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茶树RAPD反应系统和扩增程序优化 被引量:28
1
作者 陈亮 高其康 +2 位作者 杨亚军 虞富莲 陈大明 《茶叶科学》 CAS CSCD 1998年第1期16-20,共5页
以龙井43为材料,使用国产PCR仪,对茶树RAPD分析中影响PCR扩增结果的因素进行了研究,确定了茶树RAPD的最适反应系统和扩增程序,即在25μl反应体系中,含25~50ng模板DNA、2mmol/LMgCl2、各0.2mmo/LdNTPs、0.2μmol/L引物和0.5... 以龙井43为材料,使用国产PCR仪,对茶树RAPD分析中影响PCR扩增结果的因素进行了研究,确定了茶树RAPD的最适反应系统和扩增程序,即在25μl反应体系中,含25~50ng模板DNA、2mmol/LMgCl2、各0.2mmo/LdNTPs、0.2μmol/L引物和0.5~1.0UTanDNA聚合酶;扩增程序为:94℃预变性180s,94℃变性60s,38℃退火90s,72℃延伸120s,共进行40~45个循环,最后72℃延伸300~600s,这样可以取得较好的扩增结果。 展开更多
关键词 茶树 RAPD 反应系统 扩增程序
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洋葱(Alliumcepa L.)RAPD-PCR反应体系及扩增程序的优化 被引量:7
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作者 陈沁滨 侯喜林 +3 位作者 王建军 冷月强 蒋芳玲 薛萍 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2006年第4期434-438,共5页
为建立多态性高、稳定性好的洋葱RAPD-PCR反应体系,采用正交设计,研究了Taq酶、Mg2+、引物和dNTP 4种RAPD-PCR反应组分浓度变化对扩增结果的影响,在此基础上对模板DNA用量、扩增程序中退火温度和反应循环次数进行了筛选。试验结果表明,... 为建立多态性高、稳定性好的洋葱RAPD-PCR反应体系,采用正交设计,研究了Taq酶、Mg2+、引物和dNTP 4种RAPD-PCR反应组分浓度变化对扩增结果的影响,在此基础上对模板DNA用量、扩增程序中退火温度和反应循环次数进行了筛选。试验结果表明,洋葱20μl RAPD-PCR优化反应体系为1×Buffer、2.0 mmo1/L Mg2+、1.0 UTaqDNA聚合酶、200μmo1/L dNTP、0.6μmo1/L引物、2%甘油和15 ng DNA模板;PCR扩增程序为94℃预变性4 m in;94℃变性30 s,35℃退火40 s,72℃延长1.5 m in,45个循环;72℃保温延伸7 m in。 展开更多
关键词 洋葱 RAPD-PCR反应体系 扩增程序 正交设计
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小鼠RAPD-PCR反应体系及扩增程序的筛选 被引量:7
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作者 吴丰春 魏泓 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第1期19-21,共3页
目的:筛选优化小鼠RAPD-PCR反应体系及扩增程序。方法:以40条引物对9个品系的小鼠基因组DNA在各种不同条件下进行RAPD-PCR,分析比较扩增结果。结果:在下列反应体系及扩增程序下结果较好:在25μl的反应体... 目的:筛选优化小鼠RAPD-PCR反应体系及扩增程序。方法:以40条引物对9个品系的小鼠基因组DNA在各种不同条件下进行RAPD-PCR,分析比较扩增结果。结果:在下列反应体系及扩增程序下结果较好:在25μl的反应体系中含有10×bufer2.5μl,dNTP200μmol/L,Mg2+2.5mmol/L,引物0.2μmol/L,Taq酶1.5U,模板DNA20ng,扩增程序为94℃变性1min,38℃退火1min,72℃延伸2min,40个循环后接10min延伸。结论:以上述反应体系及扩增程序进行小鼠RAPD-PCR,扩增结果稳定。 展开更多
关键词 DNA 筛选 RAPD-PCR 小鼠 扩增程序
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干用辣椒RAPD-PCR反应体系及扩增程序的优化 被引量:2
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作者 王伟 郑根昌 +3 位作者 闫光照 刘鹏 陈炳艳 包凤利 《北方园艺》 CAS 北大核心 2009年第2期45-48,共4页
