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HIV-1整合酶基因序列分析方法验证
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作者 王绪琴 林倩茹 +7 位作者 冯琬清 董原 郁晓磊 刘长河 宁镇 沈鑫 潘启超 林怡 《检验医学》 CAS 2024年第4期369-375,共7页
目的 验证实验室自建人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)整合酶基因序列分析方法。该方法可用于评估HIV-1整合酶区段基因型耐药水平。方法 根据世界卫生组织自建基因序列分析方法验证的建议,从20份HIV-1阳性样本中提取RNA,扩增HIV-1整合酶区基... 目的 验证实验室自建人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)整合酶基因序列分析方法。该方法可用于评估HIV-1整合酶区段基因型耐药水平。方法 根据世界卫生组织自建基因序列分析方法验证的建议,从20份HIV-1阳性样本中提取RNA,扩增HIV-1整合酶区基因片段,并测序。通过与病毒质量保证(VQA)共识进行比对,评估实验室自建的HIV-1整合酶基因序列分析方案的准确性,通过扩增成功率评估其灵敏度,通过同一样本的重复检测结果评估其精密度和重现性。结果 20份样本与VQA共识的核苷酸一致率均>98%;10个高病毒载量(>10 000拷贝·mL^(-1))样本和5个低病毒载量(1 000~5 000拷贝·mL^(-1))样本的扩增成功率均为100%;4个样本的同批次5复孔和5个样本5次检测的结果均符合90%的样本配对比较核苷酸一致率>98%的要求。结论 该HIV-1整合酶基因序列分析方法的准确性、灵敏度、精密度和重现性均符合要求,适用于HIV-1整合酶基因序列分析。 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒1型 整合酶基因序列分析 基因型耐药检测
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2016—2021年合肥市极端气温与循环系统疾病死亡的时间序列分析
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作者 肖长春 张磊 +1 位作者 余林玲 朱昱 《环境卫生学杂志》 2024年第5期406-412,共7页
目的探讨合肥市极端气温对居民循环系统疾病死亡的影响及不同人群的敏感性分析。方法收集合肥市2016—2021年逐日气象资料、大气污染物监测资料及循环系统疾病死亡数据。采用基于广义相加模型的分布滞后非线性模型(distributed lag non-... 目的探讨合肥市极端气温对居民循环系统疾病死亡的影响及不同人群的敏感性分析。方法收集合肥市2016—2021年逐日气象资料、大气污染物监测资料及循环系统疾病死亡数据。采用基于广义相加模型的分布滞后非线性模型(distributed lag non-linear model,DLNM),评估极端气温对不同性别、年龄人群循环系统疾病死亡影响以及对循环系统主要疾病死亡的滞后效应和累积效应。以日均气温中位数(17.7℃)为对照,计算极端气温的相对危险度(RR)。结果合肥市极端气温对居民循环系统疾病死亡具有显著影响。极端低温对循环系统疾病死亡影响滞后时间长,lag4时达到最大,RR(95%CI)为1.067(1.039,1.095),且不同人群的死亡风险均明显增加。极端高温对循环系统疾病死亡的影响在当天达到最大,RR(95%CI)为1.088(1.020,1.160),持续时间短;≥65岁、女性和脑血管病患者也均在当日效应最大,且效应具有统计学意义,而对其他人群无明显影响。极端气温对不同人群的冷效应均高于热效应,低温对<65岁人群的死亡风险明显高于≥65岁人群,热效应则相反;女性冷效应和热效应均高于男性;脑血管病人群冷效应和热效应也均高于缺血性心脏病人群。结论合肥市极端气温可能增加居民循环系统疾病死亡风险,冷效应影响更大,不同人群对冷热效应的敏感性有差别。 展开更多
关键词 气温 循环系统疾病 冷效应 热效应 死亡风险 时间序列分析
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A、B、J亚群禽白血病病毒混合感染的鉴定及gp85基因序列分析 被引量:1
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作者 窦俊峰 汪最 +5 位作者 李丽 卢琴 金鑫鑫 凌小淳 罗青平 翟新国 《中国畜牧兽医》 CSCD 北大核心 2024年第1期302-311,共10页
