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基因表达系列分析技术及其应用
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作者 党冬梅 魏晓萍 +1 位作者 惠起源 符兆英 《延安大学学报(医学科学版)》 2005年第1期61-63,共3页
基因表达系列分析(Serial Analysis of GeneExpression,SAGE)是近几年来发展起来的一种全基因组基因表达分析和寻找差异基因的新技术,能同时对大量的转录物进行定性和定量分析,可以同时反映正常或异常等不同功能状态下细胞整个基因组基... 基因表达系列分析(Serial Analysis of GeneExpression,SAGE)是近几年来发展起来的一种全基因组基因表达分析和寻找差异基因的新技术,能同时对大量的转录物进行定性和定量分析,可以同时反映正常或异常等不同功能状态下细胞整个基因组基因的全貌,特别对低丰度表达基因有较高的检测结果,因而具有重要的应用价值.它不但能快速详细地同时分析成千上万个基因转录子的丰富信息,还能发现新基因.SAGE是目前较为成熟的用于全基因组基因分析的方法,经过数年的探索,SAGE受到广泛关注,显示出广阔前景.本文简介SAGE技术的基本原理、操作方法、应用前景、优缺点. 展开更多
关键词 基因表达系列分析技术 临床应用 基本原理 操作方法
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基因表达系列分析技术的新进展 被引量:9
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作者 李靖 陈宇光 孔祥银 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期613-616,共4页
作为新近建立的研究基因表达的有效工具 ,基因表达系列分析 (SAGE)技术能同时对大量的转录物进行定性和定量分析。它不仅可以显示低丰度的转录物 ,提供基因组表达的完整信息 ,而且可以通过不同状态下基因表达图谱的比较 ,深入了解基因... 作为新近建立的研究基因表达的有效工具 ,基因表达系列分析 (SAGE)技术能同时对大量的转录物进行定性和定量分析。它不仅可以显示低丰度的转录物 ,提供基因组表达的完整信息 ,而且可以通过不同状态下基因表达图谱的比较 ,深入了解基因表达的时空性和有序性 ,从而寻找和发现新基因。本文介绍了SAGE的工作原理和方法 ,并着重对其最新的应用与研究进展进行了综述。 展开更多
关键词 基因表达 基因表达系列分析 SAGE 原理 应用
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基因表达系列分析技术研究进展 被引量:3
3
作者 王大力 黄大鹏 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2009年第4期69-72,共4页
基因表达系列分析技术是一种以测序为基础,采用数字化分析手段,在转录物水平上研究细胞或组织基因表达模式的有效工具。该技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞表达的基因,获得这些基因表达丰度的数量信息,还可比较不同组织、不同时空... 基因表达系列分析技术是一种以测序为基础,采用数字化分析手段,在转录物水平上研究细胞或组织基因表达模式的有效工具。该技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞表达的基因,获得这些基因表达丰度的数量信息,还可比较不同组织、不同时空条件下基因表达的差异,具有高通量、高效性的特点,并能发现新基因。论文就基因表达系列分析技术的原理、特点及其改进进行综述。 展开更多
关键词 基因表达系列分析 原理 特点
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基因表达系列分析技术在植物基因表达中的研究进展 被引量:2
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作者 杨学 刘丽艳 +5 位作者 关凤芝 李柱刚 吴广文 王珣 路颖 陈浩 《中国麻业科学》 2009年第4期233-237,共5页
基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)是一种研究真核细胞表达基因信息的高通量检测技术,它能对细胞内所有表达基因进行定性与定量分析。SAGE技术在植物方面的应用相对较少,但在植物抗病性研究中的应用近几年发... 基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression,SAGE)是一种研究真核细胞表达基因信息的高通量检测技术,它能对细胞内所有表达基因进行定性与定量分析。SAGE技术在植物方面的应用相对较少,但在植物抗病性研究中的应用近几年发展很快。综述介绍了SAGE技术的原理与操作、实施的方法与步骤、SAGE技术的主要优点及在植物基因表达分析中的应用。明确SAGE的优势与它的缺陷,在实际应用中加以完善及采取必要的辅助方案,这样就可以构建较完美的设计思想。 展开更多