以干用辣椒叶片为材料,研究了干用辣椒RAPD分析过程中的影响因素,包括Taq酶、Mg2+、dNTPs、引物、模板DNA浓度、退火温度、退火时间及循环次数等,建立适合干用辣椒RAPD反应的PCR体系,即25μL反应体系中含有Taq酶1.5 U、Mg2+2.5 mmol/L,d... 以干用辣椒叶片为材料,研究了干用辣椒RAPD分析过程中的影响因素,包括Taq酶、Mg2+、dNTPs、引物、模板DNA浓度、退火温度、退火时间及循环次数等,建立适合干用辣椒RAPD反应的PCR体系,即25μL反应体系中含有Taq酶1.5 U、Mg2+2.5 mmol/L,dNTPs 0.6mmol/L、引物0.8μmol/L、模板DNA 60 ng。扩增程序为:94℃预变性4 min;94℃变性1 min,37℃退火1 min,72℃延伸1.5 min,40个循环;最后72℃延伸5 min。该优化体系在干用辣椒RAPD分析中获得较理想的扩增结果,为应用RAPD技术对干用辣椒遗传多样性奠定基础。 展开更多
关键词 干用辣椒 RAPD-PCR 反应体系 扩增程序
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矮化蓖麻RAPD-PCR反应体系及扩增程序的优化 被引量:3
5
作者 姚远 陈永胜 +3 位作者 李凤山 黄凤兰 宋永辉 陈献辉 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2009年第3期284-287,共4页
目的优化矮化蓖麻RAPD-PCR反应体系及扩增程序。方法采用正交试验设计,优化RAPD-PCR反应体系(引物、dNTP、Taq酶和Mg2+浓度)及扩增程序(退火温度、退火时间、变性时间、延伸时间和循环次数)。结果25μl反应体系中最佳浓度配比为:引物0.3... 目的优化矮化蓖麻RAPD-PCR反应体系及扩增程序。方法采用正交试验设计,优化RAPD-PCR反应体系(引物、dNTP、Taq酶和Mg2+浓度)及扩增程序(退火温度、退火时间、变性时间、延伸时间和循环次数)。结果25μl反应体系中最佳浓度配比为:引物0.36μmol/L,dNTP0.24mmol/L,Taq酶0.05U/μl,Mg2+1.20mmol/L;最佳扩增程序为:94℃预变性2min;94℃变性45s,36℃退火45s,72℃延伸80s,共35个循环;最后72℃再延伸5min。结论已优化了矮化蓖麻RAPD-PCR的反应体系及扩增程序,为应用RAPD-PCR技术对蓖麻株高性状进行研究奠定了基础。 展开更多
关键词 矮化蓖麻 RAPD-PCR 反应体系 扩增程序 正交设计
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Idaho Rapidcycler PCR仪上用薄壁管进行RAPD扩增的程序优化 被引量:2
6
作者 甘四明 施季森 白嘉雨 《南京林业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 2000年第1期27-31,共5页
以尾叶桉DNA为材料,对IdahoRapidcycler扩增仪上用薄壁管进行RAPD扩增的程序进行了优化研究。通过逐步对退火、延伸和变性的温度和时间及总的循环次数设置不同梯度和亚梯度,比较不同梯度和亚梯度的扩增结果,确定优化程序为:93℃预变性1m... 以尾叶桉DNA为材料,对IdahoRapidcycler扩增仪上用薄壁管进行RAPD扩增的程序进行了优化研究。通过逐步对退火、延伸和变性的温度和时间及总的循环次数设置不同梯度和亚梯度,比较不同梯度和亚梯度的扩增结果,确定优化程序为:93℃预变性1min;再40次循环:93℃变性20s,38℃退火21s,72℃延伸1min;最后72℃延伸7min。该程序的扩增时间较短,具有较好的特异性和重复性。另外,薄壁管反应架在反应室的内位比同时扩增的外位效果差,扩增时只能利用外位。 展开更多
关键词 RApiDCYCler RAPD 扩增程序 优化程序 薄壁管 检验
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正交设计优化绿竹ISSR-PCR体系和引物筛选 被引量:8
7
作者 徐雯 瞿印权 +3 位作者 韩笑 何天友 荣俊冬 郑郁善 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期103-110,共8页
