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限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)技术的优点
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作者 新展 《现代渔业信息》 2007年第11期31-31,共1页
限制性片段长度多态性(RFLP)技术是最早开发成功、建立在Southern杂交技术上的DNA分子遗传标记技术。RFLP技术的优点:
关键词 限制性片段长度多态性 分子遗传标记技术 Southern杂交技术 rflp技术 DNA
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利用12S rRNA基因的限制性酶切末端片段长度多态性鉴定动物种类 被引量:9
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作者 汪琦 张昕 +3 位作者 赵大贺 马海萍 陈广全 张惠媛 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第2期214-219,共6页
目的:建立一种精确可靠的鉴定常见的10种动物(猪、狗、牛、山羊、绵羊、马、鸡、鼠、三文鱼和鹿)的方法。方法:利用12SrRNA基因的限制性酶切末端片段长度多态性(terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)鉴别动物种... 目的:建立一种精确可靠的鉴定常见的10种动物(猪、狗、牛、山羊、绵羊、马、鸡、鼠、三文鱼和鹿)的方法。方法:利用12SrRNA基因的限制性酶切末端片段长度多态性(terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)鉴别动物种类。将线粒体12S rRNA基因通过引物的5'端用FAM荧光标记,从基因组DNA中扩增450bp的目的片段。引物对1(下游引物FAM标记,上游引物不标记)扩增的PCR产物用限制性内切酶AluⅠ酶切。引物对2(上游引物FAM标记,下游引物不标记)扩增的PCR产物用限制性内切酶Tru9Ⅰ酶切。得到的酶切产物分别在遗传分析仪ABI3100上进行毛细管电泳,片段大小用Peak Scanner 1.0软件分析。结果:根据AluⅠ酶切图谱能够区分鸡、马、猪和三文鱼,而鹿和牛、山羊和绵羊、鼠和狗因酶切图谱相同无法分开。根据Tru9Ⅰ酶切图谱,能够进一步将鹿和牛、山羊和绵羊、鼠和狗分开。同一种动物不同个体的酶切图谱完全相同,结果具有可重复性。没有出现物种内多态的现象。大多数情况下,实际得到的末端片段长度与理论值非常接近,只存在2~5bp的差异。结论:该方法操作简单、结果精确,适用于鉴定动物种类。 展开更多
关键词 限制性酶切末端片段长度多态性t—rflp 种类鉴定 12S RRNA
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细胞毒性T细胞相关抗原4基因+49位点多态性与大肠癌相关性研究 被引量:3
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作者 范志广 付佳 +1 位作者 陈婷 王国杰 《黑龙江医学》 2012年第11期810-811,共2页
目的通过对细胞毒T淋巴细胞相关抗原4(CTLA-4)基因+49位点多态性与大肠癌易感性相关性研究,帮助临床早期发现大肠癌,识别大肠癌相关分子靶点及指导患者的个性化治疗。方法选取大肠癌病例291例;正常对照组352例,试剂盒提取DNA后,利用聚... 目的通过对细胞毒T淋巴细胞相关抗原4(CTLA-4)基因+49位点多态性与大肠癌易感性相关性研究,帮助临床早期发现大肠癌,识别大肠癌相关分子靶点及指导患者的个性化治疗。方法选取大肠癌病例291例;正常对照组352例,试剂盒提取DNA后,利用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术进行CTLA-4基因第1外显子区+49位点DNA扩增,所得产物用限制性片段长度多态性(re-striction fragment length polymorphism,RFLP)方法检测CTLA-4第1外显子区+49位点多态性,分析大肠癌患者与正常对照组的差异,进而分析CTLA-4,+49位点多态性与大肠癌发生的相关性。结果大肠癌患者组和正常对照组CTLA-4基因第1外显子+49位点,GG、AA纯合子和AG杂合子基因型发生频率在大肠癌患者组与正常对照组间无显著差异(P>0.05);G等位基因和A等位基因在大肠癌患者组与正常对照组间无显著差异(P>0.05)。结论就目前的研究结果来看,CTLA-4第1外显子区域+49A/G基因多态性与黑龙江省地区汉族人群中大肠癌的发病无相关性。 展开更多
关键词 细胞毒t淋巴细胞相关抗原4(CtLA-4) 大肠癌(CRC) 限制性片段长度多态性(rflp)
