通过分析岷江柏的迁地保护居群和野生居群的遗传多样性、遗传结构及居群间基因流,判断迁地保护岷江柏居群的遗传多样性水平,为其迁地保护提供理论基础。本研究利用GBS(Genotyping-by-Sequencing)测序技术获得的SNP位点对四川大渡河双江...通过分析岷江柏的迁地保护居群和野生居群的遗传多样性、遗传结构及居群间基因流,判断迁地保护岷江柏居群的遗传多样性水平,为其迁地保护提供理论基础。本研究利用GBS(Genotyping-by-Sequencing)测序技术获得的SNP位点对四川大渡河双江口岷江柏迁地保护移栽苗、苗圃播种苗及3个野生居群进行主成分分析(PCA分析)、聚类分析、分子进化树、遗传多样性和遗传结构分析。经过GBS测序共获得高质量Clean Data 118321514728 bp,并开发了1947047个tags,从中鉴定到了1259610个SNP位点。系统发育进化树显示大部分移栽岷江柏居群和野生岷江柏聚在一起,居群结构分析结果显示交叉验证错误率的谷值确定最优分群数为1。4个岷江柏居群的观测杂合度(H_(o))、期望杂合度(H_(e))、Shannon信息指数I(S_(hi))、近交系数(F_(is))、多态信息含量(P_(ic))的值分别为0.1815~0.2720、0.2232~0.3003、0.3310~0.4649、0.1780~0.2465和0.2722~0.3092,说明岷江柏居群的遗传多样性水平较高。移栽岷江柏居群的H_(e)=0.3003,S_(hi)=0.4649,岷江柏居群迁地保护居群遗传多样性总体水平略高于野生居群。野生岷江柏居群中白湾隧道(BW)_vs_松岗镇(SA)的遗传分化指数(F_(st))较大,基因流(N_(m))较小(F_(st)=0.091,N_(m)=2.496),而迁地保护的岷江柏居群与野生岷江柏居群没有明显的遗传分化,居群间的基因交流频繁(F_(st)<0.05,基因流N_(m)>4),说明没有明显的分群现象,岷江柏居群迁地保护居群遗传多样性较高。因此,移栽濒危植物是迁地保护过程中较好的方法,本文为以后野生岷江柏迁地保护提供参考,为其他树木种质资源的保存提供理论依据。展开更多
文摘通过分析岷江柏的迁地保护居群和野生居群的遗传多样性、遗传结构及居群间基因流,判断迁地保护岷江柏居群的遗传多样性水平,为其迁地保护提供理论基础。本研究利用GBS(Genotyping-by-Sequencing)测序技术获得的SNP位点对四川大渡河双江口岷江柏迁地保护移栽苗、苗圃播种苗及3个野生居群进行主成分分析(PCA分析)、聚类分析、分子进化树、遗传多样性和遗传结构分析。经过GBS测序共获得高质量Clean Data 118321514728 bp,并开发了1947047个tags,从中鉴定到了1259610个SNP位点。系统发育进化树显示大部分移栽岷江柏居群和野生岷江柏聚在一起,居群结构分析结果显示交叉验证错误率的谷值确定最优分群数为1。4个岷江柏居群的观测杂合度(H_(o))、期望杂合度(H_(e))、Shannon信息指数I(S_(hi))、近交系数(F_(is))、多态信息含量(P_(ic))的值分别为0.1815~0.2720、0.2232~0.3003、0.3310~0.4649、0.1780~0.2465和0.2722~0.3092,说明岷江柏居群的遗传多样性水平较高。移栽岷江柏居群的H_(e)=0.3003,S_(hi)=0.4649,岷江柏居群迁地保护居群遗传多样性总体水平略高于野生居群。野生岷江柏居群中白湾隧道(BW)_vs_松岗镇(SA)的遗传分化指数(F_(st))较大,基因流(N_(m))较小(F_(st)=0.091,N_(m)=2.496),而迁地保护的岷江柏居群与野生岷江柏居群没有明显的遗传分化,居群间的基因交流频繁(F_(st)<0.05,基因流N_(m)>4),说明没有明显的分群现象,岷江柏居群迁地保护居群遗传多样性较高。因此,移栽濒危植物是迁地保护过程中较好的方法,本文为以后野生岷江柏迁地保护提供参考,为其他树木种质资源的保存提供理论依据。
