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棘阿米巴延吉土壤分离株CJY/S3的18S rDNA基因型鉴定
1
作者 朴成钢 玄英花 +3 位作者 李红花 金松竹 崔春权 朴杰 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1156-1157,共2页
致病性自由生活棘阿米巴（Acanthamoeba sp.）广泛存在于土壤、水、空气、腐败物等自然环境中,某些虫种可引起人体棘阿米巴性角膜炎（acanthamoeba keratitis,AK）和肉芽肿性阿米巴性脑炎（granulomatous amoebic encephalitis,GAE）[1... 致病性自由生活棘阿米巴（Acanthamoeba sp.）广泛存在于土壤、水、空气、腐败物等自然环境中,某些虫种可引起人体棘阿米巴性角膜炎（acanthamoeba keratitis,AK）和肉芽肿性阿米巴性脑炎（granulomatous amoebic encephalitis,GAE）[1-2]。 展开更多
关键词 棘阿米巴 核糖体基因型 18S RDNA
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Survivin shRNA-APC双基因对结肠癌裸鼠皮下移植瘤细胞内质网通路中GRP78、Caspase-12 表达的影响 被引量：4
2
作者 袁禧先 张书娟 张玉健 《临床内科杂志》 CAS 2019年第6期415-418,共4页
目的探讨细胞增殖因子短截型核糖核酸-腺瘤样结肠息肉基因(Survivin shRNA-APC)双基因对内质网应激凋亡通路中葡萄糖调节蛋白78(GRP78)及半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶-12(Caspase-12)表达的影响。方法将40只健康裸鼠随机分成5组(每组8只)... 目的探讨细胞增殖因子短截型核糖核酸-腺瘤样结肠息肉基因(Survivin shRNA-APC)双基因对内质网应激凋亡通路中葡萄糖调节蛋白78(GRP78)及半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶-12(Caspase-12)表达的影响。方法将40只健康裸鼠随机分成5组(每组8只):SurvivinshRNA-APC双基因组(简称双基因组)、APC组、Survivin shRNA组、空载组和空白组。将前期构建好的Survivin shRNA-APC、APC、Survivin shRNA、空载稳转株及人HT-29结肠癌细胞分别接种至对应组裸鼠的左前腋下,采用实时荧光定量聚合酶链反应(Real-timePCR)及免疫组化方法分别检测5组移植瘤组织细胞中GRP78、Caspase-12mRNA及蛋白的表达情况。结果与空白组、空载组比较,双基因组、APC组、SurvivinshRNA组GRP78.Caspase-12mRNA及蛋白的表达明显增强(P<0.05),与APC组和Survivin shRNA组比较,双基因组增加更显著(P<0.05),空载组与空白组比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论Survivin shRNA-APC双基因可能通过抑制Survivin表达,上调内质网通路中GRP78、Caspase-12mRNA及蛋白表达,最终诱导结肠癌细胞发生凋亡,且Survivin shRNA-APC双基因调控GRP78、Caspase-12mRNA及蛋白表达、诱导细胞凋亡能力较APC组和Survivin shRNA组强。 展开更多
关键词 短截型核糖核酸-腺瘤样结肠息肉基因双基因 内质网应激 葡萄糖调节蛋白78 半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶-12 细胞凋亡
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深圳市中央空调冷却塔军团菌核糖体基因型研究 被引量：1
3
作者 袁梦 邵祝军 +5 位作者 任红宇 段永翔 李马超 崔志刚 高源 鞠长燕 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期240-241,共2页