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DNA多态性分析技术及其在蚕业上的应用 被引量:1
4
作者 周泽扬 鲁成 +1 位作者 夏庆友 向仲怀 《蚕学通讯》 1996年第4期16-20,共5页
现代分子生物学的迅猛发展,使整个生命科学研究发生了深刻的革命.由之而孕育出的以基因组DNA多态性分析为核心的分子标记(molecular marker)技术,使人们对于生物遗传差异的认识,由表型(产物)特征深入到了分子水平,产生了由现象到本质的... 现代分子生物学的迅猛发展,使整个生命科学研究发生了深刻的革命.由之而孕育出的以基因组DNA多态性分析为核心的分子标记(molecular marker)技术,使人们对于生物遗传差异的认识,由表型(产物)特征深入到了分子水平,产生了由现象到本质的飞跃.DNA多态性是指基因组DNA在漫长的生命繁演历程中所发生的自然突变(DNA片断的插入、缺失、重排或碱基置换)状况的差异性.这种差异反映了基因组的本质特征。 展开更多
关键词 DNA多态性 分析技术 基因组DNA 分子标记 多态性分析 限制性片段长度多态性(rflp) 模板DNA 蚕业 限制性内切酶 遗传标记
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T-RFLP技术在厌氧氨氧化菌群结构分析中的应用 被引量:4
5
作者 储昭瑞 李相昆 +1 位作者 孟令威 张杰 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第2期26-30,共5页
为实现对样品中厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析,提出一种基于末端限制性片段长度多态性技术(T-RFLP)分析环境样品中厌氧氨氧化菌群结构的方法.通过对SILVA(R108)SSU Ref数据库中已知厌氧氨氧化菌16S rD-NA序列的模拟PCR和酶切分析,选... 为实现对样品中厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析,提出一种基于末端限制性片段长度多态性技术(T-RFLP)分析环境样品中厌氧氨氧化菌群结构的方法.通过对SILVA(R108)SSU Ref数据库中已知厌氧氨氧化菌16S rD-NA序列的模拟PCR和酶切分析,选取合适的PCR引物(Amx368f-Amx820r)和限制性内切酶(MspI和RsaI),使得不同厌氧氨氧化菌属对应不同末端片段长度(T-RFs),从而完成对厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析.重复性和灵敏性检验结果表明,该方法能够有效、稳定地应用于环境样品中厌氧氨氧化菌群落组成的快速分析. 展开更多
关键词 厌氧氨氧化 末端限制性片段长度多态性技术 菌群结构分析 模拟聚合酶链式反应 环境样品
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D2S44、D10S28、D4S163 VNTR多态性在亲子鉴定中的应用
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作者 黄如欣 周娟娟 洪素云 《临床输血与检验》 CAS 2000年第4期28-29,共2页
本文将限制性片段长度多态性(RFLP)技术检测数目可变的串联重复顺序(VNTR)位点的方法应用于亲子鉴定,极大地提高了鉴定准确性和亲权关系概率,现报告如下。
关键词 VNtR 限制性片段长度多态性 rflp 亲子鉴定 准确性 关系 位点 亲权 数目 技术检测
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DGGE和T-RFLP在堆肥微生物群落结构研究中的应用 被引量:4
7
作者 彭科峰 曹立群 +3 位作者 吴韶平 张晓东 张传富 王立群 《生物信息学》 2007年第1期31-33,共3页
对堆肥微生物种群分布及其动态变化的研究进行了分析,论述了分子生物技术中的变性梯度凝胶电泳和末端标记限制性片段长度多态性的原理和特点,以及用于研究堆肥微生物的群落结构演变规律,为分析和筛选堆肥中的微生物提供更加有效、快速... 对堆肥微生物种群分布及其动态变化的研究进行了分析,论述了分子生物技术中的变性梯度凝胶电泳和末端标记限制性片段长度多态性的原理和特点,以及用于研究堆肥微生物的群落结构演变规律,为分析和筛选堆肥中的微生物提供更加有效、快速的信息,促进堆肥技术的发展。 展开更多
关键词 堆肥 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 末端标记限制性片段长度多态性(t—rflp)
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基于T-RFLP和因子分析的香蒲根际细菌群落研究 被引量:7
8
