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人脯氨肽酶活性中心结构的计算机模拟 被引量:2
1
作者 郭崇志 宣振宇 +1 位作者 陈润生 孙曼霁 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期499-505,共7页
氨酰基脯氨酸二肽酶 (脯氨肽酶 )为广泛分布于生物界的细胞内二肽水解酶 .它特异性地水解以脯氨酸或羟脯氨酸为羧基端的二肽 (X Pro) ,而且只对反式肽键有催化活性 .此酶与脯氨酸代谢、胶原蛋白合成及细胞生长有密切关系 .文献报道 ,从A... 氨酰基脯氨酸二肽酶 (脯氨肽酶 )为广泛分布于生物界的细胞内二肽水解酶 .它特异性地水解以脯氨酸或羟脯氨酸为羧基端的二肽 (X Pro) ,而且只对反式肽键有催化活性 .此酶与脯氨酸代谢、胶原蛋白合成及细胞生长有密切关系 .文献报道 ,从Alteromonas细菌中提取的脯氨肽酶有水解梭曼的活性 ,其有机磷酸酐水解酶也有脯氨肽酶活性 .用重组基因表达的人肝脯氨肽酶也同时具有脯氨肽酶活性和水解梭曼的活性 .研究脯氨肽酶活性中心的结构具有重要理论意义和潜在实用价值 .但目前尚无人脯氨肽酶晶体结构的报道 .本文采用蛋白质结构模式识别 (threading)方法对脯氨肽酶的高级结构进行模拟 ,以大肠杆菌甲硫氨酸氨肽酶 (1MAT)为模板 ,模建了人脯氨肽酶C端结构域的空间结构 .通过对模建结构的 3D评估及电荷分布分析 ,对人脯氨肽酶活力中心结构进行了预测 .模建的人脯氨肽酶活性中心位于C端结构域 ,为 6条β折叠围成的一个疏水性口袋 ,外面被 5条α螺旋及一些loop包围 ,活力中心位于疏水结构中央 ,其中有 5个保守氨基酸 ,形成 1个较强的负电荷区 ,周围有 3个较弱的正电荷区域 .实验还发现 ,虽然Mn2 + 或Co2 + 对酶的活性极其重要 ,但对酶蛋白结构的贡献很小 . 展开更多
关键词 人脯氨肽酶 活性中心结构 计算机模拟 模式识别
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研究金属酶活性中心结构NMR技术中的一种新方法 被引量:12
2
作者 胡皆汉 郑学仿 +1 位作者 程国宝 许永廷 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 1997年第17期1825-1826,共2页
迄今为止,应用NMR技术研究金属酶活性中心配位结构所使用的方法,都是将金属酶中的抗磁离子(如 Zn(Ⅱ)等),或核弛豫不够快的顺磁离子(如 Cu(Ⅱ)等)进行重组置换为既是顺磁而且核弛豫也很快的金属离子(如Co(Ⅱ),Ni(Ⅱ)等),... 迄今为止,应用NMR技术研究金属酶活性中心配位结构所使用的方法,都是将金属酶中的抗磁离子(如 Zn(Ⅱ)等),或核弛豫不够快的顺磁离子(如 Cu(Ⅱ)等)进行重组置换为既是顺磁而且核弛豫也很快的金属离子(如Co(Ⅱ),Ni(Ⅱ)等),从而使活性中心配位结构的1HNMR谱与酶其余结构部分的1H NMR谱分开,得以对金属酶活性中心配位结构进行直接研究.而重组方法,一般为利用EDTA等螯合剂,先将酶中的金属离子螯合出来经过透析,再用所需金属离子进行滴定重组,手续较繁.而且该重组方法也不能进行有关金属离子与酶活性中心金属离子的直接相互作用研究.本文则首次提出一种新方法,即直接外加氯化钴(CoCl2)于铜锌超氧歧化酶(Cu2Zn2SOD)溶液中,测其1H NMR谱来证实是否此方法可以用来研究这类金属酶活性中心配位结构,以及 CoCl2与 Cu2Zn2SOD间是否存在相互作用,结果表明此新方法是可行的, CoCl2与 Cu2Zn2SOD间存在着相互作用. 展开更多
关键词 金属酶 铜锌超氧歧化酶 NMR 活性中心结构
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镍超氧化物歧化酶模拟化合物的合成、表征及活性 被引量:6
3
作者 刘媛媛 岳俊杰 刘小兰 《天津师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2003年第2期1-3,共3页