军团病（Legionnaires’disease）是由军团菌感染引起的以肺炎为主要症状的急性呼吸道传染病，嗜肺军团菌（Legionella pneumophila，Lp）是引起军团病的主要菌群。目前研究发现军团菌广泛存在于自然界的土壤和各种水环境中，中央空调... 军团病（Legionnaires’disease）是由军团菌感染引起的以肺炎为主要症状的急性呼吸道传染病，嗜肺军团菌（Legionella pneumophila，Lp）是引起军团病的主要菌群。目前研究发现军团菌广泛存在于自然界的土壤和各种水环境中，中央空调冷却塔是军团菌主要的传染源，近30年来军团病大的暴发多与中央空调冷却塔被军团菌污染有关。 展开更多
关键词 空调冷却塔 塔军团菌 中央空调 核糖体基因型 深圳市 急性呼吸道传染病 军团菌感染 嗜肺军团菌
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金黄色葡萄球菌引发医院感染的分子流行病学特征 被引量：4
4
作者 刘宝欣 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2013年第18期3062-3064,共3页
目的:观察院内感染主要的金黄色葡萄球菌克隆及其特征。方法:从200例院内感染患者痰液分离出金黄色葡萄球菌样本,分析核糖基因型组成及特异的附属基因调节(agr)多态性和特有毒素。结果:200例样本中均未见万古霉素耐药性。不同的群体及... 目的:观察院内感染主要的金黄色葡萄球菌克隆及其特征。方法:从200例院内感染患者痰液分离出金黄色葡萄球菌样本,分析核糖基因型组成及特异的附属基因调节(agr)多态性和特有毒素。结果:200例样本中均未见万古霉素耐药性。不同的群体及不同的核糖基因型样本的抗生素耐药性不同,agrⅡ型等位基因是一种流行克隆,而agrⅠ型只存在于散发病例中。在68%的样本中发现LukD/LukE白细胞毒素基因。结论:最流行的核糖基因型对于几乎所有的抗生素均敏感,其中没有LukD/LukE基因。因此可能有其他未发现的因素造成流行克隆的院内感染。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 核糖基因型 院内感染
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阪崎肠杆菌自动化核糖体分型的研究 被引量：6
5
作者 裴晓燕 郭云昌 刘秀梅 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期900-902,共3页
目的对阪崎肠杆菌食品分离株进行核糖体分型，并分析其分型效果。方法采用杜邦Riboprinter^TM指纹图谱分析仪对2株阪崎肠杆菌标准菌株和28株分离株进行核糖体分型，运用BioNumerics数据库软件建立相应的核糖体指纹图谱数据库，进行指纹... 目的对阪崎肠杆菌食品分离株进行核糖体分型，并分析其分型效果。方法采用杜邦Riboprinter^TM指纹图谱分析仪对2株阪崎肠杆菌标准菌株和28株分离株进行核糖体分型，运用BioNumerics数据库软件建立相应的核糖体指纹图谱数据库，进行指纹图谱分析。结果核糖体分型将2株阪崎肠杆菌标准菌株和28株分离株分成26种核糖体带型，其中22种带型分别对应1株阪崎肠杆菌试验菌株，其他4种带型分别对应2株试验菌株，不同带型之间的最低相似度为31．58％。所有菌株的酶切条带数为10个左右，酶切条带分子量范围位于1～50kb之间。同时，使用BioNumerics软件对结果进行分群和多维尺度分析，可见核糖体分型主要分为4个群。结论自动化核糖体分型可以方便快捷的实现阪崎肠杆菌的分型。 展开更多
关键词 肠杆菌 阪崎 食品 配方 细菌分型技术 核糖体基因型
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阴道白假丝酵母菌25SrDNA基因分型与药物敏感性的关系 被引量：10
6
作者 张旭 刘朝晖 《中华妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期279-284,共6页