作者 马栋山 熊薇 +3 位作者 张琼琼 郭羿宏 赵文吉 郭逍宇 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第10期2684-2691,共8页
以北京市永定河王平湿地为研究对象,应用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)对王平湿地再生水补水口及其远离补水口的香蒲根际细菌和氨氧化细菌(AOB)的群落结构及多样性变化进行分析,在此基础上结合MiCA3比对、典范对应分析(CCA)和多元... 以北京市永定河王平湿地为研究对象,应用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)对王平湿地再生水补水口及其远离补水口的香蒲根际细菌和氨氧化细菌(AOB)的群落结构及多样性变化进行分析,在此基础上结合MiCA3比对、典范对应分析(CCA)和多元统计中因子分析(FA),解析湿地不同空间细菌群落功能特性的变化.结果显示再生水补水口细菌群落各多样性指数均明显低于远离补水口细菌群落,而氨氧化细菌群落则呈现相反趋势.基于传统的T-RFLP片段MiCA3比对、CCA和FA相结合的分析表明:对细菌群落,占再生水补水口细菌群落总丰度55.6%的菌群与150bp代表的鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas sp.)具相似净化功能,并与总有机碳生物化学循环过程具密切关系,其次占再生水补水口上游细菌群落总丰度75.5%的菌群与81bp为代表的假单胞菌属(Pseudomonas sp.)和Geitlerinema sp.具相似净化功能,并与氮的生物化学循环过程具密切关系.占再生水补水口下游细菌群落总丰度68.7%的菌群与138bp代表的小单孢菌属(Micromonospora sp.)具相似净化功能,同时与重金属Cu、V、和Ti生物化学循环具密切关系.对氨氧化细菌,266bp受铵态氮影响较大,占再生水补水口氨氧化细菌群落总丰度65.5%的菌群与266bp代表的Nitrosomonas sp.具相似的生境特征,适合在高氨环境中生长;与58bp所代表的Nitrosospira sp.具相似功能特性菌群丰度在远离补水口样点中较前者呈现显著增加趋势,表征该类菌群适合在相对低氨环境中生长. 展开更多
关键词 因子分析(FA) 末端限制性片段长度多态性(t-rflp)技术 再生水 根际细菌
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纯胆固醇结石终端限制性片段长度多态性分析 被引量:2
9
作者 黄洁 张捷 +1 位作者 李玛琳 田大广 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期799-799,共1页
终端限制性片段长度多态性(T—RFLP)以分子生物学的手段,以微生物自身组成成分中的“家族特异性保守物质”的分子进化史等为主要工作对象来研究微生物的群落生态。我们采用T—RFLP技术对胆囊结石微生物群落16S rDNA基因序列进行分析... 终端限制性片段长度多态性(T—RFLP)以分子生物学的手段,以微生物自身组成成分中的“家族特异性保守物质”的分子进化史等为主要工作对象来研究微生物的群落生态。我们采用T—RFLP技术对胆囊结石微生物群落16S rDNA基因序列进行分析,探讨细菌群落与胆囊结石的发病机制之间的关系。 展开更多
关键词 限制性片段长度多态性分析 纯胆固醇结石 终端 微生物群落 分子生物学 rflp技术 群落生态 胆囊结石
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分子生物学技术在产甲烷古菌多样性研究中的应用 被引量:1
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作者 代金平 陈竞 +1 位作者 余雄 冯蕾 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第2期43-46,共4页
产甲烷技术因其具有废物资源综合利用和净化环境的双重功效而备受关注。为了解分子生物学技术在产甲烷古菌多样性研究中的应用,文章重点论述了分子生物学技术在产甲烷古菌多样性研究中应用的研究进展,旨在对后续我国北方地区低温甲烷古... 产甲烷技术因其具有废物资源综合利用和净化环境的双重功效而备受关注。为了解分子生物学技术在产甲烷古菌多样性研究中的应用,文章重点论述了分子生物学技术在产甲烷古菌多样性研究中应用的研究进展,旨在对后续我国北方地区低温甲烷古菌的研究和技术开发进行指导。 展开更多
关键词 甲烷 古菌 多样性 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 末端限制性片段长度多态性分析(trflp) 限制性片段长度多态性分析(rflp)
