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2021—2023年安徽省手足口病柯萨奇病毒A组16型分子分型研究
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作者 葛盈露 杨灵康 +4 位作者 刘以诺 马婉婉 王鹏 孙永 史永林 《热带病与寄生虫学》 CAS 2024年第4期233-238,共6页
目的了解安徽省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)发病情况、柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)基因型别分布情况和VP1基因进化特征。方法通过中国疾病预防控制信息系统对2021—2023年安徽省HFMD发病情况和病原... 目的了解安徽省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)发病情况、柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)基因型别分布情况和VP1基因进化特征。方法通过中国疾病预防控制信息系统对2021—2023年安徽省HFMD发病情况和病原学检测情况进行统计。收集HFMD患者咽拭子样本,分离得到CVA16毒株,对其VP1区进行PCR扩增和基因序列测定,使用肠道病毒在线分型工具鉴定基因亚型,运用MegAlign比较核苷酸和氨基酸同源性,利用MEGA 6.0构建进化树,并分析VP1区氨基酸变异位点。结果2021—2023年安徽省累计报告HFMD病例155640例,年均报告发病率为84.83/10万。2021—2023年安徽省16个地市共报告HFMD实验室确诊病例12643例,其中CV-A16占18.16%(2296/12643),各年度构成比分别为25.81%(1127/4366)、33.69%(782/2321)和6.50%(387/5956)。2021—2023年安徽省共分离到HFMD CV-A16毒株72株,其中B1a和B1b基因亚型分别为58株(占80.56%)、14株(占19.44%)。两种亚型毒株与CV-A16原型株G-10的核苷酸和氨基酸同源性分别为73.80%~76.20%和90.60%~92.30%。进化树显示B1a基因亚型流行株在遗传进化上分为4个分支簇,B1b基因亚型流行株形成3个分支簇。72条VP1区基因序列与原型株比较发现了26个氨基酸位点发生变异。结论2021—2023年安徽省HFMD CV-A16主要流行的基因亚型为B1a和B1b,B1a为优势基因亚型,应加强对CV-A16流行毒株的分子监测。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒a16 VP1编码区 进化分析 安徽省
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云南省昆明地区2022年柯萨奇病毒A16型的VP1区分子特征
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作者 张磊 沈茹 +2 位作者 楚昭阳 马绍辉 李丽 《昆明医科大学学报》 CAS 2024年第7期73-78,共6页
目的对昆明市某医院2022年从手足口病患儿分离的柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CVA16)的全VP1基因区分子特征分析。方法对昆明市某医院2022年从手足口病(hand foot mouth disease,HFMD)患儿200份临床样品粪便标本进行处理,分别... 目的对昆明市某医院2022年从手足口病患儿分离的柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CVA16)的全VP1基因区分子特征分析。方法对昆明市某医院2022年从手足口病(hand foot mouth disease,HFMD)患儿200份临床样品粪便标本进行处理,分别通过RD细胞和Vero细胞分离,对经3次培养后仍产生细胞效应(cytopathogenic effect,CPE)的细胞培养液提取病毒核酸,然后用通用引物222/224经RT-PCR扩增并测序,序列经BLAST比对确定其血清型,对鉴定为柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CVA16)的再用特异引物CA16VP1F/CA16VP1R扩增其全VP1区并测序和拼接。下载CVA16病毒标准序列,采用Geneious 5.4.1和MEGA 6.05等软件对本研究CVA16的全VP1区的核苷酸和氨基酸序列分析。结果经鉴定后共检出22株从Vero细胞分离CVA16和6株RD细胞分离的CVA16毒株,进一步通过特异引物扩增获得21株可用的CVA16VP1全长序列,基于全VP1基因系统进化分析,这21株CVA16全属于B1a基因型。21株CVA16全长VP1基因之间的核苷酸和氨基酸序列同源性均较高,分别为91.9%~99.6%和89.2%~99.3%;与中国CVA16 B1a基因型的其他株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为89.7%~96.3%和89.2%~97.0%。与CVA16 B1b其他参考株对比,其核苷酸和氨基酸序列同源性分别在84.3%~87.2%和89.2%~97.0%。与其它CVA16的B1a基因亚型相比较发现21个氨基酸位点出现变异。结论2022年中国云南省昆明某医院引起HFMD的CVA16毒株属于B1a基因型,应继续监测以明确其流行特征。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a16 全VP1基因 序列分析
