目的探究摩罗丹浓缩丸(Moluodan concentrated pill,MLD)治疗慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)潜在的分子机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database a...目的探究摩罗丹浓缩丸(Moluodan concentrated pill,MLD)治疗慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)潜在的分子机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中医药综合数据库(Traditional Chinese Medicine Integrated Database,TCMID)、中医药整合药理学研究平台(Integrative Pharmacologybased Research Platform of Traditional Chinese Medicine,TCMIP)和中药免疫肿瘤学数据库(Traditional Chinese Medicine on Immuno-Oncology,TCMIO)获取MLD的化合物和化合物相关靶点(compound-related target,CRT);DisGeNET和GeneCards数据库获取CAG相关靶点基因(CAG related target gene,CAG-RTG);采用Cytoscape 3.7.2软件构建MLD化合物-CRT网络,并将CRT和CAG-RTG取交集获取MLD相关疾病靶点(MLD-related disease target,MLD-RDT);利用STRING数据库构建MLD-RDT的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并进行拓扑结构分析,筛选重要靶点。采用基因本体论(Gene Ontology,GO)富集分析与京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析探索MLD治疗CAG的主要分子机制。结果MLD中共有259个活性分子,获得961个靶基因,其中179个可能与CAG相关。PPI网络显示,AKT1、TNF、IL-6、TP53、IL-1β等是MLD治疗CAG的关键靶点。富集分析显示,MLD治疗CAG的关键通路为PI3K-AKT信号通路和TNF信号通路。结论MLD可能通过介导TNF/PI3K/AKT信号通路治疗CAG。展开更多
文摘目的探究摩罗丹浓缩丸(Moluodan concentrated pill,MLD)治疗慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)潜在的分子机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中医药综合数据库(Traditional Chinese Medicine Integrated Database,TCMID)、中医药整合药理学研究平台(Integrative Pharmacologybased Research Platform of Traditional Chinese Medicine,TCMIP)和中药免疫肿瘤学数据库(Traditional Chinese Medicine on Immuno-Oncology,TCMIO)获取MLD的化合物和化合物相关靶点(compound-related target,CRT);DisGeNET和GeneCards数据库获取CAG相关靶点基因(CAG related target gene,CAG-RTG);采用Cytoscape 3.7.2软件构建MLD化合物-CRT网络,并将CRT和CAG-RTG取交集获取MLD相关疾病靶点(MLD-related disease target,MLD-RDT);利用STRING数据库构建MLD-RDT的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并进行拓扑结构分析,筛选重要靶点。采用基因本体论(Gene Ontology,GO)富集分析与京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析探索MLD治疗CAG的主要分子机制。结果MLD中共有259个活性分子,获得961个靶基因,其中179个可能与CAG相关。PPI网络显示,AKT1、TNF、IL-6、TP53、IL-1β等是MLD治疗CAG的关键靶点。富集分析显示,MLD治疗CAG的关键通路为PI3K-AKT信号通路和TNF信号通路。结论MLD可能通过介导TNF/PI3K/AKT信号通路治疗CAG。
