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核糖体图谱技术在植物学研究中的应用
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作者 王豫颖 王威浩 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期673-683,共11页
随着高通量测序技术的持续发展和进步,开发出很多新颖的测序技术,为诸多悬而未决的生物学难题提供了解决方案。其中,核糖体图谱技术能够在全基因组水平和单核苷酸分辨率上监控细胞内的翻译事件,填补了转录组学和蛋白质组学研究之间的空... 随着高通量测序技术的持续发展和进步,开发出很多新颖的测序技术,为诸多悬而未决的生物学难题提供了解决方案。其中,核糖体图谱技术能够在全基因组水平和单核苷酸分辨率上监控细胞内的翻译事件,填补了转录组学和蛋白质组学研究之间的空隙。核糖体图谱技术不仅能够鉴定处于翻译状态的RNA分子,还能够精确定位RNA分子上正在翻译的核苷酸,进而准确描绘RNA分子上的开放阅读框。此外,结合转录组测序数据,核糖体图谱技术还可以确定每个转录本上的核糖体数量,从而计算每个转录本的翻译效率。目前,核糖体图谱技术已成功应用于动物、植物和微生物等研究领域,加深了人们对翻译调控机制的认识。然而,由于植物细胞和组织的特性,核糖体图谱技术在植物学研究中的应用仍然存在局限。该文综述了核糖体图谱技术的实验原理,以及在植物学研究中的相关进展。 展开更多
关键词 核糖体图谱 翻译调控 上游开放阅读框
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长链非编码RNA编码小肽的生物医学意义及研究策略
2
作者 王心怡 张祯 +3 位作者 石成瑜 王颖 周天华 林爱福 《浙江大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期397-405,共9页
长链非编码RNA(lncRNA)通常认为不具有蛋白质编码能力,广泛参与细胞增殖、信号转导等生命过程。但近年来研究表明,部分lncRNA的短开放阅读框(sORF)可编码具有生物活性的短于100个氨基酸的小肽,在钙离子稳态、胚胎发育等生命活动及恶性... 长链非编码RNA(lncRNA)通常认为不具有蛋白质编码能力,广泛参与细胞增殖、信号转导等生命过程。但近年来研究表明,部分lncRNA的短开放阅读框(sORF)可编码具有生物活性的短于100个氨基酸的小肽,在钙离子稳态、胚胎发育等生命活动及恶性肿瘤的发生发展中发挥作用,是潜在的药物靶点和癌症生物标志物。目前大多采用生物信息学工具预测可编码的sORF、核糖体图谱筛选潜在编码的lncRNA、体外翻译初步检测lncRNA的编码能力、质谱鉴定潜在翻译的小肽、特异性抗体及表位标签验证小肽的内源性表达等。本文介绍了近年来鉴定的lncRNA编码小肽的生理功能、病理作用以及预测lncRNA编码潜力的研究策略。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 短开放阅读框 小肽 核糖体图谱 质谱 综述
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长链非编码RNA编码肽的研究进展
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作者 刘华 范志朋 杨秋波 《兰州大学学报（医学版）》 2023年第8期82-89,共8页
长链非编码RNA编码产物能够调控细胞核功能、细胞器代谢及Ca2+泵活性,并在心血管疾病、炎症性疾病、癌症和细胞分化中发挥不同的生物学功能。本文对如何预测和验证长链非编码RNA的编码能力、肽产物在不同疾病中的作用及作用机制等进行... 长链非编码RNA编码产物能够调控细胞核功能、细胞器代谢及Ca2+泵活性,并在心血管疾病、炎症性疾病、癌症和细胞分化中发挥不同的生物学功能。本文对如何预测和验证长链非编码RNA的编码能力、肽产物在不同疾病中的作用及作用机制等进行分析及阐述。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 肽 开放阅读框 核糖体图谱/核糖体印记
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翻译组研究技术进展 被引量：5
4
作者 魏康宁 崔俊霞 +2 位作者 王梦蕾 王丽 李用芳 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期222-229,共8页
基于高通量测序的RNA-Seq广泛被用于检测组织和细胞中基因的表达和调控机理研究,然而已有的文献表明mRNA水平并不能反映蛋白质的丰度,而研究正在翻译的mRNA的翻译组则比转录组更能反映蛋白组的实际水平,因此翻译组研究比转录组研究更具... 基于高通量测序的RNA-Seq广泛被用于检测组织和细胞中基因的表达和调控机理研究,然而已有的文献表明mRNA水平并不能反映蛋白质的丰度,而研究正在翻译的mRNA的翻译组则比转录组更能反映蛋白组的实际水平,因此翻译组研究比转录组研究更具有理论和实践意义。对翻译组研究最为经典的多聚核糖体图谱技术到最近发展起来的核糖体图谱技术、核糖体亲和纯化技术以及翻译谱分析技术进行了综述比较,并介绍了翻译组研究前景,以便为翻译组研究提供参考。 展开更多
关键词 翻译组 多聚核糖体图谱 核糖体亲和纯化技术 核糖体图谱 翻译谱分析技术
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广西1997～2001年霍乱弧菌分子流行病学研究 被引量：2
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作者 李翠云 王鸣柳 +6 位作者 董柏青 唐振柱 谭冬梅 权怡 秦卫文 林玫 曾竣 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2004年第1期43-44,78,共3页
目的　探讨广西 1997～ 2 0 0 1年霍乱流行菌株的分子生物学特征以及他们之间的内在联系及其流行特点。方法　采用打点杂交方法检测霍乱弧菌毒力相关基因ctxAB、zot,运用 16srRNA探针进行核糖体基因分型。结果　O13 9群霍乱弧菌ctxAB、... 目的　探讨广西 1997～ 2 0 0 1年霍乱流行菌株的分子生物学特征以及他们之间的内在联系及其流行特点。方法　采用打点杂交方法检测霍乱弧菌毒力相关基因ctxAB、zot,运用 16srRNA探针进行核糖体基因分型。结果　O13 9群霍乱弧菌ctxAB、zot基因携带率为 10 0 % ,埃尔托霍乱弧菌ctxAB基因携带率为 97 6 7% ,zot基因携带率为 95 35 % ;用 16srRNA探针分型可分为 6个核糖体基因型 (RT1～RT6) ,以RT1和RT4为主要型别。结论　普遍携带ctxAB、zot基因 ,具有较强的致病性。 1997～ 2 0 0 0年与 2 0 0 1年分离的菌株在核糖体杂交图谱上有明显的差异 ,同一核糖体型可以来源于不同的血清型和噬菌体 -生物型的菌株。分析认为 2 0 0 1年的稻叶型菌株不是 2 0 0 0年稻叶型菌株的延续 ,而是一个新的克隆群。 展开更多
关键词 霍乱弧菌 分子流行病学 核糖体基因型 核糖体杂交图谱
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