合成了3种具有苯并咪唑基的配体(N3,NTB,EDTB)及其与金属镍的配合物,由此模拟镍超氧化物歧化酶(Ni-SOD)的活性中心结构,对所合成的模拟化合物进行了元素分析和红外、紫外光谱的结构表征,并利用改进的邻苯三酚自氧化法测定了模拟化合物... 合成了3种具有苯并咪唑基的配体(N3,NTB,EDTB)及其与金属镍的配合物,由此模拟镍超氧化物歧化酶(Ni-SOD)的活性中心结构,对所合成的模拟化合物进行了元素分析和红外、紫外光谱的结构表征,并利用改进的邻苯三酚自氧化法测定了模拟化合物的生物活性. 展开更多
关键词 镍超氧化物歧化酶 模拟化合物 合成 结构表征 生物活性 镍配合物 活性中心结构
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甲烷在[WO_4]中心活化的分子轨道研究
4
作者 陈宏善 李树本 牛建中 《原子核物理评论》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期209-212,共4页
利用密度泛函方法研究了Mn -Na2 WO4 /SiO2 催化剂表面的活性中心结构 .对不同活性中心电子结构的分析表明 ,以单个桥氧担载的四面体 [WO4 ]是最可能的甲烷活化中心 ;计算所得活化能为 6 7kJ/mol .
关键词 甲烷 分子轨道 密度泛函方法 活性中心结构 活化 催化剂
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影响多步脱氢酶CrtI功能的关键结构特征探索
5
作者 陈琛 王颖 +3 位作者 刘宏 陈艳 姚明东 肖文海 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期189-198,共10页
在生物体内存在可催化多步连续反应的通用酶,对生物代谢过程具有重要作用。八氢番茄红素脱氢酶(CrtI)作为典型代表,可以催化多步连续脱氢反应,生成番茄红素等具有重要价值的产物。本文以酿酒酵母为底盘研究CrtI的催化功能特征。首先通... 在生物体内存在可催化多步连续反应的通用酶,对生物代谢过程具有重要作用。八氢番茄红素脱氢酶(CrtI)作为典型代表,可以催化多步连续脱氢反应,生成番茄红素等具有重要价值的产物。本文以酿酒酵母为底盘研究CrtI的催化功能特征。首先通过组合设计与筛选番茄红素合成路径中的三种外源酶CrtE、CrtB和CrtI,发现CrtI是主要的限制因素,且三孢布拉氏霉菌来源的CrtI (BtCrtI)表现出优异的催化功能。通过生物信息学与蛋白结构分析发现BtCrtI的S311残基是连接和稳定活性中心结构的关键。随后通过分析该位点的饱和突变结果,揭示了该位点的氨基酸残基类型对活性中心结构和功能的显著作用,为酶的设计和改造提供了新的思路。同时发现CrtI的活性差异未对合成路径中的类胡萝卜素的代谢流造成扰动,表明CrtI是番茄红素的产量和纯度的决定因素。 展开更多
关键词 合成生物学 生物催化 八氢番茄红素脱氢酶 多步脱氢反应 酶的活性中心结构
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氢酶结构及催化机理研究进展 被引量:5
6
作者 刘晶晶 龙敏南 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期348-353,共6页
氢酶是一类催化氢的氧化或质子还原的酶,它在微生物产氢过程中扮演着重要角色。根据氢酶所含的金属元素,可分为NiFe_氢酶、Fe_氢酶和不含金属元素的metal_free氢酶。大多数氢酶含有金属原子,它们参与氢酶活性中心和[Fe_S]簇的形成。氢... 氢酶是一类催化氢的氧化或质子还原的酶,它在微生物产氢过程中扮演着重要角色。根据氢酶所含的金属元素,可分为NiFe_氢酶、Fe_氢酶和不含金属元素的metal_free氢酶。大多数氢酶含有金属原子,它们参与氢酶活性中心和[Fe_S]簇的形成。氢酶的活性中心直接催化氢的氧化与质子的还原,[Fe_S]簇则参与氢酶催化过程中电子的传输。目前已有数种NiFe_氢酶和Fe_氢酶的X射线衍射晶体结构被阐明。根据metal_free氢酶的序列特征,推断其结构与NiFe_氢酶和Fe_氢酶之间存在较大差异。对氢酶活性中心和[Fe_S]簇的深入研究,揭示了氢酶催化反应的机理。 展开更多
关键词 氢酶 活性中心 结构特征 催化机理