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2016—2020年安徽省手足口病相关柯萨奇病毒A组16型分子分型研究 被引量:1
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作者 冯明子 傅荔艳 +4 位作者 葛盈露 马婉婉 王鹏 孙永 史永林 《热带病与寄生虫学》 CAS 2023年第4期199-203,共5页
目的了解安徽省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)相关柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)基因型别分布情况。方法通过中国疾病预防控制信息系统传染病报告管理信息系统收集安徽省2016—2020年HFMD病例资料,并收集... 目的了解安徽省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)相关柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)基因型别分布情况。方法通过中国疾病预防控制信息系统传染病报告管理信息系统收集安徽省2016—2020年HFMD病例资料,并收集HFMD患儿咽拭子标本。对荧光定量PCR检出的CV-A16核酸阳性病例样本采用RT-PCR扩增VP1区基因片段并测序。运用肠道病毒在线分型工具确定基因型别,再利用MEGA 6.0生物软件构建CV-A16 VP1区基因进化树并分析VP1区氨基酸变异位点。结果2016—2020年安徽省累计报告HFMD实验室确诊病例16650例,其中CV-A16确诊病例3809例(占22.88%),各年中CV-A16确诊病例占比依次为20.72%(219/1057)、22.91%(677/2955)、23.89%(1004/4202)、42.58%(1687/3962)、4.96%(222/4474)。对获取的436份CV-A16阳性标本进行测序,获得290条VP1区基因序列,均属于B基因型,其中B1a基因亚型65条,B1b 225条。290条VP1区基因序列核苷酸同源性为86.80%~100.00%,与CV-A16原型株G-10核苷酸同源性为74.10%~76.80%。65条B1a毒株VP1区基因序列与B1a参考株核苷酸同源性为93.00%~99.90%,225条B1b毒株VP1区基因序列与B1b参考株核苷酸同源性为88.40%~99.60%。B1a基因亚型流行株在遗传进化上分为4个分支簇,B1b基因亚型流行株在遗传进化上分为6个分支簇。与原型株G-10 VP1区编码氨基酸位点变异分析显示,290条VP1区基因存在多个位点变异。结论2016—2020年安徽省HFMD CV-A16流行株B1a与B1b基因亚型二者共同流行,应持续关注安徽省肠道病毒病原监测与分子进化变异情况。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒a16 分子分 安徽省
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盐酸石蒜碱硫酯体内抗柯萨奇病毒A16的药效研究 被引量:4
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作者 王辉强 颜海燕 +2 位作者 李兴琼 杨杰 李玉环 《中国药物警戒》 2023年第1期79-84,共6页
目的研究盐酸石蒜碱硫酯在体内抗柯萨奇病毒A16(CVA16)的药效。方法通过腹腔注射病毒液方式感染10~11 d的ICR小鼠建立CVA16感染的小鼠模型。实验分为盐酸石蒜碱硫酯1.0、0.5、0.25 mg·kg^(-1)组;50 mg·kg^(-1)RBV对照组;病毒... 目的研究盐酸石蒜碱硫酯在体内抗柯萨奇病毒A16(CVA16)的药效。方法通过腹腔注射病毒液方式感染10~11 d的ICR小鼠建立CVA16感染的小鼠模型。实验分为盐酸石蒜碱硫酯1.0、0.5、0.25 mg·kg^(-1)组;50 mg·kg^(-1)RBV对照组;病毒对照组;正常对照组。检测盐酸石蒜碱硫酯对病毒感染后小鼠发病情况、小鼠存活率和平均存活日;蛋白免疫印迹法(Western-blot)检测肌肉组织中病毒蛋白的表达水平;采用细胞病变效应法(CPE)测定肌肉组织中的病毒滴度;采用苏木素伊红(HE)染色检测肌肉组织的病理变化。结果与病毒对照组相比,盐酸石蒜碱硫酯1.0和0.5 mg·kg^(-1)剂量组能够显著降低小鼠肌肉组织的病毒滴度和病毒蛋白表达,降低CVA16感染造成的小鼠肌肉组织的炎症损伤,延缓小鼠的发病过程,显著延长小鼠的平均存活时间,增加小鼠的存活率,具有明确的保护作用。结论盐酸石蒜碱硫酯1.0和0.5 mg·kg^(-1)剂量组对CVA16感染小鼠具有显著明确的保护作用,提示盐酸石蒜碱硫酯可能成为潜在的治疗手足口病的药物。 展开更多
关键词 盐酸石蒜碱硫酯 柯萨奇病毒a16 手足口病 体内抗病毒药效 小鼠
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柯萨奇病毒A组16型抗原ELISA定量检测方法的建立与初步应用