旨在建立绿竹ISSR-PCR最佳反应体系和扩增程序,并筛选适于绿竹ISSR-PCR分析的高多态性引物。以绿竹基因组DNA为ISSR-PCR扩增模板,采用正交试验方法,对d NTPs浓度、Mg2+浓度、Taq DNA聚合酶浓度、引物浓度、模板DNA用量设计5因素4水平试... 旨在建立绿竹ISSR-PCR最佳反应体系和扩增程序,并筛选适于绿竹ISSR-PCR分析的高多态性引物。以绿竹基因组DNA为ISSR-PCR扩增模板,采用正交试验方法,对d NTPs浓度、Mg2+浓度、Taq DNA聚合酶浓度、引物浓度、模板DNA用量设计5因素4水平试验,采用极差分析法和方差分析法对试验结果进行分析。并对退火温度和循环次数进行筛选,建立绿竹ISSR-PCR最佳反应体系和扩增程序。并利用优化后的体系对100条ISSR引物进行筛选。最终确定的最佳反应体系为:20μL的扩增体系中,d NTPs浓度为0.2 mmol/L,Mg^(2+)浓度为2.0 mmol/L,Taq DNA聚合酶浓度为1.5 U,引物浓度为0.4μmol/L,DNA浓度为60 ng,10×PCR Buffer体积为2μL、剩下用灭菌ddH_2O补全。各因素影响大小依次是:Mg^(2+)>d NTPs>模板DNA>Taq DNA聚合酶>引物。扩增程序为:94℃预变性5 min;94℃变性45 s,(根据引物的退火温度)复性30 s,72℃延伸90 s,循环38次,72℃延伸10 min,4℃保存。以此体系为基础进行引物筛选,在100条ISSR引物中筛选出14条扩增条带清晰、多态性较高、重复性好的引物。 展开更多
关键词 绿竹 ISSR 正交试验设计 反应体系 扩增程序 引物筛选
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玄参ISSR-PCR反应体系的建立与优化 被引量:9
8
作者 赵志新 梁宗锁 +2 位作者 姜在民 薛媛菲 杨永宙 《药物生物技术》 CAS CSCD 2007年第5期318-323,共6页
为了建立稳定的玄参ISSR-PCR反应体系,本试验采用5因素(dNTPs、Taq DNA聚合酶、MgCl2、引物及模板)5水平正交设计筛选PCR体系,并利用单因子梯度进一步优化反应体系各因素浓度和扩增程序(退火温度、延伸时间和循环次数)。结果表明:... 为了建立稳定的玄参ISSR-PCR反应体系,本试验采用5因素(dNTPs、Taq DNA聚合酶、MgCl2、引物及模板)5水平正交设计筛选PCR体系,并利用单因子梯度进一步优化反应体系各因素浓度和扩增程序(退火温度、延伸时间和循环次数)。结果表明:在20μl反应体系中含10×buffer,0.3 mmol/L dNTPs,0.5-1.0 UTaq DNA聚合酶,2.0 mmol/L MgCl2,0.2μmol/L引物,150 ng模板,扩增效果最好。PCR扩增程序:94℃预变性5 min;94℃变性30 s,50-61℃退火(退火温度随引物不同而变化)45 s,72℃延伸1 min,35个循环;72℃延伸7 min。从而建立了适合玄参的ISSR-PCR反应体系,为采用ISSR-PCR分子标记技术研究参种质资源遗传多样性提供了技术依据。 展开更多
关键词 玄参 ISSR-PCR反应体系 PCR扩增程序 优化
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苹果黑星病菌SSR反应体系的优化 被引量:6
9
作者 董艳玲 胡小平 +1 位作者 杨家荣 苟建军 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期1148-1152,共5页
通过对苹果黑星病菌基因组DNA的SSR反应中一些重要参数进行优化,结果表明,最适反应体系为:2 5μL体系中,10×Buffer Mg Cl2 2 0 mm ol/ L 2 .5μL ,d NTP 10 0μmol·L- 1 、引物0 .5μmol·L- 1 、Taq DNA聚合酶1.5 U ,DN... 通过对苹果黑星病菌基因组DNA的SSR反应中一些重要参数进行优化,结果表明,最适反应体系为:2 5μL体系中,10×Buffer Mg Cl2 2 0 mm ol/ L 2 .5μL ,d NTP 10 0μmol·L- 1 、引物0 .5μmol·L- 1 、Taq DNA聚合酶1.5 U ,DNA模板2 m g·L- 1 ,dd H2 O 19.5μL .PCR扩增程序为93℃,2 min,5 7℃,30 s,1个循环;72℃,1m in,93℃,30 s,5 7℃,30 s,4 0个循环;72℃,10 min. 展开更多
关键词 反应体系 黑星病菌 SSR 优化 苹果 基因组DNA DNA聚合酶 DNA模板 扩增程序 MOL TAQ PCR 循环 引物
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八角ISSR-PCR反应体系的建立及引物筛选研究 被引量:5
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作者 吴涛 陈海云 +4 位作者 陈少瑜 宁德鲁 冯丹 李勇杰 张艳丽 《西部林业科学》 CAS 北大核心 2013年第2期8-13,共6页
