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肠道微生物与细菌性肺炎易感性的因果关系:双样本双向孟德尔随机化研究及cML-MA的应用
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作者 孔令宜 王园园 +2 位作者 缪长宏 许欣宜 肖璐 《中国急救医学》 CAS CSCD 2024年第2期148-155,共8页
目的通过孟德尔随机化研究方法探究肠道菌群与细菌性肺炎易感性之间的因果关系。方法使用三种不同的孟德尔随机化分析方法,对211个肠道菌群类群与细菌性肺炎之间的关系进行211次双样本分析,并进行反向孟德尔随机化分析。以随机效应逆方... 目的通过孟德尔随机化研究方法探究肠道菌群与细菌性肺炎易感性之间的因果关系。方法使用三种不同的孟德尔随机化分析方法,对211个肠道菌群类群与细菌性肺炎之间的关系进行211次双样本分析,并进行反向孟德尔随机化分析。以随机效应逆方差加权法(IVW)作为主要结果,并采用其他方法作为补充参考。结果柔膜菌纲(OR=1.14,95%CI 1.02~1.27,P=0.02)、放线菌科(OR=1.17,95%CI 1.02~1.35,P=0.03)、放线菌目(OR=1.17,95%CI 1.01~1.35,P=0.03)以及软壁菌门(OR=1.14,95%CI 1.02~1.27,P=0.02)的丰度升高与细菌性肺炎易感性的增加有关;消化球菌科(OR=0.88,95%CI 0.78~0.98,P=0.02)、直肠拟梭菌群(OR=0.85,95%CI 0.75~0.97,P=0.02)和鞘螺菌科UCG001(OR=0.90,95%CI 0.83~0.99,P=0.03)的丰度升高与细菌性肺炎的发病风险降低相关。一系列敏感性分析以及条件孟德尔随机化分析(cML-MA)的结果表示该研究结果可靠。反向孟德尔随机化未发现反向因果关联。结论肠道微生物的丰度升高与细菌性肺炎的易感性增加或降低相关,肠道菌群在细菌性肺炎发病机制中有重要作用,提供了潜在干预措施的新思路。 展开更多
关键词 肠道菌群 细菌性肺炎 条件孟德尔随机化分析(cML-MA) 孟德尔随机化
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血清微量元素与营养素对骨坏死因果效应的孟德尔随机化分析
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作者 刘艺 刘源 +3 位作者 刘金豹 李念虎 朱巍明 许波 《中国组织工程研究》 CAS 2024年第33期5326-5332,共7页
背景:多项临床研究观察表明血清微量元素和营养素与骨坏死之间存在密切关系,但血清微量元素和营养素与骨坏死之间是否存在遗传因果效应尚不清楚。目的:通过孟德尔随机化方法探讨血清微量元素与营养素对骨坏死的因果效应。方法:暴露因素... 背景:多项临床研究观察表明血清微量元素和营养素与骨坏死之间存在密切关系,但血清微量元素和营养素与骨坏死之间是否存在遗传因果效应尚不清楚。目的:通过孟德尔随机化方法探讨血清微量元素与营养素对骨坏死的因果效应。方法:暴露因素血清微量元素和维生素的单核苷酸多态性来自已发表的UK Biobank数据库以及全基因组关联研究公开数据库。结局事件骨坏死全基因组关联研究数据来自FinnGen Biobank数据库。采用孟德尔随机化方法探讨7种微量元素和3种营养素与骨坏死之间的因果关系。利用逆方差加权、MR-Egger和加权中位数等方法进行因果推断,计算F值统计量以确保工具变量的稳健性,采用Cochran’s Q统计法和留一法进行异质性检验,采用MR-Egger回归法、MR-PRESSO进行水平多效性检验。使用PhenoScanner数据库剔除具有水平多效性的单核苷酸多态性,以确保结果的可靠性。结果与结论:经过孟德尔随机化分析发现,血清硒、磷酸盐以及维生素C、维生素E与骨坏死之间存在明显的因果关系。血清硒、维生素C、维生素E对骨坏死有保护作用,磷酸盐摄入过多会增加骨坏死的风险。研究过程中没有发现异质性和水平多效性,孟德尔随机化统计效力(Power值>80%)显示上述4项结果可靠,研究结果对于开发有针对性的预防及治疗骨坏死的措施具有重要临床意义。 展开更多
关键词 孟德尔随机化 微量元素 营养素 骨坏死 单核苷酸多态性 逆方差加权法
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基于两样本孟德尔随机化方法分析低密度脂蛋白胆固醇与哮喘的因果关系
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作者 阿衣古丽·阿布来提 辛莹 黄小荣 《山西医科大学学报》 CAS 2024年第3期362-366,共5页
