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硅对镉胁迫下水稻苗期抗氧化酶系统及镉离子吸收和转运相关基因表达水平的影响 被引量:1
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作者 黄奇娜 徐有祥 +6 位作者 林光号 党洪阳 郑振权 张燕 王晗 邵国胜 尹献远 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期486-496,共11页
【目的】探究在镉(Cadmium,Cd)胁迫下,外源硅(Silicon,Si)对水稻株高、干物质量、抗氧化酶系统及对Cd^(2+)相关基因表达水平的影响,以期为阐明Si缓解Cd对水稻毒害作用机理提供理论依据。【方法】以辐品36(FP36)和中嘉早17(ZJZ17)为研究... 【目的】探究在镉(Cadmium,Cd)胁迫下,外源硅(Silicon,Si)对水稻株高、干物质量、抗氧化酶系统及对Cd^(2+)相关基因表达水平的影响,以期为阐明Si缓解Cd对水稻毒害作用机理提供理论依据。【方法】以辐品36(FP36)和中嘉早17(ZJZ17)为研究对象,通过设置不同Cd胁迫浓度(0、5μmol/L)和Si处理(0、10μmol/L、1 mmol/L)进行水培实验,重点分析处理后水稻农艺性状和抗氧化酶活性,以及Cd^(2+)吸收、转运相关基因表达水平的差异。【结果】Cd胁迫可以显著抑制水稻株高、干物质量和抗氧化酶(SOD、POD、CAT和APX)活性;但Si能有效缓解Cd毒害,显著提高水稻生物量,增强抗氧化酶活性,其中1 mmol/L Si缓解效果更佳。此外,Si还能有效增加可溶性蛋白并降低MDA含量。Cd胁迫显著增加了FP36和ZJZ17不同组织的重金属含量,其中,根系中Cd积累量显著高于地上部。在添加较低浓度Si(10μmol/L)后,水稻根系和地上部Cd含量无显著差异;但1 mmol/L Si能显著降低水稻根系和地上部Cd含量。OsNRAMP1、OsNRAMP5、OsIRT1、OsHMA2、OsHMA3等Cd^(2+)吸收和转运相关基因的表达水平在镉胁迫和Si处理后呈不同的变化趋势。其中,OsNRAMP1、OsIRT1、OsHMA2的表达量受Cd胁迫影响有所上调,OsNRAMP5表达量呈下调趋势,而OsHMA3则无显著变化。而外源添加1 mmol/L Si可显著下调上述Cd^(2+)吸收和转运相关基因的表达水平,重金属镉积累量下降。【结论】Si通过改善水稻的农艺性状、激活抗氧化系统,以及调控重金属Cd^(2+)吸收和转运相关基因的表达水平来缓解镉对水稻的毒害作用。 展开更多
关键词 水稻 镉胁迫 抗氧化酶系统 基因表达水平
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离心机训练对大鼠脑及其它组织IL-6和TNFα基因表达水平的影响 被引量:6
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作者 刘建彬 王洪波 +2 位作者 刘丽 梁雪清 于立身 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期649-653,共5页
为了解离心机训练前后大鼠脑及心、肺、肾和小肠组织中IL 6和TNFα基因表达水平的变化 ,对雄性SD大鼠进行动物离心机训练 ,刺激值从 + 7Gz~ + 12Gz ,每天增加 + 0 5Gz ,第 12d重复 + 12Gz刺激 ,第 13d离心机训练后 ,断头处死 ,取心、... 为了解离心机训练前后大鼠脑及心、肺、肾和小肠组织中IL 6和TNFα基因表达水平的变化 ,对雄性SD大鼠进行动物离心机训练 ,刺激值从 + 7Gz~ + 12Gz ,每天增加 + 0 5Gz ,第 12d重复 + 12Gz刺激 ,第 13d离心机训练后 ,断头处死 ,取心、脑、肺、肾和小肠组织 ,分别提取mRNA并定量 .用地高辛标记IL 6和TNFαcDNA作为探针 ,进行狭缝杂交 ,杂交结果通过光密度扫描定量后 ,进行统计学处理 .离心机训练不同时间 ,比较大鼠各组织IL 6和TNFα基因表达水平的变化 .结果显示随着训练时间的延长 ,表达水平均有所差异 .提示训练对大鼠脑及其它主要组织IL 6和TNFα基因表达水平有影响 。 展开更多