【目的】了解湖北地区禽白血病病毒(Avian leukosis virus, ALV)亚群之间混合感染及其gp85基因遗传变异情况,为进一步研究ALV混合感染的流行病学提供参考。【方法】对来自湖北宜昌疑似感染ALV的一只病死鸡进行病理剖检,无菌采集病变组... 【目的】了解湖北地区禽白血病病毒(Avian leukosis virus, ALV)亚群之间混合感染及其gp85基因遗传变异情况,为进一步研究ALV混合感染的流行病学提供参考。【方法】对来自湖北宜昌疑似感染ALV的一只病死鸡进行病理剖检,无菌采集病变组织接种DF-1细胞进行病毒分离,通过PCR、ELISA及间接免疫荧光试验(IFA)等方法进行亚群鉴定,进一步对分离株gp85基因的相似性和变异情况进行分析。【结果】剖检结果可见病死鸡肾脏、脾脏肿大,肺脏出血,表面可见灰白色肿瘤结节;组织匀浆接种DF-1细胞后,ELISA检测发现细胞上清P27抗原呈阳性;IFA检测发现,感染细胞里有特异性绿色荧光;PCR鉴定能同时扩增出A(692 bp)、B(847 bp)和J(545 bp)亚群的特异性条带。鉴定结果表明,从该病死鸡中分离到A、B和J亚群ALV毒株,分别命名为HBYC2022-A、HBYC2022-B和HBYC2022-J。分离株gp85基因核苷酸相似性分析显示,HBYC2022-A与江苏株JS-A1201相似性最高,为99.6%;HBYC2022-B与江苏株JS-B1204相似性最高,为99.7%;而HBYC2022-J与黑龙江株PK19FA01、广西株GX20YL12 J及安徽株AHaq02相似性均为100%。此外,分离株gp85基因高突变区域(hr1、hr2)氨基酸序列并未出现特殊点突变。【结论】鸡群存在A、B和J不同亚群ALV的混合感染情况,提示国内养禽场需提高警惕并加强针对ALV各亚群的流行病学调查。 展开更多
关键词 禽白血病病毒(ALV) 分离鉴定 混合感染 GP85基因 序列分析
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鸡群中鸡传染性贫血病原与抗体检测及分离株VP1基因序列分析
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作者 冯笑艳 胡明雪 +10 位作者 林雨萌 刘长军 李凯 祁小乐 崔红玉 高立 王素艳 陈运通 王笑梅 张艳萍 高玉龙 《中国家禽》 北大核心 2024年第2期52-58,共7页
为了解鸡群中鸡传染性贫血病毒(CAV)感染及抗体产生情况,从黑龙江省两个无临床症状鸡群(B群和S群)中,分别采集血清通过ELISA方法进行抗体检测,采集抗凝血并分离淋巴细胞,针对基因组保守序列设计引物,通过PCR方法进行病原检测,并对从B群... 为了解鸡群中鸡传染性贫血病毒(CAV)感染及抗体产生情况,从黑龙江省两个无临床症状鸡群(B群和S群)中,分别采集血清通过ELISA方法进行抗体检测,采集抗凝血并分离淋巴细胞,针对基因组保守序列设计引物,通过PCR方法进行病原检测,并对从B群病原阳性鸡分离到的分离株进行VP1基因序列分析。结果显示,B群和S群CAV抗体阳性率分别为62.7%(79/126)和68.2%(88/129),病原阳性率分别为43.0%(49/114)和62.3%(48/77),其中,B群和S群中抗体和病原双阴性的鸡分别为23.7%(27/114)和15.6%(12/77),而抗体和病原双阳性的鸡分别高达28.1%(32/114)和46.8%(36/77);在双阳性鸡中,B群和S群分别有62.5%(20/32)和58.3%(21/36)抗体滴度在1.0×10^(4)及以上,从B群病原阳性鸡全血中分离到一株CAV(HLJ/2022株),分离株HLJ/2022第394位氨基酸为谷氨酰胺,具有强毒的分子特征;两个鸡群的环境拭子CAV阳性率为10.0%(3/30),存在于消毒前的鸡蛋表面、更衣处和鞋底。研究表明,检测鸡群的CAV抗体阳性率在62.7%以上,病原阳性率在43.0%以上,抗体滴度在1.0×104及以上CAV仍可存在,CAV流行株(HLJ/2022)具有强毒分子特征,鸡群环境中存在CAV污染,结果为CIA防控提供重要的参考意见。 展开更多
关键词 鸡传染性贫血病毒 血清学检测 病原学检测 病毒分离鉴定 VP1基因序列分析
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昼夜温差对乌鲁木齐市慢性肾脏病日住院人次影响的时间序列分析
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作者 吴瑞凯 张莹 +2 位作者 杨浩峰 马龙 苏德奇 《医学新知》 CAS 2024年第2期137-148,共12页
