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帚状江蓠质体UPA和线粒体COⅠ基因的序列比较及其系统进化分析
1
作者
徐瑞
陈素文
+4 位作者
段亚飞
张文文
王珺
周传朋
王芸
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2023年第3期302-313,共12页
为研究海南省帚状江蓠(Gracilaria edulis)野生群体的种质资源、遗传多样性状况及红藻门物种间亲缘关系,采集海南省文昌和莺歌海潮间带的野生帚状江蓠,采用PCR扩增获得帚状江蓠质体UPA基因片段(质体23S rRNA V区域)和线粒体COⅠ基因片段...
为研究海南省帚状江蓠(Gracilaria edulis)野生群体的种质资源、遗传多样性状况及红藻门物种间亲缘关系,采集海南省文昌和莺歌海潮间带的野生帚状江蓠,采用PCR扩增获得帚状江蓠质体UPA基因片段(质体23S rRNA V区域)和线粒体COⅠ基因片段,分别对其进行序列比较及系统进化分析。结果表明,UPA基因片段T、C、A、G的含量分别为26.2%、16.2%、30.3%、27.3%;COⅠ基因片段T、C、A、G的含量分别为39.2%、15.1%、27.6%、18.1%;UPA和COⅠ基因片段的A+T的平均含量分别为56.5%和66.8%。UPA基因片段长度为370bp,共检测出1种单倍型,无多态性位点;COⅠ基因片段长度为664bp,共检测出2种单倍型,3个多态性位点,均为简约信息位点。与UPA基因相比,COⅠ基因具有更高的变异度,更适合用于帚状江蓠遗传多样性的分析。基于UPA和COⅠ基因片段对帚状江蓠进行系统进化分析,两者结果一致,结合形态学分析表明,帚状江蓠应是江蓠属内独立的分支。
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关键词
帚状江蓠
UPA基因
COⅠ基因
序列分析
系统进化分析
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职称材料
题名
帚状江蓠质体UPA和线粒体COⅠ基因的序列比较及其系统进化分析
1
作者
徐瑞
陈素文
段亚飞
张文文
王珺
周传朋
王芸
机构
上海海洋大学水产与生命学院
中国水产科学研究院南海水产研究所
出处
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2023年第3期302-313,共12页
基金
农业农村部财政专项(NHYYSWZZZYKZX2020)
广东省自然科学基金(2019A1515012159)
+2 种基金
广州市农村科技特派员项目(GZKTP202037)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2020KX03)
中国水产科学研究院科技创新团队项目(2020TD55)。
文摘
为研究海南省帚状江蓠(Gracilaria edulis)野生群体的种质资源、遗传多样性状况及红藻门物种间亲缘关系,采集海南省文昌和莺歌海潮间带的野生帚状江蓠,采用PCR扩增获得帚状江蓠质体UPA基因片段(质体23S rRNA V区域)和线粒体COⅠ基因片段,分别对其进行序列比较及系统进化分析。结果表明,UPA基因片段T、C、A、G的含量分别为26.2%、16.2%、30.3%、27.3%;COⅠ基因片段T、C、A、G的含量分别为39.2%、15.1%、27.6%、18.1%;UPA和COⅠ基因片段的A+T的平均含量分别为56.5%和66.8%。UPA基因片段长度为370bp,共检测出1种单倍型,无多态性位点;COⅠ基因片段长度为664bp,共检测出2种单倍型,3个多态性位点,均为简约信息位点。与UPA基因相比,COⅠ基因具有更高的变异度,更适合用于帚状江蓠遗传多样性的分析。基于UPA和COⅠ基因片段对帚状江蓠进行系统进化分析,两者结果一致,结合形态学分析表明,帚状江蓠应是江蓠属内独立的分支。
关键词
帚状江蓠
UPA基因
COⅠ基因
序列分析
系统进化分析
Keywords
Gracilaria edulis
UPA gene
COⅠgene
sequence analysis
phylogenetic analysis
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
帚状江蓠质体UPA和线粒体COⅠ基因的序列比较及其系统进化分析
徐瑞
陈素文
段亚飞
张文文
王珺
周传朋
王芸
《海洋渔业》
CSCD
北大核心
2023
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