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无标记探针技术检测IL-6基因启动子单核苷酸多态性
被引量:
1
1
作者
郜莉娜
尤崇革
+2 位作者
潘云燕
李光迪
王芳芳
《第四军医大学学报》
北大核心
2009年第16期1484-1487,共4页
目的:探讨无标记探针技术检测IL-6基因启动子单核苷酸多态性(SNP)的实用性.方法:采用新型荧光染料EvaGreen和无标记探针技术对IL-6基因启动子SNP进行基因分型.以其-597G>A位点为例设计PCR扩增引物和无标记探针,按PCR扩增效率和产物...
目的:探讨无标记探针技术检测IL-6基因启动子单核苷酸多态性(SNP)的实用性.方法:采用新型荧光染料EvaGreen和无标记探针技术对IL-6基因启动子SNP进行基因分型.以其-597G>A位点为例设计PCR扩增引物和无标记探针,按PCR扩增效率和产物特异性进行Mg2+浓度、不对称PCR引物比例以及模板浓度等条件的优化.并用此优化体系基因分型100例临床标本,杂合型与突变型以测序验证.结果:结果显示EvaGreen荧光PCR检测体系是最适Mg2+浓度为2.5mmol/L,不对称PCR引物比例为0.1/0.5μmol/L,模板浓度为10ng/10μL的两步法不对称PCR.该体系对100例样本进行IL-6基因-597G>A位点基因分型,发现7例杂合型和1例突变型,经测序与检测结果一致.结论:无标记探针技术检测基因SNP是一种值得推广的简便易行、低成本、常规化的基因分型方法.
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关键词
白细胞介素6
EvaGreen
无标记探针
多态性
单核苷酸
原文传递
基于高分辨率熔解分析的基因分型新技术
被引量:
3
2
作者
李菲菲
尤崇革
《现代检验医学杂志》
CAS
2011年第6期159-161,共3页
目的 综述基于高分辨熔解分析(HRM)的基因分型新技术.方法 介绍无标记探针、弹回引物、隐蔽探针、温度开关PCR、等位基因特异延伸PCR和低变性温度下共扩增PCR等技术的基本原理并评价其适用性.结果 这些新技术不仅避免了产物污染,提高...
目的 综述基于高分辨熔解分析(HRM)的基因分型新技术.方法 介绍无标记探针、弹回引物、隐蔽探针、温度开关PCR、等位基因特异延伸PCR和低变性温度下共扩增PCR等技术的基本原理并评价其适用性.结果 这些新技术不仅避免了产物污染,提高了HRM基因分型的准确性和敏感度,而且拓展了HRM的应用范围.结论 基于HRM的基因分型新技术有望成为临床分子诊断的新方法.
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关键词
高分辨熔解
无标记探针
弹回引物
隐蔽
探针
温度开关PCR
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职称材料
无标记小分子探针技术与中药靶点发现
被引量:
4
3
作者
葛跃伟
王淑美
张陆勇
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第19期4152-4157,共6页
靶点的确定是阐明中药作用机制的核心,是构建化学成分与药效作用相关性的关键。鉴于中药的多样性、化学成分的复杂性,传统的靶点筛选方法有所局限,靶点发现已成为中药机制研究的瓶颈。无标记小分子探针技术是化学蛋白组学领域的新兴技术...
