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L-精氨酸调节胃癌细胞中凋亡基因的差异性表达
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《肿瘤代谢与营养电子杂志》 2023年第2期261-261,共1页
近日,Precision Nutrition发表了文章“L-arginine regulates the differential expression of apoptosis genes in gastric cancer cells”。该研究旨在发现L-精氨酸如何诱导胃癌的细胞死亡。作者用CKK8和流式细胞仪检测在补充有L-精... 近日,Precision Nutrition发表了文章“L-arginine regulates the differential expression of apoptosis genes in gastric cancer cells”。该研究旨在发现L-精氨酸如何诱导胃癌的细胞死亡。作者用CKK8和流式细胞仪检测在补充有L-精氨酸的RPMI-1640培养基中培养的SGC-7901细胞的细胞毒性和凋亡率。高通量RNA测序寻找差异表达的基因。京都基因和基因组百科全书和GO基因本体论被用来分析包括DEG的生物过程和路径。结果显示在SGC-7901细胞中,L-精氨酸以剂量和时间依赖的方式降低了细胞的活力。 展开更多
关键词 差异性表达 流式细胞仪检测 凋亡基因 胃癌细胞 细胞毒性 细胞死亡
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T-bet突变介导的淋巴细胞差异性表达在结核分枝杆菌感染中的研究进展
2
作者 李若男 曾萍 张静 《巴楚医学》 2023年第1期17-21,共5页
T-bet作为CD4+T细胞最重要的转录因子,在结核分枝杆菌(MTB)增殖中起到重要作用。T-bet/GATA-3参与调控辅助性T1细胞(Th1)/Th2细胞的平衡,其中T-bet可促进CD4+T细胞向Th1细胞定向分化,进而分泌γ干扰素(IFN-γ)和肿瘤坏死因子(TNF-α)等... T-bet作为CD4+T细胞最重要的转录因子,在结核分枝杆菌(MTB)增殖中起到重要作用。T-bet/GATA-3参与调控辅助性T1细胞(Th1)/Th2细胞的平衡,其中T-bet可促进CD4+T细胞向Th1细胞定向分化,进而分泌γ干扰素(IFN-γ)和肿瘤坏死因子(TNF-α)等细胞因子,激活巨噬细胞直接清除MTB。T-bet突变会影响IFN-γ表达,不利于MTB的清除。最新研究结果发现,T-bet缺陷可抑制多种淋巴细胞亚型表达及其分泌的IFN-γ水平,但CD8+T细胞和非经典CD4+Th1*淋巴细胞表达不受影响。本文基于T-bet突变介导的淋巴细胞差异性表达,分析其在MTB感染中的研究进展。 展开更多
关键词 T-bet缺陷 淋巴细胞 结核分枝杆菌 差异性表达
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水稻与白叶枯病菌互作的基因表达谱分析与差异性表达基因的识别 被引量:20
3
作者 吴茂森 田峰 +1 位作者 齐放军 何晨阳 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期277-282,共6页
【目的】从基因组水平上阐明水稻在与白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)感病互作条件下基因表达反应的特征。【方法】用cDNA-AFLP方法对Xoo接种处理不同时间的水稻细胞进行基因表达谱分析。【结果】在测定的大约4 000个水稻... 【目的】从基因组水平上阐明水稻在与白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)感病互作条件下基因表达反应的特征。【方法】用cDNA-AFLP方法对Xoo接种处理不同时间的水稻细胞进行基因表达谱分析。【结果】在测定的大约4 000个水稻cDNA片段中,363个(9.1%)是差异性表达的,其中295个受Xoo诱导上调表达,68个被抑制下调表达。根据在不同互作时间点的表达特征,它们可分为7种表达类型。对31个差异片段的序列同源性进行分析,发现它们在己公布的水稻全基因组中完全相同的序列,但只有10个基因具有已知或推断的生物学功能,其余21个基因功能未知。用荧光实时定量PCR分析法证实了cDNA-AFLP基因表达结果。【结论】构建了水稻-Xoo感病组合在细胞水平上互作的基因表达谱,从基因组水平上识别了一批受Xoo诱导或抑制表达、与水稻感病反应相关的基因,这些新基因的发现为开展水稻感病功能基因组学的研究提供了材料。 展开更多
