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一株深海热液口超嗜热古菌的分类鉴定及高温酶活性研究 被引量:9
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作者 王淑军 陆兆新 +3 位作者 吕明生 刘红飞 徐金利 杨磊 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期130-136,共7页
对一株分离自深海热液口古菌HJ21进行了分类鉴定及高温酶活性的研究。该菌株是极端嗜热的厌氧球菌,直径为1.0~1.2μm。菌株最适生长温度88℃;菌株生长pH为5.0—9.0,最适pH为6.5~7.0;菌株生长NaCI质量浓度为10~50g·L^-... 对一株分离自深海热液口古菌HJ21进行了分类鉴定及高温酶活性的研究。该菌株是极端嗜热的厌氧球菌,直径为1.0~1.2μm。菌株最适生长温度88℃;菌株生长pH为5.0—9.0,最适pH为6.5~7.0;菌株生长NaCI质量浓度为10~50g·L^-1,最适为20g·L^-1。根据其形态特征、生理生化特性以及16S rRNA基因序列分析结果,确定HJ21菌株为热球菌属(Thermococcus)。该菌株能产生高热稳定的高温α-淀粉酶、普鲁兰酶、α-葡萄糖苷酶和蛋白酶,这些酶的最适作用温度分别为95、95、100和100℃,α-淀粉酶、普鲁兰酶和α-葡萄糖苷酶在90℃的半衰期分别为5、5和2h;蛋白酶在100℃保温2.5h后仍具有84%的酶活性。 展开更多
关键词 深海液口 嗜热古菌 16S RRNA Α-淀粉酶 普鲁兰酶 Α-葡萄糖苷酶 蛋白酶
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嗜热古菌Thermococcus sp.HJ21产高温普鲁兰酶条件和酶学性质 被引量:12
2
作者 徐金利 吕明生 +3 位作者 王淑军 李华钟 孙玉英 房耀维 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期243-249,共7页
对一株分离自热液口的超嗜热古菌(Thermococcussp.HJ21)菌株产普鲁兰酶的条件及酶学性质进行了研究。结果发现:该菌株在18h产酶量达到最高。在发酵温度为88℃、培养基初始pH6.5,以及NaCl质量浓度为2.5g/dL时,产酶较高。麦芽糖... 对一株分离自热液口的超嗜热古菌(Thermococcussp.HJ21)菌株产普鲁兰酶的条件及酶学性质进行了研究。结果发现:该菌株在18h产酶量达到最高。在发酵温度为88℃、培养基初始pH6.5,以及NaCl质量浓度为2.5g/dL时,产酶较高。麦芽糖、酵母粉和蛋白胨有利于普鲁兰酶的产生。该酶的最适作用温度为95℃,在80~100℃之间仍可保持较高的酶活性;该酶具有较好的热稳定性,100℃保温2h,仍有50%以上的残余酶活。该酶的最适作用pH为6.0,并且在PH5.0~7.0之间可以保持较高酶活性;在pH5.0~7.0之间较稳定,在pH6.5时稳定性最好。Ca2+和Na+对普鲁兰酶具有较强的激活作用,而Al3+、Ni2+、Hg2+、Cu2+等则强烈抑制酶的活性。 展开更多
关键词 嗜热古菌HJ21 普鲁兰酶 酶学性质
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超嗜热古菌Thermococcus sp.HJ21产高温α-葡萄糖苷酶条件和酶学性质初步研究 被引量:7
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作者 杨磊 吕明生 +3 位作者 王淑军 房耀维 刘姝 李华钟 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期1-6,共6页
对1株分离自深海热液口的超嗜热古菌(Thermococcus sp.HJ21)菌株进行了产α-葡萄糖苷酶条件的优化和酶学性质的初步研究。结果表明,该菌株发酵时间为6h时,较适合产胞内α-葡萄糖苷酶,发酵时间为21 h时较适合产胞外α-葡萄糖苷酶。其最... 对1株分离自深海热液口的超嗜热古菌(Thermococcus sp.HJ21)菌株进行了产α-葡萄糖苷酶条件的优化和酶学性质的初步研究。结果表明,该菌株发酵时间为6h时,较适合产胞内α-葡萄糖苷酶,发酵时间为21 h时较适合产胞外α-葡萄糖苷酶。其最适产酶温度为85℃,pH为6.5,NaCl浓度为2.5%。可溶性淀粉、酵母粉和蛋白胨促进产酶。该酶的最适作用温度为100℃,90℃半衰期(t_(1/2))为2h。最适酶作用pH值为7.0,在pH值5.0~8.0酶活力相对稳定。金属离子Cu^(2+)、Al^(3+)、Ni^(2+)对该酶有较明显抑制作用,Hg^(2+)几乎完全抑制该酶的活性,而EDTA、Fe^(3+)和K^+对该酶有激活作用。 展开更多