关键词 基因表达系列分析 植物基因 SAGE数据库 克隆
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基因表达系列分析技术在消化道肿瘤研究中的应用 被引量:1
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作者 宋向凤 王辉 《新乡医学院学报》 CAS 2007年第3期311-314,共4页
基因表达系列分析技术(SAGE)是基因表达定性和定量研究的一种新的有效手段。它不需要事先知道其基因序列,能同时对数千个转录体的丰度进行定量研究。近年来人们利用此技术对正常和疾病组织细胞的基因表达信息进行了广泛的研究,作者就SAG... 基因表达系列分析技术(SAGE)是基因表达定性和定量研究的一种新的有效手段。它不需要事先知道其基因序列,能同时对数千个转录体的丰度进行定量研究。近年来人们利用此技术对正常和疾病组织细胞的基因表达信息进行了广泛的研究,作者就SAGE在消化道肿瘤研究中的应用进展作一综述。 展开更多
关键词 基因表达系列分析 消化道肿瘤 组织细胞
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基因表达系列分析技术在植物基因表达分析中的应用 被引量:8
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作者 朱莉 常汝镇 邱丽娟 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2003年第11期1233-1240,共8页
基因表达系列分析技术 (SAGE)是一种以测序为基础 ,采用数字化分析手段 ,在转录物水平上研究细胞或组织基因表达模式的有效工具。该技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞表达的基因 ,获得这些基因表达丰度的数量信息 ,还可比较不同组... 基因表达系列分析技术 (SAGE)是一种以测序为基础 ,采用数字化分析手段 ,在转录物水平上研究细胞或组织基因表达模式的有效工具。该技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞表达的基因 ,获得这些基因表达丰度的数量信息 ,还可比较不同组织、不同时空条件下基因表达的差异 ,从而发现新基因。SAGE技术在植物方面的应用相对较少 ,但进展很快。本文着重介绍了SAGE在植物基因表达分析中的应用 ,分析SAGE所存在的问题。 展开更多
关键词 基因表达 系列分析技术 植物 应用 数字化分析 转录物水平 细胞 组织基因 功能基因组学
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基因表达系列分析技术及其应用领域
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作者 廉慧锋 马兴元 《动物科学与动物医学》 2004年第12期11-12,共2页
关键词 基因表达系列分析 基因表达 SAGE 基因 丰度 EST 基因转录 定量研究 快速 发现
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应用基因表达系列分析(SAGE)技术研究高温处理前后家蚕的基因表达差异 被引量:4
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作者 鲍忠赞 张彩霞 +6 位作者 徐世清 周前凯 魏广兵 王华 刘腾 金鑫 司马杨虎 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期456-467,共12页
高温对家蚕的生理和免疫能力有明显影响。为从分子水平上探究家蚕抗高温机制,应用基因表达系列分析(SAGE)技术获得家蚕5龄雌蚕高温处理前后中肠、丝腺和脂肪体组织的基因表达谱,构建高温组(34℃)和常温组(26℃)2个家蚕SAGE文库。2个家蚕... 高温对家蚕的生理和免疫能力有明显影响。为从分子水平上探究家蚕抗高温机制,应用基因表达系列分析(SAGE)技术获得家蚕5龄雌蚕高温处理前后中肠、丝腺和脂肪体组织的基因表达谱,构建高温组(34℃)和常温组(26℃)2个家蚕SAGE文库。2个家蚕SAGE文库分别包含3555107和3580976个原始标签,其中的标签种类分别为113684和131 296个,清洁标签的种类分别为45972和49467。比较2个文库清洁标签获得65 535种差异标签,共注释4249个基因,其中有1 062个差异表达的基因(P<0.05,错误检测率FDR≤0.001并且拷贝数的差异在2倍以上)。经GO分析发现2个文库中基因的分布极其相似,表明这些基因在不同的环境温度下有类似的生物学功能并参与类似的生理代谢过程。KEGG pathway分析显示有732个基因涉及176个KEGG路径,其中有40个为差异表达基因显著富集的路径(P<0.05),超过一半的路径与代谢、生物合成和信号传导有关。上述结果有助于对家蚕抗高温基因的鉴定以及探究基因调控的网络关系。 展开更多
