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抗癌性钌配合物[HL][trans-Ru^ⅢCl4L2](L=2-NH2-5-Me-STz)的水解机理 被引量:2
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作者 陈锦灿 陈兰美 +1 位作者 廖思燕 郑康成 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第12期2543-2550,共8页
用量子化学密度泛函理论(DFT),并结合导体极化连续模型(CPCM)研究了具有潜在抗肿瘤活性的"Kep-pler型"钌配合物trans-[RuⅢCl4(2-NH2-5-Me-STz)2](1)的水解反应过程.首先,在UB3LYP/(LanL2DZ+6-31G(d))理论水平上对水解反应中... 用量子化学密度泛函理论(DFT),并结合导体极化连续模型(CPCM)研究了具有潜在抗肿瘤活性的"Kep-pler型"钌配合物trans-[RuⅢCl4(2-NH2-5-Me-STz)2](1)的水解反应过程.首先,在UB3LYP/(LanL2DZ+6-31G(d))理论水平上对水解反应中各平衡构型在气相条件下的有关结构进行全几何优化及振动频率分析;然后,在更高的基组水平LanL2DZ(f)+6-311++G(3df,2dp)上对优化的结构进行单点能计算,并考虑溶剂效应.计算得到水解反应过程中相应的结构特征和详细的反应势能面.对于第一步水解,液相中配合物1的活化能垒为92.9kJ·mol-1,与已经报道的配合物trans-[RuⅢCl4(2-NH2-Tz)2](2)的活化能垒(96.3kJ·mol-1)相接近,并与实验结果相符.对于第二步水解,反应在热力学上优先生成顺式双水解产物,恰如顺铂的水解反应机理一样,存在着所谓"顺式效应",即生成的顺式水解产物有利于其与生物分子靶标的键合,因此,顺式双水解产物在生物反应中有望成为重要的前体药物.本文研究结果有助于深入理解抗癌性Ru(Ⅲ)配合物与相关生物靶标的作用机理. 展开更多
关键词 密度泛函理论 Ru(Ⅲ)配合物 抗癌活性 水解 导体极化连续模型
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[EPy][BF_4]和[EPy][PF_6]离子对的气相及液相阴阳离子相互作用研究 被引量:2
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作者 万辉 王小露 管国锋 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第8期1615-1620,共6页
采用从头算HF/6-31G和密度泛函理论B3LYP/6-31+G(d,p)方法,对乙基吡啶四氟硼酸盐([EPy][BF4])和乙基吡啶六氟磷酸盐([EPy][PF6])的离子对进行了结构优化和频率分析,并利用自洽反应场(SCRF)的导体极化连续模型(CPCM)考察了离子对液态下... 采用从头算HF/6-31G和密度泛函理论B3LYP/6-31+G(d,p)方法,对乙基吡啶四氟硼酸盐([EPy][BF4])和乙基吡啶六氟磷酸盐([EPy][PF6])的离子对进行了结构优化和频率分析,并利用自洽反应场(SCRF)的导体极化连续模型(CPCM)考察了离子对液态下的结构及相互作用,得到了两种离子对的红外光谱及气相、液相下最稳定结构.由两种离子对的几何参数可知,阴阳离子通过氢键相互作用,两种离子液体的红外光谱特征值与实验值比较吻合.应用自然键轨道(NBO)理论分析了吡啶阳离子及离子对中的原子电荷分布和电荷转移情况,结果表明两种离子对中阴阳离子间存在静电相互作用和氢键作用.通过几何参数、相互作用能及NBO分析研究发现,液相下由于周围电荷的中和作用,离子对中阴阳离子的相互作用明显降低. 展开更多
关键词 离子液体 密度泛函理论 自然键轨道 导体极化连续模型
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[EPy]Cl和[EPy]Br离子对的气相和液相结构及阴阳离子间的相互作用 被引量:7
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作者 王小露 万辉 管国锋 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第11期2077-2082,共6页
采用密度泛函理论B3LYP/6-31+G(d,p)方法对氯化乙基吡啶([EPy]Cl)、溴化乙基吡啶([EPy]Br)的离子对进行了结构优化和频率分析,并利用自洽反应场(SCRF)的导体极化连续模型(CPCM)考察了离子液体液相下的结构及相互作用.得到了两种离子液... 采用密度泛函理论B3LYP/6-31+G(d,p)方法对氯化乙基吡啶([EPy]Cl)、溴化乙基吡啶([EPy]Br)的离子对进行了结构优化和频率分析,并利用自洽反应场(SCRF)的导体极化连续模型(CPCM)考察了离子液体液相下的结构及相互作用.得到了两种离子液体的离子对在气相、液相下最稳定结构及气相红外光谱特征值,两种离子液体的离子对结构存在相似性,红外光谱特征值与文献值比较吻合.应用自然键轨道(NBO)理论分析了离子对中原子电荷分布及电荷转移情况,结果证明两种离子液体中阴阳离子间除了静电相互作用外还存在着氢键作用.通过对比气相及液相下的几何参数、相互作用能及NBO分析结果,发现液相下阴阳离子的相互作用明显降低.液相环境抵消了大部分阴阳离子间的静电作用,导致液相下阴阳离子间相互作用的减小. 展开更多
关键词 离子液体 密度泛函理论 自然键轨道 导体极化连续模型
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N,N-二(对氟苄基)-N′-(2′,3′-二脱氧-3′-硫代胞苷)甲脒水解反应的理论研究 被引量:5
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作者 张成华 薛英 +1 位作者 郭勇 鄢国森 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2008年第12期2354-2359,共6页