关键词 离心机训练 大鼠脑 IL-6 TNFΑ 基因表达水平 脑组织 心肌组织 加速度耐力
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胃癌组织中肝细胞生长因子受体表皮生长因子受体人类表皮生长因子受体-2基因表达水平与晚期胃癌化疗效果及患者预后的关系 被引量:7
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作者 赵郁 朱晓婷 王轶楠 《山西医药杂志》 CAS 2016年第24期2907-2909,共3页
随着人群生活饮食习惯的改变,胃癌的发病率及病死率逐年上升,胃癌根治术是目前唯一可能治愈胃癌的手段。但是目前仍有大多数胃癌患者确诊时失去手术价值,化疗成为其主要治疗方式之一。
关键词 表皮生长因子受体-2 肝细胞生长因子受体 晚期胃癌 化疗效果 胃癌患者 基因表达水平 胃癌组织 预后
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人外周血心肌肌钙蛋白Ⅰ基因表达水平与心肌损伤程度的关系 被引量:1
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作者 姚登福 朱健华 +3 位作者 吴玮 高增栋 吴信华 邱历伟 《中国临床康复》 CSCD 2004年第30期6625-6627,i001,共4页
目的:分子生物技术的发展,使监测心肌微小损伤成为可能。探讨外周血心肌肌钙蛋白Ⅰ(cardiactroponinⅠ,cTnⅠ)-mRNA对心肌损伤诊断的临床价值。方法:以电镜观察心肌损伤时的超微结构改变;从心肌组织和外周血中制备总RNA,以随机引物和反... 目的:分子生物技术的发展,使监测心肌微小损伤成为可能。探讨外周血心肌肌钙蛋白Ⅰ(cardiactroponinⅠ,cTnⅠ)-mRNA对心肌损伤诊断的临床价值。方法:以电镜观察心肌损伤时的超微结构改变;从心肌组织和外周血中制备总RNA,以随机引物和反转录酶合成cTnⅠ-cDNA,再以巢式PCR扩增和测序分析;将cTnⅠ-mRNA扩增法用于临床诊断,与心肌酶谱(CK,CK-MB,AST,LDH)及cTnⅠ定性比较,以探讨其临床价值。结果:心肌损伤组织超微结构表现为心肌线粒体肿胀、嵴断裂、严重空泡样变及细胞核异形变、染色质浓缩边聚。巢式PCR法扩增cTnⅠ-mRNA片段的灵敏度为2μg/L,测序分析证实从心肌组织及外周血中扩增基因片段与原序列完全一致。对62例慢性心脏病患者外周血cTnⅠ-mRNA的扩增分析,其阳性率明显高于酶谱或cTnⅠ定性分析(P<0.05)。结论:心肌损伤时cTnⅠ-mRNA释放进入外周血,为心肌损伤诊断的敏感基因标志物。 展开更多
关键词 心肌损伤 外周血 扩增 诊断 cTnⅠ 心肌肌钙蛋白Ⅰ RNA 基因表达水平 酶合成 巢式PCR法
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提高转基因动物基因表达水平的途径 被引量:3
5
作者 卢一凡 邓继先 +2 位作者 肖成祖 马清钧 田 《国外医学(遗传学分册)》 1997年第6期292-295,共4页
本文对转基因动物的研究特点以及近年来在转基因动物提高表达水平方面的研究做以综述。阐述了转基因的整合、MAR、共注射与同源重组、内台子以及RNA的剪接对转基因动物基因表达的影响。
关键词 基因动物 基因表达水平 基因 整合 MAR
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基因偏好模及其与基因表达水平关系的研究 被引量:2
6
作者 晋宏营 李宏 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期176-182,共7页
