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一种基于深度变分门神经网络的疾病小核糖核酸关联预测模型 被引量：1
1
作者 郭延哺 马欢 +1 位作者 李朝阳 周冬明 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2023年第5期1786-1794,共9页
小核糖核酸(miRNA)在基因表达和转录等过程中具有重要作用,与疾病的产生有着密切关联。对于疾病miRNA关联识别,生物鉴定方法代价高、耗时长和效率低。为快速自适应提取疾病和miRNA构成的异质网络信息,该文基于通道型注意力设计变分门图... 小核糖核酸(miRNA)在基因表达和转录等过程中具有重要作用,与疾病的产生有着密切关联。对于疾病miRNA关联识别,生物鉴定方法代价高、耗时长和效率低。为快速自适应提取疾病和miRNA构成的异质网络信息,该文基于通道型注意力设计变分门图自编码器和门多层感知器,构建一种深度变分门神经网络模型(VGAEN)并用于疾病miRNA关联预测任务。该模型整合miRNA及疾病的多种相似度信息得到miRNA和疾病的整合相似性特征,然后基于多数据融合的整合相似性网络和疾病miRNA邻接信息,利用变分门图自编码器提取miRNA和疾病网络的拓扑信息和语义信息;其次基于疾病miRNA关联矩阵,利用非负矩阵分解提取miRNA和疾病的低维线性去噪特征;最后,利用门多层感知器融合miRNA和疾病特征,预测其关联关系。实验结果表明VGAE-N模型能更有效地预测疾病miRNA关联,可为生物实验提供可靠的技术支撑。 展开更多
关键词 变分自编码器 矩阵分解 门机制 疾病小核糖核酸关联预测
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干扰性小核糖核酸靶向抑制趋化因子受体4基因表达对鼻咽癌细胞增殖和侵袭的影响 被引量：4
2
作者 鲁保才 卢振民 +6 位作者 张爱民 余文发 连荣 史海旭 李靖 王慧敏 袁东杰 《新乡医学院学报》 CAS 2018年第1期30-34,共5页
目的探讨干扰性小核糖核酸(siRNA)靶向抑制鼻咽癌细胞趋化因子受体4(CXCR4)基因表达对癌细胞增殖、侵袭的影响及机制。方法收集新乡医学院第一附属医院2014年1月至2016年12月保存的鼻咽癌及相应的癌旁组织标本各42例,采用实时荧光定量... 目的探讨干扰性小核糖核酸(siRNA)靶向抑制鼻咽癌细胞趋化因子受体4(CXCR4)基因表达对癌细胞增殖、侵袭的影响及机制。方法收集新乡医学院第一附属医院2014年1月至2016年12月保存的鼻咽癌及相应的癌旁组织标本各42例,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-PCR)和Western blot法分别检测鼻咽癌及相应的癌旁组织中CXCR4 mRNA及蛋白表达。将人鼻咽癌细胞系CNE-2Z分为空白对照组(细胞未做任何处理)、阴性对照组(细胞转染无义siRNA序列)和CXCR4转染组(细胞转染CXCR4的靶向siRNA序列),转染48 h后采用Western blot法检测各组细胞中CXCR4、基质金属蛋白酶(MMP)-2、MMP-9、β-连环蛋白(β-catenin)和细胞周期素D1(Cyclin D1)蛋白表达;应用细胞计数试剂盒和Transwell小室分别检测细胞的增殖和侵袭能力。结果鼻咽癌及相应的癌旁组织中CXCR4 mRNA表达分别为5.526±0.143、0.953±0.091,蛋白表达分别为0.522±0.047、0.053±0.011,鼻咽癌组织中CXCR4 mRNA及蛋白表达均显著高于癌旁组织(P<0.05)。CXCR4转染组细胞中CXCR4、MMP-2、MMP-9、β-catenin、Cyclin D1蛋白表达及细胞存活率、细胞侵袭数均显著低于空白对照组和阴性对照组(P<0.05),但空白对照组和阴性对照组细胞中CXCR4、MMP-2、MMP-9、β-catenin、Cyclin D1蛋白表达及细胞存活率、细胞侵袭数比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论抑制鼻咽癌CNE-2Z细胞中CXCR4基因表达可显著降低肿瘤细胞的增殖与侵袭能力,其机制可能与下调Wnt/β-catenin信号通路有关。 展开更多