以文山、广西2个居群6个单株的八角嫩叶为研究材料,以八角叶片基因组DNA为模板,在分析归纳相关树种ISSR-PCR体系的基础上,确定一个反应体系并对ISSR引物库进行筛选,同时结合正交设计针对具体引物进行体系优化。结果表明,八角的ISSR-PCR... 以文山、广西2个居群6个单株的八角嫩叶为研究材料,以八角叶片基因组DNA为模板,在分析归纳相关树种ISSR-PCR体系的基础上,确定一个反应体系并对ISSR引物库进行筛选,同时结合正交设计针对具体引物进行体系优化。结果表明,八角的ISSR-PCR反应体系(25μL)为DNA模板0.003~0.016 ng,Taq DNA聚合酶0.5~1.0 U,dNTPs 0.2 mmol.L-1,Mg2+浓度2.5~3.0 mmol.L-1,引物浓度0.6~0.8μmol.L-1。扩增程序为,94℃预变性5 min;94℃变性30 s,引物特异温度退火45 s,72℃延伸1 min,40个循环;72℃最后延伸7min;4℃保存。获得效果稳定并具有多态性的ISSR引物13条。研究结果可为八角遗传多样性分析和种质资源鉴定等研究奠定基础。 展开更多
关键词 八角 ISSR—PCR 反应体系 DNA模板 扩增程序 引物筛选
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绿竹ISSR-PCR反应体系的建立与优化 被引量:4
11
作者 徐雯 瞿印权 +4 位作者 陈剑成 何天友 荣俊冬 陈礼光 郑郁善 《江苏农业科学》 北大核心 2017年第15期34-38,共5页
以绿竹基因组DNA为ISSR-PCR扩增模板,采用单因素试验方法,对dNTPs、Mg^(2+)、Taq DNA聚合酶、引物、模板DNA设置7个不同浓度梯度进行研究,并对退火温度和循环次数进行筛选,建立绿竹ISSR-PCR最佳反应体系和扩增程序,并利用优化后的体系对... 以绿竹基因组DNA为ISSR-PCR扩增模板,采用单因素试验方法,对dNTPs、Mg^(2+)、Taq DNA聚合酶、引物、模板DNA设置7个不同浓度梯度进行研究,并对退火温度和循环次数进行筛选,建立绿竹ISSR-PCR最佳反应体系和扩增程序,并利用优化后的体系对100条ISSR引物进行筛选。最终确定的最佳反应体系为:20μL的扩增体系中,dNTPs浓度为0.2 mol/L,Mg2+浓度为2.0 mmol/L,Taq DNA聚合酶用量为1.0 U,引物浓度为0.4μmol/L,DNA用量为50 ng,10×PCR buffer体积为2μL、剩余体积用灭菌dd H2O补全。扩增程序为:94℃预变性5 min;94℃变性45 s,(根据引物的退火温度)复性30 s,72℃延伸90 s,循环38次;72℃延伸10 min,4℃保存。以此体系为基础进行引物筛选,在100条ISSR引物中筛选出14条扩增条带清晰、多态性较高、重复性好的引物。本研究建立了绿竹ISSR-PCR最佳反应体系并筛选出高多态性引物,为绿竹的指纹图谱、遗传多样性分析、分子育种和品种鉴定等研究提供了基础。 展开更多
关键词 绿竹 ISSR 反应体系 扩增程序 引物筛选
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杨树RAPD标记反应体系的建立与优化 被引量:4
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作者 张玉平 李丕军 +3 位作者 朱燕 潘青华 鲁绍伟 李少宁 《中国农学通报》 CSCD 2014年第13期20-24,共5页
本研究主要对杨树RAPD体系进行优化,以银白杨为试材,利用L16(45)正交试验设计和2个单因素试验,研究各主要参数的适宜浓度。结果表明,杨树RAPD优化后的反应体系:20μL反应体系中,含Mg2+1.5 mmol/L、Taq酶2.0 U、引物0.2μmol/L、dNTPs 0.... 本研究主要对杨树RAPD体系进行优化,以银白杨为试材,利用L16(45)正交试验设计和2个单因素试验,研究各主要参数的适宜浓度。结果表明,杨树RAPD优化后的反应体系:20μL反应体系中,含Mg2+1.5 mmol/L、Taq酶2.0 U、引物0.2μmol/L、dNTPs 0.2 mmol/L、模板DNA 50 ng。扩增程序为:94℃预变性3 min、94℃变性40 s、38℃退火60 s、72℃延伸90 s,共38个循环;最后在72℃延伸7 min后4℃保温。通过1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测其扩增产物,证明该体系稳定可靠,可以用于杨树的遗传学分析。 展开更多
关键词 杨树 RAPD 反应体系 扩增程序
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烟草RAPD反应体系的建立与优化研究 被引量:13