关键词 嗜热古菌 THERMOCOCCUS Α-葡萄糖苷酶 酶学性质
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超嗜热古菌耐热酸性α-淀粉酶的发酵条件和酶学性质研究 被引量:4
4
作者 王淑军 陆兆新 +4 位作者 秦松 吕明生 李富超 刘红飞 邓祥元 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期19-26,共8页
对一株分离自深海热液口的超嗜热古菌(Thermococcus sp.HJ21)菌株进行了α-淀粉酶发酵条件的优化和酶学性质的研究。该菌株发酵9h后到达产酶高峰,产酶温度范围为60—90℃,其最适产酶温度为80℃。产酶pH范围为5.0—9.0,最适产酶pH为7.5... 对一株分离自深海热液口的超嗜热古菌(Thermococcus sp.HJ21)菌株进行了α-淀粉酶发酵条件的优化和酶学性质的研究。该菌株发酵9h后到达产酶高峰,产酶温度范围为60—90℃,其最适产酶温度为80℃。产酶pH范围为5.0—9.0,最适产酶pH为7.5。产酶NaCl浓度范围为0.5%—4.0%,2.5%为最适宜NaCl浓度。糖原、淀粉、麦芽糖、酵母膏和蛋白胨促进产酶。该菌株产生的α-淀粉酶的分子量为51.4kDa,酶的最适作用温度为95℃,在100℃仍有60%的酶活力。酶在90℃的半衰期为5h,在100℃2h仍有40%的残余酶活,酶的热稳定性不依赖Ca2+。酶的最适作用pH为5.0,pH4.5仍有80%的酶活力,pH在5.5—7.0较稳定(80℃4h)。金属离子1mmol/L的Mg2+、Co2+、Sr2+、Ba2+、K+、Na+对酶有激活作用,Cu2+、Pb2+、Hg2+、Zn2+、Al3+对该酶均有抑制作用。 展开更多
关键词 嗜热古菌 Α-淀粉酶 产酶条件 酶学性质
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极端嗜热古菌的热休克蛋白 被引量:5
5
作者 陈华友 张春霞 +1 位作者 马晓珂 张毅 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期2011-2021,共11页
随着生物工程产业对于耐高温酶和菌体的需求,极端嗜热古菌热休克蛋白(Heatshock proteins,HSPs)的研究更受重视,其热休克蛋白体系非常简洁,不含HSP100s和HSP90s,就是HSP70(DnaK)、HSP40(DnaJ)和GrpE等嗜温古菌可能含有的在极端嗜热古菌... 随着生物工程产业对于耐高温酶和菌体的需求,极端嗜热古菌热休克蛋白(Heatshock proteins,HSPs)的研究更受重视,其热休克蛋白体系非常简洁,不含HSP100s和HSP90s,就是HSP70(DnaK)、HSP40(DnaJ)和GrpE等嗜温古菌可能含有的在极端嗜热古菌中几乎不含有,即仅包括HSP60、sHSP、prefoldin和AAA+蛋白4大类,因此对其结构、功能和作用机制的研究在理论和实践上都特别有意义。系统地介绍了这4大类组分的结构、功能、作用机制和协同作用的研究进展,论述了极端嗜热古菌热休克蛋白的系列研究难点和困惑,展望了进一步的研究方向和重点。 展开更多
关键词 休克蛋白 极端嗜热古菌 协同作用 原始聚体
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超嗜热古菌Sulfolobus tokodaii RadA蛋白的克隆表达及其辐射可诱导性 被引量:3
6
作者 盛多红 朱珊珊 +3 位作者 李铭峰 焦建东 倪金凤 申玉龙 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期317-322,共6页