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作者 张浩然 姜莉 +5 位作者 刘鹏 田华平 刘碧云 徐华 曹明翔 杨二霞 《质量安全与检验检测》 2023年第6期32-37,共6页
为建立柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CA16)抗原双抗体夹心ELISA定量检测方法,用于CA16灭活疫苗的研发和生产。本文以纯化的CA16病毒颗粒免疫新西兰兔,分离含有CA16-IgG的血清,经纯化得到纯度较好的CA16-IgG作为包被抗体;将辣... 为建立柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CA16)抗原双抗体夹心ELISA定量检测方法,用于CA16灭活疫苗的研发和生产。本文以纯化的CA16病毒颗粒免疫新西兰兔,分离含有CA16-IgG的血清,经纯化得到纯度较好的CA16-IgG作为包被抗体;将辣根过氧化物酶标记到CA16-IgG上作为酶标抗体。用CA16抗原国家标准品对建立方法的特异性、稳定性、精密度、准确度及线性和最低检测下限进行验证。用建立的方法检测疫苗生产中各工艺段关键中间品(包括CA16收获液、超滤浓缩液、纯化液、原液)的抗原含量。结果显示建立了CA16抗原的ELISA定量检测方法。该方法的线性范围为0.71~45.45 ng/mL,决定系数>0.99,最低检测下限为2.84 ng/mL;精密度良好,变异系数<15%;不同浓度的样本相对偏倚(RB)均≤±12%,准确度良好;将检测板密封后置于37℃5 d,决定系数>0.99且变异系数<15%,稳定性良好;与CA16以外的其他样品无交叉反应,特异性良好。随着CA16疫苗制备过程的不断推进,中间品的比活呈上升趋势。构建的CA16抗原ELISA定量检测方法符合定量检测需要,可用于CA16疫苗研发及生产。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a16 酶联免疫吸附测定 手足口病
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免疫细胞化学p16/Ki-67双染联合高危型HPV-DNA检测对宫颈癌的筛查价值
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作者 李冬青 蔡素琴 《实用中西医结合临床》 2024年第13期107-109,共3页
目的探讨免疫细胞化学p16/Ki-67双染配合高危型人乳头瘤病毒(HPV)-核糖核酸(DNA)检测对宫颈癌筛查的诊断价值。方法选取2021年8月至2022年8月于医院行阴道镜检查及宫颈组织病理学检测的98例患者为研究对象,在进行阴道镜检查前留存患者... 目的探讨免疫细胞化学p16/Ki-67双染配合高危型人乳头瘤病毒(HPV)-核糖核酸(DNA)检测对宫颈癌筛查的诊断价值。方法选取2021年8月至2022年8月于医院行阴道镜检查及宫颈组织病理学检测的98例患者为研究对象,在进行阴道镜检查前留存患者宫颈脱落细胞进行p16/Ki-67双染检测。结果纳入研究的98例患者病理检测阳性有86例,正常及慢性炎症12例。86例阳性患者包括高级别鳞状上皮内病变(HSIL)患者52例、低级别鳞状上皮内病变(LSIL)患者(CINⅠ)29例及宫颈癌(SCC)患者5例;p16/Ki-67双染色法的共检出73例阳性,高危型HPV-DNA共检出70例阳性,p16/Ki-67双染色法联合HPV-DNA检测共检出85例阳性;p16/Ki-67双染色法联合高危型HPV-DNA检测宫颈病变的灵敏度、准确度均高于两者单独检测(P<0.05);Kappa检验显示:两种措施联合检查结果同组织病理检查结果的一致性极好(Kappa值=0.771,P=0.000)。结论在宫颈癌筛查诊断中,采用免疫细胞化学p16/Ki-67双染法配合高危型HPV-DNA检测效果显著,能够进一步提高疾病筛查的准确度。 展开更多
关键词 宫颈癌 免疫细胞化学p16/Ki-67双染法 高危人乳头瘤病毒 检测筛查 诊断价值
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柯萨奇病毒A组16型中国分离株(Cox.A16 SHZH00-1)全基因组序列测定及分析 被引量:61
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作者 李琳琳 何雅晴 +4 位作者 朱俊萍 薛颖 朱雅芳 徐星晔 金奇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期217-222,共6页
对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7410bp,其中5′端非编码区(5′U... 对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7410bp,其中5′端非编码区(5′UTR)长为745bp,病毒基因组编码区全长6582个核苷酸,编码一个含2193个氨基酸残基的多聚蛋白,3′端非编码区长为83bp。Cox.A16SHZH00-1基因组的结构与Cox.A16亚洲地方株Tainan-5079-98(AF177911)十分相近,整个基因组的核苷酸同源性为97.5%,氨基酸同源性为98.8%;而与Cox.A16国际标准株G10(U05876)差别较大,两者核苷酸同源性仅为79.1%,氨基酸同源性为94.5%。Cox.A16SHZH00-1与两株肠道病毒71型SHZH03(AY465356)和BrCr(U22521)比较,核苷酸同源性均不超过80%。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a16 基因组 手足口病 同源性 序列分析 中国分离株 儿童
