微生物次级代谢产物多样性发掘方法 被引量：2

1

作者 方岫琴 王文璟 +5 位作者 李华东 张晓婷 朱天骄 车茜 李德海 张国建 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期415-426,共12页

微生物次级代谢产物是微生物在生长过程中产生的非必需性代谢产物,其往往具有独特的生物活性。随着对微生物次级代谢产物多样性研究的不断深入开展,研究者逐渐发现在实验室的常规培养条件下微生物的代谢潜能不能完全被激发,从中可获得... 微生物次级代谢产物是微生物在生长过程中产生的非必需性代谢产物,其往往具有独特的生物活性。随着对微生物次级代谢产物多样性研究的不断深入开展,研究者逐渐发现在实验室的常规培养条件下微生物的代谢潜能不能完全被激发,从中可获得的天然产物结构类型远远少于其代谢潜能所决定的数量。近年来,随着基因组技术、分子生物学技术特别是合成生物学相关技术的发展,研究人员开发了如OSMAC、表观遗传、异源表达等多种方法,从多个角度多层次地发掘次级代谢产物多样性。这些方法有效激活潜在的生物合成基因簇、提高了微生物次级代谢产物多样性,加之与高通量筛选方法联合应用,能够显著改善了微生物活性天然产物的发现效率。本文综述了微生物次级代谢潜能的激活以及代谢产物高效筛选的方法和技术,为提高微生物次级代谢产物多样性发掘,加快先导化合物的发现提供参考。 展开更多

关键词 微生物次级代谢产物 沉默基因簇 代谢潜能 激活 结构多样性

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微生物次级代谢产物生物合成基因簇与药物创新 被引量：35

2

作者 白林泉 邓子新 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期80-86,99,共8页

微生物产生众多结构和生物活性多样的次级代谢产物,其生物合成基因簇的克隆是药物创新和产量提高的必要前提。迄今为止已有超过150种生物合成基因簇通过各种方式被克隆,并被用于组合生物合成、体外糖类随机化、代谢工程的定向改造。我... 微生物产生众多结构和生物活性多样的次级代谢产物,其生物合成基因簇的克隆是药物创新和产量提高的必要前提。迄今为止已有超过150种生物合成基因簇通过各种方式被克隆,并被用于组合生物合成、体外糖类随机化、代谢工程的定向改造。我们研究室已经克隆并测定了氨基糖苷类井冈霉素/有效霉素、多烯类抗生素FR-008/克念菌素、聚醚类南昌霉素、聚酮类梅岭霉素、杂合聚酮-多肽类口恶唑霉素等生物合成基因簇。深入的基因功能分析揭示了他们独特的生物合成途径和调节机理,为正在进行的组合生物合成结构改造和代谢工程产量提高奠定了基础。 展开更多

关键词 微生物次级代谢产物 生物合成基因簇 药物创新 组合生物合成 代谢工程

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污水生物处理中微生物次级代谢产物的研究进展 被引量：7

3

作者 王金翠 孙宝盛 《给水排水》 CSCD 北大核心 2007年第S1期165-169,共5页

就污水生物处理过程中微生物次级代谢产物的生成特性及其影响的研究进行了综述。溶解性微生物产物和胞外聚合物是污水生物处理工艺过程中微生物次级代谢的主要产物,其相对分子质量分布、生物可降解性、螯合性、毒性等能说明生物处理系... 就污水生物处理过程中微生物次级代谢产物的生成特性及其影响的研究进行了综述。溶解性微生物产物和胞外聚合物是污水生物处理工艺过程中微生物次级代谢的主要产物,其相对分子质量分布、生物可降解性、螯合性、毒性等能说明生物处理系统的整体运行状况;而进水浓度、SRT、HRT、OLR(有机负荷率)等系统运行参数也影响微生物次级代谢产物的生成与性质。目前,有关污水生物处理中微生物次级代谢产物的研究还很不完善,很多问题有待进一步研究。 展开更多

关键词 污水生物处理 微生物次级代谢产物 溶解性微生物产物 胞外聚合物 运行参数

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激活沉默基因簇发掘微生物次级代谢产物的研究进展 被引量：7

4

作者 杨康敏 高向东 顾觉奋 《中国医药生物技术》 2015年第1期77-80,共4页

天然产物是指动物、植物、昆虫、海洋生物和微生物体内的组成成分或其代谢产物以及人和动物体内许许多多内源性的化学成分的总称。在医药产业，天然产物已是新药的重要来源之一，新的化学单体中，40%以上都由天然产物衍生而来，而天然... 天然产物是指动物、植物、昆虫、海洋生物和微生物体内的组成成分或其代谢产物以及人和动物体内许许多多内源性的化学成分的总称。在医药产业，天然产物已是新药的重要来源之一，新的化学单体中，40%以上都由天然产物衍生而来，而天然产物多数是由微生物的次级代谢过程产生[1]。自20世纪70年代以来，尽管人们对治疗传染性疾病和癌症的药物需求越来越多，但是，发现新的活性天然产物的速度却在不断下降，传统方法已很难获得新的次级代谢产物。如今的 DNA测序技术已经能够快速、方便地检测大量基因组序列。 展开更多

