目的探讨IL18RAP基因与肝癌患者预后和肿瘤微环境中CD8^(+)T细胞浸润的相关性以及作为肿瘤标志物的可能性。方法癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)用于评估IL18RAP基因在肝癌中的表达。单因素Cox分析、多因素COX分析和生存...目的探讨IL18RAP基因与肝癌患者预后和肿瘤微环境中CD8^(+)T细胞浸润的相关性以及作为肿瘤标志物的可能性。方法癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)用于评估IL18RAP基因在肝癌中的表达。单因素Cox分析、多因素COX分析和生存分析揭示IL18RAP基因的预后价值。KEGG、GO和Hallmark富集分析寻找与IL18RAP基因相关的功能通路。免疫浸润分析探究IL18RAP基因与22种免疫细胞浸润的关系。通过单细胞测序数据库与免疫组化验证IL18RAP基因与CD8^(+)T细胞浸润的相关性。结果IL18RAP在肝癌组织中表达下调,其低表达与肝癌患者的不良预后相关。功能富集分析显示IL18RAP的表达与免疫功能通路相关。免疫浸润、单细胞测序和免疫组化表明IL18RAP高表达于CD8^(+)T细胞。结论IL18RAP低表达与肝癌患者的不良预后相关,可能影响了抗肿瘤免疫的CD8^(+)T细胞。展开更多
为研究CD8^+T细胞的功能异常机制,对功能异常状态CD8^+T细胞和3种正常CD8^+T细胞亚型[中央记忆CD8^+T细胞(HCM)、效应记忆CD8^+T细胞(HEM)和naive CD8^+T细胞(HW)]的ATAC-seq(Assay for transposase accessible chromatin with high-thr...为研究CD8^+T细胞的功能异常机制,对功能异常状态CD8^+T细胞和3种正常CD8^+T细胞亚型[中央记忆CD8^+T细胞(HCM)、效应记忆CD8^+T细胞(HEM)和naive CD8^+T细胞(HW)]的ATAC-seq(Assay for transposase accessible chromatin with high-throughput sequencing)数据进行基因调控网络比较,结果表明,3种正常CD8^+T细胞特异表达的基因参与维持相应T细胞正常功能的信号通路,功能异常CD8^+T细胞特异的基因参与癌症相关通路。转录因子调控网络比较分析发现功能异常CD8^+T细胞GMEB2转录因子表达关闭。细胞表面受体调控网络比较分析发现功能异常CD8^+T细胞CD7和P4HB受体的表达关闭。采用基因调控网络的数据进行比较分析,发现CD8^+T细胞功能异常机制可能与GMEB2转录因子、CD7和P4HB受体表达关闭有关,这为抗病育种寻找特定基因提供新思路。展开更多
文摘目的探讨IL18RAP基因与肝癌患者预后和肿瘤微环境中CD8^(+)T细胞浸润的相关性以及作为肿瘤标志物的可能性。方法癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)用于评估IL18RAP基因在肝癌中的表达。单因素Cox分析、多因素COX分析和生存分析揭示IL18RAP基因的预后价值。KEGG、GO和Hallmark富集分析寻找与IL18RAP基因相关的功能通路。免疫浸润分析探究IL18RAP基因与22种免疫细胞浸润的关系。通过单细胞测序数据库与免疫组化验证IL18RAP基因与CD8^(+)T细胞浸润的相关性。结果IL18RAP在肝癌组织中表达下调,其低表达与肝癌患者的不良预后相关。功能富集分析显示IL18RAP的表达与免疫功能通路相关。免疫浸润、单细胞测序和免疫组化表明IL18RAP高表达于CD8^(+)T细胞。结论IL18RAP低表达与肝癌患者的不良预后相关,可能影响了抗肿瘤免疫的CD8^(+)T细胞。
文摘为研究CD8^+T细胞的功能异常机制,对功能异常状态CD8^+T细胞和3种正常CD8^+T细胞亚型[中央记忆CD8^+T细胞(HCM)、效应记忆CD8^+T细胞(HEM)和naive CD8^+T细胞(HW)]的ATAC-seq(Assay for transposase accessible chromatin with high-throughput sequencing)数据进行基因调控网络比较,结果表明,3种正常CD8^+T细胞特异表达的基因参与维持相应T细胞正常功能的信号通路,功能异常CD8^+T细胞特异的基因参与癌症相关通路。转录因子调控网络比较分析发现功能异常CD8^+T细胞GMEB2转录因子表达关闭。细胞表面受体调控网络比较分析发现功能异常CD8^+T细胞CD7和P4HB受体的表达关闭。采用基因调控网络的数据进行比较分析,发现CD8^+T细胞功能异常机制可能与GMEB2转录因子、CD7和P4HB受体表达关闭有关,这为抗病育种寻找特定基因提供新思路。
