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以CE-PCR产物为模板的STR序列多态分型方法
被引量:
2
1
作者
郭立亮
吴浩
+7 位作者
刘宗伟
龚辰宇
张驰
康克莱
韦美甜
孙宏钰
季安全
王乐
《中国法医学杂志》
CSCD
2021年第3期263-268,共6页
目的实现以荧光标记复合扩增产物为扩增模板的STR序列多态分型。方法筛选常用STR分型试剂盒基因座并设计引物,构建常染色体STR复合扩增体系。分别以毛细管电泳(CE)试剂盒GlobalFilerTM、PowerPlex?21和IdentifilerTM Plus的扩增产物为模...
目的实现以荧光标记复合扩增产物为扩增模板的STR序列多态分型。方法筛选常用STR分型试剂盒基因座并设计引物,构建常染色体STR复合扩增体系。分别以毛细管电泳(CE)试剂盒GlobalFilerTM、PowerPlex?21和IdentifilerTM Plus的扩增产物为模板,扩增、建库测序及数据分析,评估体系分型准确性及对CE扩增产物的通用性,并与Precision ID GlobalFilerTM NGS STR Panel体系进行比较。结果该复合扩增体系能够从3款CE试剂盒的扩增产物中获得所有基因座的正确分型和序列多态信息,其体系均衡性和杂合子均衡性亦良好,且均优于Precision ID体系。结论该复合扩增体系建立了CE技术与二代测序技术之间的桥梁,实现了检材的零利用,能够进一步挖掘荧光标记扩增产物的STR序列多态信息,是对现有技术的提升和有效补充。
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关键词
法医遗传学
二代测序
短串联重复序列
序列多态性
毛细管电泳扩增产物
原文传递
题名
以CE-PCR产物为模板的STR序列多态分型方法
被引量:
2
1
作者
郭立亮
吴浩
刘宗伟
龚辰宇
张驰
康克莱
韦美甜
孙宏钰
季安全
王乐
机构
中山大学中山医学院法医学系
现场物证溯源技术国家工程实验室
江苏省常熟市公安局
昆明医科大学法医学院
出处
《中国法医学杂志》
CSCD
2021年第3期263-268,共6页
基金
公安部技术研究计划(2019JSYJA05)
公安部科技强警基础工作专项(2019GABJC15)
公安部物证鉴定中心基本科研业务费(2019JB009,2019JB045)。
文摘
目的实现以荧光标记复合扩增产物为扩增模板的STR序列多态分型。方法筛选常用STR分型试剂盒基因座并设计引物,构建常染色体STR复合扩增体系。分别以毛细管电泳(CE)试剂盒GlobalFilerTM、PowerPlex?21和IdentifilerTM Plus的扩增产物为模板,扩增、建库测序及数据分析,评估体系分型准确性及对CE扩增产物的通用性,并与Precision ID GlobalFilerTM NGS STR Panel体系进行比较。结果该复合扩增体系能够从3款CE试剂盒的扩增产物中获得所有基因座的正确分型和序列多态信息,其体系均衡性和杂合子均衡性亦良好,且均优于Precision ID体系。结论该复合扩增体系建立了CE技术与二代测序技术之间的桥梁,实现了检材的零利用,能够进一步挖掘荧光标记扩增产物的STR序列多态信息,是对现有技术的提升和有效补充。
关键词
法医遗传学
二代测序
短串联重复序列
序列多态性
毛细管电泳扩增产物
Keywords
Forensic genetics
Next generation sequencing(NGS)
Short tandem repeat(STR)
Sequence polymorphism
CE PCR products
分类号
DF795.1 [医药卫生—法医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
以CE-PCR产物为模板的STR序列多态分型方法
郭立亮
吴浩
刘宗伟
龚辰宇
张驰
康克莱
韦美甜
孙宏钰
季安全
王乐
《中国法医学杂志》
CSCD
2021
2
原文传递
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