关键词 鼻咽癌 趋化因子受体4基因 干扰性小核糖核酸 基质金属蛋白酶-2 基质金属蛋白酶-9 Β-连环蛋白 细胞周期素D1 WNT/Β-CATENIN信号通路
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小核糖核酸
3
作者 顾祖维 洪琪 《劳动医学》 北大核心 2004年第2期87-87,共1页
关键词 小核糖核酸 生物分子 遗传信息 脱氧核糖核酸
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小核糖核酸,引领生物学及医疗卫生领域的一场悄然变革——记南京大学生命科学院张辰宇研究团队
4
作者 李明明 《科学中国人》 2010年第7期104-107,共4页
一次科技创新,带来的很可能是科技的全新革命。 1953年4月25日,剑桥大学两位年轻的科学家——詹姆斯·沃森和弗朗西斯·克里克在国际顶尖期刊《自然》上发表了他们的重大发现：DNA是由两条核苷酸链组成的双螺旋结构，由此揭示... 一次科技创新,带来的很可能是科技的全新革命。 1953年4月25日,剑桥大学两位年轻的科学家——詹姆斯·沃森和弗朗西斯·克里克在国际顶尖期刊《自然》上发表了他们的重大发现：DNA是由两条核苷酸链组成的双螺旋结构，由此揭示了基因复制和遗传信息传递的奥秘，引发了一场蔚为壮观的生命科学和生物技术领域的重大革命。 展开更多
关键词 生命科学 医疗卫生领域 小核糖核酸 南京大学 科学院 生物学 生物技术领域 科技创新
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用小鼠作小核糖核酸的实验研究
5
作者 赵贵英 张树庸 《实验动物科学与管理》 2006年第1期64-64,共1页
关键词 小鼠 小核糖核酸
原文传递
小核糖核酸病毒感染与人兽共患病的关系 被引量：1
6
作者 张敏怡 由芳菲 陈清 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期922-930,共9页
小核糖核酸病毒作为重要的感染性病原体,其在基因突变和重组的驱动下表现出高度的遗传变异性,可感染从低等脊椎动物到哺乳动物等多种宿主,包括人类、非人灵长类动物、啮齿动物、蝙蝠、鸟类等。近年来,由新发病毒引起的人兽共患病受到公... 小核糖核酸病毒作为重要的感染性病原体,其在基因突变和重组的驱动下表现出高度的遗传变异性,可感染从低等脊椎动物到哺乳动物等多种宿主,包括人类、非人灵长类动物、啮齿动物、蝙蝠、鸟类等。近年来,由新发病毒引起的人兽共患病受到公共卫生领域的广泛关注。鉴于小核糖核酸病毒种类的高度多样性,许多新发现的病毒属于小核糖核酸病毒科(Picornaviridae)的家族成员。目前,与人类疾病相关的小核糖核酸病毒在人群中的流行情况及其遗传多样性特征已有一定的研究基础。本文围绕小核糖核酸病毒的分子生物学特征、分类学以及可能引起人兽共患病的病毒属等进行综述,为进一步开展小核糖核酸病毒感染的预防控制和科学研究提供借鉴。 展开更多
关键词 小核糖核酸病毒 人兽共患病 感染
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基于诱导多能干细胞的Alport综合征差异性表达小核糖核酸的生物信息学分析
7
作者 陈文标 黄建溶 +2 位作者 彭武建 林小聪 戴勇 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期625-630,共6页
目的寻找Alport综合征患者(AS)与健康对照者(NC)差异性表达小核糖核酸(micro RNAs)。分析差异性表达micro RNAs的生物信息学特点。方法收集AS与NC组的尿液,从尿液中分离尿肾脏管细胞,将尿肾脏管细胞诱导分化成多能干细胞(i PSCs)。运用... 目的寻找Alport综合征患者(AS)与健康对照者(NC)差异性表达小核糖核酸(micro RNAs)。分析差异性表达micro RNAs的生物信息学特点。方法收集AS与NC组的尿液,从尿液中分离尿肾脏管细胞,将尿肾脏管细胞诱导分化成多能干细胞(i PSCs)。运用高通量测序找出2组之间差异性表达的micro RNAs,用于预测特异性靶基因。靶基因可进行gene ontology(GO)富集与Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)通路信号分析。确定差异性表达的micro RNAs靶基因的主要富集位点与通路信号条目。结果在2组样本中发现30个micro RNAs具有差异性表达,包括19个上调与11个下调。差异性表达micro RNAs靶基因GO富集主要聚集在细胞分子、细胞组成与细胞生物学过程。嘌呤代谢通路与丝裂原激活的蛋白激酶是主要的KEGG信号传导通路。结论差异性表达micro RNAs靶基因的生物信息学可能在AS发病机制中起重要作用,可作为潜在靶点用于AS病因的深入研究。 展开更多