目的探讨昼夜温差(diurnal temperature range,DTR)影响慢性肾脏病(chronic kidney diseases,CKD)日住院人次的影响。方法收集2019年1月1日至2020年12月31日乌鲁木齐市4所三甲医院、4所二甲医院、1所一甲医院CKD日住院人次数据,同期气... 目的探讨昼夜温差(diurnal temperature range,DTR)影响慢性肾脏病(chronic kidney diseases,CKD)日住院人次的影响。方法收集2019年1月1日至2020年12月31日乌鲁木齐市4所三甲医院、4所二甲医院、1所一甲医院CKD日住院人次数据,同期气象及污染物数据来自于乌鲁木齐市主城区的6个国控监测点,采用分布滞后非线性模型,控制星期几效应、假期效应、长期时间趋势及其它因素,分析DTR与CKD日住院人次的关系。结果CKD日住院人次与DTR(滞后0~21 d)的暴露-反应曲线呈“N”形,CKD患者住院风险随DTR的升高呈先上升后下降趋势。低度和高度DTR对CKD患者住院的影响存在一定的滞后效应,中度DTR对住院影响较小;DTR=5℃时,单日效应出现在第3天[RR=1.081,95%CI(1.020,1.145),P<0.05],最大效应出现在第21天[RR=1.090,95%CI(1.014,1.173),P<0.05];高度DTR=14℃(P_(95))时,单日效应出现在第4天[RR=1.086,95%CI(1.007,1.172),P<0.05],最大效应出现在第5天[RR=1.089,95%CI(1.009,1.176),P<0.05],累积滞后均暂未发现有统计学差异。男性和年龄<65岁的CKD患者更易受到DTR的影响,寒冷季节和四季更替时DTR变化对CKD患者住院的影响更大。结论男性与<65岁CKD患者更易受到DTR的影响,在寒冷季节和四季交替DTR变化时更应重点保护易感人群免受DTR的影响。 展开更多
关键词 昼夜温差 慢性肾脏病 分布滞后非线性模型 日住院人次 时间序列分析
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基于中断时间序列分析的江苏省某三甲综合医院冠脉支架集中带量采购政策实施效果研究
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作者 唐艳艳 王雪梅 +3 位作者 胡蓉蓉 范思宇 徐娟 周迎宏 《中国卫生事业管理》 北大核心 2024年第4期384-389,共6页
目的:通过分析江苏省某三甲综合医院冠脉支架集中带量采购政策实施前后的冠脉支架使用情况,评估冠脉支架集中带量采购政策实施效果,为冠脉支架集中带量采购政策协议期满后接续采购的持续优化及完善提供建议。方法:提取2018年10月~2022... 目的:通过分析江苏省某三甲综合医院冠脉支架集中带量采购政策实施前后的冠脉支架使用情况,评估冠脉支架集中带量采购政策实施效果,为冠脉支架集中带量采购政策协议期满后接续采购的持续优化及完善提供建议。方法:提取2018年10月~2022年10月江苏省某三甲综合医院冠脉支架使用量数据,采用中断时间序列分析方法分析江苏省冠脉支架集中带量采购政策和国家组织冠脉支架集中带量采购政策对江苏省某三甲综合医院冠脉支架使用数量的影响,同时分析该院实施冠脉支架集中带量采购政策前后的进口和国产冠脉支架使用情况。结果:江苏省冠脉支架集中带量采购政策执行后,冠脉支架使用量呈显著上升趋势(β_(3)=4.62,P=0.017);国家组织冠脉支架集中带量采购政策执行后,冠脉支架使用量的水平变化和趋势变化均不显著。江苏省冠脉支架集中带量采购政策实施后,国产冠脉支架和进口冠脉支架使用量都呈不显著上升趋势(β_(3)=2.46,P=0.232;β_(3)=2.16,P=0.173);国家组织冠脉支架集中带量采购政策实施后,国产冠脉支架使用量无显著变化(β_(5)=-1.09,P=0.589),进口冠脉支架使用量瞬间下降(β_(4)=-46.6,P=0.018),随后呈上升趋势,但变化不显著(β_(5)=0.16,P=0.919)。结论:该院总体上冠脉支架集中带量采购政策实施效果良好,江苏省冠脉支架集中带量采购政策实施后增加了该院冠脉支架使用量;国家组织冠脉支架集中带量采购政策促使该院冠脉支架使用量稳中有涨,其中国产冠脉支架整体呈上升趋势,进口冠脉支架使用量整体下降。后续国家冠脉支架集中带量采购政策建议探索多元化的分配方式,合理分配国产冠脉支架和进口冠脉支架中选品种,规范冠脉支架合理使用。 展开更多
关键词 冠脉支架 集中带量采购 中断时间序列分析
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公立医院科室绩效方案改革对DIP患者住院费用影响——基于中断时间序列分析
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作者 陈丽丽 王超群 +2 位作者 杨莹 曾智贤 郑勇生 《中国医院管理》 北大核心 2024年第5期36-39,共4页
