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基于抗氧化蛋白探讨中医药改善糖尿病肾病铁死亡的潜在靶点
1
作者 孙靖烨 萧文泽 +1 位作者 周艳雯 王海颖 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1445-1452,共8页
糖尿病肾病(DN)的发病机制相当复杂,铁死亡作为一种新发现的细胞死亡方式成为近年来的研究热点,而DN与铁死亡密切相关。System Xc--GSH-GPX4轴失活、铁过载、脂质过氧化及线粒体功能障碍等因素在DN铁死亡发生发展中具重要作用,抗氧化蛋... 糖尿病肾病(DN)的发病机制相当复杂,铁死亡作为一种新发现的细胞死亡方式成为近年来的研究热点,而DN与铁死亡密切相关。System Xc--GSH-GPX4轴失活、铁过载、脂质过氧化及线粒体功能障碍等因素在DN铁死亡发生发展中具重要作用,抗氧化蛋白可能是治疗DN铁死亡的潜在靶点。通过激活GPX4、Nrf2、Sirtuin家族蛋白及铁蛋白等抗氧化蛋白,可以通过不同途径与相互作用缓解铁死亡的发生发展。中药具有多成分、多靶点、多途径整体调节的特点,中药活性成分及中药复方通过增强抗氧化蛋白表达,对改善DN肾损伤和铁死亡具有潜在应用价值,为延缓DN的进展提供了新的研究方向。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 铁死亡 抗氧化蛋白 中医药 潜在靶点
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基于网络药理学探讨加味参附颗粒治疗慢性心力衰竭的潜在靶点及作用机制 被引量：3
2
作者 叶润杰 黄培红 《广州中医药大学学报》 CAS 2023年第11期2867-2876,共10页
【目的】利用网络药理学预测加味参附颗粒治疗慢性心力衰竭(CHF)的潜在靶点及其作用机制。【方法】通过TCMSP和BATMAN数据库获取加味参附颗粒的相关活性成分和靶点,通过GeneCards、DisGeNET数据库遴选慢性心力衰竭相关的靶点,取交集靶点... 【目的】利用网络药理学预测加味参附颗粒治疗慢性心力衰竭(CHF)的潜在靶点及其作用机制。【方法】通过TCMSP和BATMAN数据库获取加味参附颗粒的相关活性成分和靶点,通过GeneCards、DisGeNET数据库遴选慢性心力衰竭相关的靶点,取交集靶点;运用STRING数据库进行靶蛋白互作分析。运用Metascape数据库对药物-疾病共同靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因百科全书(KEGG)富集分析。运用Cytoscape 3.9.1软件构建成分-靶点-通路网络图。【结果】筛选出加味参附颗粒中42个活性成分和435个直接作用的蛋白靶点,得到38个药物-疾病交集靶点。GO与KEGG富集分析结果显示,加味参附颗粒在血液循环、清除氧自由基、平滑肌细胞的调节、细胞和基因调控等多生物过程方面,通过IL-6、RELA、TNF、VEGFA、MMP-2、MAPK8、TP53、EDN1、MMP-9等核心靶点,流体剪切应力与动脉粥样硬化途径、AGERAGE、HIF-1、MAPK、IL-17、TNF、cAMP、钙等信号通路治疗慢性心力衰竭。【结论】加味参附颗粒可通过改善心脏供血、抑制炎症反应、抗氧化应激、抑制心肌重构、调节心肌细胞的代谢等方面多靶点多途径治疗慢性心力衰竭。 展开更多
关键词 加味参附颗粒 慢性心力衰竭 网络药理学 潜在靶点 作用机制
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基于网络药理学研究厚朴温中汤治疗脾胃虚寒型胃病的潜在靶点和机制 被引量：4
3
作者 蒋红霞 陈婉君 +4 位作者 许炜炜 马勤阁 孙群 陈殊 刘建群 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期1764-1773,共10页
目的探究厚朴温中汤治疗脾胃虚寒型胃病的潜在靶点和机制。方法运用TCMSP数据库、疾病数据库和化合物靶点预测平台,收集活性成分、疾病靶点,预测潜在作用靶点;应用Cytoscape 3.7.2和String平台进行关键化学成分和核心靶点筛选,构建PPI... 目的探究厚朴温中汤治疗脾胃虚寒型胃病的潜在靶点和机制。方法运用TCMSP数据库、疾病数据库和化合物靶点预测平台,收集活性成分、疾病靶点,预测潜在作用靶点;应用Cytoscape 3.7.2和String平台进行关键化学成分和核心靶点筛选,构建PPI网络图;将degree值大于30的活性成分与关键靶点进行分子对接,并进行细胞实验。结果厚朴温中汤治疗脾胃虚寒型胃病的关键活性成分包括橙皮苷、厚朴酚、6-姜辣素等;关键靶点包括JUN、AKT1、IL-8等;相关通路主要涉及免疫应答、信号转导、细胞增殖与凋亡等;分子对接显示关键活性成分与关键靶点结合活性较好。细胞实验结果显示,厚朴酚、橙皮苷、6-姜辣素均对IL-8有很好的抑制作用,且呈剂量依赖关系。结论推测厚朴温中汤可能通过关键活性成分作用于关键靶点,参与PI3K-AKT、NF-κB等信号通路调控,实现治疗脾胃虚寒型胃病相关疾病作用;首次发现6-姜辣素能够与多个治疗脾胃虚寒型胃病的疾病靶点(如AKT1、IL-8等)稳定结合,提示6-姜辣素值得进一步研究;根据IL-8细胞实验结果,推测厚朴酚、橙皮苷、6-姜辣素可能通过降低胃黏膜中IL-8含量,对幽门螺杆菌感染引起的胃病产生作用。 展开更多