关键词 水稻 白叶枯病菌 CDNA-AFLP 表达 差异性表达基因
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PKC-α和PKC-δ在不同发育阶段小鼠睾丸中的差异性表达 被引量:5
4
作者 冯晨 付伟 +3 位作者 赵咏梅 陈菲 宗志宏 于秉治 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期780-782,共3页
Protein kinase C (PKC) is a family of serine/threonine protein kinases, and its multiple isoforms are expressed in various mammalian tissues. The expressions of PKC α and PKC δ at protein and mRNA level in mouse tes... Protein kinase C (PKC) is a family of serine/threonine protein kinases, and its multiple isoforms are expressed in various mammalian tissues. The expressions of PKC α and PKC δ at protein and mRNA level in mouse testis were identified by Western blotting and RT\|PCR. The expression of both PKC isoenzymes in the developing mouse testis was also examined. In testes of mouse at various developmental stages, both the protein and the mRNA of PKC\|α were uniformity; but the PKC\|δ expression occurred in the testes of 3\|week old, perhaps even relatively late in spermatid development. The results suggest that each isoenzyme may have different roles in processing and modulating physiological cellular responses of spermatogenesis. 展开更多
关键词 PKC-Α PKC-δ 发育阶段 小鼠睾丸 差异性表达
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异质生境条件下扎龙湿地羊草过氧化物同工酶的差异性表达 被引量:5
5
作者 焦德志 丁雪梅 +3 位作者 金雄华 郭万里 韩大勇 杨允菲 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期485-489,共5页
为了探讨异质生境条件对羊草(Leymus chinensis)过氧化物同工酶表达的影响,揭示羊草种群对不同土壤生境的响应机制,并为植物的趋异适应和生态可塑性研究提供依据,对扎龙自然保护区内的3种不同生境沙土、碱土、草甸土中生长的3种羊草过... 为了探讨异质生境条件对羊草(Leymus chinensis)过氧化物同工酶表达的影响,揭示羊草种群对不同土壤生境的响应机制,并为植物的趋异适应和生态可塑性研究提供依据,对扎龙自然保护区内的3种不同生境沙土、碱土、草甸土中生长的3种羊草过氧化物同工酶进行了研究。结果表明:碱土生境条件下羊草条带数最多,草甸土羊草条带数最少;在同一生境条件下,羊草根系的过氧化物酶的条带数最多,叶的条带数最少。其中,迁移率(Rf)值为0.08、0.10、0.17的条带是主带,在7个样品中出现;Rf值为0.35、0.73的条带是弱带,只在1-2个样品中出现;叶片的Shannon-Weinner指数在3个生境间变化较大,根茎的变化较小。因此,异质生境导致了扎龙自然保护区内的羊草过氧化物同工酶的表达存在差异。 展开更多
关键词 羊草 过氧化物同工酶 异质生境 差异性表达
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基因差异性表达与衰老 被引量:6