关键词 ALPORT综合征 小核糖核酸 GO富集 KEGG通路
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小核糖核酸病毒科病毒细胞受体研究进展 被引量：2
8
作者 王兴陇 冯若飞 《西北民族大学学报（自然科学版）》 2018年第1期26-32,共7页
小核糖核酸病毒是重要的人畜共患病原体,它会导致人和动物出现亚临床感染或从轻度发热到心脏、肝脏和中枢神经系统的严重疾病.近年来,该科病毒的感染机制、受体等逐渐成为学术界研究的热点.文章针对小核糖核酸病毒的分类、病毒受体的研... 小核糖核酸病毒是重要的人畜共患病原体,它会导致人和动物出现亚临床感染或从轻度发热到心脏、肝脏和中枢神经系统的严重疾病.近年来,该科病毒的感染机制、受体等逐渐成为学术界研究的热点.文章针对小核糖核酸病毒的分类、病毒受体的研究方法及研究现状作以综述,为今后相关研究提供理论依据. 展开更多
关键词 小核糖核酸病毒科 病毒受体 研究方法
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小核糖核酸分子可调控肿瘤血管新生
9
《微循环学杂志》 2018年第1期70-70,共1页
国际学术期刊《致癌基因》最新发表了中国科学院昆明动物研究所肿瘤生物学学科组陈策实课题组的成果，他们在小核糖核酸分子调控乳腺癌血管新生功能及机制的研究中取得了重要进展。据陈策实研究员介绍，实体瘤生长，需依赖于血液提供充... 国际学术期刊《致癌基因》最新发表了中国科学院昆明动物研究所肿瘤生物学学科组陈策实课题组的成果，他们在小核糖核酸分子调控乳腺癌血管新生功能及机制的研究中取得了重要进展。据陈策实研究员介绍，实体瘤生长，需依赖于血液提供充足的营养和氧气。因此，只要将肿瘤的发展阻断在血管新生阶段，就能有效抑制实体瘤的生长、侵袭和转移。编号为ｍｉＲ１５３的分子，是一个古老且进化保守的小核糖核酸分子，在多种类型的肿瘤中，它扮演着肿瘤抑制因子的角色。此前，研究人员已发现米非司酮可以诱导ｍｉＲ１５３，抑制转录因子表达，从而抑制乳腺癌干细胞，但人们对ｍｉＲ１５３在肿瘤中表达调控机制，以及这个小核糖核酸分子在调控肿瘤细胞活性中的功能、机制尚未完全清楚。最新的研究发现，这个小核糖核酸分子通过靶向作用于癌基因，抑制缺氧条件对乳腺癌细胞中缺氧诱导因子信号通路的激活，从而阻断肿瘤的血管新生，抑制裸鼠移植瘤的生长。研究人员还进一步探讨了小核糖核酸分子的表达调控机制，并发现缺氧会触发细胞内的内质网应激反应机制。在证明小核糖核酸分子抑制乳腺癌干细胞的前期基础上，这项研究结果清楚表明，ｍｉＲ１５３的确是一个强抑癌基因，可通过抑制血管新生，来抑制乳腺癌。这种小核糖核酸分子将来或可用于乳腺癌的基因治疗。 展开更多
关键词 肿瘤血管新生 小核糖核酸 核酸分子 分子调控 乳腺癌干细胞 缺氧诱导因子 昆明动物研究所 肿瘤抑制因子
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乳制品微小核糖核酸：三聚氰胺悲剧的“终结者”？
10
《河南畜牧兽医（市场版）》 2010年第7期4-4,共1页
近日，南京大学科研小组宣布，他们在牛乳中也发现了微小核糖核酸（microRNA）。此项发现将有助于生产有针对性的牛奶产品。更为重要的是．如果建立以microRNA为基础的奶制品监测办法．将根绝三聚氰胺导致的“毒奶粉”悲剧。
关键词 小核糖核酸 三聚氰胺 悲剧 乳制品 microRNA 南京大学 奶产品 奶制品
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缺乏两种小核糖核酸会导致不孕
11
作者 蓝建中 《健康向导》 2013年第4期31-31,共1页