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纳米技术提高加氢催化剂活性
7
《工业催化》 CAS 2009年第10期68-68,共1页
Criterion催化剂技术公司的新技术平台CENTERA采用纳米技术改进催化剂加氢反应的活性中心结构。初步试验结果表明,用CENTERA镍铬和钴银催化剂生产超低硫柴油,脱硫活性提高25%~50%。
关键词 催化剂活性 纳米技术 加氨 活性中心结构 催化剂技术 超低硫柴油 催化剂生产 加氢反应
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骨架型Ni-P非晶态合金的制备及其在苯加氢中催化性能的研究 被引量:25
8
作者 邓景发 李和兴 《上海师范大学学报(自然科学版)》 2001年第1期1-10,共10页
采用骤冷法制备 Ni-Al-P非晶态合金 ,通过碱抽滤得到骨架形 Ni-P催化剂(Raney Ni-P) ,其非晶态结构由 XRD和 EXAFS证实 .选择工业上具有重要应用价值的苯饱和加氢反应为探针 ,测定了上述催化剂的催化活性 (包括吸氢速率、转化率和 TOF... 采用骤冷法制备 Ni-Al-P非晶态合金 ,通过碱抽滤得到骨架形 Ni-P催化剂(Raney Ni-P) ,其非晶态结构由 XRD和 EXAFS证实 .选择工业上具有重要应用价值的苯饱和加氢反应为探针 ,测定了上述催化剂的催化活性 (包括吸氢速率、转化率和 TOF值 )和对环己烷的选择性 ,并与其对应的由传统骤冷法制备的 Ni-P非晶态合金、晶化Raney Ni-P以及工业上常用的 Raney Ni催化剂进行了比较 .实验结果显示 ,Raney Ni-P的催化性能显著优于其他三种催化剂 ,而且 DSC分析显示其具有较好的热稳定性 ,因此具有良好的工业化应用前景 .通过考察苯浓度、H2 压力和反应温度对加氢反应速率的影响 ,确定了在 Raney Ni-P催化剂上苯加氢反应的动力学速率方程和表观活化能 ,并提出了可能的反应机理 .通过 ICP,XRD,XPS,EXAFS,TEM,BET,氢吸附等一系列表征 ,讨论了催化剂的活性中心结构特征与其催化活性的关系 . Raney Ni的催化活性高于传统Ni-P主要归因于其大比表面积 (分散度 ) ,而 Raney Ni-P的催化活性高于 Raney Ni主要归因于催化活性中心本质的区别 .由于非晶态合金 Ni-P中无显著的电子转移 ,因此几何效应起主要的促进作用 .Raney 展开更多
关键词 骨架型Ni-PD非晶态合金 催化加氢 镍-磷催化剂 催化活性 活性中心结构 分散度
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化学模拟唯铁氢化酶研究进展 被引量:5
9
作者 何成江 王梅 +1 位作者 李敏娜 孙立成 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 2004年第2期250-255,共6页
氢化酶 (hydrogenase ,简称H2 ase)是一类存在于微生物体内的重要生物酶 ,它可以催化氢的氧化反应 ,也可以催化还原质子产生氢气。根据氢化酶活性中心金属的不同 ,可以大致分为三类 :Fe Fe氢化酶 ,Ni Fe氢化酶和不含金属的氢化酶。本文... 氢化酶 (hydrogenase ,简称H2 ase)是一类存在于微生物体内的重要生物酶 ,它可以催化氢的氧化反应 ,也可以催化还原质子产生氢气。根据氢化酶活性中心金属的不同 ,可以大致分为三类 :Fe Fe氢化酶 ,Ni Fe氢化酶和不含金属的氢化酶。本文主要介绍近年来唯铁 (Fe Fe)氢化酶的结构研究和化学模拟最新进展。 展开更多
关键词 唯铁氢化酶 化学模拟 氢化酶 微生物 铁硫配合物 氢能 氢气 活性中心结构 电化学性能
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负载型Au/Al_2O_3系列催化剂的研究进展 被引量:1
10
作者 李小梅 邓谦 肖菡曦 《吉首大学学报(自然科学版)》 CAS 2006年第2期104-110,共7页
