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云南松材用种质保存库的构建策略及检验
被引量:
2
1
作者
王晓丽
高成杰
李昆
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期105-114,共10页
为探讨云南松(Pinus yunnanensis Franch.)材用种质保存库构建的抽样策略并获得代表性子集,在其全分布区内选择26个代表性种群,每个种群选择30株样株组成原种质集,并选取18个表型性状测定值作为种质保存库的源数据。在此基础上,以地理...
为探讨云南松(Pinus yunnanensis Franch.)材用种质保存库构建的抽样策略并获得代表性子集,在其全分布区内选择26个代表性种群,每个种群选择30株样株组成原种质集,并选取18个表型性状测定值作为种质保存库的源数据。在此基础上,以地理种群分组,根据不加权类平均聚类分析结果进行取样;设定抽样比例分别为10%、20%、30%和40%,采用多样性指数法和改进的最小距离逐步取样法构建种质子集,并采用5个评价参数和主成分分析对不同抽样比例种质子集进行综合评价和确认。结果表明:各种质子集与原种质集18个表型性状的均值t检验均无显著差异;而40%、30%、20%和10%抽样比例种质子集分别有11、14、15和12个表型性状的方差总体上大于原种质集且差异显著,说明各种质子集表型性状的取值分散程度总体上大于原种质集。通过χ~2检验,40%、30%和20%抽样比例种质子集与原种质集18个表型性状的频率分布均无显著差异,而10%抽样比例种质子集仅有2个表型性状的频率分布与原种质集分别存在极显著和显著差异。在原种质集和4个种质子集中,不同等级样株的分布频率基本相同,但随抽样比例降低,1级、9级和10级的样株比例逐渐增大,说明在构建种质保存库时,应适当增加极端样株的比例。4个种质子集各表型性状的Shannon-Weaver遗传多样性指数(H′)普遍高于原种质集,且随抽样比例下降H′值总体增大;其中,20%抽样比例种质子集与原种质集表型性状的H′均值存在极显著差异,30%和10%抽样比例种质子集与原种质集表型性状的H′均值存在显著差异。综合评价结果表明:10%、20%、30%和40%抽样比例种质子集均可代表原种质集,其中,20%抽样比例种质子集可客观地代表原种质集的表型遗传多样性,且该种质子集的5个评价参数值综合效应优于其他种质子集。主成分分析结果表明:按照20%抽样比例构建的种质保存库能够解释的表型遗传信息量大于原种质集,且既保留了大量分布外缘的样株,又减少了中心区域大量重叠的样株,据此确认20%抽样比例种质保存库可以作为云南松材用种质的代表性子集。
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关键词
云南松
材用种质保存库
表型性状
抽样策略
表型遗传多样性
下载PDF
职称材料
基于SRAP分子标记的材用云南松种质保存库构建策略
被引量:
2
2
作者
王晓丽
高成杰
李昆
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期211-220,共10页
以云南松(Pinus yunnanensis Franch.)全分布区内干形优良的780株样株作为原种质,基于SRAP分析的位点作为种质保存库构建数据,设10%、20%、30%、40%4个抽样比例,采用改进的最小距离逐步取样法构建其种质子集。结果显示:种质子集的多态...
以云南松(Pinus yunnanensis Franch.)全分布区内干形优良的780株样株作为原种质,基于SRAP分析的位点作为种质保存库构建数据,设10%、20%、30%、40%4个抽样比例,采用改进的最小距离逐步取样法构建其种质子集。结果显示:种质子集的多态位点保留率均在90%以上且等位基因保留率皆大于95%,5个遗传多样性评价参数最小值均为10%抽样比例种质子集,且该子集居群内的遗传多样性小于原种质;在种质子集与原种质的均值t检验中,10%抽样比例种质子集有2个指标与原种质间存在显著差异;方差F检验中,20%和10%抽样比例种质子集的分别有1个和6个遗传多样性指标与原种质有显著差异且方差小于原种质;种质子集的遗传多样性均值与原种质的相关系数全部达到0.99以上,40%和30%抽样比例种质子集的遗传多样性方差与原种质的相关系数均大于0.80; 30%抽样比例种质保存库的平均遗传距离较原种质提高了52.16%,保持了原种质的方差分量分配模式,以较大的遗传距离实现了与原种质相似的聚类。本研究确认30%抽样比例种质保存库可以作为材用云南松种质资源的代表性子集。
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关键词
云南松
材用种质保存库
取样策略
SRAP分子标记
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职称材料
题名
云南松材用种质保存库的构建策略及检验
被引量:
2
1
作者
王晓丽
高成杰
李昆
机构
中国林业科学研究院资源昆虫研究所
西南林业大学林学院
出处
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期105-114,共10页
基金
中国林业科学研究院基本科研业务费专项(CAFYBB2017SY030)
文摘