关键词 家蚕 高温 基因表达系列分析技术 差异表达基因
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基因表达系列分析技术研究进展 被引量:3
9
作者 王怡 王海平 王全立 《医学分子生物学杂志》 CAS CSCD 2004年第3期168-171,共4页
基因表达系列分析技术(SAGE)是一种新的基因表达分析技术,它可以大量获取全基因组范围基因表达的类别并量化分析。由于其克服了基因丰度的影响,SAGE在新基因的发现中具有独特的优点。同时,SAGE技术被成功应用于特异组织或细胞的转录组... 基因表达系列分析技术(SAGE)是一种新的基因表达分析技术,它可以大量获取全基因组范围基因表达的类别并量化分析。由于其克服了基因丰度的影响,SAGE在新基因的发现中具有独特的优点。同时,SAGE技术被成功应用于特异组织或细胞的转录组研究、mRNA群体间的全局化比较以及差异表达基因染色体分布的分析。文章主要述及了SAGE技术的原理、特点及其在应用上的最新进展。 展开更多
关键词 基因表达系列分析 基因 表达
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基因表达系列分析(SAGE)技术在肿瘤研究中的应用 被引量:1
10
作者 潘泽民 潘晓琳 +1 位作者 杨磊 周祖钊 《生命的化学》 CAS CSCD 2004年第4期322-324,共3页
基因表达系列分析 (serialanalysisofgeneexpression ,SAGE)是一项高效、快捷、低成本的研究生物基因表达水平的方法 ,广泛用于各种肿瘤的分析研究。SAGE技术对于全面分析肿瘤组织基因表达谱、寻找肿瘤特异性表达新基因、发现肿瘤组织... 基因表达系列分析 (serialanalysisofgeneexpression ,SAGE)是一项高效、快捷、低成本的研究生物基因表达水平的方法 ,广泛用于各种肿瘤的分析研究。SAGE技术对于全面分析肿瘤组织基因表达谱、寻找肿瘤特异性表达新基因、发现肿瘤组织特异标志物和揭示肿瘤发病的分子机制发挥重要的作用。随着“肿瘤基因组解剖工程”(CGAP)的进行 ,CGAPSAGE可以通过网站分析和展示SAGE数据 ,并自动的将基因名称和SAGE转录物水平联系起来。因此 ,这为SAGE技术深入和广泛研究肿瘤提供了方便。 展开更多
关键词 基因表达系列分析 SAGE 基因表达 肿瘤 基因表达
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基因表达系列性分析技术及其应用 被引量:4
11
作者 张锦超 俞炜源 《生物技术通讯》 CAS 2002年第5期395-399,共5页
基因表达系列性分析(SAGE)是一种高通量的基因表达模式研究技术,能够对特定细胞或组织中的大量转录本同时进行定量分析。本文综述了SAGE技术的基本原理和实验流程以及近年来SAGE方法上的改进,同时介绍了该技术的一些应用研究实例和Inter... 基因表达系列性分析(SAGE)是一种高通量的基因表达模式研究技术,能够对特定细胞或组织中的大量转录本同时进行定量分析。本文综述了SAGE技术的基本原理和实验流程以及近年来SAGE方法上的改进,同时介绍了该技术的一些应用研究实例和Internet上可资利用的SAGE数据库资源。 展开更多
关键词 基因表达系列分析 应用 基因表达模式 SAGE标签
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基因表达系列分析技术在动物科学中的研究进展 被引量:1
12
作者 田勇 卢立志 《生命科学》 CSCD 2012年第10期1211-1215,共5页
基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)是一种快速分析特定组织或细胞内基因表达信息的技术,不但可以比较不同组织细胞在不同时间、空间条件下基因表达的差异,还能发现新基因。近几年来,SAGE技术在动物基因表达研... 基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)是一种快速分析特定组织或细胞内基因表达信息的技术,不但可以比较不同组织细胞在不同时间、空间条件下基因表达的差异,还能发现新基因。近几年来,SAGE技术在动物基因表达研究中的应用取得了飞速发展。就SAGE技术的原理、实验路线、优缺点和改进以及SAGE在动物科学研究中的研究现状及应用前景作一简要介绍。 展开更多
关键词 基因表达系列分析(SAGE) 表达序列标签(EST) 差异表达 动物基因
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微量材料系列性基因表达分析技术的研究
13
作者 郑芳 周新 +2 位作者 严明 叶水清 刘芳 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第3期464-474,共11页