目的以单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)为工具变量,基于孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)法探究低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)与哮喘的因果关系。方法根据全基因组关联研究(GWAS)的基因数据,借助MR-base平台... 目的以单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)为工具变量,基于孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)法探究低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)与哮喘的因果关系。方法根据全基因组关联研究(GWAS)的基因数据,借助MR-base平台,获得2020年3月10日至2023年3月10日样本量最大的LDL-C及哮喘的GWAS数据,筛选出与LDL-C相关的SNP(筛选条件设定为P<5×10-8),通过逆方差加权分析法(IVW)、加权中位数法(WME)、加权模型、简单模型和MR-Egger法分析LDL-C与哮喘风险的关系,同时绘制SNP相关的LDL-C与哮喘风险的森林图及散点图。结果筛选出的301个SNP均与哮喘不存在基因多效性(MR-Egger回归截距0.007)。所有的回归结果均显示,LDL-C为哮喘的危险因素,MR-Egger回归OR=1.609(95%CI 1.228~2.107)、WME OR=1.448(95%CI 1.266~1.656)、IVW OR=1.499(95%CI 1.348~1.667)、加权模型OR=1.462(95%CI 1.212~1.763)、简单模型OR=1.374(95%CI 1.024~1.846)。MR-Egger回归结果显示统计量Q=1095.819(P<0.001),提示SNP间存在异质性,故选择随机效应IVW模型。结论LDL-C与哮喘之间存在因果关系,LDL-C水平越高,哮喘发病风险越大。 展开更多
关键词 孟德尔随机化 低密度脂蛋白胆固醇 哮喘 因果关系 基因组学
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基于孟德尔随机化分析研究儿童肥胖与妊娠期糖尿病的因果关系及性激素结合球蛋白的调节作用
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作者 黄晶 龙俊青 《现代妇产科进展》 2024年第3期187-190,共4页
目的:探讨儿童肥胖与妊娠期糖尿病(GDM)之间的独立因果关系,并确定性激素结合球蛋白(SHBG)对这一关系的中介作用。方法:利用全基因组关联研究(GWAS)对儿童肥胖和GDM的统计数据进行了双样本孟德尔随机化分析,评估儿童肥胖与GDM的因果影响... 目的:探讨儿童肥胖与妊娠期糖尿病(GDM)之间的独立因果关系,并确定性激素结合球蛋白(SHBG)对这一关系的中介作用。方法:利用全基因组关联研究(GWAS)对儿童肥胖和GDM的统计数据进行了双样本孟德尔随机化分析,评估儿童肥胖与GDM的因果影响,并通过中介分析研究儿童肥胖和GDM之间的关联是否通过性激素结合球蛋白发挥作用。结果:单变量孟德尔随机化结果显示,儿童肥胖可显著增加GDM的风险,儿童肥胖与SHBG呈负相关,SHBG与GDM呈负相关。多因素孟德尔随机化分析显示,儿童肥胖是GDM的独立危险因素,SHBG并非是GDM的独立危险因素。中介效应分析显示,SHBG是儿童肥胖所致的GDM的中介因子。结论:儿童期肥胖对GDM发病存在因果关系,SHBG可部分调控儿童肥胖导致的GDM发生。 展开更多
关键词 妊娠期糖尿病 儿童肥胖 性激素结合球蛋白 孟德尔随机化
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双向孟德尔随机化研究分析哮喘与肌少症的因果效应
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作者 蔡虹 裴晶祺 +1 位作者 唐琳妮 朱迎钢 《老年医学与保健》 CAS 2024年第1期18-22,共5页
目的采用孟德尔随机化研究(MR)探索哮喘与肌少症的因果效应。方法两样本MR评估哮喘数据集对肌少症关联的3个数据集(低手握力、四肢肌肉重量和行走速度)的因果关系。逆方差加权法结果作为主要指标,MR-Egger回归、加权中位值、基于众数的... 目的采用孟德尔随机化研究(MR)探索哮喘与肌少症的因果效应。方法两样本MR评估哮喘数据集对肌少症关联的3个数据集(低手握力、四肢肌肉重量和行走速度)的因果关系。逆方差加权法结果作为主要指标,MR-Egger回归、加权中位值、基于众数的简单估计和基于众数的加权估计作为参考。逐步剔除法检验敏感性,Q检验检验异质性,MR-pleiotropy函数检验多效性。反向MR研究肌少症对哮喘的影响。结果哮喘与低手握力概率增加有关(OR=1.703,95%CI:1.206~2.405,P=0.003);与四肢肌肉重量减少有关(OR=0.733,95%CI:0.598~0.899,P=0.003);与行走速度降低有关(OR=0.930,95%CI:0.873~0.990,P=0.022)。逐步剔除法证实哮喘对肌少症3个数据集因果效应结果稳定。反向研究未发现肌少症对哮喘存在促进作用。结论哮喘促进肌少症的发生和发展,是肌少症的潜在不利因素。 展开更多
关键词 哮喘 肌少症 孟德尔随机化研究 握力
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维生素D与妊娠剧吐的因果关联:两样本孟德尔随机化研究