6
作者 杨东丽 张宗玉 童坦君 《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 1997年第2期142-144,共3页
微细胞融合实验表明:人的第1、4、6、7号染色体以及X染色体上存在衰老基因;基因差异性表达研究方法显示:衰老细胞具有特异性表达或高表达的基因。提示细胞衰老是个主动过程,可能与包括衰老基因在内的一系列基因激活有关。
关键词 基因表达 基因差异性表达 衰老
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急性力竭运动后大鼠骨骼肌蛋白质组差异性表达的研究 被引量:12
7
作者 张松江 史绍蓉 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期266-270,285,共6页
目的:应用双向凝胶电泳技术(2-DE),分析探讨急性大强度力竭运动后大鼠骨骼肌组织蛋白质组的表达变化及其意义。方法:10只雄性SD大鼠按体重配对随机分为安静组(5只)和运动组(5只)。运动组大鼠按Bedford模型运动至力竭。力竭后3小时处死大... 目的:应用双向凝胶电泳技术(2-DE),分析探讨急性大强度力竭运动后大鼠骨骼肌组织蛋白质组的表达变化及其意义。方法:10只雄性SD大鼠按体重配对随机分为安静组(5只)和运动组(5只)。运动组大鼠按Bedford模型运动至力竭。力竭后3小时处死大鼠,取其后肢腓肠肌全蛋白质进行SDS-固相pH梯度聚丙烯酰胺双向凝胶电泳,运用Bio-radPDquest图像分析软件对2-DE图谱进行分析。结果:安静组显示667±35个蛋白质点,运动组显示572±28个蛋白质点,蛋白质点的匹配率为75%;运动后消失88个蛋白质点,新增32个蛋白质点;运动后蛋白质量上调2倍以上的蛋白质点有12个,蛋白质量下调至1/2以下的蛋白质点有10个,共有282个蛋白质点表达有差异。结论:大鼠大强度力竭运动后3小时,腓肠肌蛋白质发生了明显的质和量的变化。 展开更多
关键词 运动性力竭 蛋白质组学 差异性表达 双向凝胶电泳 SD大鼠
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盐胁迫诱导的大麦基因差异性表达 被引量:6
8
作者 仪慧兰 梁爱华 陈芳 《植物生理学通讯》 CSCD 北大核心 2002年第5期440-442,共3页
大麦幼苗经 0 .2 0mol·L- 1 的NaCl溶液胁迫后 ,从幼根中提取细胞总RNA ,选择OligodT1 2 CA为锚定引物 ,反转录合成cDNA第一链 ,并以此为模板 ,用随机引物进行PCR扩增 ,琼脂糖电泳分离扩增产物 ,得到 5个在胁迫组中特异性表达而未... 大麦幼苗经 0 .2 0mol·L- 1 的NaCl溶液胁迫后 ,从幼根中提取细胞总RNA ,选择OligodT1 2 CA为锚定引物 ,反转录合成cDNA第一链 ,并以此为模板 ,用随机引物进行PCR扩增 ,琼脂糖电泳分离扩增产物 ,得到 5个在胁迫组中特异性表达而未经盐胁迫组中不表达的片段。 展开更多
关键词 盐胁迫 大麦 基因差异性表达 耐盐性
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SIRT1基因在绵羊不同组织器官中的差异性表达研究 被引量:3
9
作者 潘洋洋 景炅婕 +5 位作者 乔利英 贾夏丽 张静 张方 胡子乔 刘文忠 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 2015年第2期113-118,共6页
SIRT1(silent mating type information regulation 2homolog1)是一种具有NAD+依赖性去乙酰化酶活性的转录调节因子,参与能量代谢的调节。利用实时荧光定量PCR技术,对10月龄山西肉用绵羊母本品系去势公羊内脏(肝、肾、脾、肺、心)、肌肉... SIRT1(silent mating type information regulation 2homolog1)是一种具有NAD+依赖性去乙酰化酶活性的转录调节因子,参与能量代谢的调节。利用实时荧光定量PCR技术,对10月龄山西肉用绵羊母本品系去势公羊内脏(肝、肾、脾、肺、心)、肌肉(背最长肌)和脂肪(大网膜、小网膜、肠系膜、腹膜后、皮下)等11种器官或组织中SIRT1基因mRNA的表达量进行检测,以探讨SIRT1基因的差异性表达规律。结果表明,绵羊SIRT1基因在所检测的器官或组织中均有表达,且差异极显著(P<0.001)。主要表现在脾脏、肝脏和肾脏中的表达显著高于心脏和肺脏中的表达;深层脂肪组织中的表达高于浅层的皮下脂肪;在背最长肌中也有较高表达。这些差异与绵羊SIRT1基因调节脂质代谢及糖异生有关。有关结果为研究SIRT1基因的功能奠定了科学依据。 展开更多