目的 探讨医保按病种分值付费(Diagnosis-Intervention Packet,DIP)背景下公立医院科室绩效方案改革对DIP患者住院费用的影响,为优化公立医院科室绩效管理制度、降低DIP患者住院费用提供参考。方法 收集广东省某县级人民医院2020年7月—... 目的 探讨医保按病种分值付费(Diagnosis-Intervention Packet,DIP)背景下公立医院科室绩效方案改革对DIP患者住院费用的影响,为优化公立医院科室绩效管理制度、降低DIP患者住院费用提供参考。方法 收集广东省某县级人民医院2020年7月—2023年7月DIP患者的住院费用数据,采用中断时间序列分析法描述例均住院费用变化趋势,分析该院科室绩效方案改革对DIP患者住院费用的影响。结果 医院科室绩效方案改革后,DIP患者总费用下降1 071.93元,并且每月继续下降116.39元。同时,科室绩效方案改革主要对居民医保DIP患者发挥作用,对职工医保DIP患者没有明显影响。结论 公立医院科室绩效方案改革明显降低了DIP患者的总费用及其分项费用,但是对不同险种DIP患者的影响不同。应进一步完善公立医院科室绩效管理机制,建立与医疗效能、医疗质量等相关的多维度绩效考核指标体系,因地制宜推动公立医院科室绩效方案改革,促进公立医院高质量发展。 展开更多
关键词 公立医院 科室绩效方案改革 按病种分值付费 住院费用 中断时间序列分析
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基于间断时间序列分析的三明市公立医院DRG改革效果的综合评估
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作者 李及第 李敏 宫春博 《卫生软科学》 2024年第4期1-5,共5页
[目的]分析三明市C-DRG和CN-DRG医保支付方式改革对二级、三级公立医院医疗收入、服务效率和患者负担的影响。[方法]采用间断时间序列、灰色关联度和结构变动度分析方法对2015-2019年22家公立医院的医药收入等指标进行回顾性分析。[结果... [目的]分析三明市C-DRG和CN-DRG医保支付方式改革对二级、三级公立医院医疗收入、服务效率和患者负担的影响。[方法]采用间断时间序列、灰色关联度和结构变动度分析方法对2015-2019年22家公立医院的医药收入等指标进行回顾性分析。[结果]三明市实施DRG医保支付方式改革后二级医院的医疗收入降低5.2%,对三级医院的医疗收入没有显著影响;二级、三级医院的平均住院天数和病床使用率无显著改变;三级医院的门急诊次均费用增长2%,出院例均费用未受显著影响;二级医院的出院例均费用降低10.8%后增长8.4%。[结论]在三明市的DRG改革下,公立医院情况稳中向好;DRG可以完善临床路径,促进医疗机构的成本管控,未来的医改进程中,应考虑不同等级医院特点,加强改革的监督管理。 展开更多
关键词 DRG 医保支付方式改革 间断时间序列分析
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2023年黑龙江地区某鹅场鹅星状病毒分离鉴定及ORF2基因序列分析
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作者 徐烨 朱庆贺 +1 位作者 高旭 孙东波 《黑龙江八一农垦大学学报》 2024年第2期50-56,106,共8页
为调查2023年黑龙江地区某鹅场中鹅星状病毒(goose astrovirus,GoAstV)的感染及遗传进化情况,采集发病鹅的内脏组织样品进行RT-PCR检测,检测阳性样本通过鹅胚接种进行病毒分离,并利用RT-PCR以及电镜进行鉴定,利用二代测序技术进行分离... 为调查2023年黑龙江地区某鹅场中鹅星状病毒(goose astrovirus,GoAstV)的感染及遗传进化情况,采集发病鹅的内脏组织样品进行RT-PCR检测,检测阳性样本通过鹅胚接种进行病毒分离,并利用RT-PCR以及电镜进行鉴定,利用二代测序技术进行分离毒株的全基因组测序,运用MEGA6软件对ORF2基因进行遗传进化分析。结果显示,在15份样品中,GoAstV的阳性率为6.67%(1/15)。阳性样本处理后接种鹅胚进行病毒分离,盲传至第5代时,尿囊膜增厚,出现尿酸盐沉积,鹅胚在120 h内死亡率达到83.33%(20/24),死亡鹅胚尿囊液进行GoAstV RT-PCR检测,结果为阳性。电镜观察结果显示,可观察到30 nm左右的病毒粒子。提取第5代病毒尿囊液RNA进行全基因组测序,并对该毒株ORF2基因进行同源性分析和系统发育进化树分析,结果显示,鉴定的毒株与其他GoAstV的ORF2基因核苷酸同源性为54.7%到96.6%,与GoAstV LYG2株的核苷酸同源性最高,为96.6%,而其与GoAstV FLX株差异较大,为54.7%。系统发育进化树结果显示,试验鉴定的毒株属于GoAstV G2型,与火鸡星状病毒遗传关系较近。研究对黑龙江地区某鹅场GoAstV进行分离鉴定并对ORF2基因进行序列分析,为黑龙江省GoAstV遗传进化及其分子流行病学调查研究提供了基础数据。 展开更多
关键词 GoAstV RT-PCR ORF2基因 分离鉴定 序列分析
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4株滑液囊支原体分离株P80脂蛋白的基因克隆及序列分析