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Study on relationship of apolipoprotein E gene polymorphism and genetic susceptibility of stress urinary incontinence
11
作者 仝佳丽 郎景和 朱兰 《生殖医学杂志》 CAS 2010年第A02期54-58,共5页
Objective:To explore the relationship between apolipoprotein E(ApoE) gene polymorphism and susceptibility of stress urinary incontinence(SUI). Methods:ApoE genotypes were examined by polymerase chain reaction-restrict... Objective:To explore the relationship between apolipoprotein E(ApoE) gene polymorphism and susceptibility of stress urinary incontinence(SUI). Methods:ApoE genotypes were examined by polymerase chain reaction-restricted fragment length polymorphism (PCR-RFLP) technique in 99 patients with SUI and 101 asymptomatic controls. Results:The frequency of allele e3 of ApoE was slightly lower in patients with anatomic SUI than that in controls (79.44%vs.81.68%),while the frequency of allele e4 of ApoE was slightly higher in patients with anatomic SUI than that in controls(10.00%vs.9.90%).No significant difference was found in frequency of allele e3 or e4 between SUI patients and controls(x^2=0.523,P = 0.770). Conclusion:The gene polymorphism of ApoE is not independently involved in the development of SUI. 展开更多
关键词 基因多态性 遗传易感性 载脂蛋白E 尿失禁 限制性片段长度多态性 等位基因频率 APOE基因 rflp技术
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实时荧光PCR结合探针熔解曲线检测亚甲基四氢叶酸还原酶C677T基因多态性及其与肝硬化的相关性研究
12
作者 刘国政 李一荣 吴健民 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期618-620,共3页
聚合酶链反应.限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)是当前常用的检测基因多态性的方法之一,该法不仅操作时间长,且在采用限制性内切酶对PCR产物进行酶切后,通常采用溴乙锭或银染的方法观察结果。溴乙锭严重危害人体健康,而银染试剂... 聚合酶链反应.限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)是当前常用的检测基因多态性的方法之一,该法不仅操作时间长,且在采用限制性内切酶对PCR产物进行酶切后,通常采用溴乙锭或银染的方法观察结果。溴乙锭严重危害人体健康,而银染试剂相当不稳定。因此有必要建立一种快速且对人体危害性较低的多态性检测方法。实时荧光聚合酶链反应(PCR)是一种将先进的光学技术、温控技术、荧光素标记技术以及计算机软件有机结合的新型PCR,能够对PCR每一个循环的荧光强度进行监测,故称为实时荧光PCR。双探针杂交技术是一种重要的实时荧光PCR技术,通常用于基因的定量检测,但是如果结合探针熔解曲线则可用于基因多态性和突变的检测。 展开更多
关键词 荧光PCR技术 探针杂交技术 基因多态性 亚甲基四氢叶酸还原酶 定量检测 实时荧光 熔解曲线 C677t 聚合酶链反应(PCR) 限制性片段长度多态性
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污水处理工艺对氨氧化菌及细菌群落的影响 被引量:12
13
作者 王晓慧 文湘华 +2 位作者 杨宁宁 许美兰 丁鵾 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第6期622-628,共7页