关键词 网络药理学 厚朴温中汤 脾胃虚寒型胃病 分子对接 细胞验证 潜在靶点和机制
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小细胞肺癌的临床用药方案现状及潜在靶点药物治疗方案新进展 被引量：2
4
作者 章欢琪 林旭 +1 位作者 沈姝颖 李杨玲 《中国药房》 CAS 北大核心 2023年第16期2039-2043,共5页
小细胞肺癌(SCLC)约占肺癌的15%,恶性程度高,异质性和侵袭性均较强。依托泊苷联合铂类是广泛期SCLC标准一线治疗的基础,但存在易耐药、易复发的问题。近年来,新型免疫药物和新型细胞毒性药物的出现在一定程度上提高了SCLC患者的生存率,... 小细胞肺癌(SCLC)约占肺癌的15%,恶性程度高,异质性和侵袭性均较强。依托泊苷联合铂类是广泛期SCLC标准一线治疗的基础,但存在易耐药、易复发的问题。近年来,新型免疫药物和新型细胞毒性药物的出现在一定程度上提高了SCLC患者的生存率,为复发/难治型SCLC患者带来了治疗希望。本文通过综述SCLC临床用药方案的现状和潜在靶点药物治疗方案的新进展发现,目前SCLC一、二、三线方案包括依托泊苷+卡铂、阿替利珠单抗+依托泊苷+铂类药物、阿得贝利单抗、拓扑替康、多西他赛等,作用靶点主要集中在拓扑异构酶Ⅱ/Ⅰ、DNA、免疫检查点分子程序性死亡受体1/程序性死亡受体配体1、微管蛋白等;潜在靶点药物治疗方案包括阿立塞替+紫杉醇、洛伐妥珠单抗、APG-1252等,作用靶点主要集中在DNA损伤应答通路和免疫通路,可通过极光激酶A等多种潜在靶点来发挥抗肿瘤作用,实现延长患者生存期的治疗目标。 展开更多
关键词 小细胞肺癌 化疗 免疫治疗 作用靶点 潜在靶点药物治疗方案
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基于网络药理学预测复方白花蛇舌草胶囊治疗肝细胞癌的潜在靶点及其机制研究 被引量：4
5
作者 刘震 刘延 朱建国 《中国药师》 CAS 2021年第2期261-268,共8页
目的:基于网络药理学,预测复方白花蛇舌草胶囊治疗肝细胞癌的潜在靶点及其机制研究。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选出本处方5味中药潜在活性成分,通过Drug Bank和化合物与蛋白质互作(STITCH)数据库分析筛... 目的:基于网络药理学,预测复方白花蛇舌草胶囊治疗肝细胞癌的潜在靶点及其机制研究。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选出本处方5味中药潜在活性成分,通过Drug Bank和化合物与蛋白质互作(STITCH)数据库分析筛选作用靶点;查询肝癌疾病特定数据库Liverome和Onco DB.HCC得到疾病靶点;韦恩图取得交集,蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)数据库构建复方白花蛇舌草胶囊和肝细胞癌的交互靶点调控功能;通过中医药百科全书(ETCM)数据库分析药物属性和归经情况。同时利用Clu GO、DAVID分析平台进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路的富集。结果:本研究共筛选出134个潜在的活性成分与疾病映射后的41个靶点蛋白,且药物属寒性,主要对应肝经和脾经。处方中药物活性成分主要作用于TP53、PTGS2、ESR1、AR等靶蛋白,调控PI3K-AKT、MAPK和TNF信号通路等,发挥治疗肝细胞癌作用。结论:复方白花蛇舌草胶囊可以通过增强免疫力、抑制肿瘤细胞增殖和促进细胞凋亡的多靶点-多途径干预治疗肝细胞癌。 展开更多
关键词 复方白花蛇舌草胶囊 网络药理学 肝细胞癌 炎症反应 潜在靶点
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基于网络药理学的佛手干预2型糖尿病潜在靶点机制研究 被引量：3
6
作者 张磊 朴胜华 郭姣 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2020年第10期3594-3604,共11页