为探讨云南松(Pinus yunnanensis Franch.)材用种质保存库构建的抽样策略并获得代表性子集,在其全分布区内选择26个代表性种群,每个种群选择30株样株组成原种质集,并选取18个表型性状测定值作为种质保存库的源数据。在此基础上,以地理种群分组,根据不加权类平均聚类分析结果进行取样;设定抽样比例分别为10%、20%、30%和40%,采用多样性指数法和改进的最小距离逐步取样法构建种质子集,并采用5个评价参数和主成分分析对不同抽样比例种质子集进行综合评价和确认。结果表明:各种质子集与原种质集18个表型性状的均值t检验均无显著差异;而40%、30%、20%和10%抽样比例种质子集分别有11、14、15和12个表型性状的方差总体上大于原种质集且差异显著,说明各种质子集表型性状的取值分散程度总体上大于原种质集。通过χ~2检验,40%、30%和20%抽样比例种质子集与原种质集18个表型性状的频率分布均无显著差异,而10%抽样比例种质子集仅有2个表型性状的频率分布与原种质集分别存在极显著和显著差异。在原种质集和4个种质子集中,不同等级样株的分布频率基本相同,但随抽样比例降低,1级、9级和10级的样株比例逐渐增大,说明在构建种质保存库时,应适当增加极端样株的比例。4个种质子集各表型性状的Shannon-Weaver遗传多样性指数(H′)普遍高于原种质集,且随抽样比例下降H′值总体增大;其中,20%抽样比例种质子集与原种质集表型性状的H′均值存在极显著差异,30%和10%抽样比例种质子集与原种质集表型性状的H′均值存在显著差异。综合评价结果表明:10%、20%、30%和40%抽样比例种质子集均可代表原种质集,其中,20%抽样比例种质子集可客观地代表原种质集的表型遗传多样性,且该种质子集的5个评价参数值综合效应优于其他种质子集。主成分分析结果表明:按照20%抽样比例构建的种质保存库能够解释的表型遗传信息量大于原种质集,且既保留了大量分布外缘的样株,又减少了中心区域大量重叠的样株,据此确认20%抽样比例种质保存库可以作为云南松材用种质的代表性子集。
关键词
云南松
材用种质保存库
表型性状
抽样策略
表型遗传多样性
Keywords
Pinus yunnanensis Franch.
timber-used germplasm conservation bank
phenotypic trait
sampling strategy
phenotypic genetic diversity
分类号
S722.8 [农业科学—林木遗传育种]
S791.257 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
基于SRAP分子标记的材用云南松种质保存库构建策略
被引量:
2
2
作者
王晓丽
高成杰
李昆
机构
中国林业科学研究院资源昆虫研究所
西南林业大学林学院
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期211-220,共10页
基金
中国林业科学研究院基本科研业务费专项(CAFYBB2017SY030)
十三五农村领域国家科技计划(2015BAD07B0404)~~
文摘
以云南松(Pinus yunnanensis Franch.)全分布区内干形优良的780株样株作为原种质,基于SRAP分析的位点作为种质保存库构建数据,设10%、20%、30%、40%4个抽样比例,采用改进的最小距离逐步取样法构建其种质子集。结果显示:种质子集的多态位点保留率均在90%以上且等位基因保留率皆大于95%,5个遗传多样性评价参数最小值均为10%抽样比例种质子集,且该子集居群内的遗传多样性小于原种质;在种质子集与原种质的均值t检验中,10%抽样比例种质子集有2个指标与原种质间存在显著差异;方差F检验中,20%和10%抽样比例种质子集的分别有1个和6个遗传多样性指标与原种质有显著差异且方差小于原种质;种质子集的遗传多样性均值与原种质的相关系数全部达到0.99以上,40%和30%抽样比例种质子集的遗传多样性方差与原种质的相关系数均大于0.80; 30%抽样比例种质保存库的平均遗传距离较原种质提高了52.16%,保持了原种质的方差分量分配模式,以较大的遗传距离实现了与原种质相似的聚类。本研究确认30%抽样比例种质保存库可以作为材用云南松种质资源的代表性子集。
关键词
云南松
材用种质保存库
取样策略
SRAP分子标记
Keywords
Pinus yunnanensis
Germplasm bank for timber
Sampling strategy
SRAP marker
分类号
S791.257 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
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被引量
操作
1
云南松材用种质保存库的构建策略及检验
王晓丽
高成杰
李昆
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
2
下载PDF
职称材料
2
基于SRAP分子标记的材用云南松种质保存库构建策略
王晓丽
高成杰
李昆
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
2
下载PDF
职称材料
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