建立了微量材料 (1μgRNA)系列性基因表达分析技术 (minimalserialanalysisofgeneexpression ,miniSAGE) ,并用miniSAGE技术对冠心病 (coronaryarterydisease ,CAD)患者和正常人成纤维细胞的基因表达谱进行了分析 ,合成了两个高质量的S... 建立了微量材料 (1μgRNA)系列性基因表达分析技术 (minimalserialanalysisofgeneexpression ,miniSAGE) ,并用miniSAGE技术对冠心病 (coronaryarterydisease ,CAD)患者和正常人成纤维细胞的基因表达谱进行了分析 ,合成了两个高质量的SAGE库 ,比较了两个库的SAGE标签 ,为CAD发病机理的研究提供了大量表达异常基因的资料 .从而为后续分离与CAD发病相关的新基因打下了基础 .miniSAGE技术是一种有力的基因表达分析方法 ,可用于微量RNA (1μg)材料的基因表达分析 。 展开更多
关键词 微量材料 系列基因表达分析技术 冠心病 成纤维细胞 多因素复杂疾病 流行病
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基因表达系列分析技术的原理及应用进展
14
作者 艾国平 《国外医学(分子生物学分册)》 CSCD 2000年第5期262-265,共4页
生物体的特性由内在基因表达决定。个体发育和疾病发生与基因选择性表达密切相关,因此,要了解生命活动和疾病发生、发展的分子机制,就必须深入了解基因表达的时空性和差异性。基因表达系列分析技术(SAGE)是新近建立的能够定性和定量研... 生物体的特性由内在基因表达决定。个体发育和疾病发生与基因选择性表达密切相关,因此,要了解生命活动和疾病发生、发展的分子机制,就必须深入了解基因表达的时空性和差异性。基因表达系列分析技术(SAGE)是新近建立的能够定性和定量研究基因表达的有效工具,不仅可提供基因组表达丰度较完整的数量信息,而且还可帮助寻找和发现新基因。 展开更多
关键词 基因表达系列分析 原理 SAGE 实验流程
原文传递
强大的广谱基因表达分析技术——基因表达系列分析法
15
作者 吴志革 邹方东 《四川动物》 CSCD 北大核心 2006年第3期653-657,637,共6页
基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)是一项强大的数字化分析基因组整体表达模式的技术。它的诞生为定量、全局性地分析特定细胞内的基因表达情况提供了可能。本文介绍了SAGE技术的基本原理、最新进展和应用。
关键词 基因表达系列分析 原理 进展 应用
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基因表达系列分析 被引量:4
16
作者 黄骥 张红生 +2 位作者 王东 曹雅君 杨金水 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期203-206,共4页
基因表达系列分析 (serialanalysisofgeneexpression ,SAGE)是近年来发展的以测序为基础 ,全面了解特定组织或细胞类型中基因群体表达状态的一项技术 ,它的显著特点是能够大量获取基因组范围基因表达的类别与丰度。SAGE技术已成功地应... 基因表达系列分析 (serialanalysisofgeneexpression ,SAGE)是近年来发展的以测序为基础 ,全面了解特定组织或细胞类型中基因群体表达状态的一项技术 ,它的显著特点是能够大量获取基因组范围基因表达的类别与丰度。SAGE技术已成功地应用于特异组织或细胞的转录组研究和mRNA群体间差异表达基因的鉴定。本文主要回顾了SAGE技术的原理。 展开更多
关键词 基因表达系列分析 转录相 差异表达
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基因表达系列分析法(SAGE)的改进及其在植物功能基因组研究中的应用 被引量:5
17
作者 张振乾 谭太龙 +1 位作者 肖钢 官春云 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期1204-1210,共7页
基因表达系列分析方法(SAGE)是一种新的基因表达分析方法,与基因芯片技术一样具有高通量的特点,可测定特定组织的基因表达水平,在全基因组水平上同时定量检测数万个基因表达模式;可在未知目的基因的前提下,分析来自一个细胞的全部转录... 基因表达系列分析方法(SAGE)是一种新的基因表达分析方法,与基因芯片技术一样具有高通量的特点,可测定特定组织的基因表达水平,在全基因组水平上同时定量检测数万个基因表达模式;可在未知目的基因的前提下,分析来自一个细胞的全部转录本信息;对已知或未知基因表达进行定性和定量分析。目前,虽然在疾病、发育、细胞凋亡、药物筛选等多个领域已有利用SAGE方法进行的研究,但该方法在植物功能基因组研究中的应用相对较少。本文主要综述了该方法在RNA用量、PCR循环次数、SAGE效能和可靠性、标签长度和未知标签分析等方面的改进及其在植物中构建SAGE文库、筛选新基因、基因表达图谱分析等方面的应用,从而为其在植物功能基因组研究中的进一步应用提供理论参考。 展开更多