关键词 微生物次级代谢产物 活性天然产物 基因簇 DNA测序技术 发掘 激活 化学成分 动物体内

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微生物次级代谢产物及其在肥料中的应用 被引量：3

5

作者 马志明 武良 高璐阳 《肥料与健康》 CAS 2022年第3期1-6,共6页

微生物次级代谢产物在改良土壤结构、提升土壤肥力、提高作物产量和改善作物品质等方面有重要作用。概述了微生物次级代谢产物的概念、来源及其作用,介绍了微生物次级代谢产物在细菌肥料、放线菌肥料和真菌肥料中的应用,分析了微生物次... 微生物次级代谢产物在改良土壤结构、提升土壤肥力、提高作物产量和改善作物品质等方面有重要作用。概述了微生物次级代谢产物的概念、来源及其作用,介绍了微生物次级代谢产物在细菌肥料、放线菌肥料和真菌肥料中的应用,分析了微生物次级代谢产物与肥料复配生产及使用过程中需注意的事项。针对微生物功能性肥料在开发、推广和应用中存在的问题,提出了应采取的措施,并对新型功能性肥料产业的发展进行了展望。 展开更多

关键词 微生物次级代谢产物 功能性肥料 复配 应用 展望

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电子圆二色谱技术在微生物次级代谢产物结构研究中的应用研究进展

6

作者 陈宁 武艺 +2 位作者 刘冰 许颖 季宇彬 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期3699-3708,共10页

微生物次级代谢产物的化学结构十分复杂,对其绝对构型的确定十分困难。近年来,电子圆二色谱(electronic circular dichroism,ECD)由于其用量少、精度高等优点,在测定绝对构型方面的应用越来越多,已经成为研究微生物次级代谢产物结构的... 微生物次级代谢产物的化学结构十分复杂,对其绝对构型的确定十分困难。近年来,电子圆二色谱(electronic circular dichroism,ECD)由于其用量少、精度高等优点,在测定绝对构型方面的应用越来越多,已经成为研究微生物次级代谢产物结构的重要方法。本文就电子圆二色谱在微生物次级代谢产物结构研究中的应用进行综述,以期为今后的研究奠定基础。 展开更多

关键词 微生物次级代谢产物 绝对构型 电子圆二色谱

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单菌多次级代谢产物方法及其在微生物代谢产物研究中的应用 被引量：21

7

作者 韦洪娟 林贞建 +2 位作者 李德海 顾谦群 朱天骄 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期701-709,共9页

微生物次级代谢产物的结构多样性赋予其广泛的生物活性,是药物先导化合物的重要来源。然而传统单一的培养方法,使微生物中大量的代谢途径不能被表达,以至于许多代谢产物不能产生。因此,运用各种技术和方法激活这些沉默途径,获得结构多... 微生物次级代谢产物的结构多样性赋予其广泛的生物活性,是药物先导化合物的重要来源。然而传统单一的培养方法,使微生物中大量的代谢途径不能被表达,以至于许多代谢产物不能产生。因此,运用各种技术和方法激活这些沉默途径,获得结构多样的代谢产物已成为目前关注的热点。单菌多次级代谢产物(Onestrainmany compounds,OSMAC)策略作为一种简便有效的研究手段,已成功应用于该领域的研究。本文综述了OSMAC策略中常用的研究手段(包括改变培养状态、混合培养及添加酶抑制剂等),以及OSMAC与基因组扫描技术相结合的研究进展,并介绍了本研究室利用此方法对高产细胞松弛素的海洋来源真菌曲丽穗霉(Spicaria elegans KLA03)进行研究的部分结果。 展开更多

关键词 一株菌多种次级代谢产物(One STRAIN MANY compounds OSMAC) 微生物次级代谢产物 混合培养 基因组扫描

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人高密度脂蛋白受体CLA-1表达上调剂4776B和4776C的分离、结构鉴定及生物活性研究 被引量：1

8

作者 杨媛 张忠兵 +5 位作者 姜威 樊秀勇 王旻 张月琴 洪斌 司书毅 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期268-272,276,共6页

目的从微生物代谢产物中筛选和分离能够上调人高密度脂蛋白受体(CLA-1)表达的新型活性化合物。方法应用本实验室已经建立的CLA-1表达上调剂的高通量筛选模型,从6000多株微生物中筛选出8株能使CLA-1表达上调的阳性菌株。对其中一株阳性... 目的从微生物代谢产物中筛选和分离能够上调人高密度脂蛋白受体(CLA-1)表达的新型活性化合物。方法应用本实验室已经建立的CLA-1表达上调剂的高通量筛选模型,从6000多株微生物中筛选出8株能使CLA-1表达上调的阳性菌株。对其中一株阳性菌株放线菌04-4776发酵产物的活性成分进行活性跟踪分离纯化,从中获得CLA-1表达上调的化合物4776B和4776C,并测定了化合物的理化特性和波谱学数据及相关的生物活性。结果通过理化性质、质谱、紫外和核磁等波谱学数据的分析,确定了化合物4776B和4776C的结构;4776B和4776C对CLA-1的上调率分别在2.08和3.26μm ol/L时达到最大,与对照相比分别上调了60%和78%。结论放线菌04-4776产生的两个活性化合物分别与文献报道的红车轴草素和(9R,13S)-7-脱氧-13-二氢道诺霉素酮结构一致;两个化合物均具有强的上调CLA-1的表达活性,属首次报道。 展开更多

