以苦瓜(Momordica charantia L.)1/4黄期果实为材料,采用DSN(duplex-specific nuclease)均一化与SMART(switching mechanism at 5'end of RNA transcript)技术相结合,构建成熟软化期苦瓜果实均一化全长cDNA文库。经检测,该文库的转...以苦瓜(Momordica charantia L.)1/4黄期果实为材料,采用DSN(duplex-specific nuclease)均一化与SMART(switching mechanism at 5'end of RNA transcript)技术相结合,构建成熟软化期苦瓜果实均一化全长cDNA文库。经检测,该文库的转化效率为3600000个菌落/μL连接产物,其平均插入片段大小为1.4kb,重组率为98.0%,表明文库质量较好。随机挑取768个克隆进行EST测序,获得有607个高质量的EST,其中17个contig和562个singleton。冗余率为7.41%,文库的全长率67%。对测序结果进行注释和归类分析表明,已知功能基因大部分与催化活性、蛋白结合、转录调节活性、转运活性和酶调控活性有关分析,结果表明文库的可靠性好。发现有若干个与胞内蛋白质降解、细胞壁代谢、乙烯合成、信号传导和抗逆等可能与苦瓜果实成熟软化相关的新基因。展开更多
文摘以苦瓜(Momordica charantia L.)1/4黄期果实为材料,采用DSN(duplex-specific nuclease)均一化与SMART(switching mechanism at 5'end of RNA transcript)技术相结合,构建成熟软化期苦瓜果实均一化全长cDNA文库。经检测,该文库的转化效率为3600000个菌落/μL连接产物,其平均插入片段大小为1.4kb,重组率为98.0%,表明文库质量较好。随机挑取768个克隆进行EST测序,获得有607个高质量的EST,其中17个contig和562个singleton。冗余率为7.41%,文库的全长率67%。对测序结果进行注释和归类分析表明,已知功能基因大部分与催化活性、蛋白结合、转录调节活性、转运活性和酶调控活性有关分析,结果表明文库的可靠性好。发现有若干个与胞内蛋白质降解、细胞壁代谢、乙烯合成、信号传导和抗逆等可能与苦瓜果实成熟软化相关的新基因。