负载型金催化剂作为一种新型催化剂,它优异的催化氧化性能引起越来越多化学工作者的关注.Al2O3是催化剂制备中大量使用的典型氧化物载体.综述了近年来以Al2O3为载体的系列Au/Al2O3催化剂的制备方法、催化性能及其活性中心结构的研究状... 负载型金催化剂作为一种新型催化剂,它优异的催化氧化性能引起越来越多化学工作者的关注.Al2O3是催化剂制备中大量使用的典型氧化物载体.综述了近年来以Al2O3为载体的系列Au/Al2O3催化剂的制备方法、催化性能及其活性中心结构的研究状况和发展趋势,讨论的主要反应包括CO低温催化氧化为CO2、汽车尾气净化、含卤有机化合物的消除和甲烷催化燃烧. 展开更多
关键词 Au/Al2O3 催化剂 制备 催化性能 活性中心结构
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固体核磁共振技术在锡硅分子筛表征中的应用 被引量:4
11
作者 肖瑶 夏长久 +3 位作者 易先锋 刘凤庆 刘尚斌 郑安民 《波谱学杂志》 CAS 北大核心 2021年第4期571-584,共14页
生物质等绿色资源的高效转化利用是催化科学的重要发展方向.锡硅分子筛因具有优良的催化性能而得到相关研究者的普遍关注.准确构建催化剂活性中心结构/酸性与催化反应性能之间的构效关系是新型高效催化剂设计与研发的基础.固体核磁共振(... 生物质等绿色资源的高效转化利用是催化科学的重要发展方向.锡硅分子筛因具有优良的催化性能而得到相关研究者的普遍关注.准确构建催化剂活性中心结构/酸性与催化反应性能之间的构效关系是新型高效催化剂设计与研发的基础.固体核磁共振(NMR)是研究分子筛活性中心局域结构、酸特性与催化反应机理的重要手段.本文简述了近年来固体NMR技术在锡硅分子筛研究领域的一系列主要进展,并进行了展望. 展开更多
关键词 固体核磁共振 锡硅分子筛 活性中心结构 酸特性 反应机理
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大连化物所甲烷活化研究进展
12
《石油炼制与化工》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期13-13,共1页
继通过十勾建多对电子循环体系,成功实现低温(80℃)条件下甲烷选择氧化制备甲醇后,大连化物所在甲烷直接活化基础研究方面又取得了新进展。他们通过与美国西太平洋国家实验事合作,获得了完整的固体催化剂活性中心结构的信息,相关... 继通过十勾建多对电子循环体系,成功实现低温(80℃)条件下甲烷选择氧化制备甲醇后,大连化物所在甲烷直接活化基础研究方面又取得了新进展。他们通过与美国西太平洋国家实验事合作,获得了完整的固体催化剂活性中心结构的信息,相关结果发表在最新出版的《美国化学会志》上。 展开更多
关键词 大连化物所 甲烷活化 美国化学会 活性中心结构 固体催化剂 选择氧化 基础研究 直接活化
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大连化学物理研究所甲烷活化研究获进展
13
《化工进展》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第5期795-795,共1页
继通过构建多对电子循环体系,成功实现低温(80℃)条件下甲烷选择氧化制备甲醇后,大连化学物物研究所包信和研究员领导的界面和纳米催化研究组在甲烷直接活化的基础研究方面又取得了新进展。他们通过与美国西太平洋国家实验室合作,... 继通过构建多对电子循环体系,成功实现低温(80℃)条件下甲烷选择氧化制备甲醇后,大连化学物物研究所包信和研究员领导的界面和纳米催化研究组在甲烷直接活化的基础研究方面又取得了新进展。他们通过与美国西太平洋国家实验室合作,获得了完整的固体催化剂活性中心结构的信息。相关结果已发表在最新出版的《美国化学会志》上。 展开更多
关键词 大连化学物理研究所 甲烷活化 美国化学会 活性中心结构 国家实验室 固体催化剂 选择氧化 基础研究
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中科院开发高效新型非贵金属催化剂
14
《石油化工》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期509-509,共1页