目的探讨外阴阴道假丝酵母菌病患者阴道白假丝酵母菌分离株的25SrDNA基因型别分布特征，并分析不同基因型别阴道白假丝酵母菌的药物敏感性。方法根据阴道白假丝酵母菌25SrDNA基因编码区可转座I型内含子的有无及大小，通过PCR技术对954... 目的探讨外阴阴道假丝酵母菌病患者阴道白假丝酵母菌分离株的25SrDNA基因型别分布特征，并分析不同基因型别阴道白假丝酵母菌的药物敏感性。方法根据阴道白假丝酵母菌25SrDNA基因编码区可转座I型内含子的有无及大小，通过PCR技术对954株白假丝酵母菌进行基因分型。选取156株白假丝酵母菌，采用M27-A3微量肉汤稀释法测定其对伊曲康唑、氟康唑、咪康唑、克霉唑和制菌霉素5种抗真菌药物的敏感性。结果954株白假丝酵母菌分为3种基因型别，其中A型876株（91．8％，876／954）为不含内含子菌株，B型58株（6．1％，58／954）和C型20株（2．1％，20／954）为含内含子菌株。含内含子的白假丝酵母菌对伊曲康唑和氟康唑的最低抑菌浓度（MIc）值显著高于不含内含子者（伊曲康唑：0．25、0．125μg/ml，P〈0．05；氟康唑：0．25、0．125μg／ml，P〈0．01），对制霉菌素的MIC值显著低于不含内含子者（分别为4、8μg／ml，P〈0．01）。含内含子的白假丝酵母菌对伊曲康唑的耐药率（24％，19／78）显著高于不含内含子者（3％，2／78；P〈0．01）。21株伊曲康唑耐药株中有5株（24％，5／21）对氟康唑交叉耐药；6株氟康唑耐药株中有5株（5／6）对伊曲康唑交叉耐药；5株同时对伊曲康唑及氟康唑耐药的菌株均为含内含子菌株。结论25SrDNA基因编码区的可转座I型内含子可能与阴道白假丝酵母菌对伊曲康唑、氟康唑及制霉菌素的药物敏感性有关。 展开更多
关键词 念珠菌病 外阴阴道 白色念珠菌 基因型 微生物敏感性试验 DNA 核糖体 核糖体基因型
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广西1997～2001年霍乱弧菌分子流行病学研究 被引量：2
7
作者 李翠云 王鸣柳 +6 位作者 董柏青 唐振柱 谭冬梅 权怡 秦卫文 林玫 曾竣 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2004年第1期43-44,78,共3页
目的　探讨广西 1997～ 2 0 0 1年霍乱流行菌株的分子生物学特征以及他们之间的内在联系及其流行特点。方法　采用打点杂交方法检测霍乱弧菌毒力相关基因ctxAB、zot,运用 16srRNA探针进行核糖体基因分型。结果　O13 9群霍乱弧菌ctxAB、... 目的　探讨广西 1997～ 2 0 0 1年霍乱流行菌株的分子生物学特征以及他们之间的内在联系及其流行特点。方法　采用打点杂交方法检测霍乱弧菌毒力相关基因ctxAB、zot,运用 16srRNA探针进行核糖体基因分型。结果　O13 9群霍乱弧菌ctxAB、zot基因携带率为 10 0 % ,埃尔托霍乱弧菌ctxAB基因携带率为 97 6 7% ,zot基因携带率为 95 35 % ;用 16srRNA探针分型可分为 6个核糖体基因型 (RT1～RT6) ,以RT1和RT4为主要型别。结论　普遍携带ctxAB、zot基因 ,具有较强的致病性。 1997～ 2 0 0 0年与 2 0 0 1年分离的菌株在核糖体杂交图谱上有明显的差异 ,同一核糖体型可以来源于不同的血清型和噬菌体 -生物型的菌株。分析认为 2 0 0 1年的稻叶型菌株不是 2 0 0 0年稻叶型菌株的延续 ,而是一个新的克隆群。 展开更多
关键词 霍乱弧菌 分子流行病学 核糖体基因型 核糖体杂交图谱
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广东省副溶血性弧菌rDNA指纹图谱特征分析 被引量：6
8
作者 朱海明 邓峰 +8 位作者 严纪文 马聪 宋曼丹 赖蔚苳 杨冰 王海燕 何冬梅 王建 柯昌文 《华南预防医学》 2006年第6期1-5,共5页
目的通过对广东省监测食品及腹泻病人中分离的副溶血性弧菌（vibrio parahaemolyticus，VP）进行rDNA（核糖体核酸）指纹图谱分析，为VP引起的食物中毒事件流行病学调查提供诊断依据。方法对从2003～2004年广东省食品及食物中毒病人中... 目的通过对广东省监测食品及腹泻病人中分离的副溶血性弧菌（vibrio parahaemolyticus，VP）进行rDNA（核糖体核酸）指纹图谱分析，为VP引起的食物中毒事件流行病学调查提供诊断依据。方法对从2003～2004年广东省食品及食物中毒病人中分离的64株VP采用RiboPrinter微生物鉴定系统进行核糖分型，并利用RiboExplorer软件处理rDNA指纹图谱，运用Bio Numerics软件分析菌株的同源性。结果64株VP共分为51个核糖型，其中源自食品的52株分离株分为41个核糖型，源自食物中毒病人的12株分离株分为10个核糖型。来源于同一起食物中毒的E408-18-S-7核糖型的3株VP其相似度为100％，其他病人株均非同型或相似度较低（〈95％）。结论监测地区食品分离株核糖型多、分布广，有部分核糖型相似度较高；rDNA指纹图谱对于同一核糖型或相似度〉95％的菌株能达到溯源能力。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 微生物鉴定系统 rDNA指纹图谱 核糖体基因型