目的基于网络药理学方法研究佛手干预2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的潜在作用靶点。方法利用TTD数据库、Drugbank数据库、OMIM数据库和DisGeNET数据库筛选T2DM相关基因,借助TCMSP数据库筛选佛手有效化学成分作为候选药效成... 目的基于网络药理学方法研究佛手干预2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的潜在作用靶点。方法利用TTD数据库、Drugbank数据库、OMIM数据库和DisGeNET数据库筛选T2DM相关基因,借助TCMSP数据库筛选佛手有效化学成分作为候选药效成分,通过COXPRESdb数据库及STRING筛选关键蛋白,运用Cytoscape 3.7.1软件构建疾病-药效成分-靶点-通路关系网络,使用DAVID 6.8数据库进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和KEGG通路富集分析,通过Vina将佛手候选药效成分与关键蛋白进行分子对接。结果①筛选得到181个疾病靶点候选基因、佛手6种有效成分、药效成分和疾病相关的25个关键蛋白,构建疾病-药效成分-靶点-通路关系网络;②GO功能富集分析得到GO条目57个(P≤0.05),其中生物过程条目43个,分子功能条目10个,KEGG通路富集得到10条通路(P≤0.05);③选取10个关键蛋白与佛手6个药效成分进行分子对接,结果显示其结合稳定。结论通过网络药理学研究发现,佛手通过6种有效成分,影响25个潜在靶点、10条相关通路,调节胆固醇生物合成和胰岛素分泌功能干预T2DM,为佛手作为"调肝启枢化浊"法主要药味治疗糖脂代谢病提供了依据,为其进一步的临床应用和深入研究开发提供了思路和线索。 展开更多
关键词 网络药理学 佛手 2型糖尿病 潜在靶点
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基于网络药理学的附子干预糖尿病潜在靶点研究 被引量：2
7
作者 龚胜男 黎军宏 +3 位作者 梁新梅 陈梓焜 唐农 莫雪妮 《中药材》 CAS 北大核心 2020年第11期2779-2784,共6页
目的:运用网络药理学方法预测附子对糖尿病的潜在作用靶点及通路。方法:通过TCMSP数据库和PubChem Compound数据库获取附子化学成分,利用PharmMapper获取与药效成分匹配的生物大分子蛋白,再通过Uniprot数据库进行蛋白靶点匹配。通过Gene... 目的:运用网络药理学方法预测附子对糖尿病的潜在作用靶点及通路。方法:通过TCMSP数据库和PubChem Compound数据库获取附子化学成分,利用PharmMapper获取与药效成分匹配的生物大分子蛋白,再通过Uniprot数据库进行蛋白靶点匹配。通过GeneCards数据库筛选与糖尿病相关的基因,运用Metascape/Enrichr进行基因富集分析和KEGG通路分析,并运用Cytoscape软件构建PPI网络,合并成分⁃靶点网络、疾病⁃靶点PPI网络和靶点⁃通路网络得到疾病⁃成分⁃靶点⁃通路相互作用网络模型。结果:预测到附子干预糖尿病的10个药效成分和27个关键靶点;GO功能富集分析发现附子药效成分与多种酶或受体结合,影响酶的活性及调控转录等功能相关,KEGG通路富集分析发现多条通路与糖尿病相关。结论:基于网络药理学研究了附子干预糖尿病的成分⁃靶点⁃通路互作关系、作用特点及机制,对后续探索温阳类中药对糖尿病的干预作用做了基础铺垫,为进一步糖尿病的临床研究及实验验证提供了新思路和方法。 展开更多
关键词 附子 糖尿病 网络药理学 潜在靶点 通路
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基于网络药理学的黄连干预2型糖尿病潜在靶点研究 被引量：10
8
作者 罗婷婷 鲁媛 +2 位作者 严诗楷 肖雪 郭姣 《中药材》 CAS 北大核心 2019年第1期202-207,共6页
目的:基于网络药理学方法研究黄连干预2型糖尿病的潜在作用靶点。方法:筛选出黄连中口服生物利用度大于30%和类药性大于0.18的化学成分作为候选药效成分,然后利用PharmMapper发现与药效成分匹配的生物大分子,构建成分-靶点网络。通过Gen... 目的:基于网络药理学方法研究黄连干预2型糖尿病的潜在作用靶点。方法:筛选出黄连中口服生物利用度大于30%和类药性大于0.18的化学成分作为候选药效成分,然后利用PharmMapper发现与药效成分匹配的生物大分子,构建成分-靶点网络。通过GeneGards数据库筛选与2型糖尿病相关的基因,构建疾病靶点PPI网络。合并成分-靶点网络、疾病靶点PPI网络和靶点-通路网络得到疾病-成分-靶点-通路PPI网络。通过网络分析发现黄连降糖作用的关键成分和潜在作用靶点。结果:研究得到11个药效成分和25个关键靶点,GO功能富集分析涉及到生物过程和分子功能两方面,KEGG通路富集分析发现5条相关通路。结论:SORD、HSD11B1、F2、MMP3、PTPN1、GSK3B、NR1H2、MAPK14等靶点可能是黄连干预2型糖尿病的潜在作用靶点。 展开更多
