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泉州市某区食品中致泻性大肠埃希菌的检测情况
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作者 王萍霞 钟煌培 周芳芳 《中国卫生标准管理》 2024年第4期24-27,共4页
目的 分析泉州市某区集贸摊点和超市食品中致泻性大肠埃希菌携带情况。方法 选择2021年1—12月从泉州市鲤城区超市以及集贸摊点采集的100份食品样本作为研究对象,严格按照GB 4789—2016《食品安全国家标准食品微生物检验致泻性大肠埃希... 目的 分析泉州市某区集贸摊点和超市食品中致泻性大肠埃希菌携带情况。方法 选择2021年1—12月从泉州市鲤城区超市以及集贸摊点采集的100份食品样本作为研究对象,严格按照GB 4789—2016《食品安全国家标准食品微生物检验致泻性大肠埃希菌检验》对所有标本开展致泻性大肠埃希菌微生物检验以及毒力基因检测,统计最终的检测结果。比较不同食品类型的致泻性大肠埃希菌检出率差异。结果 100份检测样本当中,总共20份检出致泻性大肠埃希菌,检出率为20.00%;其中包含产肠毒性大肠埃希菌(entero toxigenic Escherichia coli,ETEC)共6株,占比为30.00%;肠致病性大肠埃希菌(entero pathogenic Escherichia coli,EPEC)共5株,占比为25.00%;肠出血性大肠埃希菌(entero hemorrhagic Escherichia coli,EHEC)共5株,占比为25.00%;肠侵袭性大肠埃希菌(entero invasive Escherichia coli,EIEC)共4株,占比为20.00%。牲畜肉类、生禽肉类、凉拌类、海产类以及蔬菜类食品的致泻性大肠埃希菌检出率依次为38.89%、45.00%、5.00%、10.00%、4.55%,其中牲畜肉类、生禽肉类的致泻性大肠埃希菌检出率高于其他食品类型(P <0.05)。分离获得的致泻性大肠埃希菌20株内,出现EHEC的O157共5株;血清凝集予以H7鉴定,其中共有5株EHEC的O157:H7鉴定血清凝集,1株O157在羊肉上分离获得,SLT2、hly、eaeA毒力基因均在H7菌中携带,其他O157共4株,4种毒力基因均为阴性。结论 严格按照有关标准开展微生物检验能有效检出食品中的大肠埃希菌以及致泻性大肠埃希菌毒力基因,有关部门应该要加强卫生监督的力度,确保人民群众的食品安全。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 致泻性大肠埃希菌 微生物检验 产肠毒性大肠埃希菌 肠致病性大肠埃希菌 肠出血性大肠埃希菌 肠侵袭性大肠埃希菌
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某医院近10年大肠埃希菌分离率和耐药率的变迁情况
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作者 郭丽洁 李富顺 +2 位作者 陈静静 王齐晖 褚云卓 《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第3期266-270,共5页
目的总结近10年中国医科大学附属第一医院大肠埃希菌的分离率和耐药率,为临床抗感染经验治疗提供依据。方法数据来自2013年至2022年间从中国医科大学附属第一医院就诊患者中分离的大肠埃希菌,使用VITEK 2和VITEK MS进行菌种鉴定,使用VIT... 目的总结近10年中国医科大学附属第一医院大肠埃希菌的分离率和耐药率,为临床抗感染经验治疗提供依据。方法数据来自2013年至2022年间从中国医科大学附属第一医院就诊患者中分离的大肠埃希菌,使用VITEK 2和VITEK MS进行菌种鉴定,使用VITEK2和KB法进行药物敏感性试验,采用WHONET 5.6软件进行分析。结果2013年至2022年共分离6845株菌株,其中80.5%来自住院患者,19.5%来自门诊和急诊患者。常见标本类型为尿液(57.8%)、血液(15.0%)、分泌物(9.2%)、引流液(8.1%)。大肠埃希菌超广谱β-内酰胺酶(ESBL)分离率为57.2%(54.3%~61.5%)。大肠埃希菌对碳青霉烯类抗菌药物的耐药率较低,仅为1.2%(0.2%~2.6%)。结论大肠埃希菌仍是临床感染的重要病原菌,对多种抗菌药物存在不同程度的耐药,且耐药率有上升趋势,临床医师应给予足够的关注。 展开更多
关键词 耐药监测 药物敏感性 大肠埃希菌
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2014—2022年北京市肠道门诊分离的肠出血性大肠埃希菌分子分型特征分析
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作者 张新 吕冰 +7 位作者 田祎 黄瑛 霍达 林长缨 曲梅 贾蕾 张代涛 王全意 《首都公共卫生》 2024年第3期144-149,共6页