利用重新定义的碱基片段的相对模式含量,研究了大肠杆菌和酵母基因序列的三碱基偏好模。发现在前导区,起始密码子模式的相对模式含量明显低于其它区,大肠杆菌基因拖尾区和编码终止区中,“SSS”型模式的相对模式含量平均较高。并研究了... 利用重新定义的碱基片段的相对模式含量,研究了大肠杆菌和酵母基因序列的三碱基偏好模。发现在前导区,起始密码子模式的相对模式含量明显低于其它区,大肠杆菌基因拖尾区和编码终止区中,“SSS”型模式的相对模式含量平均较高。并研究了基因前导区和拖尾区偏好模或禁用模出现频数与基因表达水平的关系,发现基因前导区偏好模使用频数的多少与基因表达水平成正相关关系,而禁用模使用频数的多少与基因表达水平则成反相关关系;在基因拖尾区,偏好模或禁用模使用频数的多少与基因表达水平的关系对于两种生物是不同的。 展开更多
关键词 基因 偏好模 基因表达水平 起始密码子模式 基因拖尾区
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阻滞和非阻滞品系小鼠体外发育2-细胞胚基因表达水平的比较
7
作者 林翠英 吕俊杰 +2 位作者 张卫玉 谢美容 王世鄂 《中国组织化学与细胞化学杂志》 CAS CSCD 2009年第4期494-494,共1页
关键词 基因表达水平 雄性小鼠 体外发育 细胞胚 品系 差异表达基因 雌性小鼠 体外培养
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红掌佛焰苞数字基因表达谱及关键基因表达水平分析
8
作者 彭佳佳 刘克林 +8 位作者 刘丽娅 吕学华 杨哲 李佩愉 刘春 明军 袁素霞 平吉成 张黎 《江苏农业科学》 北大核心 2016年第3期48-52,共5页
以红掌佛焰苞S5(盛花期:红色)、S8(衰老期:绿色)时期为试验材料进行数字基因表达谱(digital gene expression profiling,DGE)测序,分别得到12 766 374条(1.28 G)、18 583 390条(1.86 G)可分析序列(clean reads),被成功注释有差异表达的... 以红掌佛焰苞S5(盛花期:红色)、S8(衰老期:绿色)时期为试验材料进行数字基因表达谱(digital gene expression profiling,DGE)测序,分别得到12 766 374条(1.28 G)、18 583 390条(1.86 G)可分析序列(clean reads),被成功注释有差异表达的基因序列2 316条。为探究红掌佛焰苞颜色变化过程中关键基因的表达水平,将差异基因定位在花青素生物合成途径11条表达量变化的序列上,并通过实时荧光定量PCR对其中的4条序列进行检验,验证了DGE测序结果的准确性。同时研究这4个序列在红掌佛焰苞生长过程中的表达水平,结果表明:在佛焰苞发育初期,3条序列相对表达量逐渐增高,1条在S2时期降低,但均在S3时期达到最高或较高值;在S4、S5、S6、S7、S8时期,随着佛焰苞的成熟,4条序列表达量大体上均逐渐下降,在S8衰老期表达量最低。研究结果证明了这4条基因序列是红掌佛焰苞花色形成中的关键基因,S3时期是花青素生物合成的高峰期。 展开更多
关键词 数字基因表达 红掌佛焰苞 花青素 基因表达水平 基因序列 关键基因 花色变化 关键酶
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玉米核基质结合区在烟草中对外源转基因表达水平的影响(英文)
9
作者 李旭刚 曾千春 +3 位作者 陈松彪 徐军望 常团结 朱祯 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2002年第7期804-808,共5页