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作者 杨友才 周清明 尹晗琪 《中国农学通报》 CSCD 2005年第5期97-100,共4页
以烤烟品种为材料,研究了烟草RAPD分析过程中的影响因素,包括模板浓度、Mg2+、dNTP、引物、Taq酶、循环次数、退火温度等,建立了适于烟草RAPD分析的PCR反应体系:即在25μl反应体系中,模板用量为40ng;引物浓度为0.4μM;Mg2+浓度为2.5mM;d... 以烤烟品种为材料,研究了烟草RAPD分析过程中的影响因素,包括模板浓度、Mg2+、dNTP、引物、Taq酶、循环次数、退火温度等,建立了适于烟草RAPD分析的PCR反应体系:即在25μl反应体系中,模板用量为40ng;引物浓度为0.4μM;Mg2+浓度为2.5mM;dNTP浓度为0.2mM;TaqDNA聚合酶用量为1U。扩增程序为94℃预变性5min;然后94℃变性1min,38℃复性1min,72℃延伸1.5min,39个循环;最后72℃延伸5min。 展开更多
关键词 RAPD反应体系 优化研究 烟草 PCR反应体系 Mg^2+浓度 RAPD分析 dNTP浓度 烤烟品种 分析过程 模板浓度 Taq酶 循环次数 退火温度 引物浓度 扩增程序 酶用量 DNA 变性 延伸
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mRNA差异显示条件的优化 被引量:5
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作者 唐明娟 郭顺星 +1 位作者 申业 胡鸢雷 《生物技术通讯》 CAS 2003年第3期191-193,共3页
运用优化的mRNA差异显示技术分离受内生真菌诱导的差异基因。优化差异显示条件表现在增加锚定引物和随机引物的长度、改变PCR参数和再扩增程序、运用银染显色等。应用这些条件共获得7个阳性差异片段。用未优化的PCR程序1筛选35条差异带... 运用优化的mRNA差异显示技术分离受内生真菌诱导的差异基因。优化差异显示条件表现在增加锚定引物和随机引物的长度、改变PCR参数和再扩增程序、运用银染显色等。应用这些条件共获得7个阳性差异片段。用未优化的PCR程序1筛选35条差异带,得到3个两端均为随机引物的差示片段。而用优化的PCR程序2,52条差异带中得到9条只能用锚定引物和随机引物才能扩增出的片段。地高辛标记的反向-Northern鉴定为阳性后进行克隆和测序。PCR方法1所得的3个差示片段均无开放的阅读框。PCR程序2得到7个差异表达的基因中,2个为已知基因,5个为未知基因。因此可运用优化的差显技术分离差异表达的基因。 展开更多
关键词 MRNA差异显示 聚合酶链式反应 银染 随机引物 指定引物 扩增程序
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梨属植物ISSR技术体系的建立与优化 被引量:2
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作者 张玉星 马艳芝 赵国芳 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2011年第6期50-53,共4页
以雪花梨为材料,对ISSR反应体系中的模板用量、引物浓度、dNTPs浓度、TaqDNA聚合酶用量等一些重要参数进行探索和优化,初步建立了稳定的具有广泛适用性的梨属植物ISSR技术的反应体系及扩增程序,即20μL体系中含1×buffer(内含1.5mmo... 以雪花梨为材料,对ISSR反应体系中的模板用量、引物浓度、dNTPs浓度、TaqDNA聚合酶用量等一些重要参数进行探索和优化,初步建立了稳定的具有广泛适用性的梨属植物ISSR技术的反应体系及扩增程序,即20μL体系中含1×buffer(内含1.5mmol/LMgCl2)、模板DNA40~60ng、引物浓度为0.2μmol/L、dNTP200μmol/L、Taq DNA聚合酶1U。扩增程序为:94℃5min、退火60s、72℃延伸120s,然后连续39个循环为94℃60s、退火温度(52℃左右)60s、72℃延伸120s,完成最后1个循环后,在72℃继续延伸10min,然后在4℃保温,最后通过1.4%的琼脂糖凝胶电泳检测其扩增产物。 展开更多
关键词 ISSR 反应体系 扩增程序
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漾濞核桃RAPD反应优化体系的建立 被引量:3
16
作者 杨恩 陈少瑜 +2 位作者 张雨 范志远 习学良 《福建林业科技》 北大核心 2005年第4期25-28,48,共5页