目的 了解北京市肠出血性大肠埃希菌(enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)分子特征及流行趋势。方法 收集2014—2022年北京市肠道门诊分离到的肠出血性大肠埃希菌,通过药敏试验及全基因组测序及数据分析,以了解病原的药物敏感性... 目的 了解北京市肠出血性大肠埃希菌(enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)分子特征及流行趋势。方法 收集2014—2022年北京市肠道门诊分离到的肠出血性大肠埃希菌,通过药敏试验及全基因组测序及数据分析,以了解病原的药物敏感性及分子特征。结果 共收集到14株EHEC,其中4株为多耐药菌株;多位点序列分型(multi-locus sequence type, MLST)分析ST11型占比最高(5/14);血清分型O157:H7占比最高(6/14);全基因组单核苷酸分型(whole genome single nucleotide polymorphism, wgSNP)结果显示6株O157:H7菌株分成一簇,其他菌株分成一簇;14株北京分离到的EHEC和美国国家生物技术信息中心(NCBI)网站下载的678株中国及周边国家分离的大肠埃希菌全基因组数据wgSNP分型,没有形成明显的地域性聚集,均以散发分布为主。结论 EHEC仍是北京市肠道传染病重要的病原菌,需要进一步加强EHEC监测。 展开更多
关键词 肠出血性大肠埃希菌 全基因组测序 多位点序列分型 全基因组单核苷酸分型
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北京某医院感染性腹泻患者致泻性大肠埃希菌毒力和耐药特征分析
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作者 马思宇 马立艳 +3 位作者 罗虎 周妍妍 王雅轩 苏建荣 《临床检验杂志》 CAS 2024年第1期43-47,共5页
目的明确本院感染性腹泻患者致泻性大肠埃希菌毒力和耐药特征。方法采用VITEK MS微生物质谱检测系统初步鉴定,多重实时荧光PCR检测毒力基因,对本院感染性腹泻患者临床分离的致泻性大肠埃希菌(Diarrheagenic Escherichia coli,DEC)进行5... 目的明确本院感染性腹泻患者致泻性大肠埃希菌毒力和耐药特征。方法采用VITEK MS微生物质谱检测系统初步鉴定,多重实时荧光PCR检测毒力基因,对本院感染性腹泻患者临床分离的致泻性大肠埃希菌(Diarrheagenic Escherichia coli,DEC)进行5种型别鉴定。微量肉汤稀释法和E-test法药敏试验检测DEC菌株的耐药表型特征。二代测序及生物信息学分析其耐药分子特征。采用Fisher确切概率法进行统计学分析。结果本院DEC检出率为11.9%,其中EAEC占比37.5%,非典型EPEC占比34.38%,ETEC占比25.0%,EIEC占比3.12%,未检出EHEC菌株。32株DEC对氨苄西林、四环素、甲氨苄啶/磺胺异恶唑耐药率最高,分别为53.12%、43.75%和37.5%。ESBLs(+)株占比18.75%,其多重耐药菌株检出率为83.83%,显著高于ESBLs(-)菌株,差异有统计学意义(P=0.042)。32株DEC共有25个ST型,优势基因型为ST10共4株(12.5%),ST28、ST31和ST3153各2株(各占比6.25%),其他21个型别各1株菌(各占比3.13%)。EAEC中检出1株携带bla_(NDM-1)的耐碳青霉烯类菌株。结论我院感染性腹泻患者的DEC以aggR、pic、astA、eae 4种毒力基因较为常见,以EAEC、EPEC为主要型别,基因型别呈高度多态性,检出多重耐药菌株。 展开更多
关键词 致泻性大肠埃希菌 毒力基因 耐药基因
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青蒿琥酯联合左氧氟沙星对耐碳青霉烯类大肠埃希菌抗菌活性的影响
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作者 董国伟 唐新宁 +3 位作者 钟英成 郭洁 韩志城 杨琦 《北京中医药》 2024年第2期161-166,共6页
目的 探讨青蒿琥酯与抗生素联用对耐碳青霉烯类大肠埃希菌(CRECO)抗菌活性的影响。方法 收集分离的CRECO 20株,采用肉汤稀释法测定抗菌物质青蒿琥酯(ASN)、左氧氟沙星(LEV)、头孢他啶(CAZ)、亚胺培南(IMP)最小抑菌浓度(MIC)。用棋盘法测... 目的 探讨青蒿琥酯与抗生素联用对耐碳青霉烯类大肠埃希菌(CRECO)抗菌活性的影响。方法 收集分离的CRECO 20株,采用肉汤稀释法测定抗菌物质青蒿琥酯(ASN)、左氧氟沙星(LEV)、头孢他啶(CAZ)、亚胺培南(IMP)最小抑菌浓度(MIC)。用棋盘法测定ASN与LEV、CAZ、IMP协同抗菌活性;用细菌生长曲线法观察不同处理组CRECO临床菌株(E5)生长的情况;用RT-PCR检测外排泵基因以及调控基因的表达。结果 抗菌物质ASN、LEV、CAZ、IMP的MIC50分别为>8 192、64、2 048、32μg/mL。协同抗菌试验显示:ASN (1 024μg/mL)与LEV联用时,LEV的MIC50由64μg/mL降至16μg/mL (即1/4 MIC50),联合作用效果以协同为主;与CAZ联用时,CAZ的MIC50由2 048μg/mL降至1 024μg/mL (即1/2 MIC50),联合作用效果以相加为主。生长曲线显示,ASN联合LEV能有效抑制CRECO生长,曲线走向平缓。20株菌株全部携带外排泵基因AcrA和AcrB基因。RT-PCR结果显示ASN联合LEV可降低外排泵基因AcrB表达。结论 ASN对CRECO无抗菌活性,但ASN联合LEV能有效增强抗生素的抑菌作用,其协同抑菌机制与降低外排泵基因AcrB表达相关。 展开更多