为研究核基质结合区 (matrixattachmentregion ,MAR)在转基因植物中的功能 ,将来自玉米基因组的MAR序列构建在植物表达载体T_DNA中 ,并将报告基因β_葡糖醛酸酶 (β_glucuronidase ,GUS)基因 (uidA)插入两段MARs序列之间。将此载体与不... 为研究核基质结合区 (matrixattachmentregion ,MAR)在转基因植物中的功能 ,将来自玉米基因组的MAR序列构建在植物表达载体T_DNA中 ,并将报告基因β_葡糖醛酸酶 (β_glucuronidase ,GUS)基因 (uidA)插入两段MARs序列之间。将此载体与不包含MARs序列的植物表达载体分别转化烟草 (NicotianatabacumL .)。GUS活性检测表明 ,MARs可以显著提高外源基因uidA在转基因烟草中的表达水平 ,平均表达水平提高 2倍 ,最高单株活性可达 10倍。并且转基因植株GUS活性高低与稳定mRNA的量成正比 ,表明MARs在转录水平提高基因表达。 展开更多
关键词 玉米核基质结合区 烟草 外源转基因 β-葡萄醛酸酶 基因表达水平
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运动病大鼠脑细胞c-fos基因表达水平的变化
10
作者 王琰 董文度 +5 位作者 袁驾南 徐根兴 金淑仪 姜正林 李建成 庄坚 《解剖科学进展》 1997年第3期98-98,共1页
运动病大鼠脑细胞c-fos基因表达水平的变化王琰董文度袁驾南徐根兴金淑仪*姜正林*李建成*庄坚*(海军医学高等专科学校*南通医学院航海医学研究所)取SD大鼠16只(性别不限,体重不限)随机分为二组,每组8只,一组为正... 运动病大鼠脑细胞c-fos基因表达水平的变化王琰董文度袁驾南徐根兴金淑仪*姜正林*李建成*庄坚*(海军医学高等专科学校*南通医学院航海医学研究所)取SD大鼠16只(性别不限,体重不限)随机分为二组,每组8只,一组为正常对照组,另一组按照Crampto... 展开更多
关键词 运动病 基因表达水平 C-FOS 大鼠 脑细胞 大脑皮质 旋转刺激 阳性反应 航海医学 高等专科学校
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通气治疗PE-SWD与肺上皮细胞中c-fos基因表达水平的变化
11
作者 王琰 董文度 +4 位作者 袁驾南 徐根兴 张敏华 刘虹 赵增荣 《解剖科学进展》 1997年第3期65-65,共1页
通气治疗PE-SWD与肺上皮细胞中c-fos基因表达水平的变化王琰董文度袁驾南徐根兴张敏华刘虹赵增荣(海军医学高等专科学校细胞生物研究室)本实验选用10只新西兰一级纯种雄性兔(平均体重为2.56±0.10kg),... 通气治疗PE-SWD与肺上皮细胞中c-fos基因表达水平的变化王琰董文度袁驾南徐根兴张敏华刘虹赵增荣(海军医学高等专科学校细胞生物研究室)本实验选用10只新西兰一级纯种雄性兔(平均体重为2.56±0.10kg),进行肺内海水灌注复制海水淹溺肺水肿(P... 展开更多
关键词 基因表达水平 肺上皮细胞 通气治疗 C-FOS 原位杂交 高等专科学校 海水淹溺肺水肿 图像分析技术 海军医学 张敏华
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海水淹溺肺水肿兔肺上皮细胞中c-fos基因表达水平的变化
12
作者 王琰 董文度 +4 位作者 袁驾南 徐根兴 张敏华 刘虹 赵增荣 《解剖科学进展》 1997年第3期65-65,共1页
海水淹溺肺水肿兔肺上皮细胞中c-fos基因表达水平的变化王琰董文度袁驾南徐根兴张敏华刘虹赵增荣(海军医学高等专科学校细胞生物研究室)c-fos基因表达水平的变化,在海水淹溺肺水肿(PE-SWD)中未见报道。本文选用1... 海水淹溺肺水肿兔肺上皮细胞中c-fos基因表达水平的变化王琰董文度袁驾南徐根兴张敏华刘虹赵增荣(海军医学高等专科学校细胞生物研究室)c-fos基因表达水平的变化,在海水淹溺肺水肿(PE-SWD)中未见报道。本文选用14只新西兰纯种一级雄性兔,平均体重... 展开更多
关键词 海水淹溺肺水肿 基因表达水平 肺上皮细胞 C-FOS 高等专科学校 海军医学 张敏华 阳性反应 图像分析 动物模型
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实时荧光定量测定人B细胞激活因子受体基因表达水平
13
作者 鞠少卿 张冬雷 倪红兵 《南通大学学报(医学版)》 2006年第1期67-67,共1页
