2023年2月14日,《细胞发现》(Cell Discovery)在线刊登了浙江大学医学院李晓明教授团队与中国科学院生物物理研究所/北京师范大学王晓群教授、北京师范大学吴倩教授团队合作成果“Molecular and cellular evolution of the amygdala acr...2023年2月14日,《细胞发现》(Cell Discovery)在线刊登了浙江大学医学院李晓明教授团队与中国科学院生物物理研究所/北京师范大学王晓群教授、北京师范大学吴倩教授团队合作成果“Molecular and cellular evolution of the amygdala across species analyzed by single-nucleus transcriptome profiling”(DOI:10.1038/s41421-022-00506-y)。该研究利用单细胞转录组学方法构建了人、猕猴、小鼠和鸡的杏仁核单细胞转录组图谱,鉴定了大量杏仁核亚核团特异的神经元类型,揭示了杏仁核的跨物种保守性和差异,并为将来在细胞亚型水平研究杏仁核的功能打下了坚实的基础。展开更多
文摘目的分析慢性应激诱导的焦虑障碍模型小鼠杏仁核miRNA表达情况,探索在焦虑障碍中发挥作用的关键miRNA及其可能的作用靶点。方法选取24只8周龄C57BL/6雄性小鼠(体质量为18~22 g),采用区组随机法按照体质量分为焦虑障碍组(n=12)和对照组(n=12)。焦虑障碍组采用连续10 d的狭小空间约束方法(每天2 h)用于制造焦虑障碍小鼠模型,对照组无应激。造模完成后采用高架十字迷宫实验、旷场实验、明暗箱实验检测小鼠的焦虑样行为。采用转录组测序方法检测并分析焦虑障碍组小鼠和对照组小鼠杏仁核miRNAs表达情况,结合miRanda对差异表达miRNA靶基因进行预测,并进行功能注释(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库的信号通路分析,探索杏仁核中在焦虑障碍发挥作用的重要miRNA,并对其中关键miRNA进行RT-qPCR检测。结果焦虑障碍组小鼠在高架十字迷宫、旷场、明暗箱实验中均表现出显著的焦虑样行为。与对照组比较,焦虑障碍组小鼠杏仁核中共有35条差异表达miRNA。GO功能分析结果显示,预测靶基因在神经元突触可塑性相关功能显著富集。KEGG信号通路分析结果显示,差异miRNA预测靶基因在信号传导、癌症相关信号通路富集显著。经RT-qPCR检测,miR-128-2-5p在焦虑障碍组的表达显著降低(P<0.05),miR-10b-5p、miR-200a-3p、miR-200b-3p、miR-429-3p在焦虑障碍组的表达显著升高(P<0.05)。其中,miR-128-2-5p和miR-200a-3p的改变幅度与转录组测序结果基本一致。结论基于生物信息学分析获得的关键miRNA分子miR-128-2-5p及其下游靶基因bmpr2、if6、rbfox3可能是焦虑障碍潜在的干预治疗靶点。
文摘2023年2月14日,《细胞发现》(Cell Discovery)在线刊登了浙江大学医学院李晓明教授团队与中国科学院生物物理研究所/北京师范大学王晓群教授、北京师范大学吴倩教授团队合作成果“Molecular and cellular evolution of the amygdala across species analyzed by single-nucleus transcriptome profiling”(DOI:10.1038/s41421-022-00506-y)。该研究利用单细胞转录组学方法构建了人、猕猴、小鼠和鸡的杏仁核单细胞转录组图谱,鉴定了大量杏仁核亚核团特异的神经元类型,揭示了杏仁核的跨物种保守性和差异,并为将来在细胞亚型水平研究杏仁核的功能打下了坚实的基础。
