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凡纳滨对虾总RNA完整性的正确评估
被引量：
3
1
作者
易乐飞
穆亮亮
仲改
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2016年第12期2007-2013,共7页
凝胶电泳技术通常被用于总RNA完整性检测,一般认为28S和18S rRNA条带亮度的比值大于等于2表示总RNA完整性良好,该比值越小表明总RNA降解越严重。为了检测这一标准在水产虾蟹类中是否继续适用,分别对凡纳滨对虾rRNA和mRNA的完整性进行了...
凝胶电泳技术通常被用于总RNA完整性检测,一般认为28S和18S rRNA条带亮度的比值大于等于2表示总RNA完整性良好,该比值越小表明总RNA降解越严重。为了检测这一标准在水产虾蟹类中是否继续适用,分别对凡纳滨对虾rRNA和mRNA的完整性进行了分析。用TRIzol分离纯化的凡纳滨对虾总RNA经凝胶电泳检测,发现其28S∶18S rRNA的比值远小于2;但是以同样的总RNA为模板进行RT-PCR,能顺利扩增出长约1 100 bp的ACT和e EF1A基因序列。进一步的3'∶5'分析显示这2个内参基因mRNA的3'∶5'ratio分别为2.79和1.53,直接表明被测mRNA完整性良好。因此,凝胶电泳低估了水产虾蟹类总RNA的完整性,建议采用3'∶5'分析技术对水产虾蟹类总RNA完整性进行检测。
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关键词
凡纳滨对虾
总rna完整性
定量PCR
3'∶5'分析
隐裂
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职称材料
题名
凡纳滨对虾总RNA完整性的正确评估
被引量：
3
1
作者
易乐飞
穆亮亮
仲改
机构
淮海工学院海洋生命与水产学院
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2016年第12期2007-2013,共7页
基金
南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室开放课题(2011007)
江苏省水产养殖学品牌专业项目(PPZY2015B159)
文摘
凝胶电泳技术通常被用于总RNA完整性检测,一般认为28S和18S rRNA条带亮度的比值大于等于2表示总RNA完整性良好,该比值越小表明总RNA降解越严重。为了检测这一标准在水产虾蟹类中是否继续适用,分别对凡纳滨对虾rRNA和mRNA的完整性进行了分析。用TRIzol分离纯化的凡纳滨对虾总RNA经凝胶电泳检测,发现其28S∶18S rRNA的比值远小于2;但是以同样的总RNA为模板进行RT-PCR,能顺利扩增出长约1 100 bp的ACT和e EF1A基因序列。进一步的3'∶5'分析显示这2个内参基因mRNA的3'∶5'ratio分别为2.79和1.53,直接表明被测mRNA完整性良好。因此,凝胶电泳低估了水产虾蟹类总RNA的完整性,建议采用3'∶5'分析技术对水产虾蟹类总RNA完整性进行检测。
关键词
凡纳滨对虾
总rna完整性
定量PCR
3'∶5'分析
隐裂
Keywords
Penaeus vannamei
total
rna
integrity
real time PCR
3＇∶ 5＇ assay
hidden break
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
凡纳滨对虾总RNA完整性的正确评估
易乐飞
穆亮亮
仲改
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2016
3
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