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作者 程红 《包头医学院学报》 CAS 2024年第2期78-82,共5页
目的:采用两样本孟德尔随机化研究维生素D与妊娠剧吐之间的因果关联。方法:基于IEU OpenGWAS project网站,搜寻样本量最大的维生素D的GWAS数据集以及妊娠剧吐的GWAS数据集。从ieu-b-4808库中选取维生素D强相关的SNPs,设置P<5×10... 目的:采用两样本孟德尔随机化研究维生素D与妊娠剧吐之间的因果关联。方法:基于IEU OpenGWAS project网站,搜寻样本量最大的维生素D的GWAS数据集以及妊娠剧吐的GWAS数据集。从ieu-b-4808库中选取维生素D强相关的SNPs,设置P<5×10^(-8)且连锁不平衡系数0.001及其区域宽度10000 kb;从finn-b-O15_EXCESS_VOMIT_PREG中选择妊娠剧吐关联SNPs。合并数据集纳入174个SNPs为工具变量。采用随机效应逆方差加权(IVW)、MR-Egger、加权中值、加权模型等4种回归模型分析维生素D与妊娠剧吐之间的关联。结果:MR-Egger回归截距项是0.005,相应P值为0.513,提示SNPs没有基因多效性。IVW回归结果发现OR(95%CI s)是0.478(0.303~0.753),P值为0.001;MR-Egger、加权中值、加权模型结果与IVW结果类似。IVW和MR-Egger回归的Cochran’s Q值分别为143.733(P=0.893)和143.303(P=0.888),提示SNPs间没有异质性。结论:维生素D是妊娠剧吐的保护因素。 展开更多
关键词 妊娠剧吐 维生素D 因果关联 孟德尔随机化
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两样本双向孟德尔随机化分析胃食管反流病与偏头痛间的因果效应
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作者 马佳昕 周元植 +5 位作者 陈雯雯 赵雅涵 张旭 李雅睿 和水祥 赵艳 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 2024年第2期262-270,共9页
目的利用两样本双向孟德尔随机化(MR)研究方法,探讨胃食管反流病与偏头痛之间发病的因果关联,为两种疾病发病风险关联提供遗传学证据支持。方法从公开发表的全基因组关联分析(GWAS)数据库中获取两样本的单核苷酸多态性(SNP)信息,筛选出... 目的利用两样本双向孟德尔随机化(MR)研究方法,探讨胃食管反流病与偏头痛之间发病的因果关联,为两种疾病发病风险关联提供遗传学证据支持。方法从公开发表的全基因组关联分析(GWAS)数据库中获取两样本的单核苷酸多态性(SNP)信息,筛选出合适的SNP作为工具变量,利用逆方差加权法(IVW)、加权中位数法(WM)、MR-Egger回归法、加权众数法以及简单模型法五种MR分析方法进行双向MR分析,并进行敏感性检验。结果IVW显示以胃食管反流病为暴露的正向MR分析结果有阳性意义[OR=1.3987,95%CI(1.1817~1.6556),P=9.59×10^(-5)],以偏头痛为暴露的反向MR分析结果无阳性意义(P>0.05),在除MR-Egger外的其他方法中得到相同的结论。正向MR(P=0.92)与反向MR(P=0.64)均未发现工具变量具有水平多效性,留一法剔除单个SNP后结果具有稳健性。结论胃食管反流病与偏头痛之间可能存在单向的因果关联,胃食管反流病是偏头痛发病的危险因素。 展开更多
关键词 胃食管反流病 偏头痛 孟德尔随机化 因果关系 危险因素
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三种特应性疾病与斑秃发生风险的因果关系:两样本孟德尔随机化研究
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作者 徐媛媛 郭玲宏 +3 位作者 吴姝玮 张婷 张璐 蒋献 《中国麻风皮肤病杂志》 2024年第4期239-244,共6页
目的:应用两样本孟德尔随机化分析哮喘、特应性皮炎、过敏性鼻炎与斑秃发生风险之间的因果关系。方法:根据全基因组关联研究的汇总数据集,提取与哮喘、特应性皮炎和过敏性鼻炎显著相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,... 目的:应用两样本孟德尔随机化分析哮喘、特应性皮炎、过敏性鼻炎与斑秃发生风险之间的因果关系。方法:根据全基因组关联研究的汇总数据集,提取与哮喘、特应性皮炎和过敏性鼻炎显著相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)作为工具变量,使用逆方差加权法、MR-Egger回归、加权中位数、简单模型和加权模型评估三种特应性疾病与斑秃之间的因果关联。结果:选取64个、61个、3个分别与哮喘、特应性皮炎、过敏性鼻炎相关的SNP作为工具变量,逆方差加权法证明哮喘、特应性皮炎是斑秃发生的危险因素(OR:1.45;95%CI:1.67~1.97;OR:1.79;95%CI:1.28~2.51);加权中位数和加权模型方法进一步支持因果关联的显著性。结论:哮喘、特应性皮炎与斑秃发病风险之间存在显著的正向因果关系。 展开更多