采用针对氨氧化菌(AOB)功能基因氨单加氧酶(amoA)的末端限制性片段长度多态性技术(T-RFLP)、克隆测序等方法,研究了北京市2个污水处理厂的4个污水处理系统中AOB的群落结构,同时采用针对16SrRNA基因的T-RFLP技术分析了总细菌的群落结构.T... 采用针对氨氧化菌(AOB)功能基因氨单加氧酶(amoA)的末端限制性片段长度多态性技术(T-RFLP)、克隆测序等方法,研究了北京市2个污水处理厂的4个污水处理系统中AOB的群落结构,同时采用针对16SrRNA基因的T-RFLP技术分析了总细菌的群落结构.T-RFLP指纹图谱分析表明,4个污水处理系统中AOB的优势限制性片段(T-RF)均为291bp和354bp,细菌的优势T-RF为115,117,166,455,465,468,471,482,800,893bp等.说明污水处理工艺对系统中AOB及细菌的群落结构影响很小.对功能基因amoA的系统发育分析表明,4个污水处理系统中优势AOB均属于Nitrosomonas europaea cluster和Nitrosomonas oligotropha culster. 展开更多
关键词 氨氧化菌(AOB) 末端限制性片段长度多态性技术(t—rflp) 氨单加氧酶(amoA)处理工艺
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南京玄武湖浮游细菌群落结构的季节变化及其与环境因子的关系 被引量:23
14
作者 沈烽 赵大勇 +5 位作者 黄睿 王司辰 曹新益 徐慧敏 曾巾 余钟波 《湖泊科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第3期662-669,共8页
应用16S rRNA基因末端限制性片段长度多态性技术和多元统计方法,探究了南京玄武湖浮游细菌群落结构的季节性变化,并找出了浮游细菌群落组成分布的主要影响因子.结果表明,玄武湖4个季节中夏季Invsimpson指数、Shannon-Wiener指数和Pielo... 应用16S rRNA基因末端限制性片段长度多态性技术和多元统计方法,探究了南京玄武湖浮游细菌群落结构的季节性变化,并找出了浮游细菌群落组成分布的主要影响因子.结果表明,玄武湖4个季节中夏季Invsimpson指数、Shannon-Wiener指数和Pielou指数最高,而春季最低.非度量多维尺度分析结果显示浮游细菌群落结构存在着明显的季节性变化.Mantel检验、典范对应分析、变量分割分析表明影响玄武湖细菌群落结构最显著的环境因子为温度,其次为pH.营养盐浓度对玄武湖细菌群落结构的影响不显著.总的来说,本研究将有助于更好地理解富营养化水体中的浮游细菌群落组成的季节变化规律. 展开更多
关键词 浮游细菌 末端限制性片段长度多态性技术 多元统计 玄武湖
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石油污染生物修复研究进展 被引量:29
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作者 黄艺 礼晓 蔡佳亮 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2009年第1期361-367,共7页
石油污染多见于油田附近的土壤污染和海上油轮泄漏造成的海域污染,自1970s便出现了利用微生物降解石油污染物的生物修复研究,总结了1970s至今的相关文献发现石油污染生物修复技术受到越来越多的关注,其目前的主要研究方向包括:添加辅助... 石油污染多见于油田附近的土壤污染和海上油轮泄漏造成的海域污染,自1970s便出现了利用微生物降解石油污染物的生物修复研究,总结了1970s至今的相关文献发现石油污染生物修复技术受到越来越多的关注,其目前的主要研究方向包括:添加辅助营养物质或辅助乳化剂、石油污染降解过程的生物标记研究、菌株具体降解途径、工程示范研究。而由于石油污染成分复杂,不同微生物可利用的石油底物不同,降解途径也不同,因此传统的石油污染生物修复研究存在效率不高、难以维持等问题,而随着1990s以来分子生物学技术的迅速发展,其在石油污染生物修复中得到越来越多的应用,并有效地提高了修复效率。其应用主要包括以下两方面:(1)在掌握已有石油污染物生物降解途径和降解基因的基础上,研究针对石油污染不同底物的高效降解菌株,构建高效基因工程菌或功能互补的混合菌剂。譬如石油污染物的生物降解过程中,一系列的加氧酶/羟化酶起着最重要的作用,其中包括了单加氧酶和双加氧酶等。它们一般作用于降解的加羟基或后续的开环过程。而不同的脱氢酶、脱羧基酶、辅酶A连接酶等,则对底物加氧后的降解起着重要作用。因此本文重点分析整理了一系列典型石油污染物降解途径中的加氧酶及其参考菌株。(2)由于下游多态性分析方法的进步,越来越多的研究利用PCR对修复过程中群落的重要降解基因进行扩增,譬如对芳烃开环有重要作用的儿茶酚1,2-双加氧酶(C12O)、儿茶酚2,3-双加氧酶(C23O)以及对长链烷烃降解起作用的alkB,alkM等基因,并进而应用rDNA扩增及限制性位点分析、梯度凝胶电泳、末端限制性片段长度多态性分析等方法监测研究石油污染的生物降解过程。本文总结了近年来石油污染修复中应用上述方法的研究,为今后的石油污染生物修复工作提供参考。 展开更多