关键词 基因系列分析方法(SAGE) 功能基因 基因表达图谱分析
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全基因组基因表达分析技术及其在果树上的应用 被引量:4
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作者 张志宏 赵进春 代红艳 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期382-388,共7页
基因表达分析对于揭示基因功能、了解基因间相互关系、阐明植物生长发育过程中的生理生化调控机制起着至关重要的作用。综述了mRNA差异显示、cDNA-AFLP、基因芯片、EST数据分析、基因表达系列分析(SAGE)等全基因组基因表达分析技术的原... 基因表达分析对于揭示基因功能、了解基因间相互关系、阐明植物生长发育过程中的生理生化调控机制起着至关重要的作用。综述了mRNA差异显示、cDNA-AFLP、基因芯片、EST数据分析、基因表达系列分析(SAGE)等全基因组基因表达分析技术的原理特点及在果树上的应用情况,并介绍了利用全基因组基因表达分析技术开展果树研究的思路。 展开更多
关键词 果树 基因表达 基因芯片 表达序列标签 基因表达系列分析
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结肠癌实质细胞长标签基因表达系列分析文库的建立及应用 被引量:2
19
作者 樊军卫 唐华美 +3 位作者 严东旺 王兆文 王晓亮 彭志海 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期505-509,共5页
目的:应用长标签基因表达系列分析(long serialan alysis of gene expression,LongSAGE)技术定量分析结肠癌实质细胞转录组,并筛选肿瘤相关基因。方法:应用激光捕获显微切割(laser capture microdissection,LCM)、RNA提取和线性扩增方... 目的:应用长标签基因表达系列分析(long serialan alysis of gene expression,LongSAGE)技术定量分析结肠癌实质细胞转录组,并筛选肿瘤相关基因。方法:应用激光捕获显微切割(laser capture microdissection,LCM)、RNA提取和线性扩增方法得到结肠癌实质细胞及其相应正常结肠上皮细胞的反义RNA(antisense RNA,aRNA)样品,构建LongSAGE文库;然后应用SAGE2000软件对所得序列文本进行分析,筛选肿瘤相关基因;最后采用RT-PCR方法验证该差异表达基因。结果:结肠癌细胞LongSAGE文库标签体总数为50542个,识别出基因总数为16497个。正常结肠细胞LongSAGE文库标签体总数为50124个,识别出基因总数为16417个。LongSAGE文库筛选出结肠癌差异表达基因705个(P<0.05)。转化生长因子β诱导基因(transforming growth factor β-induced gene,TGFBI)为LongSAGE文库筛选出的结肠癌相关基因,RT-PCR检测验证了其在结肠癌组织标本中表达上调。结论:LCM-LongSAGE是对结肠癌实质细胞进行定量转录组研究的可行流程。 展开更多
关键词 结肠肿瘤 基因表达 序列分析 RNA 显微切割 基因表达系列分析 基因 TGFBI
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基因表达系列分析及其应用前景 被引量:8
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作者 邓永键 郝飞 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期315-321,共7页
基因表达系列分析 (Serialanalysisofgeneexpression ,SAGE)是一种研究真核细胞表达基因信息的高通量检测技术 ,它能对细胞内所有表达基因进行定性与定量分析。近年来此技术广泛应用于获得表达基因谱的研究 ,并且可以发现新基因信息 ,... 基因表达系列分析 (Serialanalysisofgeneexpression ,SAGE)是一种研究真核细胞表达基因信息的高通量检测技术 ,它能对细胞内所有表达基因进行定性与定量分析。近年来此技术广泛应用于获得表达基因谱的研究 ,并且可以发现新基因信息 ,还可发现基因的靶向定位以及对其它基因的影响 ,明确表达基因的功能。本文就SAGE的原理、实验方案。 展开更多
关键词 基因表达系列分析 转录组学 基因表达 原理 实验方案
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