关键词 斑秃 哮喘 特应性皮炎 过敏性鼻炎 孟德尔随机化
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孟德尔随机化分析方法在非酒精性脂肪性肝病病因探索中的应用
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作者 郭紫薇 武庆娟 +2 位作者 叶永安 陈兰羽 吕文良 《临床肝胆病杂志》 CAS 2024年第3期589-593,共5页
非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)是以肝内脂质大量堆积为特点的肝脂质代谢异常类疾病,是目前世界范围内最常见的肝脏疾病。孟德尔随机化(MR)将基因组数据纳入传统的流行病学研究设计中,以推断暴露因素与疾病风险之间的因果关系。近年来,MR在N... 非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)是以肝内脂质大量堆积为特点的肝脂质代谢异常类疾病,是目前世界范围内最常见的肝脏疾病。孟德尔随机化(MR)将基因组数据纳入传统的流行病学研究设计中,以推断暴露因素与疾病风险之间的因果关系。近年来,MR在NAFLD的病因推断研究中得到了较为广泛的应用,本文将系统总结MR在NAFLD研究中的应用进展,为认识疾病本质和科学化干预提供新思路。 展开更多
关键词 非酒精性脂肪性肝病 孟德尔随机化分析 因果律 工具变量
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脓毒症与心律失常因果关联的两样本孟德尔随机化研究
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作者 杨梦霞 赵春铭 +2 位作者 陈腾飞 徐霄龙 刘清泉 《中国急救医学》 CAS CSCD 2024年第2期142-147,共6页
目的探索脓毒症与心律失常之间的因果关联。方法以公开发表的全基因组关联性分析作为数据源,筛选出与脓毒症显著相关的单核苷酸多态性作为工具变量,采用两样本孟德尔随机化法中的逆方差加权法、加权中位数法、孟德尔随机化-Egger分析法... 目的探索脓毒症与心律失常之间的因果关联。方法以公开发表的全基因组关联性分析作为数据源,筛选出与脓毒症显著相关的单核苷酸多态性作为工具变量,采用两样本孟德尔随机化法中的逆方差加权法、加权中位数法、孟德尔随机化-Egger分析法、简单模式法和加权模式法评估脓毒症与心律失常之间的因果关联。通过异质性分析、多效性分析及敏感性分析评估结果的可靠性和稳定性。结果筛选出52个强工具变量进行两样本孟德尔随机化分析,仅逆方差加权法分析结果显示差异有统计学意义(OR=1.002,95%CI 1.001~1.003,P=0.002);其余四种分析方法结果差异无统计学意义(均P>0.05),但其效应值β与逆方差加权法的效应值β方向相同;异质性分析、多效性分析及敏感性分析结果均显示P>0.05。结论脓毒症与心律失常之间存在因果关联,即脓毒症会增加心律失常发生的风险。 展开更多
关键词 脓毒症 心律失常 孟德尔随机化 因果关联 单核苷酸多态性 逆方差加权法
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孟德尔随机化分析联合PBL教学模式在《牙周病学》本科教学中的探索
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作者 贾睿微 赵浙妤 +3 位作者 朱晓丹 曹金芳 王惠宁 孙晓瑜 《温州医科大学学报》 CAS 2024年第2期169-172,F0003,共5页
目的:将分析疾病因果关系的孟德尔随机化(MR)分析联合以问题为导向的教学方法(PBL)的教学模式应用于《牙周病学》教学,引导学生了解探究牙周病与全身因素之间的关联性,并研究此模式在牙周病教学中的应用效果。方法:以《牙周病学》教材为... 目的:将分析疾病因果关系的孟德尔随机化(MR)分析联合以问题为导向的教学方法(PBL)的教学模式应用于《牙周病学》教学,引导学生了解探究牙周病与全身因素之间的关联性,并研究此模式在牙周病教学中的应用效果。方法:以《牙周病学》教材为主,教授学生MR分析手段为辅,引导学生进行科研探究,提升科研思维和文献查阅能力。选取温州医科大学2019级两个班级的口腔医学专业学生,随机按照班级分为实验组(MR分析联合PBL教学模式)与对照组(课堂授课联合PBL教学模式),实验组53人、对照组54人。课程结束后通过学生课堂表现评分、考试成绩和科研创新思维能力对两种教学模式进行考核评价。结果:经过MR分析联合PBL教学后,实验组学生理论成绩优于对照组,实验组学生试题平均分为84.9±4.6,而对照组的试题平均分为79.2±4.3,差异有统计学意义(P<0.05)。同时,实验组学生课堂表现评分为96.7±5.7,而对照组评分为91.2±4.8,差异有统计学意义(P<0.001)。此外,实验组学生科研创新思维能力优于对照组,具体表现为参与更多科研项目及论文撰写发表。结论:采用MR分析联合PBL的教学模式进行《牙周病学》教学,可加深学生对于牙周疾病与全身疾病关联性的理解与掌握。学生通过查阅科研文献,深入探究补充牙周病与全身疾病之间的关联性,可有效提升学生科研思维能力及文献查阅能力。 展开更多