RecA/Rad51/RadA家族蛋白是细胞内重要的重组修复蛋白,在功能上非常保守。研究发现在细菌、真核生物、甲烷古菌和嗜盐古菌细胞内RecA/Rad51/RadA均可以受紫外线辐射诱导转录。而对极端嗜热古菌中的RadA辐射可诱导性仍存在争议。通过体... RecA/Rad51/RadA家族蛋白是细胞内重要的重组修复蛋白,在功能上非常保守。研究发现在细菌、真核生物、甲烷古菌和嗜盐古菌细胞内RecA/Rad51/RadA均可以受紫外线辐射诱导转录。而对极端嗜热古菌中的RadA辐射可诱导性仍存在争议。通过体外表达极端嗜热古菌Sulfolobus tokodaii的RadA蛋白,制备抗体,利用免疫学方法并结合RT-PCR分析,对嗜热古菌S.tokodaii中RadA的辐射诱导进行了研究。经过100J/m2和200J/m2UV辐照处理,radA基因的转录分别上调了2倍和3倍,同时RadA蛋白的表达分别上升了1.5倍和1倍。实验结果表明S.tokodaii中RadA可以被紫外线辐射诱导表达,证实了极端嗜热古菌S.tokodaii细胞中存在DNA损伤诱导反应的观点。 展开更多
关键词 嗜热古菌 RADA 辐射可诱导性 DNA修复
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极端嗜热古菌——芝田硫化叶菌DNA解旋酶的分离纯化和性质研究 被引量:1
7
作者 李昉 郝福英 黄力 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期340-347,共8页
采用QSepharose离子交换层析、磷酸纤维素P1 1吸附层析、肝素琼脂糖吸附层析、Su perdex 2 0 0凝胶过滤和PhenylSuperose疏水层析等步骤 ,从嗜酸热芝田硫化叶菌细胞裂解液中分离纯化了一个DNA解旋酶。该解旋酶具有受DNA激活的ATP酶活性... 采用QSepharose离子交换层析、磷酸纤维素P1 1吸附层析、肝素琼脂糖吸附层析、Su perdex 2 0 0凝胶过滤和PhenylSuperose疏水层析等步骤 ,从嗜酸热芝田硫化叶菌细胞裂解液中分离纯化了一个DNA解旋酶。该解旋酶具有受DNA激活的ATP酶活性。根据SDS PAGE测定结果 ,该酶的分子质量约为 63kD。芝田硫化叶菌DNA解旋酶可以解开底物上 70bp的双链区 ,其解旋活性依赖于双链区旁的单链分叉。该解旋酶的活性依赖于Mg2 + 和ATP的水解 ,在NaCl浓度超过 2 0 0mmol L时受到抑制。该酶的最适pH为 6 7。该酶在 40℃~ 80℃之间均有活性 ,70℃时活性最高。芝田硫化叶菌DNA解旋酶是从古菌中分离得到的第一个天然DNA解旋酶。 展开更多
关键词 极端嗜热古菌 芝田硫化叶 DNA解旋酶 分离 纯化 性质
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极端嗜热古菌—芝田硫化叶菌反向旋转酶的快速纯化
8
作者 戴鹏高 黄力 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期241-244,共4页
反向旋转酶是一种I型拓扑异构酶 ,它可以利用ATP水解的能量向DNA分子中引入正超螺旋。通过阴离子交换层析、亲和层析、聚丙烯酰胺凝胶电泳 (SDS PAGE)从芝田硫化叶菌 (Sulfolobusshibatae)中分离得到一种反向旋转酶。SDS PAGE显示 ,该... 反向旋转酶是一种I型拓扑异构酶 ,它可以利用ATP水解的能量向DNA分子中引入正超螺旋。通过阴离子交换层析、亲和层析、聚丙烯酰胺凝胶电泳 (SDS PAGE)从芝田硫化叶菌 (Sulfolobusshibatae)中分离得到一种反向旋转酶。SDS PAGE显示 ,该酶分子量约为 1 2 6kD ,N 末端序列测定结果表明 。 展开更多
关键词 极端嗜热古菌 拓扑异构酶 反向旋转酶 SDS-PAGE 纯化
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嗜热古菌S-腺苷甲硫氨酸合成酶的序列分析、基因克隆与异源表达
9
作者 马云婷 裘娟萍 余志良 《工业微生物》 CAS 2017年第4期24-29,共6页
将Methanopyrus sp.SNP6进行功能基因组测序,获得S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(sam)序列,并进行序列分析。将sam基因扩增后连接至表达质粒p ET-28b(+),转化E.coli BL21(DE3),获得重组菌后进行诱导表达。生物信息学分析表明,sam基因编码蛋... 将Methanopyrus sp.SNP6进行功能基因组测序,获得S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(sam)序列,并进行序列分析。