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快速低成本全基因组DNA测序技术 被引量:10
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作者 陆祖宏 吕华 +1 位作者 肖鹏峰 白云飞 《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期182-186,190,共6页
人类个体的全基因组序列信息,是最为重要的生物医学信息,是实现未来个体化医疗的基础;实现个体全基因组DNA序列的快速低成本检测,是人类基因组计划完成后又一个重要的技术挑战。对该技术当前的发展现状进行回顾和分析,预计在不长的时间... 人类个体的全基因组序列信息,是最为重要的生物医学信息,是实现未来个体化医疗的基础;实现个体全基因组DNA序列的快速低成本检测,是人类基因组计划完成后又一个重要的技术挑战。对该技术当前的发展现状进行回顾和分析,预计在不长的时间内人类个体全基因组的测序成本能够降低到1万元人民币以下。 展开更多
关键词 全基因组测序 个体化医疗 功能基因组学 快速dna测序技术
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Study on the Integration of T-DNA into Lilium longiflorum 被引量:3
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作者 李刚 刘菊华 +2 位作者 谭光兰 徐碧玉 金志强 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2008年第2期33-35,41,共4页
[ Objective] The aim of this study is to obtain transgenic Lilium longiflorum Thumb. [ Method] A two-step method of explant and the T-DNA integration technique were employed to transform Lilium longiflorum via Agrobac... [ Objective] The aim of this study is to obtain transgenic Lilium longiflorum Thumb. [ Method] A two-step method of explant and the T-DNA integration technique were employed to transform Lilium longiflorum via Agrobacterium mediated method. [ Result] The best infection effect appeared under the OD600 value of Agrobacterium within 0.6 -0.8, the addition of 250 mg/L AS could increase the transformation efficiency. The optimal concentration of G418 for screening is 50 mg/L. Some putative transgenic plants of Lilium longiflorum with resistance to G418 showed positive in PCR, preliminarily proving that T-DNA gene had integrated into the genome of lily. [ Conclusion] The study may lay a foundation for breeding excellent lily varieties through TDNA integration technique. 展开更多
关键词 Lilium longiflorum Agrobacterium-mediated transformation T-dna Insertion mutation
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急性病毒性坏死病毒魁蚶株IAP-86基因全长cDNA克隆和生物信息学分析 被引量:1
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作者 张帅 王崇明 +4 位作者 岳志芹 宋晓玲 白昌明 尹伟力 黄倢 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2015年第1期85-90,共6页
为深入探讨急性病毒性坏死病毒(Acute Viral Necrosis Virus,AVNV)魁蚶株的致病机理以及IAP-86蛋白的功能,从感染AVNV的濒死魁蚶外套膜中提取总RNA,反转录获得c DNA。根据NCBI公布的AVNV全基因组序列中ORF86序列设计两对反向套式引物,通... 为深入探讨急性病毒性坏死病毒(Acute Viral Necrosis Virus,AVNV)魁蚶株的致病机理以及IAP-86蛋白的功能,从感染AVNV的濒死魁蚶外套膜中提取总RNA,反转录获得c DNA。根据NCBI公布的AVNV全基因组序列中ORF86序列设计两对反向套式引物,通过c DNA末端快速扩增(RACE)技术获得ORF86 5?端和3?端的非编码区,拼接获得全长c DNA序列。Blast序列比对显示,该基因与牡蛎疱疹病毒的同源性为100%,与栉孔扇贝AVNV的同源性为99%,并存在重叠基因。生物信息学分析预测,该蛋白不含信号肽,不存在跨膜区,最大疏水指数为1.800,最小疏水指数为–3.456。该蛋白存在8个潜在的磷酸化位点(包括5个丝氨酸、1个苏氨酸和2个酪氨酸),存在1个潜在的O-糖基化位点,不存在潜在的N-糖基化位点;其抗原表位主要集中在8-11、14-16、28-39、75-76、88-95、97-100和147-158位氨基酸。推测该株病毒可能为牡蛎疱疹病毒的变异株,并且基因重叠在该类病毒进化过程中可能扮演重要角色。 展开更多
关键词 急性病毒性坏死病毒 魁蚶 细胞凋亡抑制蛋白 c dna末端快速扩增技术 生物信息学
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快速DNA检验技术及相关仪器的研究进展 被引量:2
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作者 韩俊萍 李洋 +5 位作者 王旭 马原 张金丽 畅晶晶 李永久 李彩霞 《中国法医学杂志》 CSCD 2019年第5期483-487,共5页
基于微流控芯片技术的现场快速DNA检验仪具备"样本进-结果出"的潜能,能够实现无人为干预的自动快速检验。目前国外先后推出了RapidHIT 200、DNAScan(升级版产品为ANDE 6C)、ParaDNA?现场便携仪等商业化仪器,2小时可以完成全... 基于微流控芯片技术的现场快速DNA检验仪具备"样本进-结果出"的潜能,能够实现无人为干预的自动快速检验。目前国外先后推出了RapidHIT 200、DNAScan(升级版产品为ANDE 6C)、ParaDNA?现场便携仪等商业化仪器,2小时可以完成全自动检测并生成STR图谱。美国联邦调查局(FBI)实验室自2010年起就致力于推动快速DNA检测项目的发展,同时对快速DNA检验的需求也越来越多。现就快速DNA检验技术及相关仪器的研究进展、验证评估情况以及相关标准、法案等进行简要介绍。 展开更多
关键词 法医物证学 快速dna技术 dna检验 dna联合索引系统 dna数据库
原文传递
水稻干尖线虫SPRYSEC基因的克隆及表达定位分析
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作者 王步勇 王峰 +3 位作者 李丹蕾 马玲 陈俏丽 王博文 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期305-311,共7页
根据水稻干尖线虫转录组测序结果,采用c DNA末端快速扩增技术(RACE法)从水稻干尖线虫中克隆到效应因子SPRY同源基因,并将其命名为Ab–SPRYSEC(NCBI登录号为KT188820)。该基因全长为2 089 bp,包含1个1 962 bp的开放阅读框(ORF)。... 根据水稻干尖线虫转录组测序结果,采用c DNA末端快速扩增技术(RACE法)从水稻干尖线虫中克隆到效应因子SPRY同源基因,并将其命名为Ab–SPRYSEC(NCBI登录号为KT188820)。该基因全长为2 089 bp,包含1个1 962 bp的开放阅读框(ORF)。预测蛋白编码653个氨基酸,相对分子质量为72 009,理论等电点为4.82,不稳定指数为41.5,属于不稳定性蛋白。保守区预测分析结果表明,该蛋白含有B302_SPRY和CTLH 2个保守结构域,属于SPRY超家族。多序列比对分析结果表明,该基因编码蛋白与马来丝虫的SPRY(XP_001891979.1)蛋白的相似度为43%。蛋白结构分析结果表明,β–折叠与无规则卷曲是Ab–SPRYSEC蛋白的主要结构元件。表达定位分析结果表明,Ab–SPRYSEC基因的表达位置在水稻干尖线虫食道腺附近。Ab–SPRYSEC基因作为水稻干尖线虫效应因子,在水稻干尖线虫侵染宿主中发挥了重要作用。 展开更多
关键词 水稻干尖线虫 SPRYSEC基因 原位杂交 c dna末端快速扩增技术(RACE法)
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