关键词 绵羊 SIRT1 实时定量PCR 差异性表达 组织器官
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应用抑制性消减杂交技术克隆人肺鳞癌差异性表达基因 被引量:1
10
作者 沈晨阳 刘军 +4 位作者 王丹蕾 赵辉 姜冠潮 王俊 张国良 《中国肺癌杂志》 CAS 2002年第1期10-13,共4页
目的 克隆人肺鳞癌肿瘤差异性表达基因。方法 应用抑制性消减杂交技术 (suppressionsub tractivehybridization,SSH)构建人肺鳞癌cDNA消减杂交文库 ,筛选后挑选阳性克隆进行测序 ,并在GenBank数据库中进行同源性比较 ,最后经RT PCR验... 目的 克隆人肺鳞癌肿瘤差异性表达基因。方法 应用抑制性消减杂交技术 (suppressionsub tractivehybridization,SSH)构建人肺鳞癌cDNA消减杂交文库 ,筛选后挑选阳性克隆进行测序 ,并在GenBank数据库中进行同源性比较 ,最后经RT PCR验证。结果 成功克隆 1 0个差异基因片段 ,其中 2个为新基因 (Gen Bank登录号分别为 :C2 0 :AF3630 68;C34 :AY0 32 661 )。 展开更多
关键词 差异性表达基因 抑制性消减杂交技术 肺癌状细胞癌 基因克隆 肺肿瘤 互补DNA
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周期素D1、E、A在乳腺疾病中的差异性表达 被引量:1
11
作者 马莉 尹海林 +3 位作者 杨文 杨光武 吕青 刘学旭 《华西医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期497-500,共4页
目的 探讨周期素 D1、E、A在各类乳腺疾病中表达的差别及其在肿瘤发生发展中的意义。方法 用免疫组化的方法检测人类各类乳腺疾病组织中周期素 D1、E、A的表达。结果 三种周期素的表达强度皆为恶性肿瘤高于良性肿瘤 ,高于增生性疾病 ... 目的 探讨周期素 D1、E、A在各类乳腺疾病中表达的差别及其在肿瘤发生发展中的意义。方法 用免疫组化的方法检测人类各类乳腺疾病组织中周期素 D1、E、A的表达。结果 三种周期素的表达强度皆为恶性肿瘤高于良性肿瘤 ,高于增生性疾病 ,差异极为显著 (P<0 .0 0 1)。表达阳性率在恶性肿瘤与良性肿瘤及增生性疾病之间 ,也存在显著差异 (P<0 .0 0 5 )。而恶性肿瘤中 ,在浸润性导管癌和浸润性小叶癌之间周期素 E和 A的表达阳性率也存在显著差异 (P<0 .0 0 5 )。结论 周期素 D1、E、A的过度表达与乳腺肿瘤的发生和恶性转化密切相关 ,它们的表达强度可以作为评价乳腺肿瘤恶性程度的一个分子生物学指标。而浸润性导管癌和浸润性小叶之间周期素 E和 A表达阳性率存在的差异 ,说明不同组织类型的乳腺恶性肿瘤发病机制有所不同。 展开更多
关键词 周期素 乳腺肿瘤 过度表达 差异性表达 发病机制
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抗结核药物肝损伤与无肝损伤患者化疗前血循环miRNA分子的差异性表达 被引量:1
12
作者 叶长根 孙水林 +7 位作者 白茹 朱伟星 陈彩萍 谢平 赵晖 涂文娟 高得勇 刘亮明 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2014年第3期415-422,共8页
目的:研究抗结核药物肝毒性(anti-tuberculosis drug-induced hepatotoxicity,ATDH)与非ATDH患者化疗前血浆差异性表达的miRNA分子,为ATDH易感者筛检提供新的生物学指标.方法:采用miRNA芯片检测ATDH及对照患者化疗前血浆标本.对存在差... 目的:研究抗结核药物肝毒性(anti-tuberculosis drug-induced hepatotoxicity,ATDH)与非ATDH患者化疗前血浆差异性表达的miRNA分子,为ATDH易感者筛检提供新的生物学指标.方法:采用miRNA芯片检测ATDH及对照患者化疗前血浆标本.对存在差异表达趋势的25种miRNA分子,采用高通量实时荧光定量PCR进行分析验证.应用互联网上miRNA靶基因预测软件对表达上调的miRNA进行靶基因预测,并采用PANTHER tool查找靶蛋白GO功能分类.结果:与对照组相比,ATDH患者化疗前血浆中共检出7个差异性表达的miRNA分子,其中表达上调的miRNA有4个,包括miR-4284、miR-3620、miR-652-5p和miR-4800-5p;表达下调的miRNA有3个,包括miR-338-3p、miR-424-5p和miR-194-5p.结论:ATDH患者化疗前血浆内存在差异性表达的miRNA分子,其中表达上调的miRNA分子(特别是miR-4284)可能作为ATDH易感者筛检的生物学指标. 展开更多