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内标多重荧光RT-PCR同时检测肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型 被引量:20
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作者 肖性龙 何雅青 +8 位作者 余以刚 杨洪 李惠芳 杨晓泉 张经纬 陈谷 刘冬梅 李小凤 吴晖 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期98-104,共7页
[目的]为对当前爆发的手足口病进行快速准确的检测。[方法]本研究建立了含内标的同时检测EV71和CA16的多重荧光RT-PCR方法,对该方法的特异性、灵敏度等进行评估,并对400多份临床样品进行了检测。[结果]实验结果表明,该检测方法特异... [目的]为对当前爆发的手足口病进行快速准确的检测。[方法]本研究建立了含内标的同时检测EV71和CA16的多重荧光RT-PCR方法,对该方法的特异性、灵敏度等进行评估,并对400多份临床样品进行了检测。[结果]实验结果表明,该检测方法特异性强,对10株EV71病毒、8株CA16病毒和25株其他人类病毒进行了检测,特异性为100%;该检测方法对EV71和CA16的检测灵敏度分别达到0.1 TCID50和1 TCID50;将0.1-104TCID50/mL EV71和CA16样本进行重复性实验,其变异系数分别为0.9%-2.0%和0.9%-2.3%。对400多份临床样品分别进行荧光RT-PCR检测和传统方法检测,结果显示,荧光RT-PCR对EV71和CA16的阳性检出率平均为46.1%和14.2%,比传统方法(34.5%和12.8%)的阳性检测率高。另外,实验数据显示,在粪便、直肠拭子、咽喉拭子样本中,PCR抑制物存在的比例为1.8%-3.4%,表明内标对监控PCR抑制物的存在具有重要作用。[结论]本方法能同时对EV71和CA16进行快速检测,并且灵敏度高,特异性好,由于加入了内标,能有效地监控假阴性的出现,适合于手足口病的临床检测。 展开更多
关键词 内标 多重荧光RT-PCR EV71 柯萨奇病毒a16 检测
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中国柯萨奇病毒A组16型部分VP1区序列测定及系统进化分析 被引量:19
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作者 卫灿东 李琳琳 +3 位作者 何雅晴 徐星晔 薛颖 金奇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期223-227,共5页
利用1999~2004年连续6年从中国深圳及北京地区分离的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,Cox.A16)毒株的部分VP1区基因序列进行分析和研究,试图找出中国Cox.A16的种系进化规律和分型依据.6株Cox.A16病毒部分VP1区核苷酸和氨基酸同... 利用1999~2004年连续6年从中国深圳及北京地区分离的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,Cox.A16)毒株的部分VP1区基因序列进行分析和研究,试图找出中国Cox.A16的种系进化规律和分型依据.6株Cox.A16病毒部分VP1区核苷酸和氨基酸同源性均较高,相互间核苷酸同源性为94.5%~98.0%,氨基酸同源性为97.8%~100%.6株中国分离株与Cox.A16国际参考株相比,部分VP1区核苷酸同源性高于78.2%,氨基酸同源性高于为93.3%.基因系统进化分析表明,中国大陆分离的6株Cox.A16与中国台湾流行株Tainan-5079-98(AF177911),与4株日本分离株、瑞典株及美国株GA95-2095(AF081613)、PA94-5753(AF081628)的关系均较近,核苷酸同源性大于93.3%.了解我国Cox.A16流行株的遗传学背景和种系进化关系,对有效地预防和控制Cox.A16流行有重要意义. 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a16 手足口病 系统进化分析 VP1区 序列测定 中国分离株 儿童
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HPLC-UV法检测EV71-CA16二价手足口病灭活疫苗原液相关抗原纯度的方法建立与评价
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作者 曹明翔 徐华 +4 位作者 张浩然 刘鹏 毛正睿 姜莉 杨二霞 《质量安全与检验检测》 2024年第2期21-26,共6页
