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原料乳及牧场环境中的微生物多样性及嗜冷菌污染源分析
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作者 胡少震 逯刚 +4 位作者 喻东威 吕加平 张书文 李莲瑞 逄晓阳 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第3期258-267,共10页
原料乳中嗜冷菌超标会产生较高水平的耐热蛋白酶和脂肪酶,这两种酶是导致产品进入货架期后出现质量问题的重要原因。为探究牧场奶牛生活环境以及原料乳在流转过程中不同环节的微生物多样性,找出牧场中嗜冷菌的污染来源,本研究选取河北... 原料乳中嗜冷菌超标会产生较高水平的耐热蛋白酶和脂肪酶,这两种酶是导致产品进入货架期后出现质量问题的重要原因。为探究牧场奶牛生活环境以及原料乳在流转过程中不同环节的微生物多样性,找出牧场中嗜冷菌的污染来源,本研究选取河北地区某规模化奶牛养殖场,采集TMR饲料、牛舍垫土、头三把奶、头三把奶之后的常规乳以及储奶罐中的原料乳等样品,利用宏基因组测序技术对所有样品的菌群结构、嗜冷菌种类及丰度进行分析。结果表明:在门水平上,主要微生物为变形菌门、厚壁菌门、放线菌门,在属水平上主要是无形体属、链球菌属、肠球菌属、短螺菌属、芽孢杆菌属、假单胞菌。此外对样品中的关键嗜冷菌(假单胞菌)进行分析,牛舍垫土的多样性最丰富的,包含了牧场中常规乳及储奶罐中乳假单胞菌种类的99.63%和96.39%,说明牛舍垫土是各类假单胞菌潜在的污染源。 展开更多
关键词 宏基因组测序技术 微生物多样性 嗜冷菌 假单胞菌 污染来源
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长期施加钾肥对小麦产量、氮磷钾吸收量及根际土壤微生物多样性的影响
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作者 张翔 黄媛媛 +3 位作者 宋聪 贾振华 贾良良 宋水山 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第3期254-260,共7页
为了研究长期施加钾肥对小麦产量、氮磷钾吸收量以及小麦根际土壤微生物多样性的影响,利用高通量测序技术,对河北省农林科学院辛集市马兰农场钾肥定位试验田的8个小麦根际土壤样品进行测序,得到2组样品的微生物群落组成信息,结合河北省... 为了研究长期施加钾肥对小麦产量、氮磷钾吸收量以及小麦根际土壤微生物多样性的影响,利用高通量测序技术,对河北省农林科学院辛集市马兰农场钾肥定位试验田的8个小麦根际土壤样品进行测序,得到2组样品的微生物群落组成信息,结合河北省农林科学院资源环境研究所提供的小麦产量和品质数据,进行相关性分析。结果表明,在NP组(不施加钾肥)优势细菌菌群集中在疣微菌门(Verrucomicrobia),优势真菌菌群集中在毛壳菌科(Chaetomiaceae)、锥盖伞属(Conocybe)以及被孢霉目(Mortierellales)。而NPK组(施加钾肥)的优势细菌菌群集中在假诺卡氏菌科(Pseudonocardiaceae)、Terrimonas,优势真菌菌群集中在光柄菇科(Pluteaceae)、花褶伞属(Panaeolus)。在细菌属水平上,2组间差异较大的细菌菌属有15种,其中NP组显著增多的是Terrabacter、长绳菌属(Longilinea)、硝化螺旋菌属(Nitrospira)、狭义梭菌属(Clostridium sensu stricto)、Mangroviflexus、Rhizorhabdus、Tahibacter,而NPK组显著增多的是Methyloceanibacter、Terrimonas、德克斯氏菌属(Derxia)、伦茨氏菌属(Lentzea)、Chryseolinea、间孢囊菌属(Intrasporangium)、Maricaulis、纤维微杆菌属(Cellulosimicrobium)。在真菌属水平上,差异显著的只有NP组中较多的毛壳菌属(Chaetomium)和球腔菌属(Phaeosphaeria)。结合小麦产量和养分数据可以得出,钾肥可以提高小麦的产量和氮磷钾吸收量,而参与小麦吸收钾元素的菌群应该有Ohtaekwangia、Gp3、其他菌属和一些未知细菌菌属,以及毛球壳科的一个未知菌属(unclassified_Lasiosphaeriaceae)、未知真菌菌属(unclassified_Fungi)和地星科的一个未知菌属(unclassified_Geastraceae)等真菌菌属。 展开更多
关键词 钾肥 小麦根际土壤 微生物多样性 高通量测序 冗余分析
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传统发酵食品中基于微生物多样性的生物胺形成研究进展