关键词 抗结核药物 肝毒性 microRNA 血浆 差异性表达
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L-型钙通道α1亚单位在成年鼠海马神经元上的差异性表达 被引量:1
13
作者 杨建明 胡德辉 +1 位作者 朱心红 高天明 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2005年第10期1225-1227,共3页
目的观察L-型钙通道不同的α1亚单位在成年鼠海马不同亚区神经元中表达的变化。方法运用免疫组织化学染色方法特异性地标记脑型L-型L-型钙通道不同的α1亚单位CaV1.2α1C和CaV1.3α1D。结果CaV1.2α1C主要分布在CA1区锥体细胞突起部分及... 目的观察L-型钙通道不同的α1亚单位在成年鼠海马不同亚区神经元中表达的变化。方法运用免疫组织化学染色方法特异性地标记脑型L-型L-型钙通道不同的α1亚单位CaV1.2α1C和CaV1.3α1D。结果CaV1.2α1C主要分布在CA1区锥体细胞突起部分及CA3区锥体细胞的胞体区、基树突和远端顶树突;CaV1.3α1D则主要集中分布在海马各亚区的胞体区和近端突起;此外,CaV1.2α1C和CaV1.3α1D在细胞局部的分布特性上亦明显不同,前者主要呈现簇状分布,而后者则呈均匀分布。结论L-型钙通道CaV1.2α1C和CaV1.3α1D亚单位在成年鼠海马不同亚区神经元中呈现差异性表达。 展开更多
关键词 海马 神经元 L-型钙通道亚单位 差异性表达 免疫组织化学
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UCP2基因在小尾寒羊内脏中的差异性表达研究 被引量:1
14
作者 赵武恒 乔利英 刘文忠 《畜牧与饲料科学》 2014年第7期50-52,57,共4页
解偶联蛋白2(UCP2)是一种具有解偶联功能的蛋白质,普遍认为其与脂肪酸代谢、调节ATP生成有关。利用实时荧光定量PCR技术,对不同月龄(6、8、10月龄)小尾寒羊4种内脏(心脏、脾脏、肾脏、瘤胃)组织中UCP2基因的表达量进行了分析。... 解偶联蛋白2(UCP2)是一种具有解偶联功能的蛋白质,普遍认为其与脂肪酸代谢、调节ATP生成有关。利用实时荧光定量PCR技术,对不同月龄(6、8、10月龄)小尾寒羊4种内脏(心脏、脾脏、肾脏、瘤胃)组织中UCP2基因的表达量进行了分析。结果表明,UCP2基因在6~10月龄小尾寒羊相同内脏中的表达量差异不显著(P>0.05),但在脾脏中的表达量显著(P〈0.05)高于心脏、肾脏和瘤胃,而后三者之间表达量差异不显著(P>0.05)。试验证明了UCP2基因在小尾寒羊内脏组织中有广泛表达,为UCP2基因可能与免疫相关的观点提供了证据,并且说明在6~10月龄的月龄段内,UCP2基因在小尾寒羊内脏组织中的表达受月龄的影响较小。 展开更多
关键词 小尾寒羊 解偶联蛋白2 差异性表达 荧光定量PCR 内脏组织
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褪黑激素受体Mel_(1a)在无蹼壁虎视网膜的空间差异性表达
15
作者 王智超 赵劲松 +3 位作者 张晓盼 余中宾 张倩 鲁亚平 《安徽师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2006年第5期470-474,共5页
为探讨褪黑激素对视网膜功能的调节机制,本实验运用免疫组织化学方法(ABC法)观察了褪黑激素受体Mel1a在无蹼壁虎视网膜的表达与分布.发现褪黑激素受体Mel1a免疫阳性结果主要位于光感受器细胞层的内节和内网状层的细胞突起.在外网状层、... 为探讨褪黑激素对视网膜功能的调节机制,本实验运用免疫组织化学方法(ABC法)观察了褪黑激素受体Mel1a在无蹼壁虎视网膜的表达与分布.发现褪黑激素受体Mel1a免疫阳性结果主要位于光感受器细胞层的内节和内网状层的细胞突起.在外网状层、内核层和神经节细胞层,部分细胞的胞体或突起Mel1a免疫染色呈阳性.统计表明,视网膜中央区光感受器层阳性内节线密度(3.3532±0.6941/mm)较周边区(颞或鼻侧)(21.0186±1.5023/mm)明显小(P<0.001);光感受器细胞阳性内节面积占内节总面积的百分率中央区(15.8579±2.2908%)较周边区(43.8575±5.3839%)明显低(P<0.001).褪黑激素受体Mel1a在无蹼壁虎视网膜的分布特点,提示褪黑激素可能通过Mel1a的介导对无蹼壁虎视网膜生理功能的调节不同区域存在差异性. 展开更多