关键词 孟德尔随机化分析 以问题为导向的教学 牙周病学 教学方法 科研创新思维能力
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类风湿性关节炎与骨质疏松症和骨密度关系的孟德尔随机化分析
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作者 武瑞骐 周毅 +5 位作者 夏天 张驰 杨启培 张璇 张亚忠 崔伟 《中国组织工程研究》 CAS 2024年第23期3715-3721,共7页
背景:许多临床研究观察表明类风湿性关节炎与骨质疏松症和骨密度之间存在密切关系,但类风湿性关节炎与骨质疏松症和骨密度之间是否存在因果遗传尚不清楚。目的:采用两样本孟德尔随机化研究方法评估类风湿性关节炎与骨质疏松症和骨密度... 背景:许多临床研究观察表明类风湿性关节炎与骨质疏松症和骨密度之间存在密切关系,但类风湿性关节炎与骨质疏松症和骨密度之间是否存在因果遗传尚不清楚。目的:采用两样本孟德尔随机化研究方法评估类风湿性关节炎与骨质疏松症和骨密度之间潜在的因果关系,从遗传学的角度对潜在的机制提供有意义的见解,为早期预防骨质疏松症、改善疾病的发生发展提供参考。方法:从全基因组关联研究(GWAS)公开数据库中筛选出与类风湿性关节炎相关的(P<5×10^(-8))单核苷酸多态性位点作为工具变量。研究结局主要包括骨质疏松症、5个不同部位的骨密度,包括全身骨密度、腰椎骨密度、股骨颈骨密度、足跟骨密度以及前臂骨密度。逆方差加权法为该研究评估因果效应的主要分析方法,文章采用加权中位数法、简单中位数法、加权中值方法和MR-Egger回归用于补充说明,以比值比(OR)和95%可信区间(95%CI)评价类风湿性关节炎与骨质疏松症及骨密度风险之间的因果关系,使用类风湿性关节炎Cochran’s Q检验异质性,利用MR-Egger-intercept检验是否存在水平多效性。结果与结论:①逆方差加权法结果表明遗传预测的类风湿性关节炎与骨质疏松症呈正相关(OR=1.123,95%CI:1.077-1.171,P=4.02×10^(-8)),异质性检验表明单核苷酸多态性位点不存在异质性(P=0.388),MR-Egger-intercept检验未检测到水平多效性(P=0.571),敏感性分析显示研究结果没有产生偏倚。②类风湿性关节炎与5个部位的骨密度之间不存在因果关系显示如下:全身骨密度(OR=1.000,95%CI:0.988-1.012,P=0.925)、腰椎骨密度(OR=0.999,95%CI:0.982-1.016,P=0.937)、股骨颈骨密度(OR=1.001,95%CI:0.986-1.016,P=0.866)、足跟骨密度(OR=0.996,95%CI:0.989-1.004,P=0.419)、前臂骨密度(OR=1.063,95%CI:0.970-1.031,P=0.996)。MR-Egger-intercept分析未检测到潜在的水平多效性(全身骨密度:P=0.253;腰椎骨密度:P=0.638;股骨颈骨密度:P=0.553;足跟骨密度:P=0.444;前臂骨密度:P=0.079)。③类风湿性关节炎可能通过慢性炎症与骨的形成、骨溶解和吸收之间的相互作用导致骨质疏松症,此外,糖皮质激素的使用和类风湿性关节炎患者身体内的自身抗体(如抗瓜氨酸蛋白抗体)阳性也与骨质疏松症存在相关性。④未来研究需重点关注类风湿性关节炎患者全身免疫水平的系统性炎症指标、糖皮质激素的规范使用以及定期进行骨质疏松症风险筛查。 展开更多
关键词 骨质疏松症 类风湿性关节炎 骨密度 孟德尔随机化 单核苷酸多态性 因果关联 全基因组关联研究 工具变量
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受教育程度与胰腺炎的因果关系:一项孟德尔随机化研究
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作者 曹瑞奇 冯正源 +4 位作者 吴佼星 李杰 王铮 仵正 周灿灿 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 2024年第2期200-205,共6页
目的 通过孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析探究受教育程度(educational attainment,EA)与胰腺炎之间的因果关系。方法 采用双样本MR分析,EA和胰腺炎的全基因组关联研究(GWAS)汇总数据分别来自SSGAC数据库和FinnGen数据库R... 目的 通过孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析探究受教育程度(educational attainment,EA)与胰腺炎之间的因果关系。方法 采用双样本MR分析,EA和胰腺炎的全基因组关联研究(GWAS)汇总数据分别来自SSGAC数据库和FinnGen数据库R9版本。