关键词 石油污染 生物降解 分子生物学技术 加氧酶 变性梯度凝胶电泳 末端限制性片段长度多态性分析
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饥饿及恢复喂食对花鲈肠道菌群多样性的影响 被引量:7
16
作者 潘艳艳 顾晓英 +1 位作者 张德民 钱云霞 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期776-784,共9页
为了研究饥饿及恢复摄食对花鲈肠道壁及内容物微生物菌群的影响,实验运用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术分析了花鲈经2周饥饿,恢复喂食1周和恢复喂食2周后肠道壁及其内容物菌群特征及多样性的变化。结果显示:饥饿会导致花鲈肠道... 为了研究饥饿及恢复摄食对花鲈肠道壁及内容物微生物菌群的影响,实验运用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术分析了花鲈经2周饥饿,恢复喂食1周和恢复喂食2周后肠道壁及其内容物菌群特征及多样性的变化。结果显示:饥饿会导致花鲈肠道壁细菌群落发生明显变化,引起差异的主要细菌为T-RFs 496、437、450、155 bp等所代表菌;经2周饥饿,肠壁T-RF 496 bp大肠杆菌(Escherichia)相对丰度从实验开始的43.11%±3.95%(C0肠壁组)下降为21.25%±9.97%(S2R0肠壁组),细菌多样性指数H′、E′和1/D均增大;恢复喂食2周后,肠道壁菌群结构逐渐恢复,T-RF 496 bp大肠杆菌的相对丰度逐渐上升到55.49%±8.37%(S2R2组),3个多样性指数均减小至原有水平;花鲈肠道壁和内容物的菌群有较大不同,但是两者的主要细菌类群都是变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),其中,γ-变形菌纲是花鲈肠道的最主要细菌群。本研究为进一步阐述消化道微生物功能奠定了基础,也为海水鱼类肠道菌群研究提供基础数据。 展开更多
关键词 花鲈 饥饿 恢复喂食 肠道菌落 末端限制性片段长度多态性技术
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南京内秦淮河浮游细菌群落结构分析 被引量:4
17
作者 徐慧敏 刘为锋 +5 位作者 吴燕 唐启彤 汤新政 黄睿 沈烽 赵大勇 《环境科学与技术》 CAS CSCD 北大核心 2016年第S1期1-5,共5页
为探讨城市河流浮游细菌群落结构的组成和多样性,并找出影响浮游细菌群落组成分布的主要环境因子。选取南京市内秦淮河3个采样点采集水样,应用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术分析各采样点的浮游细菌群落的随空间、时间的变化规... 为探讨城市河流浮游细菌群落结构的组成和多样性,并找出影响浮游细菌群落组成分布的主要环境因子。选取南京市内秦淮河3个采样点采集水样,应用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术分析各采样点的浮游细菌群落的随空间、时间的变化规律。结果表明,3个采样点共得到104个不同的片段(T-RFs)。各个采样点的浮游细菌群落组成不同,且不同时期不同采样点的优势细菌类群也不同。多维尺度分析(n MDS)的结果表明:浮游细菌群落按照水温的高低明显分为3个类群。典范对应分析(CCA)的结果表明:水温、溶解氧以及p H等理化指标对浮游细菌群落组成有显著影响(P<0.05)。 展开更多
关键词 浮游细菌 水温 末端限制性片段长度多态性技术 内秦淮河
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内蒙古高原干涸湖泊反硝化及甲烷氧化细菌的群落分析 被引量:6
18
作者 白玉涛 周玉 赵吉 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第7期1293-1301,共9页
以内蒙古高原半干旱草原区干涸湖泊为研究对象,应用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术对湿地土壤中的反硝化和甲烷氧化关联菌群的关键功能基因nosZ和pmoA进行了研究,根据末端限制性片段(T-RFs)分析了两种菌群的群落结构及多样性变化... 以内蒙古高原半干旱草原区干涸湖泊为研究对象,应用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)技术对湿地土壤中的反硝化和甲烷氧化关联菌群的关键功能基因nosZ和pmoA进行了研究,根据末端限制性片段(T-RFs)分析了两种菌群的群落结构及多样性变化,以及环境因素所产生的影响,并探讨了土壤微生物群落对湖泊干涸的响应机制.结果表明:干涸湖泊的湖心、湖底土壤反硝化和甲烷氧化细菌多样性指数较高,群落结构较复杂;而较早干涸的湖坡以及相邻草原对照区,两个菌群多样性指数较低,群落结构相对单一.从湖心到相邻草原,反硝化和甲烷氧化细菌的群落相似度逐渐降低,显示两个菌群处于动态演替中.湖泊干涸过程中,水分含量和有机质含量对反硝化和甲烷氧化细菌的群落结构影响显著;高pH值和高铵态氮分别对反硝化和甲烷氧化细菌有抑制作用.随着湖泊干涸,土壤微生物群落因环境扰动而受到胁迫,这一过程会加剧CO2等温室气体的排放. 展开更多