关键词 人高密度脂蛋白受体 上调剂 高通量筛选 微生物次级代谢产物

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脂肽类生物表面活性剂的研究进展 被引量：15

9

作者 李俊峰 刘丽 《化学与生物工程》 CAS 2015年第1期12-15,共4页

脂肽类生物表面活性剂是一类由微生物产生的次级代谢产物,具有独特的化学结构,表现出优良的表面活性和生理特性。简介了脂肽类生物表面活性剂的产生菌及其种类,重点介绍了海洋微生物所产的脂肽类表面活性剂,并展望了其研究前景。

关键词 脂肽 生物表面活性剂 微生物产次级代谢产物

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人高密度脂蛋白受体CLA-1上调剂9179D的分离、结构鉴定和活性研究 被引量：8

10

作者 徐扬 许艳妮 +3 位作者 巫晔翔 余利岩 洪斌 司书毅 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期377-382,共6页

目的从微生物代谢产物中分离能够上调人高密度脂蛋白受体(CLA-1)表达的新型活性化合物,并对其活性进行研究。方法应用已建立的CLA-1表达上调剂的模型,对阳性菌株链霉菌104A-9179发酵产物的活性成分进行分离纯化,获得活性化合物9179D;通... 目的从微生物代谢产物中分离能够上调人高密度脂蛋白受体(CLA-1)表达的新型活性化合物,并对其活性进行研究。方法应用已建立的CLA-1表达上调剂的模型,对阳性菌株链霉菌104A-9179发酵产物的活性成分进行分离纯化,获得活性化合物9179D;通过理化性质、质谱、紫外和核磁等波谱学数据进行结构鉴定;利用RT-PCR和Western Blot方法检测9179D对HepG2中CLA-1表达的影响;利用流式细胞仪检测其对小鼠巨噬细胞RAW264.7结合DiI-HDL的影响。结果从链霉菌104A-9179发酵产物中得到活性化合物9179D,并确定了其结构为曲占柳菌素D(Trichostatin D);9179D在CLA-1上调剂模型上的EC_(50)为46.02μmol/L,表达活性最高值为934%;9179D能增加HepG2中CLA-1的mRNA和蛋白表达;增加RAW264.7对DiI-HDL的结合。结论得到一个微生物来源的具有强的上调CLA-1的表达活性的化合物-9179D(曲古柳菌素D),属首次报道。 展开更多

关键词 人高密度脂蛋白受体 上调剂 高通量筛选 微生物次级代谢产物

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人单核巨噬细胞泡沫化抑制剂筛选模型的建立及应用

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作者 巫晔翔 刘明 +3 位作者 洪斌 司书毅 王娟 樊秀勇 《中国药师》 CAS 2004年第7期493-496,共4页

目的 :建立人单核巨噬细胞泡沫化抑制剂筛选模型 ,筛选得到可抑制细胞泡沫化的抑制剂。方法 :U937单核细胞经 10 0nmol·L-1佛波酯 (PMA)诱导 72h分化为巨噬细胞后 ,换无血清培养液于 96孔板中 ,每毫升含巨噬细胞 1× 10 6个 ,... 目的 :建立人单核巨噬细胞泡沫化抑制剂筛选模型 ,筛选得到可抑制细胞泡沫化的抑制剂。方法 :U937单核细胞经 10 0nmol·L-1佛波酯 (PMA)诱导 72h分化为巨噬细胞后 ,换无血清培养液于 96孔板中 ,每毫升含巨噬细胞 1× 10 6个 ,每孔再加入 80mg·L-1氧化的低密度脂蛋白 (ox -LDL) ,37℃培养 4 8h ,建立单核巨噬细胞泡沫化模型。利用微生物发酵液 ,或单一的化合物样品与其共孵育 ,油红。染色后观察细胞胞内变化 ,寻找对泡沫细胞形成有抑制作用的样品。利用基因工程技术表达的人清道夫受体A类II型的胞外部分 ,在本模型中可抑制巨噬细胞泡沫化的形成 ,进一步验证了模型的可行性。结果 :从 2 0 0 0个微生物发酵液中筛选到 6株微生物发酵液为阳性 ,从 10个化合物中发现一个有抑制巨噬细胞泡沫化活性的新化合物。结论 展开更多

关键词 泡沫细胞 U937 细胞系 氧化的低密度脂蛋白 筛选模型 微生物次级代谢产物

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