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作者 隋雨萌 王慧平 +3 位作者 刘嘉琪 孔保华 秦立刚 陈倩 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2024年第2期356-363,共8页
传统发酵食品中微生物群落复杂,代谢途径多样,其中具有脱羧酶活性的微生物可代谢游离氨基酸形成潜在的危害因子—生物胺(biogenic amines,BAs)。BAs是一类具有生理活性的低分子碱性含氮化合物,主要由氨基酸脱羧酶脱羧产生。BAs根据其含... 传统发酵食品中微生物群落复杂,代谢途径多样,其中具有脱羧酶活性的微生物可代谢游离氨基酸形成潜在的危害因子—生物胺(biogenic amines,BAs)。BAs是一类具有生理活性的低分子碱性含氮化合物,主要由氨基酸脱羧酶脱羧产生。BAs根据其含氨量可分为单胺、二胺和多胺,根据其化学结构又可分为脂肪类胺、芳香类胺和杂环类胺,其主要形成途径包括微生物脱羧作用以及醛、酮氨基化和转胺作用。传统发酵食品中含有脱羧酶活性的乳酸菌、假单胞菌和肠杆菌等微生物是主要产胺菌。少量的BAs可以调节人体正常生理功能,但摄入过多则会导致中毒,甚至死亡。因此,传统发酵食品中的BAs问题一直备受关注。解析微生物多样性与BAs形成之间的关系,有利于探明发酵食品中BAs形成途径和机制,可以有效控制BAs的产生与积累,以期为提高传统发酵食品安全性及品质提供参考,保证食品安全。本文重点综述了发酵蔬菜、发酵豆制品、发酵乳制品、发酵肉制品以及发酵水产品等传统发酵食品中微生物多样性与BAs形成之间的相关性,明确了各种发酵食品中的主要产胺菌株,解析BAs形成机制,以期为提高传统发酵食品安全性及品质提供参考。 展开更多
关键词 发酵食品 微生物多样性 生物 形成机制 相关性
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混合菌剂对葡萄白粉病发生及叶际微生物多样性的影响
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作者 杜鸿燕 何涛 +5 位作者 陈吉越 胡祥 史亮涛 刘海刚 杨顺林 杜飞 《中外葡萄与葡萄酒》 北大核心 2024年第1期1-9,共9页
为明确常见杀菌剂及生防菌剂处理对葡萄白粉病发生及葡萄叶际微生物多样性的影响,进一步预测叶际微生物功能,采用随机取样法调查田间葡萄白粉病害,以Illumina高通量测序技术结合生物信息学分析了混合杀菌剂及生防菌剂处理的葡萄叶际微... 为明确常见杀菌剂及生防菌剂处理对葡萄白粉病发生及葡萄叶际微生物多样性的影响,进一步预测叶际微生物功能,采用随机取样法调查田间葡萄白粉病害,以Illumina高通量测序技术结合生物信息学分析了混合杀菌剂及生防菌剂处理的葡萄叶际微生物群落多样性差异,并结合PICRUSt2对微生物功能进行预测。结果表明,施用混合菌剂能显著降低白粉病的发生;混合菌剂处理后叶际细菌群落Chao1指数及Shannon指数分别下降了50.78%、48.57%;叶际真菌群落Chao1指数降低42.80%,Shannon指数增加了0.07。在门水平上,药剂处理后的优势细菌门为Firmicutes、Actinobacteriota,优势真菌门为Ascomycota和Basidiomycota;在属水平上,药剂处理后,相对丰度显著增加的细菌有Bacillus,真菌有Erysiphe和Aspergillus。葡萄叶际微生物群落功能预测,共评估了489条MetaCyc途径,以P<0.05、倍数变化FC>3进行筛选,共得到49条相关途径,其中有2条途径显著上调,47条显著下调,下调途径主要与葡萄核酸代谢、光呼吸、叶绿素、维生素合成等功能有关。 展开更多
关键词 葡萄 农药处理 微生物多样性 葡萄白粉病
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基于宏基因组技术分析自然发酵羊肉香肠中微生物多样性及挥发性风味功能基因
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作者 牛茵 吴双慧 +3 位作者 何济坤 蔡自建 尤天棋 陈娟 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第2期139-148,共10页