关键词 青蒿琥酯 耐碳青霉烯类大肠埃希菌 左氧氟沙星 活性
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产金属β内酰胺酶大肠埃希菌感染3例
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作者 林志强 吴娜梅 蔡莉莉 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期457-461,共5页
耐碳青霉烯类革兰阴性杆菌(CRGNB)的传播是一个全球性的公共卫生问题。CRGNB分离株通常具有广泛的耐药性,导致抗菌治疗选择有限,死亡率升高。在美国,碳青霉烯类耐药肠杆菌目细菌(CRE)每年引起超过13000例感染,并导致超过1000人死亡。CR... 耐碳青霉烯类革兰阴性杆菌(CRGNB)的传播是一个全球性的公共卫生问题。CRGNB分离株通常具有广泛的耐药性,导致抗菌治疗选择有限,死亡率升高。在美国,碳青霉烯类耐药肠杆菌目细菌(CRE)每年引起超过13000例感染,并导致超过1000人死亡。CRE是指至少对一种碳青霉烯类抗生素耐药或产生碳青霉烯酶的肠杆菌目细菌,分为非产碳青霉烯酶和产碳青霉烯酶两类[1]。常见的碳青霉烯酶包括肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶(KPC)、新德里金属β内酰胺酶(NDM)、亚胺培南水解金属β内酰胺酶(IMP)、维罗纳整合子编码的金属β内酰胺酶(VIM)和苯唑西林酶(OXA-48)。NDM是肠杆菌科细菌中最常见的金属酶,主要见于大肠埃希菌、阴沟肠杆菌。我国碳青霉烯类耐药大肠埃希菌中产NDM比例超过70%,以NDM-1/5为主[2]。在制定抗感染方案时,除了考虑病原菌对抗菌药物的敏感性,还需要考虑抗菌药物在感染部位的组织浓度。本研究对福建医科大学附属泉州第一医院收治的产金属β内酰胺酶大肠埃希菌所致腹腔感染、尿路感染、骨髓炎的3个病例进行回顾性分析,总结其临床特征,为临床诊治提供参考。 展开更多
关键词 金属Β内酰胺酶 大肠埃希菌 头孢他啶-阿维巴坦 替加环素 美罗培南
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新生儿晚发型大肠埃希菌败血症的危险因素分析及风险预警模型的构建
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作者 李婷婷 毛国顺 《中国妇幼健康研究》 2024年第6期25-32,共8页
目的探讨新生儿晚发型大肠埃希菌败血症的危险因素,并构建新生儿晚发型大肠埃希菌败血症的列线图模型。方法选取2021年1月至2023年7月安徽医科大学附属阜阳人民医院收治的226例新生儿作为模型组,另收集2021年8月至2023年10月同院收治的... 目的探讨新生儿晚发型大肠埃希菌败血症的危险因素,并构建新生儿晚发型大肠埃希菌败血症的列线图模型。方法选取2021年1月至2023年7月安徽医科大学附属阜阳人民医院收治的226例新生儿作为模型组,另收集2021年8月至2023年10月同院收治的100例新生儿作为验证组。采用Logistic回归分析新生儿晚发型大肠埃希菌败血症的危险因素,采用R软件构建新生儿晚发型大肠埃希菌败血症的列线图模型,并进行模型验证。结果与无晚发型大肠埃希菌败血症组相比,晚发型大肠埃希菌败血症组胎龄较小、机械通气占比高、出生体重较低、肠外营养占比高、胎膜早破时间长、长时间抗生素暴露占比高,差异均有统计学意义(χ^(2)/t值介于6.089~11.605之间,P<0.05);Logistic回归分析结果显示,胎龄<37周、机械通气、低出生体重、肠外营养、胎膜早破时间较长及长时间抗生素暴露等是新生儿晚发型大肠埃希菌败血症的危险因素,其OR值及95%CI分别为4.031(1.492~10.982)、3.064(1.306~7.188)、3.262(1.200~8.873)、2.852(1.092~7.450)、1.517(1.275~1.806)、2.947(1.216~7.140),P<0.05;模型组和验证组的校正曲线均显示预测值与实际值基本吻合;模型组的受试者工作特征(ROC)曲线下面积是0.856(0.820~0.892),验证组的曲线下面积是0.846(0.800~0.893);模型组及验证组的决策曲线显示阈值概率分别是1%~100%、1%~98%时,列线图预测新生儿晚发型大肠埃希菌败血症的净获益值较高。结论胎龄<37周、机械通气、低出生体重、肠外营养、胎膜早破时间较长及长时间抗生素暴露等是新生儿晚发型大肠埃希菌败血症的危险因素,新生儿晚发型大肠埃希菌败血症的列线图模型具有较高的准确性及临床应用价值。 展开更多
关键词 新生儿 大肠埃希菌 晚发型败血症 危险因素 列线图