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艰难梭菌临床分离株病原学和分子流行病学及临床特征分析 被引量：13
9
作者 陈伟 刘文恩 +4 位作者 简子娟 李艳明 李艳华 罗珊 钟一鸣 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期855-860,共6页
目的：初步研究湘雅医院艰难梭菌临床分离株的病原学、毒素基因携带情况及核糖体分型情况，并对其临床特征进行分析，为临床提高艰难梭菌分离率以及采取积极有效的防控措施奠定基础。方法采用前瞻性研究，收集中南大学湘雅医院2012年6... 目的：初步研究湘雅医院艰难梭菌临床分离株的病原学、毒素基因携带情况及核糖体分型情况，并对其临床特征进行分析，为临床提高艰难梭菌分离率以及采取积极有效的防控措施奠定基础。方法采用前瞻性研究，收集中南大学湘雅医院2012年6至12月腹泻患者粪便标本452份，对其进行选择性厌氧培养及API20A鉴定，并对阳性标本进行毒素基因检测（ tcdA、tcdB、cdtA、cdtB）和核糖体分型（16S-23S间隔区多态性）；收集所有患者临床资料，并对其进行Logistic回归分析筛选其发病高危因素。结果艰难梭菌检出率13.94％（63／452），其中42.86％（36／63）为 A－B＋型，14.29％（9／63）来自社区感染，二元毒素基因检测均为阴性；共检出11种核糖体型，其中CD017最常见，占22.22％（14／63）；Logistic回归分析显示，年龄＞55（ P＝0.016； OR＝4.45；95％CI：1.33～14.91），腹泻次数（P＝0.007；OR＝0.03；95％CI：0.002～0.38）及腹泻持续时间（P＝0.015； OR＝7.86；95％CI：1.50～41.16）为其发病高危因素。结论艰难梭菌是湘雅医院腹泻患者重要致病菌，主要来自医院感染，A－B＋型检出率较高；核糖体分型存在相对优势型别CD017，无证据提示存在艰难梭菌感染的暴发流行。 展开更多
关键词 腹泻 梭菌 难辨 细菌毒素类 核糖体基因型 流行病学 分子
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2008年海南省霍乱暴发分离株的分析 被引量：4
10
作者 吴捷 刁保卫 +8 位作者 周海建 朱建华 王多春 逄波 王瑞白 阚飙 王少玲 苏新元 马焱 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1083-1086,共4页
目的 分析海南省2008年霍乱暴发菌株的分子分型成簇性,为疫情分析提供分离株的病原学特征,协助疫情判断.方法 从本次霍乱疫情患者中分离69株,外环境分离7株[其中患者家厕所1株,水样1株,患者家附近鱼（池）塘3株,患者上卫生所就诊时呕吐... 目的 分析海南省2008年霍乱暴发菌株的分子分型成簇性,为疫情分析提供分离株的病原学特征,协助疫情判断.方法 从本次霍乱疫情患者中分离69株,外环境分离7株[其中患者家厕所1株,水样1株,患者家附近鱼（池）塘3株,患者上卫生所就诊时呕吐地面的涂抹拭子1株和海南大学食堂菜刀涂抹拭子1株]共76株,对分离株进行常规病原学检测,利用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术获取受试菌株的DNA分子指纹图谱并对其结果进行聚类分析,将PFGE图像应用BioNumerics（Version4.0）数据库软件（Applied Maths BVBA,Belium）进行处理,识别图像条带,自动生成得出相似系数.结果 2008年海南省暴发霍乱疫情中分离的76株霍乱菌株中,6月份分离到的5株分离菌株图谱相同,相似系数达100%;10-11月份自患者和环境水体中分离到的70株菌图谱完全一致,相似系数达100%,但与6月份分离株的图谱不同;1株在暴发中分离自食堂菜刀的菌株,其图谱与其他菌株差异较大,相似系数为79.7%.结论 海南2008年存在不同的霍乱暴发,10-11月出现在不同市县的疫情可能属于一起较大范围的流行,环境水体污染是传播的不可忽视的环节. 展开更多
关键词 弧菌 霍乱 电泳 凝胶 脉冲场 核糖体基因型 聚类分析
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