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作者 田兴苗 郭磊 +4 位作者 王健霖 戴莎莎 司朵朵 龚振兴 李继东 《宁夏大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第1期60-68,共9页
为研究滑液囊支原体(Mycoplasma synoviae,MS)P80家族脂蛋白的功能及其异同,通过PCR方法从4株滑液囊支原体分离株中分别扩增P80-1,P80-2,P80-3蛋白的基因序列并进行测序,通过生物信息学方法对P80家族脂蛋白的蛋白序列进行分析,寻找保守... 为研究滑液囊支原体(Mycoplasma synoviae,MS)P80家族脂蛋白的功能及其异同,通过PCR方法从4株滑液囊支原体分离株中分别扩增P80-1,P80-2,P80-3蛋白的基因序列并进行测序,通过生物信息学方法对P80家族脂蛋白的蛋白序列进行分析,寻找保守结构域、抗原表位,并预测功能.结果表明,P80家族脂蛋白均为碱性亲水性稳定蛋白,在N端具有较强疏水性,只有P80-2蛋白具有跨膜螺旋区;P80家族脂蛋白信号肽的位置与疏水区结果相一致;3条P80蛋白具有12个相同的保守结构域及2~4个不同的结构域;有31~32个抗原表位;二级结构均以α-螺旋和无规则卷曲为主;三级结构预测显示,P80-1蛋白具有ABC转运蛋白的功能,P80-2蛋白为周质结合蛋白Ⅱ型,P80-3蛋白具有细胞黏附功能.研究结果可为MS P80家族脂蛋白功能的深入研究以及MS致病机制、病原诊断和疫苗研制提供参考. 展开更多
关键词 滑液囊支原体 P80家族脂蛋白 基因克隆 序列分析
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研究生时间序列分析课课程思政元素挖掘与教学实施研究
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作者 王彦彭 夏万军 《高教学刊》 2024年第12期184-188,192,共6页
时间序列分析课程具有“用数据说话,用方法验证,更易挖掘和采用中国元素与问题,便于中外横向与纵向比较,鉴往知来”等特色和优势,可以更好开展课程思政。当前有关研究生时间序列分析课程思政的研究成果缺乏。在进行时间序列分析课程思... 时间序列分析课程具有“用数据说话,用方法验证,更易挖掘和采用中国元素与问题,便于中外横向与纵向比较,鉴往知来”等特色和优势,可以更好开展课程思政。当前有关研究生时间序列分析课程思政的研究成果缺乏。在进行时间序列分析课程思政教学目标设计的基础上,深入挖掘课程简介与综述、传统和现代时间序列分析方法、课内与课外实践环节中蕴含的课程思政元素,以国家级教材为基础、以国外教材为参考,进一步完善体现中国元素的讲义,通过课程思政混合式教学平台进行课前、课中、课后一体化设计,构建多维度课程思政教学评价体系,注重课程思政教学的持续改进。多管齐下,有效开展课程思政教学,培养研究生形成正确的价值观、政治观、法治观和道德观。 展开更多
关键词 时间序列分析 教学目标设计 课堂教学 实践环节 思政元素挖掘 教学实施
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一株Clade1.3 ALV-J分离鉴定及其全基因组序列分析
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作者 卢海萍 杨福剑 +9 位作者 刘林敏 陈莹 邓乔木 唐雪梅 吴颖臻 谢英健 谢庆华 甘业仙 韦平 韦天超 《广西畜牧兽医》 2024年第1期1-4,共4页
为了解地方品种鸡禽白血病病毒(ALV)感染情况,本试验用从广西某养殖公司地方品种鸡采集的血浆样品接种DF-1细胞进行ALV的培养分离,然后用ALV-p27抗原检测试剂盒对其细胞培养上清进行ELISA检测,并进一步对细胞培养物进行病毒亚群的PCR鉴... 为了解地方品种鸡禽白血病病毒(ALV)感染情况,本试验用从广西某养殖公司地方品种鸡采集的血浆样品接种DF-1细胞进行ALV的培养分离,然后用ALV-p27抗原检测试剂盒对其细胞培养上清进行ELISA检测,并进一步对细胞培养物进行病毒亚群的PCR鉴定和病毒分离株的全基因组序列测定与分析。结果显示:从鸡血浆样品中获得一株ALV,分离毒株经分子鉴定及测序分析确定其为J亚群(ALV-J),命名为GX22YL01;通过对毒株GX22YL01的全病毒基因组与参考毒株序列进行比对分析,发现其与课题组建立的ALV-J分类方法“Pilot tree”中的参考株GX14HG04相似性最高,且同处于Clade 1.3分支。 展开更多
关键词 J亚群禽白血病病毒 分离鉴定 序列分析 Clade1.3
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禽腺病毒4型GZ-B1毒株的Hexon基因序列分析