为建立一种准确可靠的高效液相色谱-紫外(HPLC-UV)方法,检测EV71-CA16二价手足口病(HFMD)灭活疫苗原液中的相关抗原,肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(CA16)的纯度。本文采用Waters体积排阻色谱柱(SEC,UltrahydrogelTM 2507.8... 为建立一种准确可靠的高效液相色谱-紫外(HPLC-UV)方法,检测EV71-CA16二价手足口病(HFMD)灭活疫苗原液中的相关抗原,肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(CA16)的纯度。本文采用Waters体积排阻色谱柱(SEC,UltrahydrogelTM 2507.8×300 mm,6μm),流动相为0.01 mol/L的PBS中再加入0.1 mol/L氯化钠溶液,等度洗脱,流速0.3 mL/min,检测波长280 nm,进样量50μL,柱温21℃,进行EV71与CA16病毒原液的纯度检测,并对该方法的检测限、拖尾因子、专属性、重复性及检测范围进行验证。结果显示,2种抗原的灵敏度溶液的信噪比(S/N)分别为37.053和47.710,均远大于3,各试样的拖尾因子均小于3;CA16原液和EV71原液经HPLC分离纯化后的目标抗原峰馏分经SDS-PAGE和Western-Blot特异性鉴定,结果显示,色谱峰样品组成分别为CA16和EV71的2种病毒衣壳的结构蛋白,表明本检测方法专属性高。不同浓度的EV71与CA16病毒抗原经多次检测后,各浓度条件下的峰面积百分比与保留时间的RSD均小于1%,重复性良好。不同抗原浓度批样品检测结果显示,CA16原液抗原浓度在89 U/mL~26398 U/mL之间,EV71原液抗原浓度在170 U/mL~9074 U/mL之间时,2种抗原溶液经多次检测统计显示峰面积百分比与保留时间的RSD均小于1%,本方法在该抗原浓度范围内准确可靠,适用于EV71-CA16二价手足口病灭活疫苗原液中病毒抗原纯度的检测。 展开更多
关键词 高效液相色谱-紫外法 EV71-Ca16二价手足口病灭活疫苗 纯度 肠道病毒71(EV71) 柯萨奇病毒a16(Ca16)
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肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型分离株的VP1基因特征分析 被引量:13
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作者 张建华 江炳福 +2 位作者 程险峰 游贤惠 孟继鸿 《东南大学学报(医学版)》 CAS 2013年第2期173-179,共7页
目的:探讨苏皖地区手足口病(HFMD)患者肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CA16)分离株的VP1基因特征。方法:采集南京市、马鞍山市2009至2010年HFMD患者临床标本进行病毒分离和RT-PCR鉴定;扩增并测定VP1基因序列;从GenBank中选取EV71... 目的:探讨苏皖地区手足口病(HFMD)患者肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CA16)分离株的VP1基因特征。方法:采集南京市、马鞍山市2009至2010年HFMD患者临床标本进行病毒分离和RT-PCR鉴定;扩增并测定VP1基因序列;从GenBank中选取EV71和CA16不同基因型参考毒株,利用生物信息学软件进行同源性比对和系统进化树分析。结果:共分离到9株EV71和4株CA16,EV71分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为96.5%~99.8%和99%~100%;CA16分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性为96.2%~98.5%和99.3%~100%;系统进化树分析显示,9株EV71全部属于C4a基因亚型,而4株CA16则全部属于B1b基因亚型。结论:2009至2010年苏皖地区分离到的EV71和CA16毒株分别属于C4a和B1b基因亚型,与国内其他地区HFMD病原学及分子进化研究结果一致,有望成为疫苗候选株作进一步研究。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒71 柯萨奇病毒a16 VP1 基因特征
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肠道病毒71型、柯萨奇病毒A组16型相关手足口病临床特征分析 被引量:17
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作者 毛莉萍 秦刚 +3 位作者 徐明 李海波 朱勇根 章幼奕 《疑难病杂志》 CAS 2015年第7期746-748,共3页