采用逆方差加权(inverse variance weighted,IVW)、MR-Egger和weighted median法探究EA与胰腺炎之间的因果关系。通过Cochran’s Q检验和漏斗图等方法评估异质性和定向的水平多效性。结果 共有604个与EA相关的单核苷酸多态性(SNP)被纳入研究,EA与急性胰腺炎和慢性胰腺炎发病风险均具有明显的负相关性(急性胰腺炎:OR=0.52,95%CI:0.44~0.62,P=2.43×10^(-14);慢性胰腺炎:OR=0.51,95%CI:0.41~0.64,P=7.20×10^(-9))。MR-Egger和weighted median的结果也提示EA与胰腺炎发病风险呈负相关。敏感性分析结果表明研究没有违反MR的基本假设。结论 EA与急性、慢性胰腺炎的发生存在因果关系,EA与胰腺炎的发病风险呈负相关。 展开更多
关键词 胰腺炎 受教育程度(EA) 孟德尔随机化(MR) 全基因组关联研究(GWAS) 风险因素
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孟德尔随机化分析血液代谢物与肌少症相关特征的因果关系
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作者 陈天鑫 董婷婷 +2 位作者 李妍 张晟 张磊 《中国组织工程研究》 CAS 2024年第27期4288-4292,共5页
背景:临床证据显示代谢因素与肌少症之间存在相关性,血液代谢物已被用于揭示肌肉骨骼疾病的生物学机制,然而血液代谢物与肌少症之间的因果关系尚不明确。目的:运用两样本孟德尔随机化分析方法探讨血液代谢物与肌少症相关特征之间的因果... 背景:临床证据显示代谢因素与肌少症之间存在相关性,血液代谢物已被用于揭示肌肉骨骼疾病的生物学机制,然而血液代谢物与肌少症之间的因果关系尚不明确。目的:运用两样本孟德尔随机化分析方法探讨血液代谢物与肌少症相关特征之间的因果关系,分析其代谢通路。方法:从公共数据库获取486种血液代谢物与肌少症相关特征的数据集。运用逆方差加权、MR-Egger和加权中位数法评估血液代谢物与不同性别肌量、肌力的因果关系,并进行异质性、基因多效性等敏感性分析探讨结果稳健性。运用Metaboanayst 5.0工具对具有潜在因果关系的代谢物进行代谢通路分析。结果与结论:①观察到124种代谢物和肌少症相关特征具有潜在因果关系(P<0.05);②甘露糖、1-花生四烯酸甘油磷酸胆碱与男性肌量增加存在显著因果关系(P<1.03×10^(-4));十五烷酸酯、甘氨酸分别与女性肌量、肌力下降存在显著因果关系(P<1.03×10^(-4));③代谢通路分析显示“乙醛酸和二羧酸代谢”“甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢”等8条代谢通路与肌少症的肌量、肌力水平改变相关;④鉴定出的血液代谢物可被视为临床实践中筛查和预防肌少症的有效循环代谢生物标志物,也可作为未来机制探索和药物靶点选择的候选分子。 展开更多
关键词 血液代谢物 肌少症 孟德尔随机化 代谢通路 因果关系
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他汀类药物与骨密度:一项药物靶向孟德尔随机化分析
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作者 马玮玮 熊勇 +3 位作者 陈虹谷 黄文茁 黄新 周晓红 《中国组织工程研究》 CAS 2024年第27期4340-4345,共6页
背景:观察性研究表明他汀类药物可能对骨密度具有保护作用,这使其成为潜在的骨质疏松症治疗药物之一。目的:通过孟德尔随机化方法来评估药物靶点介导的脂质表型与骨密度之间的因果关系。方法:从IEU Open GWAS数据库获取了与他汀类药物... 背景:观察性研究表明他汀类药物可能对骨密度具有保护作用,这使其成为潜在的骨质疏松症治疗药物之一。目的:通过孟德尔随机化方法来评估药物靶点介导的脂质表型与骨密度之间的因果关系。方法:从IEU Open GWAS数据库获取了与他汀类药物相关的单核苷酸多态性以及骨密度相关数据。主要分析方法是逆方差加权法,同时也使用了加权中位数法、简单中位数法、加权中值方法和MR-Egger回归法。使用β值和95%CI来评估他汀类药物与骨密度之间的因果关系;另外,进行敏感性分析以验证结果的可靠性,使用Cochran’s Q检验来评估异质性,使用MR-Egger截距检验是否存在水平多效性。使用留一法分析确定是否有单个或多个单核苷酸多态性影响了结果。结果与结论:他汀类药物作用靶点——3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶介导的低密度脂蛋白胆固醇与足跟定量超声骨密度(β=-0.086,95%CI:-0.117至-0.055,P=5.42×10^(-8))和全身骨密度(β=-0.193,95%CI:-0.288至-0.098,P=7.35×10^(-5))呈显著相关。该研究结果支持了他汀类药物对骨密度的保护作用。这些发现不仅加深了对胆固醇相关基因和骨骼健康关系的理解,还揭示了改善骨密度的潜在治疗靶点。 展开更多
关键词 他汀类药物 骨密度 孟德尔随机化 全基因组关联研究 因果关系