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贵州省平塘县旅游区2020—2021年生活饮用水大肠埃希菌监测分析
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作者 陈祖坤 宋昌宇 《中国农村卫生》 2024年第8期68-70,共3页
目的通过贵州省平塘县旅游景区生活饮用水中细菌学指标进行监测,掌握生活饮用水水质现况,为预防旅游景区水质突发事件和制定应急处理措施提供依据。方法2020—2021年,选择该县7个旅游景区所在地的集中供水水厂7座为监测点,分别于每年枯... 目的通过贵州省平塘县旅游景区生活饮用水中细菌学指标进行监测,掌握生活饮用水水质现况,为预防旅游景区水质突发事件和制定应急处理措施提供依据。方法2020—2021年,选择该县7个旅游景区所在地的集中供水水厂7座为监测点,分别于每年枯水期与丰水期采集各检测点的水源水、出厂水与末梢水样本,监测水样中的总大肠菌群、大肠埃希菌阳性情况,大肠埃希菌阳性的水样再监测肠致病性大肠埃希菌阳性情况。结果共采集水样140份,其中水源水样本84份,出厂水、末梢水各28份。水源水总大肠菌群阳性60份(71.4%),大肠埃希菌阳性48份(57.1%);出厂水总大肠菌群阳性样本5份(17.9%),大肠埃希菌阳性4份(14.3%);末梢水总大肠菌群阳性样本6份(21.4%),大肠埃希菌阳性4份(14.3%),样本均未检出肠致病性大肠埃希菌。枯水期水源水、出厂水与末梢水样本的总大肠菌群与大肠埃希菌阳性检出率均高于丰水期;2021年样本大肠埃希菌阳性检出率均低于2020年同期;2021年水源水、出厂水样本总大肠菌群均低于2020年同期。结论该县旅游景区生活饮用水中水源水样本总大肠菌群和大肠埃希菌阳性检出率远高于出厂水与末梢水,末梢水样本的总大肠菌群阳性检出率略高于出厂水。建议当地采取措施加大对水源地的保护力度,集中供水水厂应规范出厂水消毒工艺和消毒效果监测,供水部门应适时维护或更换供水管网。 展开更多
关键词 平塘县旅游区 生活饮用水 大肠埃希菌 肠致病性大肠埃希菌 水质监测
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江苏省某监测点家畜来源肠致病性大肠埃希菌分离株分子特征分析 被引量:1
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作者 孔筱筱 韩悦 +2 位作者 周璐 程晓庆 董晨 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期56-61,共6页
目的分析江苏省某监测点家畜来源肠致病性大肠埃希菌分离株分子特征,进而评估其潜在的致病性,为感染性腹泻的监测与防控提供依据。方法采用全基因组测序技术对江苏省某监测点分离的家畜来源的37株肠致病性大肠埃希菌(EPEC)菌株进行特征... 目的分析江苏省某监测点家畜来源肠致病性大肠埃希菌分离株分子特征,进而评估其潜在的致病性,为感染性腹泻的监测与防控提供依据。方法采用全基因组测序技术对江苏省某监测点分离的家畜来源的37株肠致病性大肠埃希菌(EPEC)菌株进行特征性分析。结果本地家畜来源的EPEC均为非典型EPEC(aEPEC),其血清型多样,携带多种与腹泻相关的毒力基因,有9种ST型且具有区域性流行特征,eae基因包含有5种亚型,β1为优势亚型,其在腹泻病人中也最为常见。结论aEPEC对公众健康构成潜在威胁,应在感染性腹泻的监测工作中,加强对家畜粪便及养殖环境的监测。 展开更多
关键词 肠致病性大肠埃希菌 感染性腹泻 分子特征分析
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肠侵袭性大肠埃希菌噬菌体DK-13的生物学特性及应用
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作者 王梦雅 刘家齐 +3 位作者 姜海霖 李菁华 赵春燕 黄红兰 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期296-304,共9页
【目的】筛选并分离出能裂解肠侵袭性大肠埃希菌噬菌体,分析其生物学特性,并探究其对污染猪肉的杀菌作用。【方法】采用双层平板法分离鉴定噬菌体,并测定其最佳感染复数,一步生长曲线等,对其基因组进行测序分析以及裂解功效的测定。【... 【目的】筛选并分离出能裂解肠侵袭性大肠埃希菌噬菌体,分析其生物学特性,并探究其对污染猪肉的杀菌作用。【方法】采用双层平板法分离鉴定噬菌体,并测定其最佳感染复数,一步生长曲线等,对其基因组进行测序分析以及裂解功效的测定。【结果】从医院污水中分离鉴定能特异裂解肠侵袭性大肠埃希菌(Enteroinvasive Escherichia coli,EIEC)的噬菌体并命名为DK-13,其呈典型的蝌蚪状外形,包含一个正二十面体的头部和一个可收缩的螺旋对称的尾部,属于肌尾噬菌体科(Myoviridae)噬菌体;生物学特性表明:最佳感染复数为0.01,潜伏期约为10 min,裂解期约为70 min,噬菌体DK-13能在50℃,pH 5.0-10.0条件下存活。全基因组测序表明,噬菌体基因组长约172 275 bp,GC含量为40.18%,预测其共有293个开放阅读框(open reading frames,ORF),未发现已知耐药基因和毒力基因。应用试验表明:被污染的猪肉中表现的杀菌效果良好,宿主菌的数量明显减少。【结论】分离并鉴定一株新的烈性噬菌体DK-13,DK-13具有潜伏期短、裂解效率高等优势,在食品安全方面具有很大应用潜力。 展开更多