关键词 黄连 2型糖尿病 网络药理学 潜在靶点
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基于网络药理学分析淫羊藿-三七配伍治疗前列腺癌的潜在靶点及相关机制 被引量：4
9
作者 刘德果 李姿蓉 +2 位作者 赵姣 陈其华 苏艺峰 《亚太传统医药》 2021年第8期166-171,共6页
目的:基于网络药理学分析淫羊藿-三七配伍治疗前列腺癌的潜在靶点及相关机制。方法:借助TCMSP及TCMID数据库检索淫羊藿、三七的药物活性成分及靶点信息,GeneCards及OMIM数据库检索前列腺癌的作用靶点。利用Cytoscape软件构建"药物... 目的:基于网络药理学分析淫羊藿-三七配伍治疗前列腺癌的潜在靶点及相关机制。方法:借助TCMSP及TCMID数据库检索淫羊藿、三七的药物活性成分及靶点信息,GeneCards及OMIM数据库检索前列腺癌的作用靶点。利用Cytoscape软件构建"药物-成分-靶点-疾病"网络图,通过STRING及CentiScape进行PPI蛋白互作分析,同时对药物-疾病关键靶点进行GO和KEGG富集分析。结果:共检索淫羊藿-三七的有效活性成分24个,治疗前列腺癌靶点基因64个,筛选出64个核心靶点。GO富集分析中生物学过程集中在泛素化、核受体功能、转录相关功能、激素受体功能、细胞凋亡等;KEGG富集分析提示淫羊藿-三七治疗前列腺癌主要涉及细胞凋亡、肿瘤抑制信号通路(p53)、内分泌抵抗、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)、肿瘤坏死因子(TNF)等信号通路。结论:该研究初步预测了淫羊藿-三七配伍治疗前列腺癌的关键靶点以及相关信号通路,提示其可能通过促进细胞凋亡、抑制肿瘤细胞增殖、降低内分泌抵抗、杀伤肿瘤细胞以及抑制肿瘤血管生成等途径发挥抗肿瘤作用,为进一步深入研究提供了新思路。 展开更多
关键词 网络药理学 药对 淫羊藿 三七 前列腺癌 潜在靶点
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基于肠道菌群理论探讨千金苇茎汤治疗呼吸系统疾病的潜在靶点 被引量：21
10
作者 刘怀全 秦忠 +5 位作者 朱星 柴艺汇 高洁 陈云志 张孟之 李文 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2020年第2期41-43,共3页
研究表明,肠道菌群对呼吸系统疾病具有一定的调节作用。千金苇茎汤为中医学治疗肺系疾病的经典方,具有清肺化痰、逐瘀排脓之效,目前常用于治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)、重症肺炎、支气管哮喘、肺脓肿等呼吸系统疾病。根据文献报道,千金... 研究表明,肠道菌群对呼吸系统疾病具有一定的调节作用。千金苇茎汤为中医学治疗肺系疾病的经典方,具有清肺化痰、逐瘀排脓之效,目前常用于治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)、重症肺炎、支气管哮喘、肺脓肿等呼吸系统疾病。根据文献报道,千金苇茎汤与肠道菌群存在密切关联。据此推测,千金苇茎汤可能是通过调节肠道菌群的平衡治疗呼吸系统疾病,肠道菌群可能是千金苇茎汤治疗呼吸系统疾病的潜在靶点。 展开更多
关键词 肠道菌群 千金苇茎汤 呼吸系统疾病 探讨 潜在靶点
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基于网络药理学与分子对接技术预测甘草-杏仁治疗COVID-19的潜在靶点及作用机制 被引量：1
11
作者 陈萧月 张永强 +2 位作者 饶青 宋晶睿 李艳梅 《湖北民族大学学报（医学版）》 2021年第3期15-21,共7页
目的基于网络药理学与分子对接方法,初步预测甘草-杏仁治疗COVID-19的潜在靶点和作用机制.方法应用TCMSP数据库筛选甘草-杏仁药对潜在活性成分及作用靶点,通过Uniprot数据库将获得的靶点蛋白转换成Gene symbol.从GeneCards数据库筛选COV... 目的基于网络药理学与分子对接方法,初步预测甘草-杏仁治疗COVID-19的潜在靶点和作用机制.方法应用TCMSP数据库筛选甘草-杏仁药对潜在活性成分及作用靶点,通过Uniprot数据库将获得的靶点蛋白转换成Gene symbol.从GeneCards数据库筛选COVID-19疾病靶点,将获得的药物靶点与疾病靶点进行映射,利用Cytoscape软件进行PPI网络拓扑分析,STRING数据库构建蛋白互作网络以及GO富集分析和KEGG信号通路分析.将筛选到的主要有效成分与SARA-CoV2-3CL水解酶、血管紧张素转化酶2(ACE2)进行分子对接.结果共筛选到111个活性成分和与疾病映射后的48个靶点蛋白.GO富集功能分析得到生物过程(BP)1350条、分子功能(MF)130条、细胞组成(CC)60条.KEGG信号通路筛选得到167条信号通路.分子对接结果显示槲皮素、山奈酚、柚皮素与SARA-CoV2-3CL水解酶、ACE2具有较强亲和力.结论甘草-杏仁可以通过抑制炎症、抗氧化应激、细胞凋亡等功能缓解COVID-19的作用机制. 展开更多