将sam基因扩增后连接至表达质粒p ET-28b(+),转化E.coli BL21(DE3),获得重组菌后进行诱导表达。生物信息学分析表明,sam基因编码蛋白的理论分子量为44 086.4Da,三级结构为同源四聚体,与其他相关古菌来源的S-腺苷甲硫氨酸合成酶的蛋白序列较保守。实验结果显示,构建的重组表达质粒p ET28b(+)-sam可在E.coli BL21(DE3)宿主菌中高水平表达。重组蛋白的分子量与预期值基本一致,部分为胞内可溶性表达,另一部分以包涵体形式存在。本研究首次实现了Methanopyrus sp.SNP6菌株S-腺苷甲硫氨酸合成酶的异源表达,为后期的蛋白纯化、酶学性质研究和酶促转化法生产S-腺苷甲硫氨酸奠定了理论基础。 展开更多
关键词 嗜热古菌 S-腺苷甲硫氨酸合成酶 异源表达 序列分析
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极端嗜热古菌的结构与功能
10
作者 方德声 《科学》 2003年第6期63-63,共1页
据国家自然科学基金委员会2003年10月15日报道,中科院微生物所黄力研究员从事的古菌分子生物学研究,取得了国际先进水平的成果。古菌亦称'古细菌',是一类被生物学家认定为与细菌、真核生物并列的原核生物。
关键词 极端嗜热古菌 结构 拓扑异构酶 Sac10b蛋白 分子生物学 原核生物
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来源于超嗜热古菌雅氏火球菌(Pyrococcus yayanosii)CH1耐热耐压脯肽酶的酶学性质研究
11
作者 张欢欢 陈柔珂 徐俊 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1494-1505,共12页
【目的】脯肽酶是一种能从二肽(Xaa-Pro)的C末端水解脯氨酸或羟脯氨酸残基的肽酶。对深海来源的雅氏火球菌(Pyrococcus yayanosii)CH1基因组中PYCH_07700基因编码的蛋白Pyprol的体外酶学性质进行研究,以期发现新型脯肽酶。【方法】在小... 【目的】脯肽酶是一种能从二肽(Xaa-Pro)的C末端水解脯氨酸或羟脯氨酸残基的肽酶。对深海来源的雅氏火球菌(Pyrococcus yayanosii)CH1基因组中PYCH_07700基因编码的蛋白Pyprol的体外酶学性质进行研究,以期发现新型脯肽酶。【方法】在小宝岛热球菌(Thermococcus kodakarensis)TS559中异源表达Pyprol。使用二肽Met-Pro作为底物,检测重组蛋白的脯肽酶活性。【结果】Pyprol的最适温度为100℃,最适pH为6.0。Pyprol在与Co^(2+)结合时活性最高,最适的金属离子浓度为1.2 mmol/L。与P.furiosus来源的脯肽酶Pfprol相比,Pyprol在更宽的pH范围具有活性,并且能够耐受更高浓度的金属离子。Pyprol是耐压蛋白,最适静水压为40 MPa。与常压条件下相比,40 MPa下,Pyprol在40、70和100℃均有更高的活性。【结论】来源于深海热液喷口的严格嗜压的超嗜热古菌P.yayanosii CH1的新型脯肽酶Pyprol具有热稳定和耐压特性。 展开更多
关键词 嗜热古菌 雅氏火球 脯肽酶 稳定 耐压
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超嗜热古菌基因组的热稳定性 被引量:3
12
作者 盛多红 《生命科学》 CSCD 2014年第1期64-71,共8页
超嗜热古菌能够生活在80℃以上的高温环境中,它们的耐热性已经成为当前研究的热点之一。以往对超嗜热菌的认识多集中于蛋白质的耐热性,而很少有关于基因组热稳定性的综述文章。综述了当前对超嗜热古菌的基因组稳定性以及DNA损伤识别机... 超嗜热古菌能够生活在80℃以上的高温环境中,它们的耐热性已经成为当前研究的热点之一。以往对超嗜热菌的认识多集中于蛋白质的耐热性,而很少有关于基因组热稳定性的综述文章。综述了当前对超嗜热古菌的基因组稳定性以及DNA损伤识别机制的研究进展,以期更好地了解超嗜热古菌的耐热机制。 展开更多
关键词 嗜热古菌 基因组稳定性 DNA损伤诱导反应 DNA修复
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极端嗜热古菌——芝田硫化叶菌DNA结合蛋白Ssh12对DNA超螺旋的影响 被引量:1
13
作者 楼慧强 VietQ.Mai 黄力 《中国科学(C辑)》 CSCD 1999年第4期375-381,共7页