关键词 肠侵袭性大肠埃希菌 体疗法 食品安全
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三叶片抑制金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌作用的关键组分挖掘
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作者 米卓鑫 齐育麟 +3 位作者 李玉红 李琳 张鹏 赵鑫 《中南药学》 CAS 2024年第6期1537-1543,共7页
目的 挖掘三叶片发挥抑制金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus)和大肠埃希菌(Escherichia coli,E.coli)作用的关键组分。方法 采用16S rRNA测序技术,在高脂饮食小鼠模型上评价三叶片对肠道菌群的调节作用及对肠道中致病菌S.a... 目的 挖掘三叶片发挥抑制金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,S.aureus)和大肠埃希菌(Escherichia coli,E.coli)作用的关键组分。方法 采用16S rRNA测序技术,在高脂饮食小鼠模型上评价三叶片对肠道菌群的调节作用及对肠道中致病菌S.aureus、E.coli的抑制作用。采用牛津杯法测定三叶片、不同药物组合及其单味药对S.aureus和E.coli的体外抑菌活性,挖掘三叶片中发挥抑菌作用的关键组分,并采用琼脂稀释法研究三叶片及其关键组分对两种致病菌株的最小抑菌浓度(MIC)。结果 菌群测序结果显示,三叶片可以上调高脂饮食小鼠肠道菌群物种丰富度和多样性,降低菌群中包括S.aureus、E.coli等致病菌的丰度。体外抑菌结果显示,三叶片、丹参赤芍组合以及丹参、赤芍组分对上述细菌均有显著的抑制作用。其中三叶片对S.aureus的MIC为0.781 25 mg·mL^(-1),对E.coli的MIC为3.125 mg·mL^(-1)。丹参赤芍组合对S.aureus的MIC为0.25 mg·mL^(-1),对E.coli的MIC为3.125 mg·mL^(-1)。三叶片中丹参组分可显著抑制S.aureus,其MIC为0.125 mg·mL^(-1);赤芍组分对E.coli的抑制作用优于其他组分,其MIC为3.125 mg·mL^(-1)。结论 三叶片能够抑制常见的肠道致病菌如S.aureus和E.coli,该方中丹参为抑制S.aureus的关键组分,赤芍为抑制E.coli的关键组分。 展开更多
关键词 三叶片 关键组分 金黄色葡萄球 大肠埃希菌 活性
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禽源大肠埃希菌氟喹诺酮类药物耐药研究进展
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作者 郭皖露 宋时萍 +10 位作者 高玉斌 韩先杰 胡方圆 刘耀蓬 顾鹏坤 刘燕鑫 郎雨辰 曲志娜 刘俊辉 王琳 王君玮 《中国动物检疫》 CAS 2024年第5期72-78,共7页
氟喹诺酮类药物是家禽养殖中常用的抗菌药物之一。近年来,氟喹诺酮类药物在禽养殖业中的广泛过度使用导致大肠埃希菌耐药菌株出现,且该细菌对此类药物的耐药性愈发严重,耐药谱不断扩大;耐药机制越来越复杂,主要通过染色体介导、外排系... 氟喹诺酮类药物是家禽养殖中常用的抗菌药物之一。近年来,氟喹诺酮类药物在禽养殖业中的广泛过度使用导致大肠埃希菌耐药菌株出现,且该细菌对此类药物的耐药性愈发严重,耐药谱不断扩大;耐药机制越来越复杂,主要通过染色体介导、外排系统介导、膜通透性降低和质粒介导4种作用机制;耐药检测技术得到不断发展,目前已有药物敏感试验以及基因芯片、PCR、荧光原位杂交、全基因组测序、宏基因组测序等多种检测方法。针对当前日趋严峻的大肠埃希菌耐药形势,需要大力开展细菌耐药性监测,开发中药、喹诺酮类杂化物等新型药物;通过加强宣传教育,完善监测预警体系,指导合理用药;采取“减抗替抗”等综合防控措施,积极应对细菌耐药性问题。本文以4种常见的氟喹诺酮类代表药物恩诺沙星、环丙沙星、氧氟沙星、萘啶酸为例,综述了该类药物在禽源大肠埃希菌中的耐药进展状况,及其耐药作用机制、检测方法及防控措施研究进展,以期为保障食品动物安全和公共卫生安全提供依据。 展开更多
关键词 氟喹诺酮 大肠埃希菌 耐药性
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血培养大肠埃希菌的耐药特点、毒力基因分布及种系分型
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作者 马小轩 翟俊斌 +4 位作者 曹小利 张燕 郑洁 张之烽 沈瀚 《临床检验杂志》 CAS 2024年第5期321-326,共6页