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类风湿性关节炎中免疫相关基因表达及免疫细胞的双样本孟德尔随机化分析
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作者 范以东 秦刚 +3 位作者 何凯毅 龚玉芳 李威材 吴广涛 《中国组织工程研究》 CAS 2024年第27期4312-4318,共7页
背景:类风湿性关节炎是一种慢性全身性自身免疫疾病,研究其涉及的免疫学特征改变对诊断和治疗具有重要意义。目的:通过生物信息学方法筛选类风湿性关节炎中免疫相关生物标志物,分析其免疫细胞浸润变化及与免疫细胞的潜在因果关系。方法... 背景:类风湿性关节炎是一种慢性全身性自身免疫疾病,研究其涉及的免疫学特征改变对诊断和治疗具有重要意义。目的:通过生物信息学方法筛选类风湿性关节炎中免疫相关生物标志物,分析其免疫细胞浸润变化及与免疫细胞的潜在因果关系。方法:基于GEO与ImmPort数据库,采用差异表达分析筛选类风湿性关节炎中表达上调的免疫相关基因,采用GO与KEGG富集分析探索这些上调基因的潜在作用。采用支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)、最小绝对收缩和选择算法(Lasso)筛选类风湿性关节炎中免疫特征基因,独立的数据集进行差异验证,绘制特征基因的受试者工作特征曲线评价诊断性能。采用免疫细胞浸润分析类风湿性关节炎中免疫细胞的差异情况及特征基因与免疫细胞的相关性。最后,进行孟德尔随机化分析,以确定免疫细胞中单核细胞与类风湿性关节炎的因果效应。结果与结论:①筛选得到了39个在类风湿性关节炎中高表达的差异基因,GO富集分析显示其主要富集在趋化性、细胞因子活性、免疫受体活性等过程,KEGG富集分析显示其在肿瘤坏死因子信号通路、白细胞外周迁移等途径显著富集;②通过Lasso与SVM-RFE两种机器学习算法确定了5个特征基因,分别为CXCL13、SDC1、IGLC1、PLXNC1和SLC29A3,独立的数据集对特征基因验证发现他们同样在类风湿性关节炎样本中高表达,5个特征基因在2个数据集中的AUC值均大于0.8;③免疫细胞浸润发现大多数免疫细胞如单核细胞、自然杀伤细胞等在类风湿性关节炎样本里表现出更高的浸润水平,相关性分析显示5个特征基因与记忆B细胞、不成熟B细胞等呈正相关性,逆方差加权法发现单核细胞与类风湿性关节炎发病风险相关。 展开更多
关键词 类风湿性关节炎 机器学习 免疫浸润 全基因组关联研究 孟德尔随机化
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孟德尔随机化在肝癌研究中的应用
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作者 李凌巍 秦俊杰 +1 位作者 贾云龙 吕浩 《临床肝胆病杂志》 CAS 2024年第2期391-396,共6页
近年来,基于全基因组关联研究的孟德尔随机化研究方法被广泛应用于医学领域的病因探索,以其遗传变异的分配随机性和时序优先性的独特优势,可以有效克服传统观察性研究中的混杂偏倚和反向因果的干扰。本文针对该方法及其在肝癌研究领域... 近年来,基于全基因组关联研究的孟德尔随机化研究方法被广泛应用于医学领域的病因探索,以其遗传变异的分配随机性和时序优先性的独特优势,可以有效克服传统观察性研究中的混杂偏倚和反向因果的干扰。本文针对该方法及其在肝癌研究领域的应用进展作一综述,旨在为肝癌的因果关联研究提供新思路。 展开更多
关键词 孟德尔随机化分析 肝肿瘤 全基因组关联研究
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基于两样本孟德尔随机化的失眠与2型糖尿病关联研究
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作者 马雨佳 卢燃藜 +4 位作者 周泽宸 李晓怡 闫泽玉 武轶群 陈大方 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 2024年第1期174-178,共5页
目的:为克服观察性研究中的混杂因素和反向因果关系的影响,通过两样本孟德尔随机化法探讨失眠与2型糖尿病之间的关联关系。方法:在欧洲裔人群最新的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)中选择与失眠密切相关的遗传位... 目的:为克服观察性研究中的混杂因素和反向因果关系的影响,通过两样本孟德尔随机化法探讨失眠与2型糖尿病之间的关联关系。方法:在欧洲裔人群最新的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)中选择与失眠密切相关的遗传位点作为工具变量。剔除与吸烟、体育活动、饮酒、教育程度、肥胖或2型糖尿病显著相关的位点后,使用逆方差加权评估失眠对2型糖尿病的效应,并采用加权中位数法和MR-Egger回归分析来检验结果的稳健性。通过计算F统计量来检验工具变量的适用性,F统计量大于10认为存在弱工具变量偏倚可能性较小。采用MR-Egger回归进行多效性检验。此外,采用留一法(leave-one-out)进行敏感性分析,以进一步验证结果的稳定性和可靠性。