSNP进行生物信息学预测,包括蛋白... 目的利用生物信息学技术分析APC基因同义突变SNP(sSNP)在家族性腺瘤性息肉病(FAP)中的发病机制。方法选取云南省遗传性大肠癌组织标本库中的5个FAP患者的组织标本进行APC基因突变比对分析,将筛选得到的sSNP进行生物信息学预测,包括蛋白编码、剪接调节、转录调节、翻译后调节,并对RNA二级结构影响分析方面的预测。结果筛选得到5个可能对APC蛋白产生影响的sSNP,生物信息学预测提示这些sSNP在mRNA水平影响剪接增强子(ESE)从而引起APC外显子异常剪切,使APC蛋白截短而导致FAP。RNA二级结构分析发现这些sSNP对RNA稳定、与其他RNA或蛋白的相互作用等产生功能性影响。结论利用生物信息学预测手段,APC基因的某些sSNP引起的突变效应可以解释部分APC阴性FAP的病因。 展开更多

关键词 基因 腺瘤息肉病 结肠 遗传性疾病 先天性 家族性腺瘤样息肉病 APC基因 同义突变SNP 生物信息学工具

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ABCA3基因同义突变与内蒙古地区蒙汉族新生儿呼吸窘迫综合征的相关性研究 被引量：2

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作者 霍梦月 梅花 +4 位作者 张钰恒 张艳波 曹晓梅 刘春枝 胡亚楠 《中华急诊医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期671-676,共6页

目的探讨三磷酸腺苷结合盒A3转运体(ABCA3)基因同义变异是否会增加内蒙古地区蒙汉族新生儿患呼吸窘迫综合征(RDS)的风险.方法对2018年01月至2019年06月于内蒙古医科大学附属医院新生儿科住院的蒙汉族RDS患儿与对照组患儿行ABCA3外显子... 目的探讨三磷酸腺苷结合盒A3转运体(ABCA3)基因同义变异是否会增加内蒙古地区蒙汉族新生儿患呼吸窘迫综合征(RDS)的风险.方法对2018年01月至2019年06月于内蒙古医科大学附属医院新生儿科住院的蒙汉族RDS患儿与对照组患儿行ABCA3外显子基因测序,分析ABCA3基因是否存在同义突变。结果共纳入RDS患儿101例,其中蒙古族患儿37例,汉族患儿64例;对照组113例,其中蒙古族患儿45例,汉族患儿68例。蒙汉族RDS患儿与对照组患儿均可检出多个同义突变位点,如:F353F、P585P、A227A、V150V、L982L、A928A、S1372S、P1653P、E1618E、及A1027A等,其中p.A227A,p.F353F,p.P585P和p.S1372S四个同义变异体是常见的同义突变体:,无论蒙古族与汉族,RDS组患儿ABCA3基因同义突变频率均高于对照组患儿,差异有统计学意义(蒙古族:x^(2)=9.402,P=0.002;汉族:x^(2)=9.348,P=0.002)。蒙汉族RDS患儿F353F位点及P585P位点突变率高于对照组患儿,差异有统计学意义(蒙古族F353F位点:x^(2)=5.270,P=O.022;汉族F353F位点:x^(2)=5.532,P=0.019蒙古族P585P位点:x^(2)=4.711,P=0.030;汉族P585P位点:x^(2)=4.480,P=0.034)结论ABCA3基因的同义变异可能会增加内蒙古地区蒙汉族新生儿患RDS的风险,其中F353F位点及P585P位点可能是内蒙古地区蒙汉族新生儿患RDS的易感基因之一。 展开更多

关键词 新生儿 呼吸窘迫综合征 ABCA3基因 同义突变 易感基因 蒙古族 汉族 基因多态性

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同义突变SND1慢病毒质粒的构建及回复表达 被引量：1

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作者 哈传博 赵然 +3 位作者 雷静 高茹 杨洁 辛灵彪 《生物技术》 CAS 2018年第4期329-334,391,共7页