关键词 甘草-杏仁 网络药理学 分子对接 COVID-19 潜在靶点
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去甲汉黄芩素抗脓毒症潜在靶点的筛选与鉴定 被引量：1
12
作者 柏慧 王新会 +2 位作者 娄佳悦 李小清 陈桂荣 《药学研究》 CAS 2021年第11期708-712,共5页
目的对去甲汉黄芩素的分子特征进行研究,筛选并鉴定其在治疗脓毒症的潜在靶点。方法基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),对去甲汉黄芩素的药理参数以及分子特征进行分析;利用Swiss TargetPrediction和DRAR-CPI,甄别得到去甲汉... 目的对去甲汉黄芩素的分子特征进行研究,筛选并鉴定其在治疗脓毒症的潜在靶点。方法基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),对去甲汉黄芩素的药理参数以及分子特征进行分析;利用Swiss TargetPrediction和DRAR-CPI,甄别得到去甲汉黄芩素抗脓毒症的潜在目标靶点。去甲汉黄芩素的靶点筛选是基于人类孟德尔遗传病数据库,毒性与基因比较数据库和药物靶点数据库中收载的靶点相匹配得出。将筛选出的去甲汉黄芩素抗脓毒症的靶点,通过分子对接软件进一步筛选鉴定得到去甲汉黄芩素的潜在靶点。结果去甲汉黄芩素成药性良好,其口服生物利用度(OB)为39.40%,药物的相似度(DL)为0.21。实验筛选得到的105个潜在靶点中,发现其中有7个与脓毒症直接相关,在经分子对接软件鉴定后得出去甲汉黄芩素抗脓毒症的5个潜在靶点:凝血因子Ⅸ(F9)、人雌激素受体β(ESR2)、组织蛋白酶G(CTSG)、嘌呤核苷磷酸化酶(PNP)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)。结论去甲汉黄芩素可通过与筛选的靶标结合,调控凝血因子Ⅸ参与凝血系统级联反应,调节ESR2维持雌激素水平的稳定,调节组织蛋白酶G、丝裂原活化蛋白激酶1和嘌呤核苷磷酸化酶抑制脓毒症组织和器官损伤,起到保护脓毒症损伤器官的作用,最终通过缓解脓毒症的症状及炎症等水平起到抗脓毒症作用。 展开更多
关键词 去甲汉黄芩素 脓毒症 潜在靶点
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二氢乳清酸脱氢酶介导的铁死亡防御是肿瘤治疗中的潜在靶点 被引量：105
13
作者 李娜(编译) Mao C +1 位作者 Liu X Zhang Y 《国际老年医学杂志》 2021年第4期202-202,共1页
铁死亡是一种过度的脂质过氧化诱导的调节性细胞死亡形式,是关键的肿瘤抑制机制。谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)和铁死亡抑制蛋白1(FSP1)构成了2个主要的铁死亡防御系统。本研究表明用GPX4抑制剂治疗癌细胞会导致N-氨基甲酰基-l-天冬氨酸(... 铁死亡是一种过度的脂质过氧化诱导的调节性细胞死亡形式,是关键的肿瘤抑制机制。谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)和铁死亡抑制蛋白1(FSP1)构成了2个主要的铁死亡防御系统。本研究表明用GPX4抑制剂治疗癌细胞会导致N-氨基甲酰基-l-天冬氨酸(一种嘧啶生物合成中间体)的急性消耗,并伴随尿苷的积累。 展开更多
关键词 氨基甲酰 肿瘤治疗 脂质过氧化 铁死亡 防御系统 调节性 潜在靶点 天冬氨酸
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基于网络药理学预测定清片治疗白血病的潜在靶点及其机制研究 被引量：3
14
作者 张永强 杨珏 +2 位作者 饶青 宋晶睿 李艳梅 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2020年第11期145-148,I0029,I0030,I0031,共7页
