目的:结合生物信息学分析和PCR表达验证,探索子宫内膜癌(endometrial carcinoma,EC)肿瘤微环境中的预后关键基因。方法:下载获取TCGA数据库中552例EC患者的基因表达数据,应用R软件ESTIMATE算法进行免疫评分和基质评分,筛选表达差异基因...目的:结合生物信息学分析和PCR表达验证,探索子宫内膜癌(endometrial carcinoma,EC)肿瘤微环境中的预后关键基因。方法:下载获取TCGA数据库中552例EC患者的基因表达数据,应用R软件ESTIMATE算法进行免疫评分和基质评分,筛选表达差异基因。多种算法对差异基因的预后情况和相关通路进一步探索。PCR实验分析差异基因在细胞系中的表达相关性。结果:Cox回归分析和KM生存分析提示CCR4(C-C motif chemokine receptor 4,CCR4)为潜在预后相关基因。GSEA(gene set enrichment analysis,GSEA)、KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析结果发现,CCR4在免疫应答-激活细胞表面受体信号通路中显著富集。RT-qPCR结果表明,在细胞水平,CCR4在肿瘤组的表达显著高于非肿瘤组。结论:子宫内膜癌的肿瘤微环境中存在免疫浸润,CCR4有望成为新的子宫内膜癌诊断标记物。展开更多
文摘目的:结合生物信息学分析和PCR表达验证,探索子宫内膜癌(endometrial carcinoma,EC)肿瘤微环境中的预后关键基因。方法:下载获取TCGA数据库中552例EC患者的基因表达数据,应用R软件ESTIMATE算法进行免疫评分和基质评分,筛选表达差异基因。多种算法对差异基因的预后情况和相关通路进一步探索。PCR实验分析差异基因在细胞系中的表达相关性。结果:Cox回归分析和KM生存分析提示CCR4(C-C motif chemokine receptor 4,CCR4)为潜在预后相关基因。GSEA(gene set enrichment analysis,GSEA)、KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析结果发现,CCR4在免疫应答-激活细胞表面受体信号通路中显著富集。RT-qPCR结果表明,在细胞水平,CCR4在肿瘤组的表达显著高于非肿瘤组。结论:子宫内膜癌的肿瘤微环境中存在免疫浸润,CCR4有望成为新的子宫内膜癌诊断标记物。