以漾濞核桃中的大姚三台核桃为实验材料,通过对影响RAPD扩增结果的主要因子Tag酶、Mg+2、引物、模板DNA、dNTPs等不同的浓度和组合的试验研究,确定了漾濞核桃的最适反应体系和扩增程序,即在25μL反应体系中,0.75 u.L-1Taq DNA聚合酶,3.0... 以漾濞核桃中的大姚三台核桃为实验材料,通过对影响RAPD扩增结果的主要因子Tag酶、Mg+2、引物、模板DNA、dNTPs等不同的浓度和组合的试验研究,确定了漾濞核桃的最适反应体系和扩增程序,即在25μL反应体系中,0.75 u.L-1Taq DNA聚合酶,3.0 mmol.L-1Mg+2,0.3 mmol.L-1引物,含1.6 mg.L-1模板,2.5 ul 10×Buffer,dNTPs各0.2 mmol.L-1。扩增程序为:94℃预变性300 s,94℃变性40 s,36℃退火60 s,72℃链延伸120 s,45次循环后,72℃延伸600 s。 展开更多
关键词 漾濞核桃 RAPD(随机多态性DNA) 反应体系 扩增程序 品种鉴定
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匍匐茎草本蛇莓RAPD反应体系优化 被引量:2
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作者 廖信军 李雅宜 胡雪华 《井冈山大学学报(自然科学版)》 2013年第4期37-40,共4页
为了建立蛇莓RAPD反应的最佳反应体系,我们对每个反应因子进行优化研究。在本实验室常用的RAPD反应体系的基础上,根据RAPD扩增效果确定蛇莓基因组DNA的最佳RAPD反应体系。经优化后,我们建立了适合蛇莓的最佳RAPD反应体系:25μL反应体系... 为了建立蛇莓RAPD反应的最佳反应体系,我们对每个反应因子进行优化研究。在本实验室常用的RAPD反应体系的基础上,根据RAPD扩增效果确定蛇莓基因组DNA的最佳RAPD反应体系。经优化后,我们建立了适合蛇莓的最佳RAPD反应体系:25μL反应体系中含10×Buffer 2.5μL,2 mmol/L Mg2+,1.5 UTaqDNA聚合酶,50 ng模板,0.22 mmol/L dNTPs,0.35μmol/L随机引物S30。本研究结果为下一步野生蛇莓遗传多样评估奠定基础。 展开更多
关键词 蛇莓 RAPD 扩增程序
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RAPD法研究穗花杉遗传多样性的反应条件优化
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作者 朱柏芳 朱笃 +2 位作者 李思光 刘如龙 邓荣根 《江西师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2005年第2期142-145,共4页
以改进CTAB法抽提的中国特有濒危植物穗花杉嫩叶总DNA为模板,进行随机扩增多态性DNA(RAPD)最佳条件优化,结果表明:RAPD分析最佳反应体系为10×Buffer缓冲液2μL,模板70ng,Mg2+2.0mmol/L,dNTPs0.2mmol/L,引物0.60μmol/L,Taq酶1.5U,... 以改进CTAB法抽提的中国特有濒危植物穗花杉嫩叶总DNA为模板,进行随机扩增多态性DNA(RAPD)最佳条件优化,结果表明:RAPD分析最佳反应体系为10×Buffer缓冲液2μL,模板70ng,Mg2+2.0mmol/L,dNTPs0.2mmol/L,引物0.60μmol/L,Taq酶1.5U,PCR反应体积为20μL.最佳扩增程序为94℃5min,1个循环;94℃1min、37℃1min、72℃2min,40个循环;72℃10min,1个循环. 展开更多
关键词 反应条件优化 穗花杉 遗传多样性 RAPD法 改进CTAB法 随机多态性 Buffer 最佳反应体系 RAPD分析 MG^2+ 总DNA 濒危植物 Taq酶 扩增程序 反应体积 缓冲液 MOL PCR 循环 模板
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互助北山林区冬瓜杨遗传多样性测定
19
作者 赵昌宏 马明呈 许焕 《青海师范大学学报(自然科学版)》 2018年第3期35-39,共5页
为了对青海互助北山林区冬瓜杨遗产多样性进行测定,采集青海互助北山林区不同地理居群冬瓜杨叶片共20个样品,并进行生物学鉴定.在本研究中青海互助北山林区冬瓜杨ITS序列的扩增片片段在700~800bp间,单倍型多态性水平为0.6879,基因流Nm(... 为了对青海互助北山林区冬瓜杨遗产多样性进行测定,采集青海互助北山林区不同地理居群冬瓜杨叶片共20个样品,并进行生物学鉴定.在本研究中青海互助北山林区冬瓜杨ITS序列的扩增片片段在700~800bp间,单倍型多态性水平为0.6879,基因流Nm(0.0486)<1.青海互助北山林区不同地理居群冬瓜杨ITS序列的扩增片段满足杨属DNA条形码的片段,psbA-trnH序列分析,高于植物平均水平,但是青海互助北山林区冬瓜杨基因交流程度较低,因而,居群之间的遗传变异较大. 展开更多