[目的]构建抵抗shRNA的同义突变SND1慢病毒质粒,并在SND1敲低的卵巢癌细胞系中回复表达SND1。[方法]依据密码子的简并性,针对shRNA识别的序列(TCTCGTCTCAAACTCTATTTG)设计同义突变序列(TAGGTATAACTTTAACCTGCT)并通过重叠延伸PCR的方法... [目的]构建抵抗shRNA的同义突变SND1慢病毒质粒,并在SND1敲低的卵巢癌细胞系中回复表达SND1。[方法]依据密码子的简并性,针对shRNA识别的序列(TCTCGTCTCAAACTCTATTTG)设计同义突变序列(TAGGTATAACTTTAACCTGCT)并通过重叠延伸PCR的方法将同义突变序列引入SND1的编码序列中,得到recombination SND1(rSND1)目的片段,与pLVX-IRES-Hyg载体连接。测序验证pLVX-FLAG-rSND1质粒序列。pLVX-FLAG-rSND1质粒与包装质粒共转染293T细胞,获得携带FLAG-rSND1的慢病毒毒粒。用慢病毒感染SND1敲低的卵巢癌SKOV3-sh SND1-2细胞株,经潮霉素B筛选后,用Western Blot检测FLAG和SND1的表达。[结果]抵抗shRNA的真核pLVX-FLAG-rSND1重组慢病毒质粒构建成功,可检测到FLAG及SND1的表达。[结论]成功构建了同义突变SND1的pLVX-FLAG-rSND1质粒并在卵巢癌细胞中回复表达,为继续研究SND1蛋白在卵巢癌中的功能奠定了基础。 展开更多

关键词 SND1 质粒构建 重叠延伸PCR 同义突变 慢病毒

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猪嗜血支原体OxaA基因的同义定点突变、克隆及在Vero细胞中的表达 被引量：2

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作者 刘明明 贾立军 +2 位作者 薛书江 梁晚枫 张守发 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期592-594,共3页

为真核表达猪嗜血支原体(Mycoplasma suis)膜蛋白OxaA基因,本实验采用PCR技术扩增包含OxaA基因全长在内的1 561 bp序列,通过引物突变法对OxaA基因内部的两个编码蛋白障碍的碱基进行同义定点突变,应用Overlap PCR技术将3对引物扩增得到的... 为真核表达猪嗜血支原体(Mycoplasma suis)膜蛋白OxaA基因,本实验采用PCR技术扩增包含OxaA基因全长在内的1 561 bp序列,通过引物突变法对OxaA基因内部的两个编码蛋白障碍的碱基进行同义定点突变,应用Overlap PCR技术将3对引物扩增得到的OxaA片段进行拼接,获得能够正确翻译膜蛋白的OxaA基因序列,将鉴定正确的pVAX-OxaA重组质粒转染Vero细胞,应用IFA和western blot方法鉴定OxaA基因在Vero细胞中的表达。结果显示,突变的OxaA基因经Overlap PCR扩增获得长度为747 bp的基因片段,与GenBank中M.suis基因组的核苷酸序列同源性为98%,IFA检测OxaA基因在Vero细胞中获得瞬时表达,western blot分析表达蛋白的分子量为29 ku,具有较好的反应原性。本实验首次在真核细胞中表达了M.suis的QxaA基因,为M.suis基因疫苗的研究奠定了基础。 展开更多

关键词 猪嗜血支原体 OxaA基因 同义定点突变 真核表达

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GHR基因多态性与鸡生长、屠体性状的相关性分析

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作者 张帅 郑子健 罗文 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期95-100,共6页

鸡的生长轴上,GH(生长激素)作为调节动物生长的重要激素,具有促进生长的功能。GH通过结合靶细胞表面的GHR(生长激素受体),形成GHR传导信号进入细胞产生生理功能。因此,GHR基因是GH调节细胞生理功能的关键基因。为了解GHR基因多态性与肉... 鸡的生长轴上,GH(生长激素)作为调节动物生长的重要激素,具有促进生长的功能。GH通过结合靶细胞表面的GHR(生长激素受体),形成GHR传导信号进入细胞产生生理功能。因此,GHR基因是GH调节细胞生理功能的关键基因。为了解GHR基因多态性与肉鸡生长、屠体性状的关联,本试验以“杏花鸡×隐性白洛克鸡”F2代资源群作为试验材料,通过PCR扩增和直接测序方法对GHR基因外显子的多态性进行检测,在第10外显子区域中发现2个SNP位点:A1514T和G1595A。关联分析结果显示,A1514T与鸡的活重、胸重、腿重、翅膀重、屠体重、胸肌剪切力等多个与生长和肉质相关的性状显著关联,G1595A与鸡的活重、腿肉重、屠体重、腿肌肉色、腿肌剪切力、胸肌剪切力、腿肌pH值和腿肌电导率等多个性状显著相关。生物信息学分析表明,2个SNPs属于同义突变,其可能导致GHR mRNA二级结构改变,还将导致GHR mRNA翻译过程中选择使用频率更低的密码子,从而可能影响GHR mRNA的翻译效率,进而影响GHR蛋白含量。综上所述,鸡GHR基因第10外显子上的2个同义突变可影响肉鸡生长和屠体性状。 展开更多

