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少量降水对壤中气汞量测量结果的影响 被引量：2
1
作者 邹长毅 史长义 张金华 《物探与化探》 CAS CSCD 2000年第6期451-454,共4页
降水是影响壤中气汞测量结果的重要因素之一。大雨或透雨过后 ,壤中气汞含量急剧降低 ,甚至使异常消失 ;降水量较小 ,有时会使壤中气汞含量显著浓集。
关键词 壤中气汞量测量 降水量 小雨 汞含量 显著富集
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骨肉瘤组织差异表达基因筛选及其与患者预后的关系 被引量：2
2
作者 张晋煜 《山东医药》 CAS 北大核心 2017年第32期10-12,共3页
目的采用生物信息学的方法筛选骨肉瘤组织差异表达基因,并探讨其与患者预后的关系。方法收集骨肉瘤组织及其配对癌旁正常组织标本各4例份,采用转录组测序技术筛选两种组织中的差异表达基因,并进行基因本体(GO)功能显著性富集分析。在癌... 目的采用生物信息学的方法筛选骨肉瘤组织差异表达基因,并探讨其与患者预后的关系。方法收集骨肉瘤组织及其配对癌旁正常组织标本各4例份,采用转录组测序技术筛选两种组织中的差异表达基因,并进行基因本体(GO)功能显著性富集分析。在癌症和肿瘤基因图谱骨肉瘤数据库中选择258例份骨肉瘤组织标本,采用Kaplan-Meier曲线分析富集于生物学过程的差异表达基因对患者生存时间的影响。结果骨肉瘤及其癌旁正常组织存在差异表达基因875个,其中表达上调的基因346个、表达下调的基因529个。GO功能显著性富集分析共识别出14个有意义的类型;在6个生物学过程类型中,差异表达基因主要富集于外源性代谢过程、细胞黏附、细胞外基质组成、类固醇代谢过程等;在8个细胞成分类型中,差异表达基因主要富集于细胞外体、细胞外空间、胶原三聚体、核小体等。258例份骨肉瘤组织中,还原酶1(NQO1)基因高表达233例份、低表达25例份,NQO1基因高表达、低表达患者生存时间分别为(2 763±15)、(1 568±13)d,二者比较P<0.01;醛脱氢酶3族A1(ALDH3A1)基因高表达233例份、低表达25例份,ALDH3A1基因高表达、低表达患者生存时间分别为(2 725±11)、(1 421±14)d,二者比较P<0.01;其余基因表达情况对患者的生存时间均无明显影响(P均>0.05)。结论采用生物信息学的方法筛选出骨肉瘤组织差异表达基因875个,主要富集于生物学过程和细胞成分类型;其中NQO1、ALDH3A1基因低表达提示患者预后不良。 展开更多
关键词 骨肉瘤 基因本体功能显著性富集分析 基因筛选 转录组测序 生物信息学 生存时间
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纸皮核桃内果皮硬化期差异表达基因筛选及功能预测 被引量：8
3
作者 鱼尚奇 贾昌路 +5 位作者 宋岩 刘春花 郭永翠 张文涛 陈立平 张锐 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期410-420,共11页
【目的】综合分析纸皮核桃内果皮硬化期转录本表达情况,获得3个代表样本间差异表达基因,为系统研究纸皮核桃内果皮木质化的分子机理打下基础。【方法】采用转录组测序技术对其内果皮硬化期3个样品测序,利用生物信息学方法和软件筛选样... 【目的】综合分析纸皮核桃内果皮硬化期转录本表达情况,获得3个代表样本间差异表达基因,为系统研究纸皮核桃内果皮木质化的分子机理打下基础。【方法】采用转录组测序技术对其内果皮硬化期3个样品测序,利用生物信息学方法和软件筛选样本间的差异表达基因并进行生物学功能预测。【结果】通过Trinity软件拼接得到76 814条Unigene,筛选出了609个差异表达基因,利用Gene Ontology和KEGG数据库对差异表达基因注释,发现差异表达基因显著富集在植物激素信号转导、苯丙烷类生物合成、苯丙氨酸代谢、ABC转运子合成、泛醌和其他萜类醌生物合成等途径中。【结论】筛出了纸皮核桃内果皮硬化期差异表达基因显著富集的主要代谢途径,为今后系统研究纸皮核桃内果皮木质化的分子机理打下了良好基础。 展开更多
关键词 核桃内果皮 差异表达基因 表达模式分析 功能显著性富集分析
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