结果:在全基因组水平上选择了248个与失眠独立相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)作为候选工具变量集合,基于千人基因组计划对候选工具变量集合进行修剪并剔除潜在的多效SNPs后,共纳入与失眠相关的167个SNPs作为最终的工具变量。本研究中F统计量为39.74,符合孟德尔随机化的相关性假设。逆方差加权法发现失眠与2型糖尿病的发生风险较高,在失眠的人群中发生2型糖尿病的风险是无失眠人群的1.14倍(95%CI:1.09~1.21,P<0.001)。加权中位数法和MR-Egger回归结果支持失眠对2型糖尿病存在正向关联。多效性检验表明结果受多效性影响的可能性较小,敏感性分析支持研究结果的可靠性与稳定性。结论:失眠是2型糖尿病的危险因素,失眠与2型糖尿病发病存在正向关联,本研究为糖尿病高危人群保持健康的生活方式提供了进一步的理论依据。 展开更多
关键词 入睡和睡眠障碍 糖尿病 2型 孟德尔随机化分析
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趋化因子CCL2与肺癌的因果关系:两样本孟德尔随机化研究
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作者 刘梓燊 郑瑛瑛 +2 位作者 袁梦琪 张甘霖 杨国旺 《实用医学杂志》 CAS 2024年第4期532-536,共5页
目的探究趋化因子CCL2(又称单核细胞趋化蛋白1,MCP-1)与肺癌(lung cancer)是否具有因果关系。方法从全基因组关联研究(GWAS)提取趋化因子CCL2和肺癌不同病理分型的遗传数据,使用逆方差加权分析(IVW)作为主要分析,另选用加权中位数法、... 目的探究趋化因子CCL2(又称单核细胞趋化蛋白1,MCP-1)与肺癌(lung cancer)是否具有因果关系。方法从全基因组关联研究(GWAS)提取趋化因子CCL2和肺癌不同病理分型的遗传数据,使用逆方差加权分析(IVW)作为主要分析,另选用加权中位数法、简单模式法、MR-Egger回归法、加权模式法进行补充分析,并进行敏感性分析验证数据的可靠性。结果趋化因子CCL2对肺腺癌的IVW分析结果OR=1.065,95%CI(0.919~1.234),P=0.401。趋化因子CCL2对肺鳞状细胞癌的IVW分析结果OR=1.059,95%CI(0.931~1.205),P=0.381。趋化因子CCL2对小细胞肺癌的IVW分析结果OR=0.959,95%CI(0.760~1.208),P=0.720。结论趋化因子CCL2与肺癌没有直接因果关系。 展开更多
关键词 孟德尔随机化 单核细胞趋化因子 肺癌 因果关系
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孟德尔随机化研究溃疡性结肠炎与甲状腺功能减退发生风险的因果关系
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作者 花胤 王晓燕 +2 位作者 王振 辛永宁 刘守胜 《实用医学杂志》 CAS 2024年第6期827-832,共6页
目的 运用两样本孟德尔随机化(two sample mendelian randomization, TSMR)评估溃疡性结肠炎(ulcerative colitis, UC)与甲状腺功能减退(hypothyroidism, HT)之间的双向因果关系。方法 UC与HT相关的单核苷酸多态性位点(single nucleotid... 目的 运用两样本孟德尔随机化(two sample mendelian randomization, TSMR)评估溃疡性结肠炎(ulcerative colitis, UC)与甲状腺功能减退(hypothyroidism, HT)之间的双向因果关系。方法 UC与HT相关的单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism, SNP)数据分别来自芬兰生物银行和IEU数据库,提取出与UC强相关的独立SNP作为工具变量,采用逆方差加权法(inverse variance weighted,IVW)、Egger回归法(MR-Egger)、中位数加权法(weighted median)评估UC与HT之间的因果关联,同时采用MR-PRESSO评估水平多效性及离群的SNP,Cochran′s Q检测及漏斗图(funnel test)评估SNPs中的异质性,留一法分析(leave one out)是否存在单个SNP能够影响因果评估的结果。结果 筛选出4个与UC强相关关联的工具变量,IVW法提示UC和HT之间存在因果关系(OR=0.975,95%CI:0.924~0.990,P=0.011),Cochran Q检验Q=2.566,P=0.463,提示SNP之间不存在异质性。MR-Egger法(P=0.523)和MR-PRESSO法(P=0.548)均提示不存在水平多效性,反向TSMR的结果不支持反向因果关系。结论 TSMR发现UC与HT之间存在负向因果关系。 展开更多
关键词 溃疡性结肠炎 甲状腺功能减退 孟德尔随机化
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