目的:建立实时荧光定量聚合酶链反应(RFQ-PCR)检测人B细胞激活因子受体(BAFF-R)含量的方法,及探讨其在外周血单个核细胞(PBMC)中BAFF-RmRNA表达的检测价值。方法:在BAFF-R基因高保守区设计特异性引物和荧光探针,用逆转录(RT-... 目的:建立实时荧光定量聚合酶链反应(RFQ-PCR)检测人B细胞激活因子受体(BAFF-R)含量的方法,及探讨其在外周血单个核细胞(PBMC)中BAFF-RmRNA表达的检测价值。方法:在BAFF-R基因高保守区设计特异性引物和荧光探针,用逆转录(RT-PCR)扩增目的片段实时检测产物的荧光强度,根据标准品建立标准曲线,由软件自动计算出待测样本中BAFF-RmRNA含量,并以BAFF-RmRNA和132MmRNA含量的比值进行BAFF-R表达水平评价。结果:RFQ-PCR检测BAFF-R含量的线性范围为10^∧9~10^∧1pg/ml,低浓度样本批内和批间变异系数(CV)分别为12.5%和11.9%,高浓度样本批内和批间CV分别为8.3%和9.3%。30名健康献血员样本的PBMC中,83%(25/30)有BAFF-RmRNA表达,范围为0.14-1.03。结论:RFQ-PCR检测BAFF-mRNA含量的方法,具有较好的检测灵敏度和重复性。 展开更多
关键词 实时荧光定量聚合酶链反应 B细胞激活因子 基因表达水平 荧光定量测定 受体 FQ-PCR检测 变异系数(CV) RNA含量 外周血单个核细胞 mRNA表达
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灌浆期开放式增温对水稻强势粒和弱势粒淀粉代谢关键酶相关基因表达水平的影响 被引量:7
14
作者 沈直 唐设 +3 位作者 张海祥 陈文珠 丁艳锋 王绍华 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期898-906,共9页
[目的]阐明模拟全球气候变暖对水稻灌浆期淀粉代谢关键酶相关基因表达水平的影响,为全球气候变暖的应对措施提供依据。[方法]以大穗型粳稻品系CJ03和中穗型粳稻品种‘宁粳3号’为材料,在水稻抽穗期进行开放式增温处理,测定强、弱势粒的... [目的]阐明模拟全球气候变暖对水稻灌浆期淀粉代谢关键酶相关基因表达水平的影响,为全球气候变暖的应对措施提供依据。[方法]以大穗型粳稻品系CJ03和中穗型粳稻品种‘宁粳3号’为材料,在水稻抽穗期进行开放式增温处理,测定强、弱势粒的千粒质量、灌浆速率、总淀粉与直链淀粉含量及花后10 d和20 d淀粉代谢关键酶的主要调控基因表达水平。[结果]在灌浆前期,与对照弱势粒相比,开放式增温明显促进弱势粒的灌浆进程,主要表现在弱势粒灌浆速率及其峰值均有增加,灌浆启动提前;在灌浆后期,随着增温处理时间的延长,强、弱势粒灌浆活跃期均缩短。实时荧光定量PCR的测定结果表明,参与籽粒淀粉代谢的关键酶,如蔗糖合成酶(Su Sase)、腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)、可溶性淀粉合成酶(SSS)、颗粒结合型淀粉合成酶(GBSS)和淀粉分支酶(SBE),它们的基因表达水平在不同处理和不同部位均有差异。在花后10 d的增温处理下,强、弱势粒中Su Sase、AGPase、SSS和SBE合成相关基因的表达水平上调,而GBSS合成相关基因的表达水平下调。花后20 d,相对于强势粒,各处理弱势粒中淀粉合成关键酶相关基因的表达水平均显著下调。[结论]增温处理下,弱势粒中淀粉合成关键酶相关基因表达水平的上调是其灌浆速率增加的主要原因。 展开更多
关键词 开放式增温 籽粒灌浆 强势粒 弱势粒 基因表达水平
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大肠杆菌SD序列与基因表达水平的关系 被引量:7
15
作者 李宏 杨体强 +1 位作者 达赖 罗辽复 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1998年第2期172-176,共5页