目的检测并分析血培养大肠埃希菌的耐药特点、种系分型和毒力基因分布。方法收集我院2019年1月1日至2020年12月13日连续且非重复血培养大肠埃希菌。采用微量肉汤法测定大肠埃希菌对17种抗菌药物的敏感性;水煮法提取细菌基因组DNA,采用PC... 目的检测并分析血培养大肠埃希菌的耐药特点、种系分型和毒力基因分布。方法收集我院2019年1月1日至2020年12月13日连续且非重复血培养大肠埃希菌。采用微量肉汤法测定大肠埃希菌对17种抗菌药物的敏感性;水煮法提取细菌基因组DNA,采用PCR法检测arpA、chuA、yjaA、TspE4C2、ArpAgpE和trpAgpC基因以确定细菌的种系分型;采用多重PCR法检测毒力基因iutA、fimH、fyuA、kpsMTⅡ、cnf1、cvac、hlyA、traT、kpsMTⅢ和PAI;使用卡方检验分析种系分型之间的耐药率及毒力基因分布差异。结果270株血培养大肠埃希菌对头孢曲松、复方新诺明、氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦、头孢唑林和环丙沙星的耐药率较高,均大于50.0%;对亚胺培南、厄他培南、阿米卡星和哌拉西林/他唑巴坦的敏感性较高,耐药率均低于5.0%。在种系分型方面,最常见的型别是B2型和D型,分别占总数的38.0%和16.2%,而E型和隐分支Ⅰ型占比<1.0%,较为少见。毒力基因分析发现,fimH和fyuA基因的分布率最高,均在99.0%以上,而kpsMTⅢ、hlyA和cvaC 3种基因的分布率较低,均低于20.0%。卡方检验显示,毒力基因iutA、fimH、fyuA、kpsMTⅡ、cnf1、PAI在B2型的分布显著高于非B2型(P<0.05),且B2型携带的iutA、fyuA、kpsMTⅡ、cnf1、PAI基因显著高于D型(P<0.05)。结论在治疗引起血流感染的大肠埃希菌时,应慎用头孢曲松、复方新诺明、氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦、头孢唑林和环丙沙星等药物。血流感染的大肠埃希菌为B2型时,应同时进行中段尿培养以确认感染源并监测治疗的成功率。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 耐药 毒力基因 种系分型
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基于CRISPR序列的致泻性大肠埃希菌跨种传播风险机器学习模型构建
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作者 冯新元 赵佳雪 +5 位作者 龙金照 胡景妍 席岩岩 陈帅印 杨海燕 段广才 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期4060-4065,共6页
【目的】基于CRISPR序列信息应用机器学习模型预测致泻性大肠埃希菌感染人的潜在风险,并以此识别具有人兽共患风险的高危菌株。【方法】从Enterobase数据库批量获取806株中国分离的致泻性大肠埃希菌基因组序列信息,提取CRISPR位点的间... 【目的】基于CRISPR序列信息应用机器学习模型预测致泻性大肠埃希菌感染人的潜在风险,并以此识别具有人兽共患风险的高危菌株。【方法】从Enterobase数据库批量获取806株中国分离的致泻性大肠埃希菌基因组序列信息,提取CRISPR位点的间隔序列构造特征,建立机器学习模型并使用交叉验证评价机器学习模型的预测效果。使用最佳模型输出致泻性大肠埃希菌的感染风险,并比较不同动物来源分离株对人的潜在感染风险。【结果】从806株菌株中共获取1093个间隔序列簇,人源分离株独有间隔序列簇为196个,动物源分离株独有间隔序列簇为291个,其中606个二者共享,线性判别分析发现人源和动物源菌株的间隔序列簇分布存在明显差异。以间隔序列簇作为特征,成功构建随机森林模型、逻辑斯谛回归模型、支持向量机模型和梯度提升树模型4种机器学习模型,其宿主预测准确率均超过0.82,受试者工作特征曲线下面积(area under receiver operating characteristic curve,AUC)值均接近0.9。最终确定随机森林模型的分类效果最佳,优化后模型预测准确率为0.844,AUC值为0.915。根据最佳模型输出的致泻性大肠埃希菌的感染风险,猪源分离株感染人的风险最高,羊源分离株感染人的风险较低,极少数禽源分离株可能具备感染人的潜力。【结论】基于间隔序列构建的机器学习模型对具有人兽共患风险的致泻性大肠埃希菌具备一定的识别能力,该模型为传染性疾病防控提供了新思路。 展开更多
关键词 间隔序列 机器学习 致泻性大肠埃希菌 跨种传播风险预测
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兔源肠致病性大肠埃希菌全基因组测序及毒力和耐药基因分析
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作者 董浩 赵明海 +8 位作者 刘志国 李楠 邢壮壮 张乐颖 左琴 董青花 梁春南 刘佐民 马丽颖 《实验动物科学》 2024年第1期70-76,共7页
