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混合谱图所引发的肽段质谱数据分析的问题及其解决方案
1
作者
邓亚美
谢丹丹
+2 位作者
许少行
闻博
刘斯奇
《生命的化学》
CAS
CSCD
2017年第1期57-64,共8页
基于数据依赖性采集模式(DDA)的质谱分析是进行规模化蛋白质组学研究的常用方法。由于这类方法往往是液相色谱与质谱联用,因此肽段分离及其质量鉴定是该方法的核心指标。对于复杂肽段混合物而言,混合质谱图是广泛存在的;它们给肽段定性...
基于数据依赖性采集模式(DDA)的质谱分析是进行规模化蛋白质组学研究的常用方法。由于这类方法往往是液相色谱与质谱联用,因此肽段分离及其质量鉴定是该方法的核心指标。对于复杂肽段混合物而言,混合质谱图是广泛存在的;它们给肽段定性和定量都带来严重的问题。在当前的技术条件下,开发用于识别和分析混合质谱图的生物信息学工具是解决这一问题的可行方案。本文主要介绍了混合质谱图产生的原因和影响因素,以及识别和分析混合谱图的相关生物信息学工具的最新开发进展。
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关键词
蛋白质组学
质谱分析法
计算生物学
数据
依赖性
采集
模式
(
dda
)
混合谱图
原文传递
题名
混合谱图所引发的肽段质谱数据分析的问题及其解决方案
1
作者
邓亚美
谢丹丹
许少行
闻博
刘斯奇
机构
深圳华大基因研究院
中国科学院北京基因组研究所
深圳大学
出处
《生命的化学》
CAS
CSCD
2017年第1期57-64,共8页
基金
国家国际科研合作专项(2014DFB30020)
文摘
基于数据依赖性采集模式(DDA)的质谱分析是进行规模化蛋白质组学研究的常用方法。由于这类方法往往是液相色谱与质谱联用,因此肽段分离及其质量鉴定是该方法的核心指标。对于复杂肽段混合物而言,混合质谱图是广泛存在的;它们给肽段定性和定量都带来严重的问题。在当前的技术条件下,开发用于识别和分析混合质谱图的生物信息学工具是解决这一问题的可行方案。本文主要介绍了混合质谱图产生的原因和影响因素,以及识别和分析混合谱图的相关生物信息学工具的最新开发进展。
关键词
蛋白质组学
质谱分析法
计算生物学
数据
依赖性
采集
模式
(
dda
)
混合谱图
Keywords
proteomics
mass spectrometry
computational biology
data-dependent acquisition （
dda
）
chimera spectra
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
O657.63 [理学—分析化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
混合谱图所引发的肽段质谱数据分析的问题及其解决方案
邓亚美
谢丹丹
许少行
闻博
刘斯奇
《生命的化学》
CAS
CSCD
2017
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