目的基于网络药理学,预测定清片治疗白血病的潜在靶点及其机制研究。方法应用TCMSP数据库筛选出本处方6味中药潜在活性成分,通过Drugbank、STITCH和DRAR-CPI数据库分析筛选作用靶点;从TTD、KEGG和DisGeNET数据库查询白血病疾病靶点;分... 目的基于网络药理学,预测定清片治疗白血病的潜在靶点及其机制研究。方法应用TCMSP数据库筛选出本处方6味中药潜在活性成分,通过Drugbank、STITCH和DRAR-CPI数据库分析筛选作用靶点;从TTD、KEGG和DisGeNET数据库查询白血病疾病靶点;分别采用韦恩图取得交集,PPI数据库构建定清片和白血病的交互靶点调控功能;同时利用DAVID、KEGG、STRING分析平台进行GO分析和KEGG信号通路的富集。结果本研究共筛选出55个潜在的活性成分和与疾病映射后的43个靶点蛋白。处方中药物活性成分主要作用于RXRA、CASP3、ESR1、AR、RB1等靶蛋白,调控PI3K-Akt和JAK-STAT信号通路等,发挥治疗白血病作用。结论定清片可以通过阻滞细胞周期抑制肿瘤细胞增殖和促进细胞凋亡的多靶点-多途径干预治疗白血病。 展开更多
关键词 定清片 网络药理学 白血病 潜在靶点 细胞周期
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基于维生素D轴探讨补肾治疗结直肠癌的潜在靶点 被引量：1
15
作者 张孟之 段亚平 +7 位作者 王宗陵 任慧敏 高洁 柴艺汇 李文 秦忠 管连城 陈云志 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2019年第11期2708-2711,共4页
维生素D属人体内必需的脂溶性维生素,大多通过进食或照射阳光后获得,与肝、肾、甲状腺系统密切相关。维生素D不仅能改善骨骼系统疾病,还对结直肠癌等危重疾病有着正向调节作用。基于课题组前期研究发现,中医"肾精"与维生素D... 维生素D属人体内必需的脂溶性维生素,大多通过进食或照射阳光后获得,与肝、肾、甲状腺系统密切相关。维生素D不仅能改善骨骼系统疾病,还对结直肠癌等危重疾病有着正向调节作用。基于课题组前期研究发现,中医"肾精"与维生素D轴在获取来源、调控机制及治疗效用等方面存在密切的相关性且补肾疗法对于改善结直肠癌术后预后有着较好的疗效。据此推测,中医补肾疗法可能是通过调节维生素D轴治疗结直肠癌,维生素D轴可能是补肾治疗结直肠癌的潜在靶点。 展开更多
关键词 维生素D轴 补肾 结直肠癌 潜在靶点 探讨
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单羧酸转运体1和4对肿瘤代谢的影响以及作为肾癌治疗潜在靶点的研究进展
16
作者 杨若男 纪建磊 +5 位作者 黄涛 王洪阳 李树娟 郭琛 董震 曹延炜 《泌尿外科杂志（电子版）》 2020年第2期1-6,共6页
肿瘤细胞有氧糖酵解被称为瓦伯格(War-burg)效应.单羧酸转运蛋白(monocarboxylate transporters,MCTs)负责在细胞内外转运乳酸,从而成为酵解的关键分子.其中MCT1和MCT4是两种在生理和病理状态下主要调节乳酸转运的蛋白.已有多项研究证实... 肿瘤细胞有氧糖酵解被称为瓦伯格(War-burg)效应.单羧酸转运蛋白(monocarboxylate transporters,MCTs)负责在细胞内外转运乳酸,从而成为酵解的关键分子.其中MCT1和MCT4是两种在生理和病理状态下主要调节乳酸转运的蛋白.已有多项研究证实了MCT1和MCT4在多种类型的肿瘤中呈现高表达状态,并且与肿瘤细胞的恶性程度及其预后呈正相关.抑制MCT1和MCT4的表达可以抑制肿瘤细胞的生长、侵袭和迁移,因此MCT1和MCT4逐渐成为肿瘤靶向治疗的潜在靶点.本文针对MCT1和MCT4在肿瘤发生发展中的作用以及其作为肾癌治疗潜在靶点的研究进展做一阐述.单羧酸转运蛋白是一类重要的跨膜转运蛋白,主要对乳酸进行转运[1],进而维持机体内环境的动态平衡.目前已知的MCT家族主要有14个成员,其亚型命名为1~14号[2].根据蛋白水解和拓扑分析结果表明,MCTS家族全部成员都具有相似的拓扑结构,均由N-端、C-端和12个跨膜域(transmembrane domain)组成.MCTS具有相似的生化特征和不同的组织细胞分布.其中MCT1几乎分布于人体所有组织细胞中,主要参与乳酸的转运,在肿瘤细胞中MCT1异常高表达.Warburg效应表明,在肿瘤细胞中,有氧糖酵解是其进行细胞代谢的主要方式[3],即使在有氧的条件下肿瘤细胞依然依靠糖酵解供能.此过程中细胞内产生的乳酸过多,MCT1能及时将细胞内产生的乳酸转运到细胞外,维持细胞内的pH值稳定;同时,当细胞内的葡萄糖缺乏时,乳酸可以作为"替代燃料",肿瘤细胞会利用乳酸作为能源,MCT1会将细胞外游离的乳酸转运至细胞内,为肿瘤细胞供能[4].MCT4对乳酸的亲和力较低[5],常在高度依赖糖酵解的细胞中出现,如白肌纤维和肿瘤细胞,主要负责细胞中乳酸的转出.MCT4可将肿瘤细胞中产生的大量乳酸转运到细胞外,维持细胞内外环境稳定.肿瘤细胞主要通过糖酵解获取能量,因此要获得较高的糖酵解率,加快肿瘤细胞的生长,必须将乳酸转运到细胞外.已有多项研究表明,MCT1和MCT4在多种肿瘤细胞中高表达,并且与肿瘤细胞的增殖、侵袭及预后密切相关. 展开更多