利用宏基因组技术测定自然发酵过程中羊肉香肠的微生物群落演替,并运用直系同源蛋白分组比对、京都基因与基因组百科全书和碳水化合物活性酶数据库对挥发性风味物质代谢途径、参与代谢的微生物和酶进行注释与分析。结果发现,羊肉香肠样... 利用宏基因组技术测定自然发酵过程中羊肉香肠的微生物群落演替,并运用直系同源蛋白分组比对、京都基因与基因组百科全书和碳水化合物活性酶数据库对挥发性风味物质代谢途径、参与代谢的微生物和酶进行注释与分析。结果发现,羊肉香肠样品中流感嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌、酒类酒球菌等是发酵过程的优势菌种,样品发酵至14d腐生葡萄球菌与马胃葡萄球菌相对丰度达到最大值(16.52%与10.53%)。在发酵0、5、14d和26d样品中,发酵5d样品注释到的基因数最多,发酵过程中碳水化合物代谢和氨基酸代谢是注释最多的代谢途径,糖苷水解酶与糖基转移酶是数量最多的碳水化合物酶。有167个基因参与氨基酸代谢所需酶的编码,碳水化合物代谢途径所需酶由217个基因编码,脂肪酸代谢途径中共有92个基因参与了相关酶的编码,参与3条代谢途径的酶注释到的微生物主要是葡萄球菌属、明串珠菌属、假单胞菌属、嗜冷杆菌属、弧菌属等,发酵14d样品中3条代谢途径的大部分酶丰度达到最大值。研究结果对于解析羊肉香肠中微生物的动态变化以及挥发性风味物质的形成机理具有重要的参考价值。 展开更多
关键词 羊肉香肠 宏基因组学 微生物多样性 挥发性风味物质 代谢途径 功能基因
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柴达木地区患根腐病枸杞根际土壤微生物多样性分析
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作者 方泰军 侯璐 白露超 《中国农业科技导报》 CSCD 北大核心 2024年第1期133-139,共7页
为了解枸杞受根腐病菌侵染后植株根组织与根际土壤中真菌与细菌群落结构以及多样性,采用高通量测序技术对柴达木地区患根腐病枸杞的根组织和根际土壤样本进行分析。结果表明,根际土壤中的细菌群落丰度略高于根组织,而真菌多样性和丰度... 为了解枸杞受根腐病菌侵染后植株根组织与根际土壤中真菌与细菌群落结构以及多样性,采用高通量测序技术对柴达木地区患根腐病枸杞的根组织和根际土壤样本进行分析。结果表明,根际土壤中的细菌群落丰度略高于根组织,而真菌多样性和丰度在根际土壤和根组织样本中无显著差异。在门水平,细菌群落中变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)的相对丰度较高,真菌群落中子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)的相对丰度较高;在属水平,细菌中以假单胞菌(Pseudomonas)为主,真菌中以枝孢属(Cladosporium)和被孢霉属(Mortierella)为主。相关性分析显示,细菌群落在根组织和根际土壤样本中差异较大,而真菌群落在根组织和根际土壤样本间相关性较高;枝孢属(Cladosporium)和被孢霉属(Mortierella)的相对丰度在根组织和根际土壤中均显著上调,初步推测这2属真菌可能与枸杞根腐病发病相关。 展开更多
关键词 枸杞 根腐病 高通量测序 微生物多样性
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伴生栽培对主栽番茄植株根际土壤肥力及微生物多样性的影响
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作者 杨妲 庞师婵 +2 位作者 李祖健 宋静静 杨尚东 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期22-30,共9页
为探究伴生不同作物对主栽番茄根际土壤肥力与健康影响的作用机制,设置番茄伴生生菜、苋菜、菜心、薄荷和葱的栽培模式,基于高通量测序技术分析伴生不同作物栽培模式下主栽番茄根际土壤肥力及细菌、真菌多样性。结果显示:除菜心外,其他... 为探究伴生不同作物对主栽番茄根际土壤肥力与健康影响的作用机制,设置番茄伴生生菜、苋菜、菜心、薄荷和葱的栽培模式,基于高通量测序技术分析伴生不同作物栽培模式下主栽番茄根际土壤肥力及细菌、真菌多样性。结果显示:除菜心外,其他4种伴生作物均显著提高了主栽番茄植株根际土壤中涉及氮、磷循环的土壤酶活性以及微生物生物量碳、氮、磷;伴生栽培虽然没有丰富主栽番茄植株根际土壤中细菌、真菌多样性,但改变了主栽番茄植株根际土壤细菌、真菌优势门属间的丰度占比;门分类水平下,伴生管理均提高了变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、Patescibacteria细菌的丰度占比;属分类水平下,norank f Microscillace⁃ae、norank f norank o Vicinamibacterales、芽孢杆菌属(Bacillus)、norank f Gemmatimonadaceae、交替赤杆菌属(Altererythrobacter)细菌是番茄伴生不同作物中丰度占比前10的特有优势细菌属。此外,伴生栽培不同程度地改变了主栽番茄植株根际土壤真菌多样性和丰富度,富集了壶菌门、担子菌门和油壶菌门优势真菌门;同时富集了unclassified o Sordariales、油壶菌属(Olpidium)和锥盖伞属(Conocybe)、Phialemonium、unclassified o Pleosporales、unclassified o Boletales和Sodiomyces属等优势真菌属,亦提高了毛壳菌属(Chaetomium)的丰度占比。研究结果表明,番茄伴生栽培生菜、苋菜、薄荷和葱4种植物均同程度地有助于不提高番茄根际土壤肥力和维护根际微环境土壤健康的作用,其中,伴生栽培生菜和薄荷提升土壤肥力及维护土壤健康的效果优于伴生菜心、苋菜和葱。 展开更多