采用密度泛函理论方法B3LYP/6-31++G(d,p)//B3LYP/6-31G(d,p)和导体极化连续模型B3LYP/CPCM/6-31++G(d,p)方法对苯环对位上有F取代的N,N-二(对氟苄基)-N′-(2′,3′-二脱氧-3′-硫代胞苷)甲脒(FBFA-3TC)水解反应机理和溶剂效应进行了研... 采用密度泛函理论方法B3LYP/6-31++G(d,p)//B3LYP/6-31G(d,p)和导体极化连续模型B3LYP/CPCM/6-31++G(d,p)方法对苯环对位上有F取代的N,N-二(对氟苄基)-N′-(2′,3′-二脱氧-3′-硫代胞苷)甲脒(FBFA-3TC)水解反应机理和溶剂效应进行了研究.考虑两条可能反应途径:水分子首先进攻CN双键的途径(PathA)和先进攻C—N单键的途径(PathB).计算结果表明,气相和水中两条途径的第一步都是速率控制步骤,PathA比PathB更有利.对优势途径PathA的第二步反应的进一步研究发现,中间体的羟基H原子转移到双键N比单键N更容易,从而形成2′,3′-二脱氧-3′-硫代胞苷(3TC)的最终水解产物. 展开更多
关键词 N N-二(对氟苄基)-N′-(2′ 3′-二脱氧-3′-硫代胞苷)甲脒 水解 密度泛函理论 导体极化连续模型
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溶剂化效应对6-亚甲基环戊二烯酮与HCN的反应机理影响的理论研究 被引量:2
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作者 贾秀娟 潘秀梅 +4 位作者 王莉伟 刘颖 孙昊 苏忠民 王荣顺 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2008年第6期1224-1227,共4页
在B3LYP/6-311+G**计算水平上,采用导体极化连续模型研究了溶剂化效应对6-亚甲基环戊二烯酮与HCN反应生成主要产物b类酸的反应机理的影响.计算结果表明,在溶剂中的反应机理与在气相中的反应机理一致.溶剂化效应使反应路径中各驻点的自... 在B3LYP/6-311+G**计算水平上,采用导体极化连续模型研究了溶剂化效应对6-亚甲基环戊二烯酮与HCN反应生成主要产物b类酸的反应机理的影响.计算结果表明,在溶剂中的反应机理与在气相中的反应机理一致.溶剂化效应使反应路径中各驻点的自由能降低,稳定化了各物质.溶液中的活化自由能与气相相比也有所降低,反应更容易发生,其中CC进攻方式的活化自由能降低得更多. 展开更多
关键词 6-亚甲基环戊二烯酮 HCN 导体极化连续模型 溶剂化效应
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Hydrolysis Mechanism of the NAMI-A-type Antitumor Complex (HL)[trans-RuCl4L(dmso-S)] (L=1-methyl-l,2,4-triazole)
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作者 陈兰美 陈锦灿 +3 位作者 廖思燕 刘江琴 罗辉 郑康成 《Chinese Journal of Chemical Physics》 SCIE CAS CSCD 2011年第4期383-390,I0003,共9页
The hydrolysis process of Ru(III) complex (HL)[trans-RuC14L(dmso-S)] (L=l-methyl-l,2,4- triazole and dmso-S=S-dimethyl sulfoxide) (1), a potential antitumor complex similar to the well-known antitumor agent ... The hydrolysis process of Ru(III) complex (HL)[trans-RuC14L(dmso-S)] (L=l-methyl-l,2,4- triazole and dmso-S=S-dimethyl sulfoxide) (1), a potential antitumor complex similar to the well-known antitumor agent (Him)[trans-RuC14 (dmso-S)(im)] (NAMI-A, im=imidazole), was investigated using density functional theory combined with the conductor-like polarizable continuum model approach. Tile structural characteristics and the detailed energy profiles for the hydrolysis processes of this complex were obtained. For the first hydrolysis step, complex 1 has slightly higher barrier energies than the reported anticancer drug NAMI-A, and the result is in accordance with the experimental evidence indicating larger half-life for complex 1. For the second hydrolysis step, the formation of cis-diaqua species is thermodynamic preferred to that of trans isomers. In addition, on the basis of the analysis of electronic characteristics of species in the hydrolysis process, the trend in nucleophilic attack abilities of hydrolysis products by pertinent biomolecules is revealed and predicted. 展开更多
关键词 NAMI-A-type complex Anticancer activity HYDROLYSIS Density functional theory Conductor-like polarizable continuum model
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