目的揭示一株从腹泻实验兔中分离到的肠致病性大肠埃希菌ILAREc-01的基因组特征、毒力基因和耐药基因分布情况。方法采用高通量测序法对基因组序列进行测定,采用VFDB、ARDB、CAZy、SWISS-PROT、COG、CARD、KEGG、T3SS等8个数据库对基因... 目的揭示一株从腹泻实验兔中分离到的肠致病性大肠埃希菌ILAREc-01的基因组特征、毒力基因和耐药基因分布情况。方法采用高通量测序法对基因组序列进行测定,采用VFDB、ARDB、CAZy、SWISS-PROT、COG、CARD、KEGG、T3SS等8个数据库对基因组中的基因功能进行预测,并且对ILAREc-01菌株进行了遗传进化分析。结果ILAREc-01基因组中编码5249个基因;CARD数据库分析表明ILAREc-01菌株具有7类耐药机制的59个耐药基因;通过VFDB数据库分析,在ILAREc-01中注释了553个毒力基因,并发现了肠细胞脱落位点毒力岛(LEE);ILAREc-01与FORC028、E2865和110512株具有较高的同源性。结论本研究进行了兔源肠致病性大肠埃希菌ILAREc-01的全基因组测序,完成了毒力基因和耐药基因的注释,并开展了遗传进化分析,为揭示该病原的致病机制和科学防控实验兔大肠埃希菌病提供了数据支撑。 展开更多
关键词 肠致病性大肠埃希菌 全基因组测序 毒力基因 耐药基因
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大肠埃希菌中表达多聚纳米抗体研究进展
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作者 李鸿鹤 赵天阔 +1 位作者 张小梅 胡学军 《微生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期112-119,共8页
利用大肠埃希菌(Escherichia coli)生产的多聚纳米抗体已经广泛应用于医疗诊断、治疗、食品检测等方面的研究。通过特定多聚体结构域与纳米抗体重组融合从而形成多聚体纳米抗体,具有可提高纳米抗体的稳定性、亲和力、抗水解能力,延长血... 利用大肠埃希菌(Escherichia coli)生产的多聚纳米抗体已经广泛应用于医疗诊断、治疗、食品检测等方面的研究。通过特定多聚体结构域与纳米抗体重组融合从而形成多聚体纳米抗体,具有可提高纳米抗体的稳定性、亲和力、抗水解能力,延长血清半衰期和增加检测灵敏度等优点。本文回顾总结了多聚化纳米抗体的形成机制、类型、功能以及研究的最新进展,综述其在抗肿瘤抗病毒的作用以及作为“探针”诊断疾病、检测食品、环境痕量污染物的应用,为多聚体纳米抗体应用于疾病治疗、诊断、检测试剂研发提供思路。 展开更多
关键词 纳米抗体 多聚体 大肠埃希菌 抗肿瘤 抗病毒 检测试剂
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牛乳铁蛋白功能片段在大肠埃希菌中的表达及其抑菌活性验证
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作者 戴珊 赵燕 +2 位作者 刘芬 滕慧 张学文 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期38-43,共6页
以pET-30a和pEGX为出发载体,构建牛乳铁蛋白功能片段(BlfFf)基因工程表达的非融合性表达质粒(pET-BlfFf)和融合性表达质粒(pEGX-BlfFf),并在大肠埃希菌BL21中诱导了蛋白表达。SDS-PAGE分析结果表明,pET-BlfFf表达的目标蛋白主要以包涵... 以pET-30a和pEGX为出发载体,构建牛乳铁蛋白功能片段(BlfFf)基因工程表达的非融合性表达质粒(pET-BlfFf)和融合性表达质粒(pEGX-BlfFf),并在大肠埃希菌BL21中诱导了蛋白表达。SDS-PAGE分析结果表明,pET-BlfFf表达的目标蛋白主要以包涵体形式存在,而pEGX-BlfFf表达的目标蛋白则可大量溶于细胞破碎上清液中,说明后者更适合表达可溶性目标蛋白。pEGX-BlfFf诱导表达产物经GST标签填料柱亲和层析纯化后,可制备出可溶性融合蛋白GST-BlfFf,其产量约为60 mg/L。该蛋白经凝血酶去除GST标签,获得纯化的目标肽。BlfFf的生物活性试验结果表明,经过胃蛋白酶水解后的多肽对金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌均具有抗菌活性。 展开更多
关键词 牛乳铁蛋白功能片段 大肠埃希菌表达 蛋白纯化 活性
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大肠埃希菌裂解性噬菌体vB_EcoP-R1的特性及其抗细菌生物膜活性分析
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作者 石志新 李泽轩 +4 位作者 张立涛 洪欣 刘径 赵哲 刘根焰 《临床检验杂志》 CAS 2024年第4期261-266,共6页