目的分析肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CA16)相关手足口病(HFMD)的临床特征。方法回顾性分析209例EV71及CA16相关HFMD患儿临床资料,并进行比较。结果普通型HFMD患儿中,EV71感染患儿平均月龄偏大,体温高,呕吐及臀部出疹率高(P&... 目的分析肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CA16)相关手足口病(HFMD)的临床特征。方法回顾性分析209例EV71及CA16相关HFMD患儿临床资料,并进行比较。结果普通型HFMD患儿中,EV71感染患儿平均月龄偏大,体温高,呕吐及臀部出疹率高(P<0.05);CA16感染患儿男性偏多,发热天数长,心率快,AST、CRP显著升高(P<0.05)。重症HFMD患儿中,EV71所致病例多于CA16所致者(P<0.05),且嗜睡、肌震颤、易惊等临床表现的发生率高,易并发脑膜脑炎、脑干脑炎(P<0.05),实验室指标WBC、血糖(GLU)水平升高(P<0.05);CA16感染患儿男性较多,流涎、腹泻、口腔溃疡发生率高(P<0.05),实验室指标AST、CK、CRP水平显著升高(P<0.05)。结论 EV71及CA16相关HFMD临床特征有所不同,根据临床表现结合实验室指标WBC、GLU、AST及CRP等,有助于区分EV71或CA16感染。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒71 柯萨奇病毒a16
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2011~2012年武汉地区柯萨奇病毒A16型VP1基因的遗传进化分析 被引量:8
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作者 伍仕敏 项杰 +4 位作者 周虹 吴志强 李虹泽 刘为勇 吴建国 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期272-276,共5页
目的了解武汉地区手足口病(HFMD)患儿柯萨奇病毒A16型(CA16)的基因型及重组特点。方法收集2011年4月至2012年3月武汉地区1 844例HFMD患儿的咽拭子标本,用实时荧光定量PCR检测CA16核酸,阳性标本进行病毒分离,对分离株进行VP1基因序列测序... 目的了解武汉地区手足口病(HFMD)患儿柯萨奇病毒A16型(CA16)的基因型及重组特点。方法收集2011年4月至2012年3月武汉地区1 844例HFMD患儿的咽拭子标本,用实时荧光定量PCR检测CA16核酸,阳性标本进行病毒分离,对分离株进行VP1基因序列测序,选择2株来自重症和1株来自轻症患儿的CA16病毒株构建VP1序列系统进化树并分析其全基因组序列的重组特点。结果 1 844例HFMD患儿的咽拭子标本中分离出42株CA16,VP1序列系统进化分析显示,所有分离株均属于B1亚型,其中13株属于B1a亚群,29株属于B1b亚群。重组分析表明,3株CA16分离株均为亲本株CA16 A型毒株FY18/AH/CHN/2008和EV71 A型毒株Hubei-09/HB/CHN/2009型间重组所产生,重组交叉位点为基因组P2区2A和2B基因交界处。结论武汉地区的CA16分离株均为B1亚型,其中B1b亚群占明显优势,且CA16分离株存在亲本株CA16A型和EV71 A型毒株的型间重组。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a16 手足口病 重组 系统进化分析
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湖北2013年部分柯萨奇A16型肠道病毒VP1基因分子特征分析 被引量:5
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作者 李静 占建波 +3 位作者 杨朝晖 雷亚克 张婷 李国明 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期320-324,共5页
目的全面研究和了解2013年湖北省柯萨奇A16型的VP1基因特征,分析CVA16型病毒在我省的基因型别及分子进化分析。方法对2013年湖北省21株CVA16病毒流行株进行VP1区全长基因序列测定,并对核苷酸及氨基酸序列进行同源性比较及系统进化分析... 目的全面研究和了解2013年湖北省柯萨奇A16型的VP1基因特征,分析CVA16型病毒在我省的基因型别及分子进化分析。方法对2013年湖北省21株CVA16病毒流行株进行VP1区全长基因序列测定,并对核苷酸及氨基酸序列进行同源性比较及系统进化分析。结果2013年湖北省21株CVA16型病毒流行株的VP1区核苷酸序列全长均为891bp,VP1区核苷酸和蛋白氨基酸序列同源性分别为90.0%~100.0%和96.3%~100.0%。VP1区基因系统进化分析表明,湖北CVA16流行株主要位于ligeage1和3分支上,分属于B1a和B1b基因亚型。结论 2013年湖北省21株CVA16型流行株主要为B1b基因亚型,其次为B1a基因亚型,在同一地区有两种基因亚型的CVA 16病毒同时存在,在不同的地区存在同一种亚型的CVA16病毒。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒CVa16 VP1区 基因特征
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利用减毒沙门菌递送的柯萨奇病毒A16型VP1基因重组质粒的构建和鉴定 被引量:5
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作者 刘泽 白冰珂 +4 位作者 高蓉 蔡少平 胡燕 沈宏辉 貌盼勇 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期501-503,共3页