当今社会不孕症的发病率有明显上升趋势,而无法顺利排卵是导致不孕症的重要原因之一。日本的一个研究小组在动物实验中发现,如果缺乏两种特定的小核糖核酸（miRNA）,会引发排卵障碍。
关键词 小核糖核酸 不孕症 排卵障碍 动物实验 发病率
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乳品中微小核糖核酸科研成果公布
12
作者 伟民 《农产品加工》 2010年第7期43-43,共1页
6月17日，一项关于牛奶中微小核糖核酸（microRNA）的最新研究成果宣布问世。该成果由南京大学研究小组、泰州国家医药高新技术产业开发区、伊利集团共同研发。业内专家指出此项成果可作为未来检测牛奶品质的标准之一。
关键词 小核糖核酸 科研成果 高新技术产业开发区 乳品 牛奶品质 研究成果 南京大学 伊利集团
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微小核糖核酸
13
作者 Ina Dahlsveen 《经济导报（医药技术）》 2006年第4期66-69,共4页
最近几年中，微小核糖核酸和基因转录后调节领域出现了飞快的发展。微小核糖核酸．或缩写为miRNA，是小的．调节性核糖核酸，它与小的干扰核糖核酸（SiRNA）类似．但它是体内天然表达的。
关键词 小核糖核酸 干扰核糖核酸 转录后调节 MIRNA 调节性
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2002年十大科技突破冠军:小核糖核酸的研究成果
14
《中国科技信息》 2003年第1期39-39,共1页
多项研究表明,一些长度较短的核糖核酸、即所谓"小核糖核酸",能够对细胞和基因的很多行为进行控制,比如打开和关闭多种基因,删除一些不需要的DNA片段等.它们在细胞分裂过程中也能发挥重要的控制作用,可指导染色体中的物质形... 多项研究表明,一些长度较短的核糖核酸、即所谓"小核糖核酸",能够对细胞和基因的很多行为进行控制,比如打开和关闭多种基因,删除一些不需要的DNA片段等.它们在细胞分裂过程中也能发挥重要的控制作用,可指导染色体中的物质形成正确的结构.这些发现有望为科学家提供操作干细胞的新工具,以及用于研制治疗癌症等由基因组错误所导致的疾病的新方法. 展开更多
关键词 2002年 小核糖核酸 太阳中微子 科技研究成果 基因组学
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人类基因组多样性(HGD)与人类基因组多样性计划(HGDP)(2) 小核糖核酸(miero-RNA)和RNA干扰(RNAi)
15
《现代临床医学生物工程学杂志》 2003年第1期73-74,共2页
micro -RNA和RNAi被美国Science《科学》杂志和英国Nature《自然》杂志评为 2 0 0 2年度重要的科技成果的首位 ,是RNA研究的突破性进展 .是生物医学领域近 2 0年来与HGP相提并论的最重大成果之一 .micro -RNA和RNAi主要特点是调节和关... micro -RNA和RNAi被美国Science《科学》杂志和英国Nature《自然》杂志评为 2 0 0 2年度重要的科技成果的首位 ,是RNA研究的突破性进展 .是生物医学领域近 2 0年来与HGP相提并论的最重大成果之一 .micro -RNA和RNAi主要特点是调节和关闭基因的表达 ,删除一些不需要的基因 .继而调控细胞的各种高级生命活动 .在细胞分裂过程中也能发挥重要的控制作用 ,引导染色体中的物质形成正确的结构 ,推动基因组结构与功能的研究 ,为研制治疗癌症等由基因错误所致疾病提供新方法、新药物 . 展开更多
关键词 小核糖核酸 miero-RNA RNA干扰 干扰性核糖核酸
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小核糖核酸病毒用作重组活疫苗载体
16
作者 GirardM 魏云林 《国外医学（预防．诊断．治疗用生物制品分册）》 1996年第2期55-58,共4页