目的从医院污水中分离大肠埃希菌特异性噬菌体,分析其生物学特性,并检测其对细菌生物膜的裂解作用。方法通过双层琼脂平板法分离纯化噬菌体,透射电镜观察其形态,并测定其一步生长曲线、体外裂解曲线、温度及酸碱稳定性。全基因测序分析... 目的从医院污水中分离大肠埃希菌特异性噬菌体,分析其生物学特性,并检测其对细菌生物膜的裂解作用。方法通过双层琼脂平板法分离纯化噬菌体,透射电镜观察其形态,并测定其一步生长曲线、体外裂解曲线、温度及酸碱稳定性。全基因测序分析噬菌体基因组组成及特性,结晶紫染色法评估噬菌体对宿主菌生物膜的清除效果。结果从医院污水中新分离1株大肠埃希菌特异性噬菌体,命名为vB_EcoP-R1;透射电镜下显示形态与尾病毒目足病毒科噬菌体成员相似,在-20~50℃的温度范围内以及在pH值5.0~11.0酸碱条件下能稳定存活。vB_EcoP-R1基因组全长为40875 bp,GC含量为49.94%,不含毒力基因和耐药基因。vB_EcoP-R1能够裂解临床分离的大肠埃希菌,且显示高度种属特异性。噬菌体作用于宿主菌预成形生物膜4 h后,对生物膜的清除率达到80.16%。结论vB_EcoP-R1是1株新的大肠埃希菌特异性噬菌体,裂解性强且种属特异性高,可裂解宿主菌已形成的生物膜,有望用于大肠埃希菌感染的替代治疗。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 生物学特性 体治疗 生物膜
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农贸市场食品来源大肠埃希菌的耐药性及其ESBL耐药基因的研究
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作者 郑月 蔡鹏 +3 位作者 李艳 张云霞 吴智云 王学龙 《食品安全导刊》 2024年第13期95-99,共5页
目的:调查云南省保山市农贸市场售卖畜禽肉蛋和蔬菜超广谱β-内酰胺酶(Extended-Spectrumβ-Lactamase,ESBL)大肠埃希菌污染情况,研究样品分离获得的大肠埃希菌ESBL耐药基因类型。方法:收集农贸市场食品样本,分离鉴定样品中的大肠埃希... 目的:调查云南省保山市农贸市场售卖畜禽肉蛋和蔬菜超广谱β-内酰胺酶(Extended-Spectrumβ-Lactamase,ESBL)大肠埃希菌污染情况,研究样品分离获得的大肠埃希菌ESBL耐药基因类型。方法:收集农贸市场食品样本,分离鉴定样品中的大肠埃希菌并进行药敏试验,扩增大肠埃希菌的ESBL基因,对扩增产物进行测序和同源性比对分析。结果:245份食品样本中分离获得大肠埃希菌75株,其中产ESBL大肠埃希菌25株。对ESBL耐药基因测序结果进行系统发育分析,发现耐药基因为CTX-M型,CTX-M-15序列有9株,占比为36%;CTX-M-14有16株,占比为64%。结论:肉类和蔬菜携带ESBL大肠埃希菌,多重耐药菌及其耐药基因可能通过食品在社区传播。 展开更多
关键词 食品 大肠埃希菌 多重耐药 超广谱Β-内酰胺酶 耐药基因
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大肠埃希菌血流感染产ESBLs株分子流行机制
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作者 刘伟阳 王燕 +3 位作者 邱淑妍 朱丛 杨小兰 赵毅 《分子诊断与治疗杂志》 2024年第3期573-577,共5页
目的 调查分析大肠埃希菌血流感染产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)株分子流行机制,阐明不同耐药基因介导的耐药情况。方法 收集惠州市第三人民医院2019年1月至2022年12月期间血流感染住院患者中分离的ESBLs阳性大肠埃希菌株50例,通过聚合酶... 目的 调查分析大肠埃希菌血流感染产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)株分子流行机制,阐明不同耐药基因介导的耐药情况。方法 收集惠州市第三人民医院2019年1月至2022年12月期间血流感染住院患者中分离的ESBLs阳性大肠埃希菌株50例,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增法检测菌株耐药基因表达情况,并选取部分扩增阳性产物外送测序,分析其基因亚型及对应耐药性。结果 50株ESBLs阳性大肠埃希菌株中有45株菌携带有blaCTX-M基因,占比90.00%(45/50),30株菌携带有blaTEM基因,占60.00%(30/50);CTX-M基因中16株为CTX-M-1亚群,占35.56%(16/45),29株为CTX-M-9亚群,占64.4%(29/45)。未检出blaSHV基因。经测序,CTX-M-1亚群以CTX-M-15为主,CTX-M-9亚群以CTX-M-14亚型为主。CTX-M-9组菌株头孢他啶及头孢吡肟耐药率低于CTX-M-1组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 惠州地区ESBLss阳性大肠埃希菌株耐药基因以CTX-M型为主,且以CTX-M-9亚群为主要类型,而CTX-M-9亚群以CTX-M-14亚型为主,CTX-M-14亚型对头孢他啶和头孢吡肟耐药率低于CTX-M-1亚群及CTX-M-15亚型。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 血流感染 耐药性分析 耐药基因 分型
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