目的:构建能够稳定携带柯萨奇病毒A16型(CoxA16)VP1基因的重组减毒伤寒沙门菌并鉴定目的抗原的表达,研发利用减毒沙门菌递送的口服疫苗。方法:利用DNA重组技术,构建表达CoxA16 VP1蛋白的真核表达质粒,体外转染Vero细胞后检测VP1蛋白表... 目的:构建能够稳定携带柯萨奇病毒A16型(CoxA16)VP1基因的重组减毒伤寒沙门菌并鉴定目的抗原的表达,研发利用减毒沙门菌递送的口服疫苗。方法:利用DNA重组技术,构建表达CoxA16 VP1蛋白的真核表达质粒,体外转染Vero细胞后检测VP1蛋白表达情况及抗原活性,并将该质粒通过电转化构建重组减毒伤寒沙门菌。结果:构建了表达CoxA16 VP1蛋白的重组质粒,转染vero细胞后检测到CoxA16 VP1蛋白的表达并具有抗原活性;获得能稳定携带该质粒的重组减毒伤寒沙门菌。结论:成功构建稳定携带柯萨奇病毒A16型(CoxA16)VP1基因的重组减毒伤寒沙门菌,为口服CoxA16疫苗的研究打下了基础。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a16 口服DNA疫苗 减毒伤寒沙门菌
原文传递
柯萨奇病毒A16型VP1-VP4基因克隆及其表达产物的抗原相关性分析 被引量:4
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作者 宋远斌 何思杰 +4 位作者 余楠 陈欣欣 王斌 车小燕 曾其毅 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期1713-1717,共5页
目的克隆并表达柯萨奇病毒A16型VP1-VP4蛋白基因,初步分析其抗原相关性。方法抽提病毒RNA,经RT-PCR方法分别扩增出VP1-VP4蛋白基因片段,经克隆后,在QIA表达系统中表达,表达产物经8 mol/L尿素洗涤及镍柱亲和层析纯化后,用柯萨奇病毒A16... 目的克隆并表达柯萨奇病毒A16型VP1-VP4蛋白基因,初步分析其抗原相关性。方法抽提病毒RNA,经RT-PCR方法分别扩增出VP1-VP4蛋白基因片段,经克隆后,在QIA表达系统中表达,表达产物经8 mol/L尿素洗涤及镍柱亲和层析纯化后,用柯萨奇病毒A16型病毒免疫兔血清及肠道病毒71型病毒免疫兔血清对重组蛋白进行Western blotting及ELISA分析其抗原相关性及交叉反应性。结果成功构建的重组质粒pQE30a/VP1-VP4并经IPTG诱导,重组蛋白VP1-VP4高效表达并纯化成功,经Western blotting及ELISA证实重组蛋白VP1-VP4可以被CVA16免疫兔血清特异识别,部分与肠道病毒71型免疫血清存在交叉反应。结论在大肠杆菌M15中高效表达出柯萨奇病毒A16型VP1-VP4蛋白,经纯化产物具有较强的抗原反应性。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a16 VP1蛋白 VP2蛋白 VP3蛋白 VP4蛋白 克隆 原核表达 抗原反应性
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实时荧光RT-PCR及RT-PCR快速检测肠道病毒71型和柯萨奇A16病毒 被引量:11
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作者 何雅青 肖性龙 +3 位作者 杨洪 张海龙 姚相杰 阳帆 《中国卫生检验杂志》 CAS 2008年第12期2780-2781,共2页
关键词 实时荧光RT-PCR 肠道病毒71 柯萨奇a16病毒
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2011~2013年杭州市手足口病病原谱流行特征及柯萨奇病毒A16型VP1区基因变异研究 被引量:3
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作者 郑书发 谢国良 +4 位作者 崔大伟 杨先知 余斐 王忆吟 陈瑜 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2015年第2期104-107,共4页
目的了解杭州市手足口病病原谱流行特征及柯萨奇病毒A16型(CA16)分离株的VP1基因变迁规律。方法采集杭州市2011-2013年手足口病患者的2 197份临床标本,用通用引物进行肠道病毒实时荧光定量RT-PCR检测,对阳性标本进行分型,对部分CA16... 目的了解杭州市手足口病病原谱流行特征及柯萨奇病毒A16型(CA16)分离株的VP1基因变迁规律。方法采集杭州市2011-2013年手足口病患者的2 197份临床标本,用通用引物进行肠道病毒实时荧光定量RT-PCR检测,对阳性标本进行分型,对部分CA16感染阳性重症患者标本测定VP1基因序列并进行同源性比对和系统进化树分析。结果杭州地区肠道病毒通用型核酸检出率为56.0%(1 317/2 197),肠道病毒71(EV71)、CA16和其他肠道病毒的检出率分别为24.1%(530/2 197)、13.9%(306/2 197)和22.8%(501/2 197)。在咽拭子和粪便标本中EV71检出率均最高,分别为23.9%(301/1 258)和23.6%(148/627),而在疱疹液标本中其他型肠道病毒检出率最高,为32.6%(76/233),脑脊液标本中无CA16检出。咽拭子标本和粪便标本在发病初期的检出率较高,发病后第5天和第6天后检出率低于发病初期检出率,而脑脊液和疱疹液不同病程阶段的检出率无统计学意义。9株CA16分离株VP1基因的核苷酸同源性为90.8%-99.7%,分属于B1b亚型和B1a亚型。结论 2011-2013年杭州地区手足口病患者主要病原体以EV71和CA16为主,样本类型和采样时间是影响肠道病毒检出率的重要原因。杭州地区CA16毒株VP1区基因的变异程度较低,需进一步加强开展手足口病的监测。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒 柯萨奇病毒a16 VP1