关键词 番茄 伴生栽培 根际 土壤肥力 微生物多样性
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蒲公英水提物对热应激条件下奶牛产奶性能、血清生化指标、乳中体细胞数及粪便微生物多样性的影响
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作者 李赵嘉 孟然 +6 位作者 杨文娇 冯薇 李名雪 陈志颖 王秀萍 毛立娟 陈娜 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期1003-1019,共17页
本试验旨在研究蒲公英水提物(DWE)对热应激条件下奶牛产奶性能、血清生化指标、乳中体细胞数(SCC)及粪便微生物多样性的影响,探究奶牛饲粮中适宜的蒲公英水提物添加水平。试验选用120头泌乳日龄、体重、胎次、产奶量均相近的产奶期荷斯... 本试验旨在研究蒲公英水提物(DWE)对热应激条件下奶牛产奶性能、血清生化指标、乳中体细胞数(SCC)及粪便微生物多样性的影响,探究奶牛饲粮中适宜的蒲公英水提物添加水平。试验选用120头泌乳日龄、体重、胎次、产奶量均相近的产奶期荷斯坦奶牛,采用完全随机试验设计原则分为3组,每组5个重复,每个重复8头牛。对照组(DZ组)饲喂基础饲粮,试验组分别在基础饲粮中添加50(DWE_(50)组)和70 g/(头·d)(DWE70组)的蒲公英水提物。预试期3 d,正试期28 d。结果表明:1)正试期内,牛舍日平均温湿度指数(THI)>72,表明试验奶牛均处于热应激状态。2)与DZ组相比,DWE_(50)组、DWE70组的第14、21、28天时产奶量显著增加(P<0.05);DWE_(50)组的第21、28天乳蛋白率显著增加(P<0.05),第28天乳脂率显著增加(P<0.05);DWE70组的第7、14、21、28天乳蛋白率显著增加(P<0.05),第14、21、28天乳脂率显著增加(P<0.05)。3)第28天,与DZ组相比,DWE_(50)组的血清谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性和总抗氧化能力(T-AOC)显著升高(P<0.05),DWE70组的血清超氧化物歧化酶(SOD)、GSH-Px活性及T-AOC显著升高(P<0.05),DWE_(50)组、DWE70组的血清丙二醛(MDA)含量显著降低(P<0.05)。4)第28天,与DZ组相比,DWE_(50)组的血清免疫球蛋白G(IgG)含量显著升高(P<0.05),DWE70组的血清球蛋白(GLB)含量著升高(P<0.05)。5)与DZ组相比,DWE_(50)组、DWE70组的乳中SCC均呈下降趋势,DWE70组的乳中SCC下降较为迅速,且第28天乳中SCC更低。6)在门水平上,各组粪便优势菌门均为拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes);在属水平上,各组粪便相对丰度最大菌属均为拟杆菌属(Bacteroides)。线性判别分析效应大小(LEfSe)分析结果显示,DWE70组较其他组具有显著差异的物种更多,主要为梭状芽孢杆菌纲(Clostridia)、梭状芽孢杆菌目(Clostridiales)、厚壁菌门等。综上所述,饲粮中添加蒲公英水提物可提高奶牛产奶量、乳蛋白率、乳脂率,降低乳中SCC,增加粪便微生物多样性及相对丰度,正向调节机体抗氧化能力和免疫功能。 展开更多
关键词 蒲公英水提物 产奶性能 抗氧化能力 免疫功能 体细胞数 粪便微生物多样性
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缓控释肥处理下油橄榄土壤微生物多样性特征分析
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作者 秃玉翔 胡青 +6 位作者 辛培尧 陆斌 郭永清 赵敏 郝佳波 赵川 徐亮 《西部林业科学》 CAS 北大核心 2024年第1期145-155,162,共12页