关键词 有氧糖酵解 潜在靶点 肾癌治疗 恶性程度 细胞代谢 组织细胞 生化特征 拓扑分析
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基于网络药理学的益母草治疗心梗潜在靶点的研究 被引量：1
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作者 杨雨微 聂锐 +3 位作者 单鑫 陈静 汪洁 吕志阳 《现代盐化工》 2020年第5期60-61,共2页
基于网络药理学方法研究益母草治疗心梗的作用机制。采用中药系统药理学数据库及技术平台(TCMSP)根据OB≥30%和DL≥0.18的条件筛选出益母草中的化学成分及相关作用靶点,通过Uniprot数据库找出官方基因名称。利用疾病靶点相关数据库检索... 基于网络药理学方法研究益母草治疗心梗的作用机制。采用中药系统药理学数据库及技术平台(TCMSP)根据OB≥30%和DL≥0.18的条件筛选出益母草中的化学成分及相关作用靶点,通过Uniprot数据库找出官方基因名称。利用疾病靶点相关数据库检索与心梗相关的靶点基因。将活性成分所对应的靶点基因和心梗相关的靶点基因交集,获得两者的共同基因即为益母草治疗心梗的关键靶点。使用Cytoscape软件构建中药-活性成分-关键靶点网络,根据度值进行筛选,寻找益母草治疗心梗的主要物质基础。将关键靶点导入String数据库获得蛋白互作关系,结果导入Cytoscape软件进行可视化。利用DAVID数据库及ClueGo插件对关键作用靶点进行GO注释分析和KEGG通路分析,探究益母草治疗心梗的生物过程及作用通路。 展开更多
关键词 益母草 心梗 网络药理学 潜在靶点
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基于随机森林算法预测红景天治疗心脑血管类疾病的潜在靶点
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作者 苑婕 王红旗 +1 位作者 谢丽敏 葛晓静 《海南医学》 CAS 2022年第19期2487-2491,共5页
目的 应用网络药理学研究方法中的随机森林算法构建药物-靶点模型,预测红景天治疗心脑血管类疾病的关键靶标。方法 搜集KEGG数据库中小分子药物-核蛋白、小分子药物-G蛋白、小分子药物-离子通道、小分子药物-酶四类药靶数据作为训练集,... 目的 应用网络药理学研究方法中的随机森林算法构建药物-靶点模型,预测红景天治疗心脑血管类疾病的关键靶标。方法 搜集KEGG数据库中小分子药物-核蛋白、小分子药物-G蛋白、小分子药物-离子通道、小分子药物-酶四类药靶数据作为训练集,采用随机森林算法构建药物-靶点模型并预测红景天体内潜在作用靶点,应用Cytoscape软件构建红景天化学成分、体内潜在作用靶点及相关疾病网络;利用十折交叉验证进行模型精度评价。结果 红景天的9个化学成分被预测出多个作用靶点并得到较好的文献验证,小分子药物-核蛋白、小分子药物-G蛋白、小分子药物-离子通道、小分子药物-酶四类药靶模型的预测正确率分别是68.22%、73.71%、67.08%、71.36%。结论 本方法所建模型预测红景天治疗心脑血管类疾病的关键靶标精度较高,也可用于预测其他中药化学成分的潜在作用靶点。 展开更多
关键词 红景天 网络药理学 随机森林算法 心脑血管疾病 潜在靶点
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黄柏酮抗脓毒症潜在靶点的筛选与鉴定
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作者 陈玉婷 刘雨浓 +2 位作者 刘畅 徐煜彬 陈桂荣 《中华危重病急救医学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期829-834,共6页
目的研究黄柏酮的分子特性,筛选并鉴定黄柏酮抗脓毒症的潜在靶点。方法通过中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)分析黄柏酮的药理参数和分子特性;通过化合物靶标预测平台工具SwissTargetPrediction服务器和化学成分靶向蛋白服务器(DRAR... 目的研究黄柏酮的分子特性,筛选并鉴定黄柏酮抗脓毒症的潜在靶点。方法通过中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)分析黄柏酮的药理参数和分子特性;通过化合物靶标预测平台工具SwissTargetPrediction服务器和化学成分靶向蛋白服务器(DRAR-CPI),以Z'值<-0.5筛选黄柏酮抗脓毒症的潜在靶点;通过人类孟德尔遗传在线(OMIM)数据库、毒性与基因比较数据库(CTD)和药物靶标数据库(TTD)中已报道的蛋白信息与脓毒症相关疾病靶标进行匹配,筛选黄柏酮抗脓毒症的靶点;进一步通过分子对接软件鉴定黄柏酮抗脓毒症的潜在靶点。