关键词 生长激素受体基因(GHR) SNP 生长性状 同义突变 鸡

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酿酒酵母APA1的定点突变以及与增强型绿色荧光蛋白EGFP基因的共表达 被引量：1

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作者 马涛 姚明月 刘延琳 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第23期200-204,共5页

应用基因突变技术向酿酒酵母APA1基因中引入同义突变,为进一步研究APA1表达量与酿酒酵母硫化氢产量的关系提供实验基础。从酿酒酵母S288c中利用聚合酶链式反应扩增APA1基因,与EGFP基因融合构建表达载体。以该载体为模板,通过一步法点突... 应用基因突变技术向酿酒酵母APA1基因中引入同义突变,为进一步研究APA1表达量与酿酒酵母硫化氢产量的关系提供实验基础。从酿酒酵母S288c中利用聚合酶链式反应扩增APA1基因,与EGFP基因融合构建表达载体。以该载体为模板,通过一步法点突变技术向APA1基因中分别引入APA1-1/2/3/4 4个突变。测序结果表明突变位点与预期结果一致。成功获得了APA1的4个同义突变。一步法点突变技术是一种高效的定点突变方法。分别转化酿酒酵母YS59,荧光显微镜下可见绿色激发荧光,表明APA1-1/2/3/4与EGFP基因共表达。 展开更多

关键词 载体构建 酿酒酵母 同义突变

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同义密码子的频率分布

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作者 罗辽复 《内蒙古大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 1989年第1期71-76,共6页

本文提出了关于同义密码子非无规分布的一个机制,从主方程出发,如果只考虑同义突变由图论方法证明了密码子的均匀分布,但是如果考虑了不同氮基酸间的突变,便可导出同义密码子的非无规分布。后者反映了选择约束对密码子分布的影响。

关键词 密码子 同义突变 氨基酸 主方程

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非小细胞肺癌表皮生长因子受体第19、21号外显子突变研究 被引量：1

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作者 叶雪梅 毛伟敏 +3 位作者 刘杏娥 陈国平 赵力 谢海宝 《浙江医学》 CAS 2010年第3期338-342,共5页

目的分析非小细胞肺癌（NSCLC）患者肺癌组织中的表皮生长因子受体（EGFR）第19、21号外显子（exon19、21）的突变率、突变类型及其与患者临床特征的关系。方法从90例可手术的NSCLC患者的肺癌组织中提取DNA，扩增EGFR基因的19和21号外... 目的分析非小细胞肺癌（NSCLC）患者肺癌组织中的表皮生长因子受体（EGFR）第19、21号外显子（exon19、21）的突变率、突变类型及其与患者临床特征的关系。方法从90例可手术的NSCLC患者的肺癌组织中提取DNA，扩增EGFR基因的19和21号外显子基因片段，从正反两个方向对进行DNA测序和分析。结果90例NSCLC患者中检测到29例（32．2％）有EGFR基因的经典突变。29例突变中包括16例（55.2％）发生于exon 19上的缺失突变，13例（44．8％）发生于exon 21上的替代突变。腺癌和细支气管肺泡癌的突变率明显高于鳞癌[13／34（38．2％），（9／10）90．0％与7／46（15.2％），P〈0.001]；非吸烟者的突变率高于吸烟者[18／36（50．0％）与11／54（20．4％）．P〈0.001]；女性突变率也高于男性[15／25（60．0％）与14／65（21．5％）．P〈0．01]；而突变率与患者年龄及分期无关（P均〉0．05]。另外，47例（52．2％）患者存在同义突变S749S（A 2244 G）。鳞癌患者突变率高于腺癌或支气管肺泡癌（P〈0．05），而其突变率与患者性别、年龄、吸烟状况、TNM分期无明显相关（P〉0．05）。结论NSCLC患者EGFR的突变率较高，总突变率为3212％。腺癌（尤其是细支气管肺泡癌）、不吸烟及女性患者是预测突变的四个重要因素。发现同义突变，并且与患者病理类型有关，在鳞癌中多见，与其他因素无关，并探讨其遗传生物学效应，初步猜测可能与EGFR酪氨酸激酶抑制剂（EGFR—TKI）耐药相关。 展开更多