为了探究油橄榄健康施肥和实现土壤可持续化经营管理提供理论和实践依据,采用Illumina Miseq高通量测序技术对不同缓释肥处理下的油橄榄种植地0~10 cm和10~20 cm土层土壤微生物多样性及群落特征进行研究。结果显示:(1)细菌OUT隶属于35门... 为了探究油橄榄健康施肥和实现土壤可持续化经营管理提供理论和实践依据,采用Illumina Miseq高通量测序技术对不同缓释肥处理下的油橄榄种植地0~10 cm和10~20 cm土层土壤微生物多样性及群落特征进行研究。结果显示:(1)细菌OUT隶属于35门111纲268目485科1087属;真菌OUT隶属14门42纲95目230科431属。(2)变形菌门、放线菌门、酸杆菌门、厚壁菌门、绿弯菌门和芽单胞菌门为优势细菌门,子囊菌门、担子菌门和被包霉门为优势真菌门;假单胞菌属、67-14、索利红杆菌属、Subgroup_6和红色杆菌属为优势细菌属,镰刀菌属、无茎真菌属、瓶毛壳属、小囊菌属和葡孢霉属为优势真菌属。(3)施肥处理能明显促进土壤中0~20 cm土层的真菌和0~10 cm土层的细菌生长,而抑制10~20 cm细菌生长。(4)细菌和真菌群落分布与土层相关性较小;各个处理下土壤细菌群落结构差异不明显,而真菌则存在明显差异。研究表明,施用缓控释肥能够有效增加土壤中微生物多样性,尤其是混合施肥效果更明显,6 kg半焦肥+8颗力浮丸的组合可作为生产实践中的优选参考方案。 展开更多
关键词 油橄榄 缓控释肥 微生物群落结构 微生物多样性
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不同药用植物根际土壤原核微生物多样性研究
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作者 李运涛 孟忠祥 +3 位作者 董晋 苏佳铭 李欢 吕超田 《微生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期90-99,共10页
为研究不同药用植物根际土壤中的原核微生物多样性,分别采集白术(Atractylodes macrocephala)、白芍(Paeonia sterniana)、牡丹(Paeonia suffruticosa)、玄参(Scrophularia ningpoensis)四种药用植物的根际土壤以及非种植区的土壤,针对1... 为研究不同药用植物根际土壤中的原核微生物多样性,分别采集白术(Atractylodes macrocephala)、白芍(Paeonia sterniana)、牡丹(Paeonia suffruticosa)、玄参(Scrophularia ningpoensis)四种药用植物的根际土壤以及非种植区的土壤,针对16S rRNA基因的V3~V4区进行测序,分析土壤细菌群落的组成。结果表明,药用植物根际土壤中的细菌群落多样性指数显著高于非种植区土壤。五组样本的优势类群差异不大,总体相对丰度较高的有变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、绿弯菌门(Chloroflexi)等,药用植物根际中的放线菌相对丰度高于非种植区。属水平上四种药用植物根际细菌和非种植区的群落结构有较大差异,四种中药材的根际土壤中各自富集了特异性的有益细菌属。药用植物根际土壤中的NMD1、Dongia、Gaiella、Streptomyces等相对丰度高于非种植区,而非种植区土壤中Lysobacter相对丰度显著高于药用植物。此外,四种中药材的根际土壤中硝酸盐还原和芳香族化合物降解功能被富集。 展开更多
关键词 药用植物 微生物多样性 高通量测序 根际土壤 原核微生物
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白酒糟与脐橙渣混合青贮品质与微生物多样性的研究
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作者 张强 雷小文 +3 位作者 连海 施小生 黄志文 钟云平 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1456-1465,共10页
【目的】通过研究白酒糟与脐橙渣混合青贮的品质和微生物多样性,探究白酒糟和脐橙渣混合青贮的最适比例。【方法】试验所用白酒糟粗蛋白质含量为15.05%,脐橙渣可溶性碳水化合物含量为24.29%。设置白酒糟与脐橙渣7个比例(10∶0、9∶1、7... 【目的】通过研究白酒糟与脐橙渣混合青贮的品质和微生物多样性,探究白酒糟和脐橙渣混合青贮的最适比例。【方法】试验所用白酒糟粗蛋白质含量为15.05%,脐橙渣可溶性碳水化合物含量为24.29%。设置白酒糟与脐橙渣7个比例(10∶0、9∶1、7∶3、5∶5、3∶7、1∶9、0∶10)混贮试验组,每组6个重复,每个重复3 kg,青贮60 d后测定营养成分、发酵品质及微生物多样性等指标。【结果】白酒糟与脐橙渣混合青贮的发酵品质测定结果显示,各组pH均低于4.2。其中,7∶3和5∶5组的pH最低,且显著低于10∶0和0∶10组(P<0.05),且其乳酸含量最高,也显著高于这两组(P<0.05);9∶1和7∶3组的丙酸含量显著低于0∶10组(P<0.05),且未检测到丁酸;从混合青贮比例达到7∶3开始,各组青贮氨态氮含量显著低于10∶0组(P<0.05)。微生物丰度测定结果显示,7∶3和5∶5组的乳植物杆菌属、伴生乳杆菌属、乳杆菌属、黏液乳杆菌属、促生乳杆菌属等5种乳杆菌属总含量显著高于10∶0组(P<0.05),7∶3组的芽孢杆菌属丰度显著高于0∶10组(P<0.05),9∶1、7∶3、5∶5和3∶7组假单胞菌属丰度显著低于0∶10组(P<0.05)。【结论】白酒糟∶脐橙渣为7∶3混合青贮时,发酵品质和青贮微生物多样性均较优,为最适混贮比例。 展开更多