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合肥市0-14岁人群柯萨奇病毒A组16型和肠道病毒71型的感染状况调查 被引量:5
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作者 宋建 都鹏飞 程邦宁 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2014年第7期1013-1015,共3页
采用ELISA法检测0-14岁人群柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)及肠道病毒71型(EV71)抗体水平。在入选的1000例儿童中,EV71 IgM总阳性率19.9%,EV71 IgG总阳性率47.7%,CoxA16 IgM总阳性率22.8%,CoxA16 IgG总阳性率51.3%;EV71 IgM总阳性率... 采用ELISA法检测0-14岁人群柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)及肠道病毒71型(EV71)抗体水平。在入选的1000例儿童中,EV71 IgM总阳性率19.9%,EV71 IgG总阳性率47.7%,CoxA16 IgM总阳性率22.8%,CoxA16 IgG总阳性率51.3%;EV71 IgM总阳性率与CoxA16 IgM总阳性率比较,差异无统计学意义(χ^2=2.794,P〉0.05);EV71 IgG总阳性率与CoxA16 IgG总阳性率比较,差异无统计学意义(χ^2=2.793,P〉0.05)。各年龄组比较,新生儿组IgG抗体阳性率较高,其EV71 IgG抗体阳性率41.5%,CoxA16 IgG抗体阳性率49.5%;婴儿组IgG抗体阳性率最低,EV71 IgG、CoxA16 IgG抗体阳性率分别为38.0%,43.5%;除新生儿组外,随年龄增加,人群EV71、CoxA16 IgG逐渐增高,组间差异有统计学意义(χ^2=27.04、19.98, P 〈0.01);在 IgM 方面,人群EV71、CoxA16 IgM 随年龄逐渐升高,组间差异有统计学意义(χ^2=41.12、37.13,P〈0.01)。两种HFMD病原体的IgM、IgG抗体性别间差异无统计学意义(χ^2=0.51、1.77、0.36、2.12,P〉0.05)。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒a16 肠道病毒71 IGG IGM 流行病学
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2019年云南省文山州柯萨奇病毒A16型的基因特征 被引量:5
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作者 张丽芬 周雪花 +5 位作者 徐敏 姜黎黎 寸建萍 周晓芳 伏晓庆 田炳均 《昆明医科大学学报》 CAS 2020年第11期18-24,共7页
目的对云南省文山州2019年手足口病(hand,foot and mouth disease,hfmd)病原分离情况和14株柯萨奇病毒a16型(coxsackievirus a16,cv-a16)的基因特征进行分析。方法对文山州2019年hfmd实验室送到云南省疾病预防控制中心hfmd实验室的595... 目的对云南省文山州2019年手足口病(hand,foot and mouth disease,hfmd)病原分离情况和14株柯萨奇病毒a16型(coxsackievirus a16,cv-a16)的基因特征进行分析。方法对文山州2019年hfmd实验室送到云南省疾病预防控制中心hfmd实验室的595份手足口病患者粪便标本进行病毒分离,并对分离到的74株肠道病毒(enterovirus,ev)vp1区基因进行扩增和测序定型,对cv-a16病毒进行基因特征和分子流行病学分析。结果共从595份标本中分离到74株ev,ev分离率为12.44%(74/595),其中a组病毒(enterovirus species a,ev-a)72株,占97.30%(72/74),ev-b组病毒2株,占2.70%(2/74),未分离到ev-c和ev-d组病毒。ev-a组病毒中,cv-a6病毒最多,共44株,占ev-a组分离数的61.11%(44/72),cv-a16次之,共14株,占ev-a组病毒的19.44%(14/72),ev-a109株,占12.50%(9/72)。基因进化分析表明,14株cv-a16均为b1基因亚型(subgenotype b1)。它们分为2个不同的进化分支(b1a和b1b),其中8株为b1a,6株为b1b。结论2019年文山州hfmd病原以cv-a6组为主,cv-a16次之。cv-a16病毒b1a和b1b两个分支同时在文山州流行。 展开更多
关键词 手足口病 病原分析 柯萨奇病毒a16 VP1基因 基因特征分析
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