通过SPSepharose,DNA纤维素和磷酸纤维素等柱层析 ,从极端嗜热古菌———芝田硫化叶菌 (Sulfolobusshibatae)中纯化得到分子量为 11.5ku的DNA结合蛋白Ssh12 .Ssh12约占细胞总蛋白的 4% .该蛋白既能与负超螺旋DNA也能与松弛DNA结合 .利... 通过SPSepharose,DNA纤维素和磷酸纤维素等柱层析 ,从极端嗜热古菌———芝田硫化叶菌 (Sulfolobusshibatae)中纯化得到分子量为 11.5ku的DNA结合蛋白Ssh12 .Ssh12约占细胞总蛋白的 4% .该蛋白既能与负超螺旋DNA也能与松弛DNA结合 .利用含单切刻环状DNA进行的切刻闭合分析表明 ,Ssh12在与DNA结合时能够固定负超螺旋 .这种能力在室温 ( 2 2℃ )下很弱 ,而在 3 7℃以上则大大增强 .Ssh12的细胞内含量和固定负超螺旋的能力提示 ,该蛋白对于芝田硫化叶菌染色体DNA的组织以及热稳定性起着重要作用 . 展开更多
关键词 极端嗜热古菌 芝田硫化叶 结合蛋白 DNA
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超嗜热古菌遗传操作系统研究进展 被引量:1
14
作者 王飞雁 张松涛 +2 位作者 黄奇洪 申玉龙 倪金凤 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期1418-1423,共6页
遗传操作系统,是研究基因和基因产物功能的一个极为重要的工具。超嗜热古菌遗传操作系统方面的研究落后于甲烷菌及嗜盐古菌中的研究,主要原因是选择标记的缺乏。然而,近十年来,在以硫化叶菌(Sulfolobus)为代表的超嗜热泉古菌和Thermococ... 遗传操作系统,是研究基因和基因产物功能的一个极为重要的工具。超嗜热古菌遗传操作系统方面的研究落后于甲烷菌及嗜盐古菌中的研究,主要原因是选择标记的缺乏。然而,近十年来,在以硫化叶菌(Sulfolobus)为代表的超嗜热泉古菌和Thermococcus kodakaraensis为代表的超嗜热广古菌中,遗传操作系统研究取得了很大的进展。本文主要对这两种超嗜热古菌的遗传操作系统进展以及应用进行概述。 展开更多
关键词 嗜热古菌 遗传操作系统 SULFOLOBUS THERMOCOCCUS kodakaraensis
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超嗜热古菌Thermococcus eurythermalis A501编码B家族DNA聚合酶的生化特性及PCR应用 被引量:2
15
作者 翁妍 刘喜朋 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期807-819,共13页
DNA聚合酶广泛应用于PCR技术,在生命科学研究及相关领域发挥重要作用。但目前商业化DNA聚合酶仍不能完全满足科研需要,有必要寻求高性能DNA聚合酶。文中克隆表达了超嗜热古菌(Thermococcus eurythermalis)A501来源的B家族DNA聚合酶基因(... DNA聚合酶广泛应用于PCR技术,在生命科学研究及相关领域发挥重要作用。但目前商业化DNA聚合酶仍不能完全满足科研需要,有必要寻求高性能DNA聚合酶。文中克隆表达了超嗜热古菌(Thermococcus eurythermalis)A501来源的B家族DNA聚合酶基因(NCBI数据库基因登录号为TEU_RS04875)、表征该重组蛋白的生化特性、评价了其PCR应用。将删除intein蛋白序列的DNA聚合酶(Teu-PolB)进行体外重组表达,经亲和层析和离子交换层析纯化获得Teu-PolB蛋白;利用5′端带荧光标记的寡核苷酸作为底物,用尿素变性聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定Teu-PolB的生化特性;以噬菌体λDNA基因组为模板,探究Teu-PolB的PCR应用。结果显示,Teu-PolB具有DNA聚合酶活性和3′→5′核酸外切酶活性,该酶在98℃下的半衰期约为2 h,热稳定性高。使用Teu-PolB进行PCR扩增,最适PCR缓冲液为50 mmol/L Tris-HCl pH 8.0,2.5 mmol/L MgCl_(2),60 mmol/L KCl,10 mmol/L(NH_(4))_(2)SO_(4),0.015%Triton X-100和0.01%BSA,最适延伸温度为68℃。此外,Teu-PolB能在2 kb/min条件下成功扩增4 kb目的片段,扩增产量弱于商品化Taq DNA聚合酶,优于Pfu DNA聚合酶,但扩增速率和保真度优于Taq和Pfu DNA聚合酶,且对盐的耐受性较高。综上所述,本研究鉴定了一种高保真DNA聚合酶Teu-PolB的生化特性,结果表明该酶可应用于PCR扩增,具有热稳定性高、耐盐性能好、扩增速率高、保真度高等特征。 展开更多