关键词 白酒糟 脐橙渣 青贮品质 微生物多样性
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氮添加和水分改变对亚热带人工林红壤微生物多样性及群落组成的影响
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作者 孙浩钊 刘桂珍 +4 位作者 朱玉璘 林雪萍 郭豪 钱笑杰 方熊 《生态科学》 CSCD 北大核心 2024年第1期94-104,共11页
氮沉降加剧与全球降雨格局改变是全球变化的重要特征,外源氮素的输入及土壤水分条件的变化势必会影响土壤微生物的多样性和群落组成,进而影响地球化学过程。运用Illumina Miseq高通量测序技术,研究氮添加、水分改变及二者交互作用对亚... 氮沉降加剧与全球降雨格局改变是全球变化的重要特征,外源氮素的输入及土壤水分条件的变化势必会影响土壤微生物的多样性和群落组成,进而影响地球化学过程。运用Illumina Miseq高通量测序技术,研究氮添加、水分改变及二者交互作用对亚热带人工林红壤细菌、真菌多样性、群落组成的影响及其与土壤理化因子间的关系。结果表明:土壤细菌多样性随水分含量的降低而减少,且氮添加增强了这一抑制作用。施氮后中水分处理土壤真菌Shannon指数显著高于低水分处理。氮添加显著降低Acidobacteria的相对丰度,增加Actinobacteria、Bacteroidetes的相对丰度。土壤Acidobacteria、Bacteroidetes的相对丰度随土壤含水量的升高而增加,Actinobacteria、Firmicutes则相反。干旱加剧了氮添加对Acidobacteria相对丰度的抑制作用,氮水交互处理显著影响Cyanobacteria的相对丰度。而氮添加、土壤水分及二者交互作用对土壤真菌群落组成均无显著影响。冗余分析表明土壤细菌群落组成的变化与土壤含水量、pH、NO_(3)^(–)-N含量、TN含量显著相关,分别解释了土壤细菌群落组成变化的65.6%、26.1%、21.5%、20.7%。研究表明氮添加会改变干旱对土壤细菌多样性和群落组成的影响的强度和方向。 展开更多
关键词 氮沉降 土壤含水量 微生物多样性 微生物群落组成
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无菌检查中污染微生物多样性分析及数据偏差调查
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作者 王璐 向东 +2 位作者 张艳 刘勤 徐帆 《中国药业》 CAS 2024年第8期67-70,共4页
目的对无菌检查中污染微生物进行多样性分析及数据偏差调查。方法以曲安奈德注射液为例,按2020年版《中国药典》方法进行无菌检查,对污染微生物分离纯化后进行生化鉴定及基于16SrRNA的微生物多样性分析,与实验环境中的环境菌库进行比较... 目的对无菌检查中污染微生物进行多样性分析及数据偏差调查。方法以曲安奈德注射液为例,按2020年版《中国药典》方法进行无菌检查,对污染微生物分离纯化后进行生化鉴定及基于16SrRNA的微生物多样性分析,与实验环境中的环境菌库进行比较并溯源,同时进行微生物数据检查偏差数据调查(MDD)。结果样品中检出表皮葡萄球菌、克式柠檬酸杆菌、唾液链球菌,且均在试验环境菌库39株环境菌中。MDD结果表明,样品中污染的微生物是由操作人员未完全按无菌隔离器使用的标准操作规程进行规范操作而导致的。即样品中污染的微生物来源于环境,而非样品本身,试验结果无效,应重试。结论对无菌检查中污染微生物进行溯源及数据偏差调查,可确认其阳性结果的准确性。 展开更多
关键词 无菌检查 曲安奈德注射液 细菌 生化鉴定 微生物多样性 溯源 偏差数据调查
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不同发酵剂对玉米秸秆发酵品质及微生物多样性的影响
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作者 佘龙 《粮食与饲料工业》 CAS 2024年第1期56-58,64,共4页
以玉米秸秆发酵为研究对象,采用试验对比的方式,在玉米秸秆发酵过程中添加不同发酵剂,并重点探究复合发酵剂对玉米秸秆发酵品质及微生物多样性的影响。与空白试验组对比,分析发酵玉米秸秆的营养成分含量、发酵品质和微生物多样性。结果... 以玉米秸秆发酵为研究对象,采用试验对比的方式,在玉米秸秆发酵过程中添加不同发酵剂,并重点探究复合发酵剂对玉米秸秆发酵品质及微生物多样性的影响。与空白试验组对比,分析发酵玉米秸秆的营养成分含量、发酵品质和微生物多样性。结果表明:与空白试验组比较,掺入发酵剂后玉米秸秆发酵品质均有所提高,且添加的发酵剂种类越多,发酵后的玉米秸秆中微生物多样性越丰富。 展开更多