依据基因表达水平的理论预测方法从1373个大肠杆菌基因中选出了73个甚高表达基因和100个甚低表达基因.研究了这两类基因编码区起始密码子ATG前-1到-21位点(包含SD序列)的碱基构成与基因表达水平的关系.结果表明... 依据基因表达水平的理论预测方法从1373个大肠杆菌基因中选出了73个甚高表达基因和100个甚低表达基因.研究了这两类基因编码区起始密码子ATG前-1到-21位点(包含SD序列)的碱基构成与基因表达水平的关系.结果表明,SD序列中的富嘌呤区(约在-7到-12位点)G和T的概率分布曲线中心到ATG的距离(记为LH)与基因表达水平有明显的关系.甚高表达基因LH约为10,甚低表达基因的LH约为8;另外在-1位点处。 展开更多
关键词 SD区域 基因表达水平 大肠杆菌
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基因表达水平与同义密码子使用关系的初步研究 被引量:6
16
作者 李宏 罗辽复 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第2期237-244,共8页
提出一个预测基因表达水平和同义密码子使用的自洽信息聚类方法。将同义密码子分成最适密码子、非最适密码子和稀有密码子,认为三者的使用频率是调控基因表达水平的主要因素。基于这一观点,对Ecoli(121个基因)和Yeast... 提出一个预测基因表达水平和同义密码子使用的自洽信息聚类方法。将同义密码子分成最适密码子、非最适密码子和稀有密码子,认为三者的使用频率是调控基因表达水平的主要因素。基于这一观点,对Ecoli(121个基因)和Yeast(107个基因)两类生物的基因表达水平和密码子的使用,用自洽信息聚类方法进行了预测。发现高低表达基因明显分开,基因表达水平被分为四级:甚高表达基因(VH)、高表达基因(H)、较低表达基因(LM)和低表达基因(LL);预测结果与现有的结论和实验结果保持了很好的一致性。 展开更多
关键词 基因表达水平 自洽信息聚类 预测 同义密码子
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昆虫激素对家蚕ALP活性及其基因表达水平的影响 被引量:5
17
作者 唐芬芬 杨伟克 《河南农业科学》 北大核心 2020年第11期153-158,共6页
为了探究昆虫激素对家蚕碱性磷酸酶(ALP)活性及其基因表达水平的影响,以五龄第3天家蚕(大造)幼虫为试验材料,注射外源蜕皮激素20E和保幼激素JH,分析检测家蚕血淋巴和中肠ALP基因及ALP酶活性的变化情况。结果显示,20E或JH处理后6 h、12 h... 为了探究昆虫激素对家蚕碱性磷酸酶(ALP)活性及其基因表达水平的影响,以五龄第3天家蚕(大造)幼虫为试验材料,注射外源蜕皮激素20E和保幼激素JH,分析检测家蚕血淋巴和中肠ALP基因及ALP酶活性的变化情况。结果显示,20E或JH处理后6 h、12 h和24 h,家蚕血淋巴ALP均明显上调表达,而中肠ALP仅在12 h和24 h上调表达。其中20E处理组,血淋巴ALP在6 h的相对表达量最高,为对照组的2.3倍;中肠ALP在12 h表达量最高,为对照组的2.8倍。JH处理组,血淋巴和中场ALP均是在24 h的相对表达量最高,分别是对照组的3.7倍和4.7倍。另外,20E和JH均能显著激活家蚕血淋巴和中肠的ALP酶活性。20E处理组,血淋巴ALP酶活性在20E处理6 h、12 h和24 h显著高于对照组;在12 h活性最高,为33.34 U/mg。中肠ALP酶活性是在12 h和24 h极显著高于对照组,其活性分别为37.68 U/mg和40.95 U/mg。JH处理组,血淋巴和中肠ALP酶活性在6 h,12 h和24 h显著高于对照组,其中血淋巴的ALP酶活性在6 h出现最高值(42.29 U/mg),而中肠ALP酶活性在12 h升至最高值(46.84 U/mg)。上述结果表明,家蚕ALP基因受激素20E和JH的调控,且激素对ALP基因表达水平的影响与ALP酶活性变化规律一致。 展开更多
关键词 昆虫激素 家蚕 碱性磷酸酶 酶活性 基因表达水平 蜕皮激素 保幼激素
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碱基关联与基因表达水平的关系 被引量:3