关键词 嗜热古菌 DNA聚合酶 PolB PCR
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超嗜热古菌的ATP非依赖型蛋白酶和肽酶研究进展 被引量:1
16
作者 高晓威 唐晓峰 唐兵 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期1373-1382,共10页
蛋白酶和肽酶在超嗜热古菌的营养代谢、蛋白质转换与加工以及蛋白质质量控制等重要生物学过程中发挥关键作用。超嗜热古菌蛋白酶和肽酶具有优良的热稳定性和高温活性,是研究蛋白质耐热分子机制和酶行使功能上限温度等科学问题的理想材料... 蛋白酶和肽酶在超嗜热古菌的营养代谢、蛋白质转换与加工以及蛋白质质量控制等重要生物学过程中发挥关键作用。超嗜热古菌蛋白酶和肽酶具有优良的热稳定性和高温活性,是研究蛋白质耐热分子机制和酶行使功能上限温度等科学问题的理想材料,同时也具有重要的工业应用价值。本文对超嗜热古菌的ATP非依赖型蛋白酶和肽酶的种类、功能、催化特性、热稳定机制以及应用前景进行综述与分析。 展开更多
关键词 嗜热古菌 蛋白酶 肽酶 温度适应 稳定性
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多重极端环境中的生命:深海热液中的超嗜热古菌Thermococclaes 被引量:5
17
作者 赵维殳 肖湘 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2017年第5期470-481,共12页
超嗜热古菌Thermococcales是一类在类早期地球环境深海热液系统中常见的优势微生物类群,同时也是一类很好地适应了热液系统中剧烈波动的理化因子的微生物,部分Thermococcales微生物具有惊人的生长跨度(超过40℃的温度生长跨度、超过5个p... 超嗜热古菌Thermococcales是一类在类早期地球环境深海热液系统中常见的优势微生物类群,同时也是一类很好地适应了热液系统中剧烈波动的理化因子的微生物,部分Thermococcales微生物具有惊人的生长跨度(超过40℃的温度生长跨度、超过5个pH单位的pH生长跨度以及超过80 MPa的压力生长跨度),同时与其他绝大多数微生物相比具有较小的基因组(<2.3 Mb).有关Thermococcales在不同极端环境下的适应性研究发现,其特殊的代谢途径与多重极端环境适应相关,这些代谢途径包括:相容性溶质、能量代谢、膜脂、氨基酸代谢及抗氧化途径,进而发现可能存在应对多重极端环境的共同适应机制.研究Thermococcales的共同适应机制,可帮助探索深部生物圈这样低能、高温极端环境下(包括域外)微生物的生存策略,将为探究早期生命的代谢特点,进而更好地理解生命起源提供宝贵的模型和研究思路,也为合成生物学研究及工业化应用提供理论借鉴与生物材料. 展开更多
关键词 Thermococcales 深海 多重极端环境 适应性 嗜热古菌
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极端嗜热古菌DNA修复核酸内切酶的研究进展 被引量:2
18
作者 李玉婷 史昊强 张立奎 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1889-1896,共8页
极端嗜热古菌由于生活在高温环境,其基因组DNA面临着严重的挑战,因此,它们如何维持其基因组稳定是本研究领域最为关注的科学问题之一。极端嗜热古菌具有与常温微生物相似的自发突变频率,暗示着它们比常温微生物具有更加有效的DNA修复体... 极端嗜热古菌由于生活在高温环境,其基因组DNA面临着严重的挑战,因此,它们如何维持其基因组稳定是本研究领域最为关注的科学问题之一。极端嗜热古菌具有与常温微生物相似的自发突变频率,暗示着它们比常温微生物具有更加有效的DNA修复体系进行修复高温所造成的基因组DNA损伤。目前,极端嗜热古菌DNA修复的分子机制尚不清楚。核酸内切酶在DNA修复途径中发挥着重要的作用。基因组序列显示极端嗜热古菌编码多种DNA修复核酸内切酶,但是其研究尚处于初期阶段。本文综述了极端嗜热古菌DNA修复核酸内切酶Nuc S、Endo V、Endo Q、XPF和Hjc的研究进展,并对今后的研究提出了展望。 展开更多