关键词 玉米秸秆 发酵剂 发酵品质 微生物多样性 复合发酵 植物乳酸菌
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基于高通量测序分析建曲发酵过程中微生物多样性变化
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作者 谭斯尹 潘礼业 +4 位作者 罗宇琴 李国卫 陈向东 孙冬梅 张军 《中国现代中药》 CAS 2024年第1期104-112,共9页
目的:明确建曲在发酵过程中微生物种类、优势类群的组成和功能特征的变化。方法:通过高通量测序技术对建曲不同发酵时间点的细菌和真菌群落结构和功能进行分析。结果:建曲发酵过程中,真菌的优势类群为曲霉菌属(Aspergillus, 36.57%),其... 目的:明确建曲在发酵过程中微生物种类、优势类群的组成和功能特征的变化。方法:通过高通量测序技术对建曲不同发酵时间点的细菌和真菌群落结构和功能进行分析。结果:建曲发酵过程中,真菌的优势类群为曲霉菌属(Aspergillus, 36.57%),其中溜曲霉(Aspergillus tamarii, 22.30%)和小菌核曲霉(Aspergillus minisclerotigenes,21.19%)为发酵后的优势菌种。细菌由红串红球菌(Rhodococcus erythropolis,29.56%)和类肠膜魏斯菌(Weissella paramesenteroides,25.24%)先后成为优势类群。在整个发酵过程中,建曲的优势菌群均出现明显的变化,反映了建曲发酵过程中存在清晰的群落演替。功能预测分析显示,建曲中存在丰富的与代谢途径相关的真菌和细菌功能基因,且不同发酵时间点微生物发挥的功能也不同。结论:建曲发酵后的真菌主要为溜曲霉和小菌核曲霉,细菌主要为红串红球菌和类肠膜魏斯菌,不同发酵时间点其菌群相对丰度和功能有所不同,为后续建立稳定可控的建曲现代发酵工艺提供参考依据。 展开更多
关键词 建曲 发酵 高通量测序 微生物多样性
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黄河麦春季制曲过程微生物多样性的分析研究
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作者 许玲 董乔娟 +3 位作者 姜明慧 王洋 白秀彬 赵纪文 《酿酒科技》 2024年第2期25-29,34,共6页
运用高通量测序技术,解析了黄河流域国井白酒中高温大曲春季发酵过程的微生物群落结构,以及微生物菌群结构与生产操作的相关性,初步明确了不同工艺阶段的关键微生物种类,为进一步优化操作,提升大曲质量提供了参考依据。
关键词 黄河麦 春季制曲 微生物多样性
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基于高通量测序的海州湾沉积物中微生物多样性分析
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作者 顾颖 伏光辉 +3 位作者 王亚东 叶仁智 卢璐 孙苗苗 《南方农业》 2024年第3期1-5,26,F0003,共7页
为探究海州湾浅海域沉积物中微生物群落结构的组成及差异性,选取6个点位的沉积物样品,采用高通量测序技术对沉积物微生物群落结构的组成进行分析。结果表明,海州湾6个点位沉积物样品中微生物群落结构组成存在差异。6个采样点共发现2 851... 为探究海州湾浅海域沉积物中微生物群落结构的组成及差异性,选取6个点位的沉积物样品,采用高通量测序技术对沉积物微生物群落结构的组成进行分析。结果表明,海州湾6个点位沉积物样品中微生物群落结构组成存在差异。6个采样点共发现2 851个OUTs,分属于31门74纲116目199科331属;在门水平上,海州湾水域沉积物的主要优势菌群为变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、放线菌门(Actinobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)和硬壁菌门(Firmicutes)等。其中,6个点位沉积物样品中微生物群落丰度最高的优势菌门均为变形菌门。共现网络分析结果表明,变形菌门、绿弯菌门、酸杆菌门和放线菌门是对共现网络结构有重要作用的中心节点微生物,在群落结构和多样组成中具有重要作用。此外,FAPROTAX功能预测发现海州湾沉积物中微生物主要参与硫循环、碳循环和氮循环等海洋生物地球化学过程。 展开更多
关键词 沉积物 微生物多样性 高通量测序 海州湾
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异常毕赤酵母和纤维素酶对甜高粱青贮质量及微生物多样性的影响 被引量:1
