基于整合药理学和实验验证探讨健脾除痰解毒方(Jianpi Chutan Jiedu Decoction,JCJD)干预肺癌的作用机制。采用中医药整合药理学研究平台(Integrative Pharmacology-based Research Platform of Traditional Chinese Medicine,TCMIP)V2...基于整合药理学和实验验证探讨健脾除痰解毒方(Jianpi Chutan Jiedu Decoction,JCJD)干预肺癌的作用机制。采用中医药整合药理学研究平台(Integrative Pharmacology-based Research Platform of Traditional Chinese Medicine,TCMIP)V2.0,检索并获取健脾除痰解毒方靶标及功能信息,以及肺癌疾病靶标及功能信息,借助中医关联网络挖掘平台构建“疾病-方剂”关联网络,并通过网络拓扑特征计算、自定义多维关联网络可视化(方剂-中药材-核心靶标-通路-疾病)以及基因本体(GO)功能和依托Reactome数据库的Pathway信息进行富集分析,发现健脾除痰解毒方干预肺癌的关键网络靶标及其作用机制。最后通过动物实验进一步验证整合药理学结果。结果共获得健脾除痰解毒方干预肺癌的核心靶标53个;GO富集分析得到生物过程有20种条目,细胞组分有11种条目,分子功能有20种条目;Reactome Pathway富集分析得到11个条目,主要涉及呼吸电子传递、TP53调节代谢基因、细胞内受体的SUMO化、白细胞介素(IL)-4和IL-13通路等信号通路。动物实验结果显示与模型组比较,联合组肿瘤组织中乳酸含量明显下降(P<0.05),联合组可明显上调肿瘤组织中磷酸酯酶与张力蛋白同源物(PTEN)蛋白平均光密度值(P<0.05),降低丙酮酸激酶M2(PKM2)和己糖激酶2(HK2)蛋白平均光密度值(P<0.05);与模型组比较,联合组可明显上调肿瘤组织中肿瘤抑制蛋白(P53)、PTEN mRNA及蛋白表达(P<0.01,P<0.05),降低肿瘤组织中TP53诱导的糖酵解与凋亡调控因子(TIGAR)、葡萄糖转运蛋白1(GLUT1)、PKM2、HK2 mRNA及蛋白表达(P<0.01)。综上,健脾除痰解毒方通过TP53调节代谢基因来下调葡萄糖代谢,从而抑制肺癌增殖。展开更多
[目的]运用网络药理学和体外实验探讨玉泉胶囊治疗糖尿病肾病的潜在作用机制。[方法]借助中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)和中医药综合数据...[目的]运用网络药理学和体外实验探讨玉泉胶囊治疗糖尿病肾病的潜在作用机制。[方法]借助中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)和中医药综合数据库(Traditional Chinese Medicine Integrated Database,TCMID)筛选玉泉胶囊有效成分及靶点基因,基因组注释数据平台(Genome Annotation Database Platform,GeneCards)、疾病基因网络(Disease Gene Network,DisGeNET)数据库和治疗靶点数据库(Therapeutic Target Database,TTD)筛选糖尿病肾病的疾病相关基因,STRING 11.5数据库构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,并利用Cytoscape 3.7.2软件可视化,利用Cytoscape 3.7.2软件的CytoHubba和MCODE插件筛选关键化合物与核心靶点,利用R软件(ClusterProfiler包)进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析,利用AutoDock和PyMOL软件进行分子对接验证,最后对网络药理学预测结果进行体外实验验证。[结果]玉泉胶囊抗糖尿病肾病活性成分有177个,活性成分作用靶点共477个,作用于糖尿病肾病的靶点有135个,核心靶点包括丝氨酸/苏氨酸激酶1(serine/threonine kinase 1,AKT1)、白细胞介素-1β(interleukin-1 beta,IL1B)、过氧化氢酶(catalase,CAT)、一氧化氮合酶(nitric oxide synthase 3,NOS3)、瘦素(leptin,LEP)、胰岛素样生长因子1(insulin-like growth factor 1,IGF1)和趋化因子配体2(C-C motif chemokine ligand 2,CCL2);GO富集分析共得到相关条目2557个,其中生物过程1415个、细胞组成657个、分子功能48个;KEGG通路分析结果显示玉泉胶囊作用于糖尿病肾病的靶点富集在66条通路上,其中环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)信号通路、高级糖基化终末产物-受体(advanced glycation end products-receptor for advanced glycation end products,AGE-RAGE)信号通路在糖尿病并发症中的作用等可能是玉泉胶囊治疗糖尿病肾病的关键通路。分子对接结果显示核心靶点与关键化合物均能较好地结合。实验验证显示,CCL2蛋白水平呈药物剂量依赖性下降,CAT、内皮型一氧化氮合酶(endothelial nitric oxide synthase,eNOs)蛋白水平呈药物剂量依赖性上升。[结论]玉泉胶囊治疗糖尿病肾病具有多成分、多靶点的特点,其机制可能与下调CCL2、上调CAT、eNOs的蛋白表达,抑制糖尿病肾病的氧化应激,调节关键通路相关。展开更多
文摘基于整合药理学和实验验证探讨健脾除痰解毒方(Jianpi Chutan Jiedu Decoction,JCJD)干预肺癌的作用机制。采用中医药整合药理学研究平台(Integrative Pharmacology-based Research Platform of Traditional Chinese Medicine,TCMIP)V2.0,检索并获取健脾除痰解毒方靶标及功能信息,以及肺癌疾病靶标及功能信息,借助中医关联网络挖掘平台构建“疾病-方剂”关联网络,并通过网络拓扑特征计算、自定义多维关联网络可视化(方剂-中药材-核心靶标-通路-疾病)以及基因本体(GO)功能和依托Reactome数据库的Pathway信息进行富集分析,发现健脾除痰解毒方干预肺癌的关键网络靶标及其作用机制。最后通过动物实验进一步验证整合药理学结果。结果共获得健脾除痰解毒方干预肺癌的核心靶标53个;GO富集分析得到生物过程有20种条目,细胞组分有11种条目,分子功能有20种条目;Reactome Pathway富集分析得到11个条目,主要涉及呼吸电子传递、TP53调节代谢基因、细胞内受体的SUMO化、白细胞介素(IL)-4和IL-13通路等信号通路。动物实验结果显示与模型组比较,联合组肿瘤组织中乳酸含量明显下降(P<0.05),联合组可明显上调肿瘤组织中磷酸酯酶与张力蛋白同源物(PTEN)蛋白平均光密度值(P<0.05),降低丙酮酸激酶M2(PKM2)和己糖激酶2(HK2)蛋白平均光密度值(P<0.05);与模型组比较,联合组可明显上调肿瘤组织中肿瘤抑制蛋白(P53)、PTEN mRNA及蛋白表达(P<0.01,P<0.05),降低肿瘤组织中TP53诱导的糖酵解与凋亡调控因子(TIGAR)、葡萄糖转运蛋白1(GLUT1)、PKM2、HK2 mRNA及蛋白表达(P<0.01)。综上,健脾除痰解毒方通过TP53调节代谢基因来下调葡萄糖代谢,从而抑制肺癌增殖。