结果黄柏酮口服生物利用度(OB)为81.58%,药物相似度(DL)为0.57,表明其口服吸收较好,具有很好的成药性。通过SwissTargetPrediction和DRAR-CPI服务器共筛选到242个黄柏酮抗脓毒症的潜在靶点,其中有13个靶点与脓毒症直接相关。经分子对接软件鉴定,组织蛋白酶G(CTSG)、胱天蛋白酶1(CASP1)、S100钙结合蛋白A9(S100A9)、蛋白C(凝血因子Ⅴa和Ⅷa抑制因子,PROC)、丝裂素活化蛋白激酶1(MAPK1)、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)、白细胞介素-10(IL-10)、巨噬细胞移动抑制因子(MIF)、C5a受体1(C5AR1)、胱天蛋白酶3(CASP3)、CXC趋化因子受体2(CXCR2)、凝血酶受体(F2R)和烟酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT)为黄柏酮抗脓毒症的潜在靶点,自由结合能分别为-32.55、1.26、-30.00、300.08、-31.88、-30.29、-21.38、-30.79、16777.84、-21.80、6443.36、-20.38、-23.47 kJ/mol。结论黄柏酮通过调控PROC和F2R抑制凝血并改善炎症反应;调节MIF、S100A9、G6PD和IL-10起到免疫应答作用;调节CTSG、CASP1、MAPK1、C5AR1和CASP3起到保护脓毒症损伤器官的作用;调控CXCR2减少中性粒细胞向炎症部位过度迁移,减轻组织损伤;调控NAMPT改善细胞能量状态,减少氧化应激从而保护细胞不受损害,并通过减轻脓毒症的症状和炎症反应来发挥其抗脓毒症的作用。 展开更多
关键词 黄柏酮 潜在靶点 炎症 脓毒症
原文传递
右归丸治疗腰椎间盘突出症:网络药理学分析活性成分及潜在治疗靶点 被引量：2
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作者 杨敬言 马涉 +3 位作者 黄仁俊 杨骁侠 汤笑尘 于栋 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第27期4346-4352,共7页
背景:右归丸具有温肾助阳、益精填髓的作用,临床多用于治疗肾阳虚证的腰椎间盘突出症且具有较好的疗效。目的:采用网络药理学、分子对接技术并结合动物实验探讨右归丸治疗腰椎间盘突出症的潜在靶点及作用机制。方法:①网络药理学分析:通... 背景:右归丸具有温肾助阳、益精填髓的作用,临床多用于治疗肾阳虚证的腰椎间盘突出症且具有较好的疗效。目的:采用网络药理学、分子对接技术并结合动物实验探讨右归丸治疗腰椎间盘突出症的潜在靶点及作用机制。方法:①网络药理学分析:通过TCMSP等数据库获取经过筛选后的右归丸有效成分与作用基因靶点,在GeneCards等数据库中收集与腰椎间盘突出症相关的基因,取二者交集进行拓扑结构分析,得到主要活性成分及核心治疗靶点。使用R软件对核心治疗靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析。②分子对接:运用Autodock和Pymol软件进行中药活性成分与核心治疗靶点分子结合能预测。③动物实验:将18只SD大鼠随机分为对照组、退变组与退变+右归丸组,每组6只。取退变组与退变+右归丸组大鼠,采用纤维穿刺法制备椎间盘退行性变模型,造模后2周,退变+右归丸组大鼠给予右归丸汤剂(1次/d)灌胃,连续给药2周。给药结束后,采用ELISA法检测血清中肿瘤坏死因子α质量浓度,苏木精-伊红染色后观察椎间盘纤维环及髓核细胞的形态学改变。结果与结论:①筛选出右归丸有90种活性成分和64种靶点,且主要活性成分为槲皮素、山奈酚、β-胡萝卜素、大豆黄素,4′-O-甲基尼亚萨酚。右归丸治疗腰椎间盘突出症的核心靶点为白细胞介素6、肿瘤坏死因子α、AKT1、白细胞介素1B、血管内皮生长因子A。富集分析发现,交集基因可能通过白细胞介素17、肿瘤坏死因子、MAPK、PI3K-AKT等信号通路改善椎间盘退变。②分子对接实验验证了右归丸中的槲皮素、山奈酚、β-胡萝卜素等与核心靶点有较强的结合能力。③动物实验结果显示,退变组大鼠血清肿瘤坏死因子α质量浓度高于对照组(P<0.05),退变+右归丸组大鼠血清肿瘤坏死因子α质量浓度低于退变组(P<0.05);苏木精-伊红染色显示,退变组大鼠椎间盘纤维环、髓核结构遭到破坏,髓核细胞数量减少;退变+右归丸组大鼠椎间盘纤维环可见重建趋势,髓核细胞数量较退变组增加。④结果表明,右归丸可能通过槲皮素、山奈酚、β-胡萝卜素等主要活性成分作用于肿瘤坏死因子α等核心靶点改善椎间盘退变,进而治疗腰椎间盘突出症。 展开更多
关键词 右归丸 腰椎间盘突出症 网络药理学 分子对接 信号通路 炎症因子 潜在靶点 纤维环穿刺
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