关键词 冬瓜杨 DNA PCR扩增程序
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Impact Assessment of Diesel Oil on the Zhe Oyster (Crassostrea plicatula) Using RAPD Analysis
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作者 Anglv Shen Chunyan Ma Liu Shao 《Journal of Life Sciences》 2013年第2期97-104,共8页
The lethal and sublethal effects of oils on aquatic organisms have been widely investigated, but the potential molecular impacts of oils on aquatic organisms are remaining unclear now. In order to realize the effects ... The lethal and sublethal effects of oils on aquatic organisms have been widely investigated, but the potential molecular impacts of oils on aquatic organisms are remaining unclear now. In order to realize the effects of diesel oil on the Zhe oyster, the RAPD (random amplified polymorphic DNA) technique was used. RAPD is a useful assay procedure for the detection of genotoxin-induced DNA damage and mutations. In the present study, the Zhe oysters were exposed to diesel oil at different concentrations and for different exposure periods. The results showed that the DNA band change in RAPD profiles of oysters following diesel oil treatment included loss of normal DNA bands, the appearance of new DNA bands and variations in DNA intensity compared to oysters not exposed to diesel oil. The effects of changes to GTS (genome template stability) were time- and concentration-dependent, the GTS of 10 mg/L was 82.46%, 80.70% and 63.15% in the 8, 16 and 32 days, the GTS of 20 mg/L was 75.44%, 71.93% and 56.14% in the 8, 16 and 32 days, the GTS of 40 mg/L was 73.68%, 70.18% and 56.14% in the 8, 16 and 32 days, respectively. The DNA polymorphisms detected by RAPD analysis could be used as a useful biomarker assay for the detection of genotoxic effects in diesel oil pollution on the oysters, and may be useful for environmental contamination risk assessment. 展开更多
关键词 Diesel oil Zhe oyster RAPD GTS DNA damage biomarker.
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