关键词 反硝化细菌 甲烷氧化细菌 末端限制性片段长度多态性(t-rflp)技术 干涸湖泊 草原湿地
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同型半胱氨酸及代谢酶基因多态性与脑卒中的相关性研究 被引量:15
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作者 傅毅 刘建荣 +2 位作者 倪培华 应雅韵 陈生弟 《中华老年医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期413-417,共5页
目的进一步确定亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T、胱硫醚β合成酶(CBS)基因844ins68、T27796C和甲硫氨酸合成酶(MS)基因A2756G这4种基因突变在脑卒中发病中的意义。方法选择年龄及性别基本匹配的脑梗死组78例、脑出血组26例、神... 目的进一步确定亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T、胱硫醚β合成酶(CBS)基因844ins68、T27796C和甲硫氨酸合成酶(MS)基因A2756G这4种基因突变在脑卒中发病中的意义。方法选择年龄及性别基本匹配的脑梗死组78例、脑出血组26例、神经系统其他疾病组29例和健康老年组50例,采用酶联免疫分析法测定受检者血浆同型半胱氨酸(Hcy)浓度,并运用多聚酶链反应限制性内切酶片段长度多态性技术,检测基因表型。结果脑梗死组和脑出血组血Hcy浓度明显高于神经系统其他疾病组和健康老年组。CBS844ins68及MSA2756G突变频率较国外报道明显低。此外,C677T纯合突变型的Hcy水平均高于野生型和杂合突变型,CBST27796C基因杂合子突变则可能使Hcy水平降低;而4种基因各组之间基因型频率差异无统计学意义。结论Hcy水平与脑卒中的发生有一定联系。CBS844ins68和MSA2756G突变可能存在种族或地域差异,MTHFRC677T纯合子突变可能是导致血浆总Hcy(tHcy)水平升高的遗传决定簇,而CBST27796C基因杂合子突变可能引起tHcy水平的降低;4种基因突变符合遗传平衡定律。 展开更多
关键词 代谢酶基因多态性 脑卒中 相关性研究 限制性内切酶片段长度多态性技术 亚甲基四氢叶酸还原酶 844ins68 胱硫醚Β-合成酶 血浆同型半胱氨酸 基因C677t 甲硫氨酸合成酶 酶联免疫分析法 多聚酶链反应 基因突变 其他疾病 神经系统
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河流水体与滨岸土壤微生物群落特征差异分析 被引量:2
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作者 刘睿 周孝德 +1 位作者 吴巍 贾如宾 《西安理工大学学报》 北大核心 2017年第4期384-389,共6页
本文采用末端限制性片段长度多态性技术,对比了渭河中游表层水、沉积物及滨岸土壤中总体细菌和氨氧化古菌(AOA)、氨氧化细菌(AOB)群落的物种丰度、均匀度与多样性,分析了不同样本中微生物群落结构的相似度和优势菌群的构成差异。结果表... 本文采用末端限制性片段长度多态性技术,对比了渭河中游表层水、沉积物及滨岸土壤中总体细菌和氨氧化古菌(AOA)、氨氧化细菌(AOB)群落的物种丰度、均匀度与多样性,分析了不同样本中微生物群落结构的相似度和优势菌群的构成差异。结果表明,河流滨岸土壤中微生物群落的整体物种丰度和多样性高于表层水和沉积物;土壤与表层水中共有的末端限制性片段(T-RF)数量及微生物群落结构的相似度,高于沉积物与表层水;不同类型样本间AOA、AOB各自的群落相似度,均高于不同类型样本间总体细菌群落相似度;表层水、沉积物和土壤中细菌优势物种构成差异显著,而AOA、AOB各自的优势物种构成相对一致但存在丰度差异。由分析结果推测,渭河滨岸土壤很可能是河流浮游微生物群落重要的源,对稳定氨氧化功能细菌和古菌优势群落、维持水体细菌群落多样性具有积极意义。 展开更多
关键词 渭河 微生物群落 末端限制性片段长度多态性技术 AOA AOB
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