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作者 罗青华 罗东还 +1 位作者 温贵兰 徐飞 《贵州畜牧兽医》 2024年第1期54-56,共3页
为了解禽腺病毒4型(FAdV-4)GZ-B1株的遗传进化情况,试验设计合成FAdV-4 Hexon基因的特异引物,对GZ-B1株Hexon基因进行PCR扩增并克隆至pMD-19T载体,基因测序和遗传进化分析。结果:扩增的Hexon基因长度为327 bp,与预期相符。GZ-B1株与国内... 为了解禽腺病毒4型(FAdV-4)GZ-B1株的遗传进化情况,试验设计合成FAdV-4 Hexon基因的特异引物,对GZ-B1株Hexon基因进行PCR扩增并克隆至pMD-19T载体,基因测序和遗传进化分析。结果:扩增的Hexon基因长度为327 bp,与预期相符。GZ-B1株与国内外13株FAdV参考毒株中的7株FAdV-C毒株同源性较高(95.8%~98.5%),其中与国内强毒株GDMZ、LC1611、SDSG、SDXL同源性最高(均为98.5%),与基因型A、B、D、E的6株参考毒株同源性较低(73.0%~77.5%)。遗传进化树显示,GZ-B1株与基因型A、B、D、E毒株处于不同进化分支,与国内外C基因型毒株处于同一进化分支,表明该毒株与C基因型毒株遗传差异较小,其中与国内C型强毒株LC1611的遗传差异最小,亲缘关系最近。结论:FAdV-4 GZ-B1株属于C基因型、血清4型,与国内流行株FAdV-4 LC1611亲缘关系最近,同源性最高。 展开更多
关键词 禽腺病毒4型 GZ-B1毒株 Hexon基因 序列分析
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“互联网+教育”下“应用时间序列分析”改革探究
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作者 王明辉 卢俊岚 陈思源 《教育教学论坛》 2024年第3期125-128,共4页
“应用时间序列分析”是一门理论性和实践性都很强的应用统计学核心专业课程,在数字经济时代愈发重要。在“互联网+教育”视域下,基于慕课、翻转课堂、微课、学习通等教学形式,结合“应用时间序列分析”课程教学实践,探究理论知识、实... “应用时间序列分析”是一门理论性和实践性都很强的应用统计学核心专业课程,在数字经济时代愈发重要。在“互联网+教育”视域下,基于慕课、翻转课堂、微课、学习通等教学形式,结合“应用时间序列分析”课程教学实践,探究理论知识、实践知识、知识巩固、实践教学、考核测评等五个方面的改革思路,提出相应的改进策略,以期帮助学生更好地掌握专业技能,灵活地解决实际问题,培养出更加符合数字经济时代需要的应用统计学人才。 展开更多
关键词 “互联网+教育” 应用时间序列分析 课程改革
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山羊睾丸细胞LGALS1基因的克隆及序列分析
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作者 张煜杭 郑维豪 +2 位作者 姬格金 葛佳仪 鲜思美 《贵州畜牧兽医》 2024年第1期6-9,共4页
为了解山羊LGALS1基因的遗传进化情况,根据NCBI中山羊LGALS1基因序列(登录号:XM_018048739.1)设计1对特异引物,采用RT-PCR技术从山羊睾丸细胞中扩增LGALS1基因,并将其克隆至pMD-19T载体,构建pMD-19T-LGALS1质粒,通过质粒PCR、双酶切和... 为了解山羊LGALS1基因的遗传进化情况,根据NCBI中山羊LGALS1基因序列(登录号:XM_018048739.1)设计1对特异引物,采用RT-PCR技术从山羊睾丸细胞中扩增LGALS1基因,并将其克隆至pMD-19T载体,构建pMD-19T-LGALS1质粒,通过质粒PCR、双酶切和序列测序进行验证,对其核苷酸序列进行比对分析并绘制系统进化树。结果:山羊睾丸细胞LGALS1基因长度为408 bp,编码135个氨基酸。该基因与GenBank中登录的山羊LGALS1编码区序列相似性达100%;与绵羊、羚羊、水牛、牛、人、马、猪、猩猩、虎鲸、猫、驴、大熊猫、家鼠、斑马鱼的核苷酸一致性分别为99.3%、99.0%、97.1%、96.8%、87.3%、87.0%、88.5%、88.5%、90.9%、88.7%、87.0%、86.3%、84.3%、54.6%。系统进化树表明,山羊睾丸细胞LGALS1基因与绵羊、羚羊亲缘关系最近,与斑马鱼亲缘关系最远。结论:试验成功克隆了山羊睾丸细胞的LGALS1基因,不同物种内LGALS1基因高度保守。 展开更多
关键词 山羊 睾丸细胞 LGALS1基因 克隆 序列分析
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水牛SFRP 1基因序列分析、真核表达载体构建及组织表达分析