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作者 任海伟 黎金莲 +5 位作者 南亭植 卢娜娜 郭晓鹏 陆栋 刘瑞媛 张丙云 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期4011-4027,共17页
本试验旨在探究添加异常毕赤酵母和纤维素酶对甜高粱青贮质量及微生物多样性的动态影响,并采用隶属函数法对青贮质量进行综合评价,以筛选适宜添加剂。试验设置纤维素酶组(CE组)、异常毕赤酵母组(PA组)、异常毕赤酵母+纤维素酶组(PC组)3... 本试验旨在探究添加异常毕赤酵母和纤维素酶对甜高粱青贮质量及微生物多样性的动态影响,并采用隶属函数法对青贮质量进行综合评价,以筛选适宜添加剂。试验设置纤维素酶组(CE组)、异常毕赤酵母组(PA组)、异常毕赤酵母+纤维素酶组(PC组)3个添加剂组和1个空白对照组(CK组),分别于青贮第7、14和21天时对其感官质量、常规营养成分含量、发酵品质以及微生物群落结构进行分析。结果表明:1)3个添加剂组酸性洗涤纤维和中性洗涤纤维含量在青贮第21天时均显著低于CK组(P<0.05),相对饲喂价值显著高于CK组(P<0.05)。PA组在青贮第21天时可溶性碳水化合物、粗蛋白质和淀粉含量均显著高于其他3个组(P<0.05),主要营养成分保存良好。2)整个青贮过程中,4个组pH、氨态氮/总氮值以及有机酸组成和含量均处于优良青贮范围。基于隶属函数法分析发现,青贮第21天时PA组隶属函数值平均值最高,青贮质量综合评价效果最好。3)4个组在属水平上的微生物群落包含泛菌属(Pantoea)、明串珠菌属(Leuconostoc)和肠杆菌属(Enterobacter)以及少量乳杆菌属(Lactobacillus)、沙雷氏菌属(Serratia)、片球菌属(Pediococcus)和葡糖杆菌属(Gluconobacter)等28个属。PA组在整个青贮期间乳杆菌属、明串珠菌属、片球菌属、魏斯氏菌属(Weissella)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)和肠球菌属(Enterococcus)等6种乳酸菌总相对丰度为19.05%~23.61%,同时含有较高相对丰度的泛菌属和葡糖杆菌属,通过优化细菌群落结构形成了一种新的稳定的青贮微生态体系。综上所述,添加异常毕赤酵母可以明显改善甜高粱的青贮质量,有望成为一种经济高效且适用于甜高粱的专用青贮添加剂。 展开更多
关键词 甜高粱 异常毕赤酵母 纤维素酶 青贮质量 微生物多样性
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发酵甜菜渣对断奶仔猪生长性能、血液生化与免疫指标和肠道微生物多样性的影响 被引量:3
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作者 敖维平 程梦 +4 位作者 陈颜旭 孙继鹏 张春雷 赵先乐 周波 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期247-253,共7页
试验旨在研究仔猪饲粮中添加发酵甜菜渣对仔猪生长性能及肠道菌群结构的影响。选择同批次120头28~32日龄、平均体重为(9.96±0.13)kg的杜×长×大断奶仔猪(公母各半),随机分成2组,每组5个重复(栏),每栏12头猪,试验期28 d。... 试验旨在研究仔猪饲粮中添加发酵甜菜渣对仔猪生长性能及肠道菌群结构的影响。选择同批次120头28~32日龄、平均体重为(9.96±0.13)kg的杜×长×大断奶仔猪(公母各半),随机分成2组,每组5个重复(栏),每栏12头猪,试验期28 d。对照组饲喂基础日粮,发酵甜菜渣组用发酵甜菜渣等量(以干物质为基础)替代基础日粮中5.26%玉米。结果表明:与对照组相比,发酵甜菜渣组断奶仔猪的末重增加6.61%(P<0.05),但日增重差异不显著;发酵甜菜渣组仔猪的血浆白蛋白浓度提高了28.31%(P<0.05),血浆谷草转氨酶、尿素氮和丙二醛浓度分别降低了27.74%、12.20%和46.90%(P<0.05);仔猪血浆IgA和IgG的含量在组间没有显著差异;直肠微生物16S rRNA基因测序发现,对照组肠道微生物特有OUT有79个,发酵甜菜渣组特有OUT为74个,2组Alpha多样性指数差异不显著,但发酵甜菜渣组肠道厚壁菌门相对丰度高于对照组(P<0.05)。另外,成本计算发现发酵甜菜渣组仔猪的单位增重成本比对照组减少了0.21元/kg。本试验条件下,发酵甜菜渣替代饲粮中部分玉米(5.26%)对断奶仔猪增重无负面影响,对血浆IgA、IgG含量和肠道微生物Alpha多样性影响不显著,但可提高仔猪抗氧化能力,增加肠道厚壁菌门相对丰度,降低饲养成本。 展开更多
关键词 甜菜渣 发酵 断奶仔猪 抗氧化指标 肠道微生物多样性
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