18
作者 李宏 罗辽复 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1996年第1期35-44,共10页
研究了E.coli和Yeast基因编码区内碱基关联与基因表达水平的关系,结果表明:1)单碱基构成与基因表达水平有一定的关系;2)紧邻、次紧邻碱基间的关联(t≤2)与基因表达水平有较好的线性关系;3)密码子第1位碱基的... 研究了E.coli和Yeast基因编码区内碱基关联与基因表达水平的关系,结果表明:1)单碱基构成与基因表达水平有一定的关系;2)紧邻、次紧邻碱基间的关联(t≤2)与基因表达水平有较好的线性关系;3)密码子第1位碱基的构成与基因表达水平有关系;4)密码子内1、3位和2、3位碱基之间的关联熵与基因表达水平有很强的关系;5)密码子内各位碱基与相邻密码子第1位碱基的关联熵与基因表达水平有很好的线性关系. 展开更多
关键词 碱基 密码子 关联熵 基因表达水平
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在前列腺癌中通过原位测序识别TMPRSS2-ERG融合基因转录体、体细胞点突变和基因表达水平 被引量:2
19
作者 Kiflemariam S Mignardi M +3 位作者 Ali M A 魏建国 许春伟 张博 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期9-9,共1页
易位导致上皮性肿瘤的发生、发展,特别在前列腺癌的发展过程中有着十分重要的作用。为了更好的理解融合基因转录体的作用和阐明多灶性肿瘤的克隆组成,作者发明了一种多通道原位检测和识别融合基因转录体表达的技术。与免疫组化相比分为T... 易位导致上皮性肿瘤的发生、发展,特别在前列腺癌的发展过程中有着十分重要的作用。为了更好的理解融合基因转录体的作用和阐明多灶性肿瘤的克隆组成,作者发明了一种多通道原位检测和识别融合基因转录体表达的技术。与免疫组化相比分为TMPRSS2-ERG融合阴性和融合阳性的前列腺肿瘤。在人类前列腺癌组织中,作者对最普遍存在的TMPRSS2-ERG融合变异体进行了识别和量化,第一次通过原位测序法直接测定了不同基因融合转录体的比例。 展开更多
关键词 前列腺癌组织 融合基因 转录体 基因表达水平 测序法 识别 点突变 体细胞
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基因表达水平与密码子使用的关系及其预测 被引量:2
20
作者 李宏 罗辽复 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1995年第5期544-561,共18页
研究了两个方面的问题.首先,对E.coli(121个基因),B.subtilis(111个基因)、Yeast(107个基因)三种生物的核酸序列,将同义密码子按使用频率统计值分成三种特性的密码子:最适密码子、非最适密码... 研究了两个方面的问题.首先,对E.coli(121个基因),B.subtilis(111个基因)、Yeast(107个基因)三种生物的核酸序列,将同义密码子按使用频率统计值分成三种特性的密码子:最适密码子、非最适密码子和稀有密码子.对每一序列的编码区,算出它们各自出现的概率后,用信息聚类法聚类.发现每种生物的高低表达基因明显分开,将三种生物基因聚类结果综合来看,基因表达水平被分为四级:甚高表达基因(VH)、高表达基因(H)、较低表达基因(LM)和低表达基因(LL).每类基因的表达水平与实验结果保持了很好的相关性.在此基础上提出一个预测稀有密码子及基因表达水平的自洽信息聚类方法,E.coli、Yeast预测的结果与E.coli、Yeast的现有资料相比,符合很好.文中还预测了B.subtilis、Drosophila和Bacterio-phage三种基因的表达水平及稀有密码子. 展开更多
关键词 密码子 基因表达水平 自洽信息聚类 预测
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