关键词 褪黑激素受体MeIla 无蹼壁虎 视网膜 空间差异性表达
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高通量测序筛查特发性膜性肾病患者外周血细胞microRNA的差异性表达
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作者 陈文标 黄建溶 +3 位作者 喻祥琪 彭武建 林小聪 戴勇 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1507-1514,1541,共9页
目的 :寻找特发性膜性肾病(idiopathic membranous nephropathy,IMN)患者外周血单个核细胞小核糖核苷酸(micro RNA)的差异性表达以及发生碱基突变的难易度。方法:运用高通量测序技术分别对IMN患者和健康对照者(NC)的micro RNA进行测序,... 目的 :寻找特发性膜性肾病(idiopathic membranous nephropathy,IMN)患者外周血单个核细胞小核糖核苷酸(micro RNA)的差异性表达以及发生碱基突变的难易度。方法:运用高通量测序技术分别对IMN患者和健康对照者(NC)的micro RNA进行测序,构建IMN与NC组之间micro RNA差异性表达谱。并对两组的micro RNA进行碱基编辑分析,寻找发生了碱基突变的micro RNA,比较IMN与NC组micro RNA碱基突变的难易程度。结果:通过构建表达谱,找到了has-mi R-208b、has-mi R-195-3p、has-mi R-23b-5p、has-mi R-95、has-mi R-503、has-mi R-449a、has-mi R-486-3p与has-mi R-27 8个micro RNAs最具有差异性表达。2组共同表达的41个micro RNA中,IMN比NC更容易发生碱基编辑而引起碱基突变。结论:IMN患者与健康对照者的micro RNA存在着差异性表达,差异性表达的micro RNA特异性很高,可以作为深入研究IMN发病机制的靶点。IMN患者相比健康对照者更容易发生micro RNA碱基编辑引起碱基突变,这些发生碱基突变的micro RNA可能用于解释IMN的病因基础。 展开更多
关键词 膜性肾病 小核糖核酸 高通量测序 差异性表达 碱基编辑
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白羊草转录组和差异性表达分析
17
作者 方志红 石永红 +9 位作者 吴欣明 任彬琳 张燕 贾会丽 郭璞 池惠武 李莲芬 王运琦 董宽虎 刘建宁 《中国农学通报》 2018年第35期111-119,共9页
为了获得白羊草(Bothriochloa ischaemum)转录组数据库和差异表达基因,通过Illumina HiSeq4000高通量测序技术对白羊草对照组和干旱胁迫组进行转录组测序。经组装分析共获得118580条Unigenes;将所得到的Unigenes与基因库数据进行比较,对... 为了获得白羊草(Bothriochloa ischaemum)转录组数据库和差异表达基因,通过Illumina HiSeq4000高通量测序技术对白羊草对照组和干旱胁迫组进行转录组测序。经组装分析共获得118580条Unigenes;将所得到的Unigenes与基因库数据进行比较,对Unigenes进行功能注释,共50070条Unigenes获得功能注释。白羊草转录组中的Unigenes根据GO功能大致可分为细胞组分、分子功能和生物学过程三大类共54个分支。通过将所有Unigenes与KOG数据库比对,共有1586条Unigenes可归为25类。以KEGG数据库作为参考,依据代谢途径可将Unigene定位到116个代谢途径分支。通过差异性分析发现,差异性表达基因共3987条,其中上调基因占39.45%,下调基因占60.55%。本研究为白羊草分子生物学研究提供了宝贵的基因组数据库资源。 展开更多