关键词 极端嗜热古菌 核酸内切酶 DNA修复
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嗜热古菌Archaeoglobus fulgidus RecJ核酸酶的表达纯化及酶学特征 被引量:1
19
作者 王天乐 刘喜朋 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期219-230,共12页
【目的】克隆表达嗜热古菌Archaeoglobus fulgidus (A.fulgidus)来源的RecJ核酸酶基因(ORF编号AF_0699,NCBI数据库基因登陆号为AF_RS03550),对该重组蛋白的核酸酶活性及酶学特征进行鉴定和分析。【方法】将A.fulgidus RecJ (AfuRecJ)核... 【目的】克隆表达嗜热古菌Archaeoglobus fulgidus (A.fulgidus)来源的RecJ核酸酶基因(ORF编号AF_0699,NCBI数据库基因登陆号为AF_RS03550),对该重组蛋白的核酸酶活性及酶学特征进行鉴定和分析。【方法】将A.fulgidus RecJ (AfuRecJ)核酸酶在大肠杆菌中进行重组表达,经亲和层析纯化得到电泳纯蛋白;利用人工合成的带有末端荧光标记的寡核苷酸作为底物,体外反应后,利用8 mol/L尿素变性聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定AfuRecJ核酸酶的水解产物。【结果】AfuRecJ核酸酶具有单链DNA特异性的3’–5’外切核酸酶活性,酶活性依赖于二价金属离子Mn2+或Mg2+,且Mn2+存在条件下的催化效率明显优于Mg2+;其最适反应温度范围为55–65℃;高于200 mmol/L的NaCl会显著抑制AfuRecJ的核酸酶活性。AfuRecJ还具有单链RNA 3’–5’外切酶活性,且活性高于单链DNA底物。单链核酸3’末端的磷酸基团对水解活性有一定抑制作用。AfuRecJ对单链核酸的长度有一定的选择性,可以有效水解长度≥4个核苷酸长度的单链RNA、≥12个核苷酸长度的单链DNA,而且对双链DNA中的3’单链DNA结构(3’突出单链尾巴与末端分叉结构)具有类似单链DNA的水解活性。【结论】本研究证实AfuRecJ是一种单链核酸特异性的3’–5’外切核酸酶,且相比单链DNA,单链RNA为优势底物,推测其在胞内可能参与RNA降解与DNA修复。 展开更多
关键词 嗜热古菌 DNA修复 RecJ核酸酶 核酸酶
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极端嗜酸热古菌S5菌株的重新分类研究 被引量:6
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作者 何正国 李雅芹 周培瑾 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期259-264,共6页
对已经鉴定的嗜酸热硫球菌 (Sulfosphaerellusthermoacidophilumgen.nov .sp .nov)S5菌株的进一步研究发现 ,它既能在好氧条件也能在厌氧条件下代谢元素硫进行化能自养生长 ,结合其 1 6SrRNA基因的分子系统学分析 ,S5菌株应归于Acidianu... 对已经鉴定的嗜酸热硫球菌 (Sulfosphaerellusthermoacidophilumgen.nov .sp .nov)S5菌株的进一步研究发现 ,它既能在好氧条件也能在厌氧条件下代谢元素硫进行化能自养生长 ,结合其 1 6SrRNA基因的分子系统学分析 ,S5菌株应归于Acidianus属。另外 ,S5菌株与Acidianus属中三个已知种基因组DNA的同源性分别仅有 44%、2 2 %和 2 3% ,DNA中G +Cmol%为 38,与已知种 31 0和 32 7有较大差异 ;而且 ,在代谢特性上S5菌株为专性化能无机营养型 ,与Acidianusbrierleyi有明显不同。因此S5菌株应是Acidianus属中一个新种 ,建议定名为 :腾冲嗜酸两面菌 (Acidianustengchongensessp .nov .)。 展开更多
关键词 极端 16SrRNA DNA杂交性 腾冲酸两面 分类
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