中国科学院化学所通过对金属酶活性中心结构的模拟,计算设计了高效、廉价的新型非贵金属催化剂。该研究集中在过渡金属催化的加氢和脱氢反应。这是石化、制药以及精细化工等领域的基础,并与二氧化碳转化利用和可再生能源开发密切相关。
关键词 非贵金属催化剂 可再生能源开发 中科院 中国科学院化学所 活性中心结构 过渡金属催化 计算设计 脱氢反应
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贵州省1996年医药卫生科技进展
15
作者 沈义良 《医学研究杂志》 1997年第4期4-7,共4页
1996年,贵州省医药卫生共获厅级以上科技进步奖40项。其中省级奖18项(包括一等奖1项、二等奖1项、三等奖8项、四等奖8项)、国家中医药管理局中医药基础研究奖1项(三等)、厅级奖21项(包括一等奖12项、二等奖9项)。现择要分类介绍于后: (... 1996年,贵州省医药卫生共获厅级以上科技进步奖40项。其中省级奖18项(包括一等奖1项、二等奖1项、三等奖8项、四等奖8项)、国家中医药管理局中医药基础研究奖1项(三等)、厅级奖21项(包括一等奖12项、二等奖9项)。现择要分类介绍于后: (一)基础医学 1.碳酸酐酶催化功能与活性中心结构的关系研究该项目运用停流技术、快速扫描、化学修饰和钴代技术。 展开更多
关键词 医药卫生 贵州省 胰腺癌 催化功能 癌基因表达 碳酸酐酶 关系研究 化学修饰 活性中心结构 小巨核细胞
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甲烷活化制芳烃基础研究取得新进展
16
《化学与生物工程》 CAS 2008年第6期9-9,共1页
关键词 甲烷活化 基础研究 中科院大连化学物理研究所 固体催化剂 芳烃 活性中心结构 国家实验室 选择氧化
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兰州化物所仿生催化氧化研究取得进展
17
《河南化工》 CAS 2021年第8期45-45,共1页
生物体利用金属酶活化氧气完成新陈代谢的氧化。受此启发,科研人员发展了一系列重要的仿生催化氧化反应体系。其中,基于非血红酶(牛磺酸双加氧酶、甲烷单加氧酶等)活性中心结构构建的四氮铁、锰配合物在羧酸辅助下活化H_(2)O_(2),实现了... 生物体利用金属酶活化氧气完成新陈代谢的氧化。受此启发,科研人员发展了一系列重要的仿生催化氧化反应体系。其中,基于非血红酶(牛磺酸双加氧酶、甲烷单加氧酶等)活性中心结构构建的四氮铁、锰配合物在羧酸辅助下活化H_(2)O_(2),实现了对C=C键和C-H键的高效选择性氧化。然而,配合物在均相氧化反应条件下易被氧化失活。长期以来,催化剂的氧化降解难题未得到有效解决。 展开更多
关键词 选择性氧化 锰配合物 甲烷单加氧酶 科研人员 活性中心结构 仿生催化氧化 新陈代谢 双加氧酶
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大连化物所甲烷活化研究取得新进展
18
《气体净化》 2008年第3期24-25,共2页
继通过构建多对电子循环体系,成功实行了低温(80℃)条件下甲烷选择氧化制备甲醇(J.Am.Chem.Soc.,128(2006)16028)后,大连化物所包信和研究员领导的”界面和纳米催化”研究组在甲烷直接活化的基础研究方面又取得了新进展。... 继通过构建多对电子循环体系,成功实行了低温(80℃)条件下甲烷选择氧化制备甲醇(J.Am.Chem.Soc.,128(2006)16028)后,大连化物所包信和研究员领导的”界面和纳米催化”研究组在甲烷直接活化的基础研究方面又取得了新进展。通过与美国西太平洋国家实验室合作,采用高场固体核磁技术,直接对真实催化剂进行研究,获得了完整的固体催化剂活性中心结构的信息。 展开更多
关键词 大连化物所 甲烷活化 固体催化剂 活性中心结构 国家实验室 CHEM 选择氧化 基础研究
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Ethylene Polymerization Using Improved Polyethylene Catalyst 被引量:6
19
