目的运用网络药理学、分子对接方法探索泮托拉唑治疗肺癌的关键靶点及分子作用机制。方法通过Swiss TargetPrediction数据库预测泮托拉唑治疗肺癌的作用靶点,采用GeneCards、OMIM等数据库搜索肺癌的相关靶点,取2者的交集靶点获得潜在靶...目的运用网络药理学、分子对接方法探索泮托拉唑治疗肺癌的关键靶点及分子作用机制。方法通过Swiss TargetPrediction数据库预测泮托拉唑治疗肺癌的作用靶点,采用GeneCards、OMIM等数据库搜索肺癌的相关靶点,取2者的交集靶点获得潜在靶点;应用STRING数据库找出靶点的作用关系,使用Cytoscape3.10.0软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络并筛选核心靶点。利用DAVID网站进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,利用AutoDock软件进行分子对接。结果获得105个泮托拉唑的作用靶点、2180个肺癌相关靶点,两者取交集后共得到41个泮托拉唑治疗肺癌的作用靶点。在PPI网络中,EGFR、ERBB2、PIK3CA、MMP9等13个靶点处于核心位置。GO富集分析和KEGG通路分析显示,泮托拉唑调控的核心靶点与细胞信号通路激活、肿瘤进展、肿瘤耐药等机制密切相关;分子对接结果显示,泮托拉唑与核心靶点均有较强的相互作用。结论泮托拉唑可能通过EGFR、ERBB2、PIK3CA、MMP9等靶点及多条信号通路治疗肺癌。展开更多
文摘目的运用网络药理学、分子对接方法探索泮托拉唑治疗肺癌的关键靶点及分子作用机制。方法通过Swiss TargetPrediction数据库预测泮托拉唑治疗肺癌的作用靶点,采用GeneCards、OMIM等数据库搜索肺癌的相关靶点,取2者的交集靶点获得潜在靶点;应用STRING数据库找出靶点的作用关系,使用Cytoscape3.10.0软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络并筛选核心靶点。利用DAVID网站进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,利用AutoDock软件进行分子对接。结果获得105个泮托拉唑的作用靶点、2180个肺癌相关靶点,两者取交集后共得到41个泮托拉唑治疗肺癌的作用靶点。在PPI网络中,EGFR、ERBB2、PIK3CA、MMP9等13个靶点处于核心位置。GO富集分析和KEGG通路分析显示,泮托拉唑调控的核心靶点与细胞信号通路激活、肿瘤进展、肿瘤耐药等机制密切相关;分子对接结果显示,泮托拉唑与核心靶点均有较强的相互作用。结论泮托拉唑可能通过EGFR、ERBB2、PIK3CA、MMP9等靶点及多条信号通路治疗肺癌。
