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基于气相色谱-质谱和网络药理学探讨蒙药嘎拉图呼和挥发油成分抗胃癌的作用机制
1
作者
刘静
王海生
+7 位作者
张金月
王宇琦
刘星月
孟钰坤
王芳
李君
张微
马宇衡
《内蒙古医科大学学报》
2023年第4期357-360,377,共5页
目的通过提取蒙药嘎拉图呼和挥发油部位,进行化学成分鉴定,结合网络药理学分析探讨传统蒙药嘎拉图呼和抗胃癌潜在作用机制。方法采用气相色谱-质谱(GC-MS)联用法定性分析嘎拉图呼和挥发油部位成分,并结合Pubchem和Swiss TargetPredictio...
目的通过提取蒙药嘎拉图呼和挥发油部位,进行化学成分鉴定,结合网络药理学分析探讨传统蒙药嘎拉图呼和抗胃癌潜在作用机制。方法采用气相色谱-质谱(GC-MS)联用法定性分析嘎拉图呼和挥发油部位成分,并结合Pubchem和Swiss TargetPrediction数据库,进行活性成分靶点的筛选;在Gene Cards、OMIM、Pharm Gkb、TTD、DrugBank数据库中检索胃癌相关的靶点;利用在线Venn将查到的靶点信息取交集;Cytoscape 3.9.0软件构建成分-靶点-疾病网络图筛选关键成分;STRING 11.0数据库构建蛋白互作网络筛选核心作用靶点,利用DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析;利用Discovery Studio 2019进行核心靶点与相应小分子化合物之间分子对接。结果通过GC-MS共鉴定出嘎拉图呼和挥发油部位中56种成分;以GC-MS结果为基础,通过化学成分靶点预测数据库搜索并获得46个活性成分,150个活性靶点;化学成分靶点与胃癌相关靶点取交集,获得135个潜在治疗基因;进行GO功能富集与KEGG通路分析,获得包括G蛋白偶联信号通路、乙酰胆碱受体信号通路等多条胃癌相关信号通路;PPI蛋白互作筛选核心基因,结果显示VEGFA、KDR、PTGS2和MAPK14为挥发油治疗胃癌的潜在作用靶点。结论蒙药嘎拉图呼和挥发油中的46个有效成分可能通过调控VEGFA、KDR、PTGS2和MAPK14参与多条信号通路共同发挥抗胃癌作用。本研究为进一步探讨蒙药复方抗胃癌作用机制提供了数据依据。
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关键词
嘎拉图呼和
胃癌
气相色谱-质谱
网络药理学
分子对接
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职称材料
题名
基于气相色谱-质谱和网络药理学探讨蒙药嘎拉图呼和挥发油成分抗胃癌的作用机制
1
作者
刘静
王海生
张金月
王宇琦
刘星月
孟钰坤
王芳
李君
张微
马宇衡
机构
内蒙古医科大学药学院
内蒙古医科大学基础医学院
出处
《内蒙古医科大学学报》
2023年第4期357-360,377,共5页
基金
内蒙古自治区自然科学基金项目(2023QN08050)
内蒙古自治区高等学校科学研究项目(NJZY23135)
+1 种基金
内蒙古医科大学青年项目(YKD2022QN004)
2022年度大学生创新创业培训计划项目(202210132071)。
文摘
目的通过提取蒙药嘎拉图呼和挥发油部位,进行化学成分鉴定,结合网络药理学分析探讨传统蒙药嘎拉图呼和抗胃癌潜在作用机制。方法采用气相色谱-质谱(GC-MS)联用法定性分析嘎拉图呼和挥发油部位成分,并结合Pubchem和Swiss TargetPrediction数据库,进行活性成分靶点的筛选;在Gene Cards、OMIM、Pharm Gkb、TTD、DrugBank数据库中检索胃癌相关的靶点;利用在线Venn将查到的靶点信息取交集;Cytoscape 3.9.0软件构建成分-靶点-疾病网络图筛选关键成分;STRING 11.0数据库构建蛋白互作网络筛选核心作用靶点,利用DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析;利用Discovery Studio 2019进行核心靶点与相应小分子化合物之间分子对接。结果通过GC-MS共鉴定出嘎拉图呼和挥发油部位中56种成分;以GC-MS结果为基础,通过化学成分靶点预测数据库搜索并获得46个活性成分,150个活性靶点;化学成分靶点与胃癌相关靶点取交集,获得135个潜在治疗基因;进行GO功能富集与KEGG通路分析,获得包括G蛋白偶联信号通路、乙酰胆碱受体信号通路等多条胃癌相关信号通路;PPI蛋白互作筛选核心基因,结果显示VEGFA、KDR、PTGS2和MAPK14为挥发油治疗胃癌的潜在作用靶点。结论蒙药嘎拉图呼和挥发油中的46个有效成分可能通过调控VEGFA、KDR、PTGS2和MAPK14参与多条信号通路共同发挥抗胃癌作用。本研究为进一步探讨蒙药复方抗胃癌作用机制提供了数据依据。
关键词
嘎拉图呼和
胃癌
气相色谱-质谱
网络药理学
分子对接
分类号
R96 [医药卫生—药理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于气相色谱-质谱和网络药理学探讨蒙药嘎拉图呼和挥发油成分抗胃癌的作用机制
刘静
王海生
张金月
王宇琦
刘星月
孟钰坤
王芳
李君
张微
马宇衡
《内蒙古医科大学学报》
2023
0
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