以脊髓灰质炎病毒为代表的小核糖核酸类病毒,是当前发展重组活疫苗的一组重要载体。由于其遗传背景清楚,操作方便且高效和多价性,一直为世人所关注。目前此类载体已从最早的适应嵌合病毒技术开始发展到了今天能适应杂交病毒复制子、杂... 以脊髓灰质炎病毒为代表的小核糖核酸类病毒,是当前发展重组活疫苗的一组重要载体。由于其遗传背景清楚,操作方便且高效和多价性,一直为世人所关注。目前此类载体已从最早的适应嵌合病毒技术开始发展到了今天能适应杂交病毒复制子、杂交病毒等新技术,并且逐步从实验阶段走向了实用阶段。可以相信,随着这些技术的不断完善和发展,小核糖核酸类病毒必将为人类提供新一代的活疫苗载体。 展开更多
关键词 小核糖核酸病毒 活疫苗 疫苗载体 脊髓灰质炎
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小核糖核酸调控蚊虫代谢解毒酶基因表达的研究进展
17
作者 武佳慧 宋晓 +1 位作者 彭荟 公茂庆 《中国热带医学》 CAS 2023年第7期766-772,共7页
随着分子生物学的发展,研究发现非编码小核糖核酸(small ribonucleic acid, sRNA)在基因表达及蛋白质活性方面具有重要的调控作用,影响着包括蚊虫对杀虫剂抗药性在内的多种生物学途径。了解抗药性的分子调控机制对控制蚊虫至关重要。其... 随着分子生物学的发展,研究发现非编码小核糖核酸(small ribonucleic acid, sRNA)在基因表达及蛋白质活性方面具有重要的调控作用,影响着包括蚊虫对杀虫剂抗药性在内的多种生物学途径。了解抗药性的分子调控机制对控制蚊虫至关重要。其中代谢抗性是最关键的机制,主要指蚊虫体内的代谢解毒酶(特别是细胞色素P450酶系)相关基因的高表达。在已验证抗药性基因的基础上进一步研究sRNA与其之间的联系,为进一步阐明蚊虫抗药性发生机制提供了新的思路和方向。蚊虫代谢抗性机制的研究对病媒蚊虫治理、抗药性监测及新型杀虫剂研发意义重大。本文就抗药性基因、sRNA的生物合成、参与调控蚊虫代谢解毒酶基因及实际应用的研究进展予以综述。 展开更多
关键词 小核糖核酸 微小核糖核酸 小干扰核糖核酸 与piwi蛋白相作用的核糖核酸 蚊虫 抗药性
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微小核糖核酸在胃癌中的研究进展 被引量：2
18
作者 潘洁 杜颖 《中华消化杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期718-720,共3页
微小核糖核酸（miRNA）是一类保守、短序列、非编码的单链RNA。miRNA在转录后水平负调控mRNA表达，通过调节多种信号分子调控多种生物学过程，例如应激、凋亡、增殖、代谢、个体发育和细胞分化等。近年来提出了原癌miRNA组学这一概念，... 微小核糖核酸（miRNA）是一类保守、短序列、非编码的单链RNA。miRNA在转录后水平负调控mRNA表达，通过调节多种信号分子调控多种生物学过程，例如应激、凋亡、增殖、代谢、个体发育和细胞分化等。近年来提出了原癌miRNA组学这一概念，成为了关注热点。 展开更多
关键词 小核糖核酸 MRNA表达 miRNA 胃癌 生物学过程 分子调控 细胞分化 个体发育
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德国研究人员发现1种小核糖核酸与Ⅱ型糖尿病有关
19
《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第2期148-148,共1页
新华网伦敦2月6日报道：英国最新一期《自然》杂志刊登报告,研究人员发现了1种小核糖核酸与胰岛素耐受性相关,该发现可为开发Ⅱ型糖尿病新疗法提供思路。
关键词 Ⅱ型糖尿病 小核糖核酸 研究人员 德国 《自然》杂志 新华网 耐受性 胰岛素
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《自然》：一种小核糖核酸与Ⅱ型糖尿病有关
20
《现代生物医学进展》 CAS 2013年第14期I0002-I0002,共1页
德国马克斯·普朗克研究所的研究人员报告说，他们通过动物实验发现，一种名为”miR-802”的小核糖核酸分子在成年实验鼠体内的过度表达会使胰岛素敏感性受损，产生葡萄糖耐受不良，从而与过度肥胖和糖尿病等病症相关。
关键词 Ⅱ型糖尿病 小核糖核酸 《自然》 胰岛素敏感性 过度表达 研究人员 实验发现 核酸分子
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