关键词 肺癌 非小细胞 表皮生长因子受体 突变 同义突变

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一种高效的β地中海贫血CD17(A>T)点突变293T细胞系的建立

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作者 刘永祥 蔡炳 +3 位作者 许言 曾艳红 周少虎 麦庆云 《中国临床解剖学杂志》 CSCD 北大核心 2022年第5期581-586,共6页

目的 建立一种高效构建β-地中海贫血CD17(A>T)点突变基因型HEK293T细胞系的方法。方法 利用改良的CRISPR/Cas9基因编辑技术,即无痕基因组编辑(consecutive re-Guide or re-Cas steps to erase CRISPR/Cas-blocked targets, CORRECT)... 目的 建立一种高效构建β-地中海贫血CD17(A>T)点突变基因型HEK293T细胞系的方法。方法 利用改良的CRISPR/Cas9基因编辑技术,即无痕基因组编辑(consecutive re-Guide or re-Cas steps to erase CRISPR/Cas-blocked targets, CORRECT),通过电转染CRISPR/Cas9质粒诱导HEK293T细胞HBB基因切割,同时以引入有CD17(A>T)点突变和同义突变碱基(G>T)的单链寡核苷酸(singlestranded oligo DNA nucleotides, ssODNs)作为同源模板进行重组,经单克隆筛选、测序验证获得β-珠蛋白基因(HBB)点突变CD17(A>T)基因型HEK293T细胞系。结果 利用“CORRECT”技术成功获得一株β-地贫CD17(A>T)基因型点突变的HEK293T细胞系,同义突变的引入减少Cas9蛋白对靶点不准确的再编辑,提高单碱基突变效率。结论 通过“CORRECT”技术可以高效获得点突变的293T细胞系,对单碱基突变疾病模型的细胞系及动物模型的建立具有重要意义。 展开更多

关键词 地中海贫血 CRISPR/Cas9 同义突变 单碱基突变

原文传递

白三叶类黄酮合成基因TrCHI的克隆及转录分析

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作者 张婷婷 刘洋 +1 位作者 张鹤山 许本波 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期2547-2555,共9页

为研究白三叶类黄酮合成途径的关键基因TrCHI在白三叶(Trifolium repens)花色形成中的作用,以白三叶野生型和红花突变体为材料,通过同源克隆得到TrCHI基因并进行转录分析和CHI酶活性测定。结果表明,白三叶野生型TrCHI基因开放阅读框长66... 为研究白三叶类黄酮合成途径的关键基因TrCHI在白三叶(Trifolium repens)花色形成中的作用,以白三叶野生型和红花突变体为材料,通过同源克隆得到TrCHI基因并进行转录分析和CHI酶活性测定。结果表明,白三叶野生型TrCHI基因开放阅读框长660 bp,编码219个氨基酸,其红花突变体TrCHI开放阅读框长度为669 bp,编码222个氨基酸。7处氨基酸突变包括:第13号位的谷氨酸突变成天冬氨酸,第75号位的谷氨酸突变成谷氨酰胺,第154号位的丝氨酸突变成苏氨酸,第218号位的赖氨酸突变成精氨酸,并在末尾增加了甘氨酸、蛋氨酸和赖氨酸。进化分析发现,CHI基因进化具有物种保守性,Tr CHI属于Ⅱ型CHI。花瓣、根和叶柄中,红花突变体TrCHI转录水平显著高于野生型;但在茎、叶和花梗中,红花突变体TrCHI基因转录水平低于野生型。突变体花瓣中CHI酶活性极显著高于野生型(P<0.001)。推测白三叶突变体的红花表型与TrCHI基因突变并对白三叶中的类黄酮化合物的合成调控有关。本研究为进一步研究TrCHI在白三叶上的潜在功能提供了一定的价值。 展开更多

关键词 基因克隆 同义突变 错义突变 开放阅读框 进化分析 转录水平 CHI酶活性分析

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