关键词 白羊草 转录组 RNA测序 表达分析 差异性表达基因 代谢通路
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构建SLE患者novel microRNA差异性表达谱及其靶基因的功能分析
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作者 陈文标 戴勇 +5 位作者 钟馨 叶素惠 何桂芳 缪蕙 丘衍博 李朝辉 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期225-230,共6页
目的构建系统性红斑狼疮(SLE)患者与健康对照者(NC)新小核糖核酸(novel microRNA)的差异性表达谱;对显著性差异表达的novel microRNA进行靶基因预测,对靶基因的GO(gene ontology)及KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)的功... 目的构建系统性红斑狼疮(SLE)患者与健康对照者(NC)新小核糖核酸(novel microRNA)的差异性表达谱;对显著性差异表达的novel microRNA进行靶基因预测,对靶基因的GO(gene ontology)及KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)的功能进行分析,探讨SLE的发病机制。方法运用高通量测序技术(high-throughput sequencing)获得SLE与NC总的RNA,对总RNA进行长度分布、基因比对、RNA分类注释、RNA特有及公共序列统计后,运用Mireap软件预测novel microRNA。得到novel microRNA进行差异性表达分析,寻找两组之间具有显著性表达的novel microRNA。采用Targetscan软件对差异性表达的novel microRNA进行靶基因预测,并选取靶基因借用DAVID功能注释软件对其参与的生物学过程进行GO富集及KEGG通路分析。结果 61个novel microRNAs在SLE与NC组之间具有显著差异性表达,其中43个上调表达,18个下调表达。差异性表达novel microRNA的靶基因主要富集在细胞与小分子结合、细胞器官与细胞膜、细胞代谢中。靶基因KEGG通路主要体现在粘附复合体通路中。结论 SLE与NC的novel microRNA存在差异性表达。差异性表达novel microRNA的靶基因可能在SLE的发病机制与临床症状中起着重要作用,可能作为特异性靶点深入研究。 展开更多
关键词 系统性红斑狼疮 新小核糖核酸 靶基因 差异性表达 GO富集 KEGG通路
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Smad3、Smad7基因差异性表达与肝纤维化发病关系研究
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作者 张国 王天才 《胃肠病学》 2001年第C00期193-194,共2页
关键词 肝纤维化 受体型Cmad3 拮抗型Smad7 肝星状细胞 基因差异性表达 发病机制
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吸烟相关慢性阻塞性肺疾病中microRNAs差异性表达的研究进展
20
作者 李男 毛明清 +3 位作者 宋楠 加慧 李云霞 夏书月 《沈阳医学院学报》 2017年第5期432-435,共4页
慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)是一种以持续性气流受限为特征的慢性炎症性疾病。吸烟是导致COPD的重要原因之一。micro RNAs(miRNAs)是一类高度保守的短链非编码RNA,参与调控基因的表达。研究表明吸烟... 慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)是一种以持续性气流受限为特征的慢性炎症性疾病。吸烟是导致COPD的重要原因之一。micro RNAs(miRNAs)是一类高度保守的短链非编码RNA,参与调控基因的表达。研究表明吸烟可致miRNAs的表达上调或下调进而参与COPD的生物学过程,提示miRNAs可能成为COPD的诊断及治疗的新靶点。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 MIRNAS 差异性表达 吸烟
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