作者 朱孝恒 郭子芳 +1 位作者 岑为 毛炳权 《Chinese Journal of Chemical Engineering》 SCIE EI CAS CSCD 2011年第1期52-56,共5页
The study concerns the use of MgCl2-supported high-activity Ziegler-Natta catalysts for the polymerization of ethylene.In particular,two types of catalysts were investigated,which were N-catalyst(BRICI)and improved ... The study concerns the use of MgCl2-supported high-activity Ziegler-Natta catalysts for the polymerization of ethylene.In particular,two types of catalysts were investigated,which were N-catalyst(BRICI)and improved polyethylene catalyst.The effects of catalyst structure on kinetic behavior were examined.The distribution of active centers in these catalysts was investigated by energy dispersive analysis by X-rays(EDAX),and morphologies of catalyst particles and polymer products were examined by scanning electron microscope(SEM).Hydrogen response and copolymerization performance were investigated and compared with the two catalysts.The results were correlated with the kinetic behavior of the two catalysts and appropriate models for polymer particle growth were presented.The improved polyethylene catalyst showed higher activity,better hydrogen response and copolymerization performance. 展开更多
关键词 polyethylene catalyst POLYETHYLENE slurry polymerization process ethoxy group
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新生物能源的挑战——有关镍铁氢化酶研究的新进展 被引量:1
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作者 张岐 廖代正 王耕霖 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 1998年第9期897-902,共6页
氢化酶是可逆分裂重组氢分子的一类酶 .由于在燃料细胞和新能源方面具有诱人的应用前景 ,成为当今自然界向能源、化学学科挑战课题之一 .目前发现的 4种氢化酶中 ,镍铁氢化酶的存在最为普遍 ,研究也最为深入 .但在活性中心结构组成和催... 氢化酶是可逆分裂重组氢分子的一类酶 .由于在燃料细胞和新能源方面具有诱人的应用前景 ,成为当今自然界向能源、化学学科挑战课题之一 .目前发现的 4种氢化酶中 ,镍铁氢化酶的存在最为普遍 ,研究也最为深入 .但在活性中心结构组成和催化机理方面一直存在着不同观点和争论 ,引起许多国家学者的极大关注 . 展开更多
关键词 镍铁氢化酶 活性中心结构 催化机理 生物能源
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