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作者 黄丽清 段安琴 +2 位作者 郑海英 杨春艳 尚江华 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1807-1818,共12页
【目的】获取水牛分泌型卷曲相关蛋白1(SFRP1)基因CDS区序列,并预测其编码蛋白的结构功能,构建SFRP 1基因真核表达载体,检测SFRP 1基因在水牛不同组织中的表达情况,为探索SFRP 1基因在水牛生长发育中的作用奠定基础。【方法】以水牛卵... 【目的】获取水牛分泌型卷曲相关蛋白1(SFRP1)基因CDS区序列,并预测其编码蛋白的结构功能,构建SFRP 1基因真核表达载体,检测SFRP 1基因在水牛不同组织中的表达情况,为探索SFRP 1基因在水牛生长发育中的作用奠定基础。【方法】以水牛卵巢组织cDNA为模板,通过RT-PCR对SFRP 1基因CDS区序列进行扩增并测序,利用生物信息学在线分析软件对水牛SFRP 1基因与不同物种进行比对和系统进化树构建,并预测SFRP1蛋白理化性质、信号肽、跨膜结构等。将获得的目的基因连接至pCMV-HAhyPBase-mcheery载体并转染至水牛颗粒细胞,检测转染后荧光和基因表达情况。通过实时荧光定量PCR检测水牛不同组织中SFRP 1基因表达情况。【结果】水牛SFRP 1基因CDS区长927 bp,共编码308个氨基酸。多重序列比对结果显示,水牛SFRP 1基因氨基酸序列与黄牛、牦牛、山羊、虎鲸、黑猩猩、北极狐、猫、人、小鼠的相似性分别为100%、100%、99.65%、98.58%、98.23%、98.23%、98.58%、98.23%、96.45%,存在CRD_FZ、NTR_like和DUF3367结构域。水牛SFRP 1基因核苷酸序列与黄牛、绵羊、山羊、牦牛、野牛、马鹿、野骆驼、猪、人的相似性分别为97.3%、95.9%、95.8%、94.5%、94.2%、93.7%、80.4%、78.5%和77.3%。系统进化树结果显示,水牛与黄牛、牦牛、野牛聚为一支。生物信息学分析结果显示,SFRP1蛋白呈碱性,为不稳定蛋白;第1—15位氨基酸处存在信号肽,为分泌型蛋白,存在跨膜结构,主要定位于细胞外;存在21个磷酸化位点和8个O-糖基化修饰位点。二级结构主要由α-螺旋、延伸链和无规则卷曲构成;水牛、黄牛、人的SFRP1蛋白三级结构高度相似。成功构建pCMV-mcheery-SFRP1真核表达载体并转染水牛颗粒细胞,转染72 h后pCMV-mcheery-SFRP1重组质粒组细胞内SFRP 1基因表达量极显著高于对照组(P<0.01)。实时荧光定量PCR结果显示,SFRP 1基因在水牛不同组织中均有表达,且在脾脏中表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01)。【结论】SFRP 1基因在不同物种以及遗传进化过程中具有高保守性,在水牛不同组织中广泛表达。研究结果为今后探究SFRP 1基因在水牛生长发育中的功能及分子机制奠定基础。 展开更多
关键词 水牛 SFRP 1基因 序列分析 真核表达载体 组织表达
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应用中断时间序列分析评价医院等级评审对医务人员手卫生依从性的影响
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作者 杨鹏 叶蕾 +1 位作者 蒋瑶 赖仁展 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期502-507,共6页
目的应用中断时间序列分析模型,评价综合干预措施对医务人员手卫生依从性的影响。方法选取某三级医院全部临床和医技科室的工作人员为研究对象,在三级医院等级评审迎检筹备期间,实施培训、调查、竞赛等多种形式的手卫生综合干预措施。... 目的应用中断时间序列分析模型,评价综合干预措施对医务人员手卫生依从性的影响。方法选取某三级医院全部临床和医技科室的工作人员为研究对象,在三级医院等级评审迎检筹备期间,实施培训、调查、竞赛等多种形式的手卫生综合干预措施。收集干预前后手卫生依从性监测数据,应用中断时间序列方法进行模型构建,评价干预的即刻效果和远期效果。结果医务人员手卫生依从率由干预前的67.58%提升至干预后的81.43%。中断时间序列分析结果显示,干预实施后总体医务人员的手卫生依从率即刻提升19.717%(t=5.473,P<0.001);但其斜率改变量为-1.995(t=-2.249,P=0.048),提示干预实施后手卫生依从率的下降趋势扩大;干预对不同岗位工作人员均有即刻提升效果,以医生群体提升幅度最大;对不同岗位工作人员的斜率改变量均为负值,以护士群体的改变量绝对值最小。结论综合干预措施可以有效提升医务人员手卫生依从性,但其远期效果不甚理想。中断时间序列模型可有效用于手卫生依从性监测数据的分析。 展开更多