靶点的确定是阐明中药作用机制的核心,是构建化学成分与药效作用相关性的关键。鉴于中药的多样性、化学成分的复杂性,传统的靶点筛选方法有所局限,靶点发现已成为中药机制研究的瓶颈。无标记小分子探针技术是化学蛋白组学领域的新兴技术,其突出特点为无需对小分子成分进行结构修饰与改造,普适于复杂的中药化学成分,同时该方法基于蛋白质组进行靶点筛选,利于发现中药作用的新靶点、新途径。鉴于该方法在中药研究中的应用潜力,该文综述了其分析原理与应用现状,总结了其一般性分析步骤,以促进该方法在中药化学成分靶点阐明中的应用。
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关键词
无标记
小分子
探针
中药靶点
化学蛋白组学
DARTS
TPP
SPROX
原文传递
题名
无标记探针技术检测IL-6基因启动子单核苷酸多态性
被引量:
1
1
作者
郜莉娜
尤崇革
潘云燕
李光迪
王芳芳
机构
兰州大学第二医院检验科
出处
《第四军医大学学报》
北大核心
2009年第16期1484-1487,共4页
文摘
目的:探讨无标记探针技术检测IL-6基因启动子单核苷酸多态性(SNP)的实用性.方法:采用新型荧光染料EvaGreen和无标记探针技术对IL-6基因启动子SNP进行基因分型.以其-597G>A位点为例设计PCR扩增引物和无标记探针,按PCR扩增效率和产物特异性进行Mg2+浓度、不对称PCR引物比例以及模板浓度等条件的优化.并用此优化体系基因分型100例临床标本,杂合型与突变型以测序验证.结果:结果显示EvaGreen荧光PCR检测体系是最适Mg2+浓度为2.5mmol/L,不对称PCR引物比例为0.1/0.5μmol/L,模板浓度为10ng/10μL的两步法不对称PCR.该体系对100例样本进行IL-6基因-597G>A位点基因分型,发现7例杂合型和1例突变型,经测序与检测结果一致.结论:无标记探针技术检测基因SNP是一种值得推广的简便易行、低成本、常规化的基因分型方法.
关键词
白细胞介素6
EvaGreen
无标记探针
多态性
单核苷酸
Keywords
intekleukin-6
EvaGreen
unlabeled probes
polymorphism, single nucleotide
分类号
R392.11 [医药卫生—免疫学]
原文传递
题名
基于高分辨率熔解分析的基因分型新技术
被引量:
3
2
作者
李菲菲
尤崇革
机构
兰州大学第二医院中心实验室
出处
《现代检验医学杂志》
CAS
2011年第6期159-161,共3页
基金
甘肃省科技支撑项目(090NKCA094).
文摘
目的 综述基于高分辨熔解分析(HRM)的基因分型新技术.方法 介绍无标记探针、弹回引物、隐蔽探针、温度开关PCR、等位基因特异延伸PCR和低变性温度下共扩增PCR等技术的基本原理并评价其适用性.结果 这些新技术不仅避免了产物污染,提高了HRM基因分型的准确性和敏感度,而且拓展了HRM的应用范围.结论 基于HRM的基因分型新技术有望成为临床分子诊断的新方法.
关键词
高分辨熔解
无标记探针
弹回引物
隐蔽
探针
温度开关PCR
Keywords
high resolution melting
unlabled probe
snapback primer
mask probe
temperature switch PCR
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
无标记小分子探针技术与中药靶点发现
被引量:
4
3
作者
葛跃伟
王淑美
张陆勇
机构
广东药科大学中药学院
广东省(高校)中药质量工程技术研究中心
国家中医药管理局中药数字化质量评价技术重点研究室
广州市新药筛选模型体系构建与应用重点实验室
出处
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第19期4152-4157,共6页
基金
国家自然科学基金项目(81872988)
文摘
靶点的确定是阐明中药作用机制的核心,是构建化学成分与药效作用相关性的关键。鉴于中药的多样性、化学成分的复杂性,传统的靶点筛选方法有所局限,靶点发现已成为中药机制研究的瓶颈。无标记小分子探针技术是化学蛋白组学领域的新兴技术,其突出特点为无需对小分子成分进行结构修饰与改造,普适于复杂的中药化学成分,同时该方法基于蛋白质组进行靶点筛选,利于发现中药作用的新靶点、新途径。鉴于该方法在中药研究中的应用潜力,该文综述了其分析原理与应用现状,总结了其一般性分析步骤,以促进该方法在中药化学成分靶点阐明中的应用。
关键词
无标记
小分子
探针
中药靶点
化学蛋白组学
DARTS
TPP
SPROX
Keywords
label-free small molecule probe
protein targets of traditional Chinese medicine
chemproteomics
DARTS
TPP
SPROX
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
无标记探针技术检测IL-6基因启动子单核苷酸多态性
郜莉娜
尤崇革
潘云燕
李光迪
王芳芳
《第四军医大学学报》
北大核心
2009
1
原文传递
2
基于高分辨率熔解分析的基因分型新技术
李菲菲
尤崇革
《现代检验医学杂志》
CAS
2011
3
下载PDF
职称材料
3
无标记小分子探针技术与中药靶点发现
葛跃伟
王淑美
张陆勇
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2019
4
原文传递
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