关键词 中断时间序列分析 手卫生 依从性 医院等级评审
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北京地区猫杯状病毒的分离鉴定及VP1基因序列分析
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作者 张中华 纪志辉 +5 位作者 赵晓 苏煜智 董昊 司永芳 王金明 石文达 《动物医学进展》 北大核心 2024年第1期29-35,共7页
为了解猫杯状病毒(FCV)新流行毒株的流行情况、变异特点及致病性,通过收集2016-2022年4月北京地区多家宠物医院就诊疑似感染FCV的猫眼、鼻、咽拭子进行RT-PCR检测和分离培养,对分离到的5株FCV进行病毒含量测定、VP1基因序列分析,并对其... 为了解猫杯状病毒(FCV)新流行毒株的流行情况、变异特点及致病性,通过收集2016-2022年4月北京地区多家宠物医院就诊疑似感染FCV的猫眼、鼻、咽拭子进行RT-PCR检测和分离培养,对分离到的5株FCV进行病毒含量测定、VP1基因序列分析,并对其中1株进行致病性试验。结果显示,2018-2022年4月阳性率分别为36.98%、34.30%、41.33%、40.46%和34.39%,总阳性率为37.93%。5株FCV分离株VP1基因核苷酸和氨基酸同源性分别为74.1%~85.4%和83.6%~91.0%;5株FCV分离株与国内疫苗株255株核苷酸和氨基酸同源性分别为74.8%~84.5%和83.7%~91.6%;与国内疫苗株255株、国外疫苗株F9株在不同的小分支上。致病性试验结果显示,猫感染BJH13株FCV后出现精神沉郁、食欲减退、体温升高、体重下降、眼鼻分泌物增多和舌泛红、溃疡等典型感染FCV临床症状;FCV感染猫的舌和肺脏组织病理切片结果显示,FCV侵染猫舌和肺脏并呈典型感染FCV病理特征。以上结果表明,FCV阳性率高;分离株BJH13株致病力强;FCV VP1基因序列变异大,与目前临床使用的疫苗株255、F9株VP1基因存在明显差异,存在疫苗免疫失败的风险。这对现阶段FCV防控带来了巨大挑战,同时为今后的疫苗研发提供了候选毒株和科学依据。 展开更多
关键词 猫杯状病毒 分离鉴定 VP1基因 序列分析 致病性
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基于滞后序列分析的学生合作学习行为模式研究
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作者 白洁琼 周晶 《教育理论与实践》 北大核心 2024年第10期52-58,共7页
采用滞后序列分析法对合作学习过程中学生的学习行为模式进行量化分析,结果发现,学生在合作学习的过程中,小组成员之间产生了9条具有显著意义的学习行为序列,其中代表学习者正在进行高阶思维以及知识建构的行为序列占70%;在合作解决问... 采用滞后序列分析法对合作学习过程中学生的学习行为模式进行量化分析,结果发现,学生在合作学习的过程中,小组成员之间产生了9条具有显著意义的学习行为序列,其中代表学习者正在进行高阶思维以及知识建构的行为序列占70%;在合作解决问题过程中,产生了3条具有显著价值的行为序列路径,解释了小组成员是如何互相支持、围绕着共同的目标解决问题的。合作学习有助于学生理解和建构知识,形成问题解决等高阶思维,进而提高课堂参与度。分析学生在合作学习情境中的学习行为,能够帮助教师把握学生的学习行为模式,诊断影响学习效果的潜在问题,从而调整教学策略以促进其获得更好的学习结果。 展开更多
关键词 学生 合作学习 合作学习行为模式 滞后序列分析 问题情境
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贝叶斯因子序列分析:实验设计中平衡信息与效率的新方法
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作者 郑元瑞 胡传鹏 《应用心理学》 2024年第2期158-171,共14页
实验设计的关键是平衡信息量与效率。贝叶斯因子序列分析利用贝叶斯因子不断更新证据的特点,通过贝叶斯因子标准和在收集数据过程中的序列分析来平衡信息量与效率。本文展示如何使用开源软件JASP和R实现该分析的三个步骤:确定关键效应... 实验设计的关键是平衡信息量与效率。贝叶斯因子序列分析利用贝叶斯因子不断更新证据的特点,通过贝叶斯因子标准和在收集数据过程中的序列分析来平衡信息量与效率。本文展示如何使用开源软件JASP和R实现该分析的三个步骤:确定关键效应、确定停止标准、数据收集中序列分析并决策。该方法考虑现实条件且简单易行,可帮助研究者更有效地进行实验。 展开更多
关键词 贝叶斯因子序列分析 统计检验力 实验设计 JASP R
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